data_JKB
#

_chem_comp.id                                   JKB
_chem_comp.name                                 "(2,4-dinitrophenyl)-[4-[(4-fluorophenyl)methyl]piperazin-1-yl]methanone"
_chem_comp.type                                 NON-POLYMER
_chem_comp.pdbx_type                            HETAIN
_chem_comp.formula                              "C18 H17 F N4 O5"
_chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id              ?
_chem_comp.pdbx_synonyms                        ?
_chem_comp.pdbx_formal_charge                   0
_chem_comp.pdbx_initial_date                    2019-03-07
_chem_comp.pdbx_modified_date                   2019-06-14
_chem_comp.pdbx_ambiguous_flag                  N
_chem_comp.pdbx_release_status                  REL
_chem_comp.pdbx_replaced_by                     ?
_chem_comp.pdbx_replaces                        ?
_chem_comp.formula_weight                       388.350
_chem_comp.one_letter_code                      ?
_chem_comp.three_letter_code                    JKB
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_details       ?
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag  Y
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details       Corina
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag  N
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code       6QXD
_chem_comp.pdbx_subcomponent_list               ?
_chem_comp.pdbx_processing_site                 RCSB
#   #
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.alt_atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.pdbx_align
_chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag
_chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag
_chem_comp_atom.pdbx_stereo_config
_chem_comp_atom.model_Cartn_x
_chem_comp_atom.model_Cartn_y
_chem_comp_atom.model_Cartn_z
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id
_chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id
_chem_comp_atom.pdbx_ordinal
JKB  C01  C1   C   0  1  Y  N  N  24.464  17.873   96.316   5.333  -1.673  -0.370  C01  JKB   1  
JKB  C02  C2   C   0  1  Y  N  N  23.560  16.780   96.157   6.603  -1.431   0.119  C02  JKB   2  
JKB  C03  C3   C   0  1  Y  N  N  25.814  17.670   96.213   4.586  -0.636  -0.899  C03  JKB   3  
JKB  C04  C4   C   0  1  Y  N  N  24.074  15.479   95.901   7.125  -0.149   0.084  C04  JKB   4  
JKB  C05  C5   C   0  1  Y  N  N  26.325  16.359   95.947   5.107   0.644  -0.934  C05  JKB   5  
JKB  C06  C6   C   0  1  Y  N  N  25.425  15.267   95.790   6.374   0.890  -0.440  C06  JKB   6  
JKB  C07  C7   C   0  1  N  N  N  26.768  18.886   96.392   3.204  -0.902  -1.437  C07  JKB   7  
JKB  N08  N1   N   0  1  N  N  N  27.819  18.631   95.744   2.219  -0.737  -0.360  N08  JKB   8  
JKB  C09  C8   C   0  1  N  N  N  29.448  19.500   94.332   1.263   0.757   1.329  C09  JKB   9  
JKB  C10  C9   C   0  1  N  N  N  28.280  19.790   95.240   2.163   0.660   0.092  C10  JKB  10  
JKB  N11  N2   N   0  1  N  N  N  30.432  18.868   95.203  -0.039   0.155   1.008  N11  JKB  11  
JKB  C12  C10  C   0  1  N  N  N  30.062  17.729   96.026  -0.057  -1.194   0.422  C12  JKB  12  
JKB  C13  C11  C   0  1  N  N  N  28.632  17.921   96.543   0.895  -1.214  -0.780  C13  JKB  13  
JKB  C14  C12  C   0  1  N  N  N  31.802  19.424   95.197  -1.187   0.821   1.245  C14  JKB  14  
JKB  C15  C13  C   0  1  Y  N  N  32.993  18.966   96.101  -2.479   0.242   0.820  C15  JKB  15  
JKB  C16  C14  C   0  1  Y  N  N  33.773  18.428   98.340  -4.502   0.388  -0.466  C16  JKB  16  
JKB  C17  C15  C   0  1  Y  N  N  32.750  18.775   97.472  -3.297   0.934  -0.074  C17  JKB  17  
JKB  C18  C16  C   0  1  Y  N  N  35.055  18.284   97.864  -4.900  -0.843   0.025  C18  JKB  18  
JKB  C19  C17  C   0  1  Y  N  N  35.328  18.496   96.497  -4.090  -1.537   0.906  C19  JKB  19  
JKB  C20  C18  C   0  1  Y  N  N  34.291  18.850   95.613  -2.883  -1.002   1.307  C20  JKB  20  
JKB  O22  O1   O   0  1  N  N  N  31.994  20.374   94.500  -1.159   1.898   1.808  O22  JKB  21  
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JKB  O24  O2   O  -1  1  N  N  N  35.663  18.045  100.236  -6.906  -0.816  -1.180  O24  JKB  23  
JKB  O25  O3   O   0  1  N  N  N  37.166  17.596   98.628  -6.546  -2.506   0.031  O25  JKB  24  
