#SentieonCommandLine: /lustre8/home/ykawai-tnproj-pg/packages/sentieon-genomics-201911/libexec/driver -t 8 -r /lustre8/home/ncbn-pg/data/resource/Homo_sapiens_assembly38.fasta -i HGDP/HGDP00175/HGDP00175.cram --algo InsertSizeMetricAlgo HGDP/HGDP00175/QCmetrics/HGDP00175.InsertSizeMetricAlgo.txt MEDIAN_INSERT_SIZE MEDIAN_ABSOLUTE_DEVIATION MIN_INSERT_SIZE MAX_INSERT_SIZE MEAN_INSERT_SIZE STANDARD_DEVIATION READ_PAIRS PAIR_ORIENTATION WIDTH_OF_10_PERCENT WIDTH_OF_20_PERCENT WIDTH_OF_30_PERCENT WIDTH_OF_40_PERCENT WIDTH_OF_50_PERCENT WIDTH_OF_60_PERCENT WIDTH_OF_70_PERCENT WIDTH_OF_80_PERCENT WIDTH_OF_90_PERCENT WIDTH_OF_99_PERCENT 422.000000 57.000000 2 244926796 428.650185 92.952049 317163607 FR 23 43 65 89 115 143 177 221 295 635 insert_size All_Reads.fr_count 2 1056 3 1127 4 1150 5 1181 6 1160 7 1316 8 1200 9 1132 10 1124 11 1172 12 1103 13 1218 14 1235 15 1117 16 1175 17 1242 18 1202 19 1248 20 1277 21 1273 22 1528 23 1615 24 1675 25 1721 26 2037 27 2087 28 2158 29 2362 30 3595 31 3752 32 3951 33 5588 34 7373 35 7784 36 8090 37 9540 38 10425 39 11742 40 12209 41 12345 42 13617 43 14265 44 14592 45 15102 46 15050 47 15687 48 16365 49 16826 50 16830 51 17302 52 17638 53 18527 54 19347 55 18979 56 19125 57 19358 58 20234 59 20765 60 20767 61 21329 62 21417 63 22236 64 22850 65 23009 66 23202 67 23349 68 24139 69 25265 70 24961 71 24730 72 24964 73 25271 74 25649 75 25545 76 25244 77 24912 78 25858 79 26519 80 25408 81 25369 82 24929 83 25828 84 25985 85 25938 86 25734 87 25469 88 25918 89 26584 90 26460 91 25977 92 25905 93 26861 94 27672 95 26932 96 26635 97 26478 98 26980 99 26970 100 26732 101 26041 102 25788 103 26741 104 26891 105 26286 106 25626 107 25445 108 25976 109 26369 110 25720 111 25355 112 25472 113 25688 114 25751 115 25055 116 25008 117 24728 118 25051 119 25448 120 25318 121 25246 122 25200 123 25181 124 25059 125 25070 126 24144 127 24193 128 24033 129 24161 130 23897 131 23863 132 23310 133 23514 134 23150 135 22994 136 22710 137 22850 138 22597 139 22845 140 22553 141 22318 142 22209 143 22273 144 22154 145 21916 146 21431 147 21328 148 21567 149 21284 150 21009 151 21560 152 21297 153 21341 154 21501 155 20888 156 20430 157 20196 158 20143 159 20284 160 19790 161 19568 162 19422 163 19318 164 19330 165 19095 166 19002 167 18942 168 18675 169 18685 170 18081 171 18507 172 18092 173 18256 174 18173 175 17873 176 17960 177 17650 178 17871 179 18133 180 17794 181 17481 182 17965 183 17800 184 17883 185 17933 186 17752 187 17802 188 17911 189 18097 190 17903 191 18105 192 17874 193 18388 194 18151 195 18383 196 18350 197 18232 198 18479 199 18968 200 19062 201 18948 202 19389 203 19605 204 19901 205 19980 206 20538 207 20548 208 21007 209 21328 210 21262 211 21978 212 22507 213 23235 214 23623 215 24347 216 24829 217 25436 218 26735 219 26826 220 27616 221 28404 222 29524 223 30665 224 31787 225 32752 226 33682 227 34716 228 35764 229 37276 230 38905 231 39534 232 41192 233 42820 234 44742 235 45981 236 47537 237 49651 238 51528 239 53675 240 55458 241 57496 242 59352 243 61595 244 63903 245 66409 246 69359 247 71363 248 74520 249 77438 250 79942 251 82945 252 86070 253 89275 254 93178 255 96075 256 100241 257 104106 258 107785 259 112165 260 115996 261 120407 262 124942 263 129706 264 133644 265 138931 266 144311 267 149366 268 155444 269 160823 270 166562 271 172996 272 178999 273 186417 274 193553 275 202283 276 208062 277 215179 278 220828 279 227552 280 234402 281 242191 282 249323 283 258029 284 266253 285 273671 286 282553 287 290687 288 298707 289 310006 290 318642 291 327920 292 338172 293 347610 294 356708 295 366591 296 377665 297 388488 298 400306 299 411414 300 422253 301 434117 302 446603 303 459196 304 471099 305 482511 306 493735 307 506950 308 520476 309 532558 310 545482 311 558673 312 571679 313 586962 314 601086 315 614505 316 626775 317 642243 318 655010 319 670431 320 684489 321 699863 322 714746 323 728887 324 744686 325 759719 326 773947 327 791294 328 804994 329 820054 330 837736 331 854389 332 868647 333 882394 334 899289 335 913580 336 927666 337 944020 338 958035 339 971970 340 989122 341 1005711 342 1022411 343 1037773 344 1049974 345 1067795 346 1079463 347 1095579 348 1111720 349 1123559 350 1136313 351 1152828 352 1165783 353 1181370 354 1194449 355 1206388 356 1220611 357 1233500 358 1245848 359 1258970 360 1270148 361 1284436 362 1297342 363 1308209 364 1320912 365 1331633 366 1338118 367 1353341 368 1363743 369 1371956 370 1381633 371 1390685 372 1400909 373 1411760 374 1419494 375 1430978 376 1438476 377 1445565 378 1453878 379 1460653 380 1465462 381 1472463 382 1478938 383 1484810 384 1491695 385 1500294 386 1504234 387 1509006 388 1514756 389 1517757 390 1520830 391 1525137 392 1528430 393 1532223 394 1536998 395 1539434 396 1542703 397 1545222 398 1545941 399 1548251 400 1