JKB  N26  N4   N   1  1  N  N  N  31.481  18.907   98.042  -2.874   2.251  -0.599  N26  JKB  25  
JKB  O28  O5   O   0  1  N  N  N  30.906  19.897   97.949  -1.759   2.676  -0.352  O28  JKB  26  
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JKB  H4   H4   H   0  1  N  N  N  25.804  14.277   95.585   6.780   1.890  -0.467  H4   JKB  31  
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JKB  H6   H6   H   0  1  N  N  N  26.295  19.798   95.999   3.154  -1.921  -1.822  H6   JKB  33  
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JKB  H9   H9   H   0  1  N  N  N  29.151  18.819   93.521   1.126   1.804   1.601  H9   JKB  35  
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JKB  H16  H16  H   0  1  N  N  N  33.564  18.271   99.388  -5.136   0.923  -1.158  H16  JKB  42  
JKB  H17  H17  H   0  1  N  N  N  36.337  18.386   96.127  -4.407  -2.497   1.286  H17  JKB  43  
JKB  H18  H18  H   0  1  N  N  N  34.500  19.029   94.569  -2.252  -1.545   1.995  H18  JKB  44  
JKB  O27  O27  O  -1  1  N  N  N       ?       ?        ?  -3.640   2.911  -1.278  O27  JKB  45  
#   #
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
JKB  C09  N11  SING  N  N   1  
JKB  C09  C10  SING  N  N   2  
JKB  O22  C14  DOUB  N  N   3  
JKB  C14  N11  SING  N  N   4  
JKB  C14  C15  SING  N  N   5  
JKB  N11  C12  SING  N  N   6  
JKB  C10  N08  SING  N  N   7  
JKB  C20  C15  DOUB  Y  N   8  
JKB  C20  C19  SING  Y  N   9  
JKB  N08  C07  SING  N  N  10  
JKB  N08  C13  SING  N  N  11  
JKB  F21  C04  SING  N  N  12  
JKB  C06  C04  DOUB  Y  N  13  
JKB  C06  C05  SING  Y  N  14  
JKB  C04  C02  SING  Y  N  15  
JKB  C05  C03  DOUB  Y  N  16  
JKB  C12  C13  SING  N  N  17  
JKB  C15  C17  SING  Y  N  18  
JKB  C02  C01  DOUB  Y  N  19  
JKB  C03  C01  SING  Y  N  20  
JKB  C03  C07  SING  N  N  21  
JKB  C19  C18  DOUB  Y  N  22  
JKB  C17  N26  SING  N  N  23  
JKB  C17  C16  DOUB  Y  N  24  
JKB  C18  C16  SING  Y  N  25  
JKB  C18  N23  SING  N  N  26  
JKB  O28  N26  DOUB  N  N  27  
JKB  O25  N23  DOUB  N  N  28  
JKB  C01  H1   SING  N  N  29  
JKB  C02  H2   SING  N  N  30  
JKB  C05  H3   SING  N  N  31  
JKB  C06  H4   SING  N  N  32  
JKB  C07  H5   SING  N  N  33  
JKB  C07  H6   SING  N  N  34  
JKB  C09  H8   SING  N  N  35  
JKB  C09  H9   SING  N  N  36  
JKB  C10  H10  SING  N  N  37  
JKB  C10  H11  SING  N  N  38  
JKB  C12  H12  SING  N  N  39  
JKB  C12  H13  SING  N  N  40  
JKB  C13  H14  SING  N  N  41  
JKB  C13  H15  SING  N  N  42  
JKB  C16  H16  SING  N  N  43  
JKB  C19  H17  SING  N  N  44  
JKB  C20  H18  SING  N  N  45  
JKB  N23  O24  SING  N  N  46  
JKB  N26  O27  SING  N  N  47  
#   #
loop_
_pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id
_pdbx_chem_comp_descriptor.type
_pdbx_chem_comp_descriptor.program
_pdbx_chem_comp_descriptor.program_version
_pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor
JKB  InChI             InChI                 1.03   "InChI=1S/C18H17FN4O5/c19-14-3-1-13(2-4-14)12-20-7-9-21(10-8-20)18(24)16-6-5-15(22(25)26)11-17(16)23(27)28/h1-6,11H,7-10,12H2"  
JKB  InChIKey          InChI                 1.03   ZPXJBWPENHAIHH-UHFFFAOYSA-N  
JKB  SMILES_CANONICAL  CACTVS                3.385  "[O-][N+](=O)c1ccc(C(=O)N2CCN(CC2)Cc3ccc(F)cc3)c(c1)[N+]([O-])=O"  
JKB  SMILES            CACTVS                3.385  "[O-][N+](=O)c1ccc(C(=O)N2CCN(CC2)Cc3ccc(F)cc3)c(c1)[N+]([O-])=O"  
JKB  SMILES_CANONICAL  "OpenEye OEToolkits"  2.0.7  "c1cc(ccc1CN2CCN(CC2)C(=O)c3ccc(cc3[N+](=O)[O-])[N+](=O)[O-])F"  
JKB  SMILES            "OpenEye OEToolkits"  2.0.7  "c1cc(ccc1CN2CCN(CC2)C(=O)c3ccc(cc3[N+](=O)[O-])[N+](=O)[O-])F"  
#
_pdbx_chem_comp_identifier.comp_id          JKB
_pdbx_chem_comp_identifier.type             "SYSTEMATIC NAME"
_pdbx_chem_comp_identifier.program          "OpenEye OEToolkits"
_pdbx_chem_comp_identifier.program_version  2.0.7
_pdbx_chem_comp_identifier.identifier       "(2,4-dinitrophenyl)-[4-[(4-fluorophenyl)methyl]piperazin-1-yl]methanone"
#   #
loop_
_pdbx_chem_comp_audit.comp_id
_pdbx_chem_comp_audit.action_type
_pdbx_chem_comp_audit.date
_pdbx_chem_comp_audit.processing_site
JKB  "Create component"  2019-03-07  RCSB  
JKB  "Initial release"   2019-06-19  RCSB  
##
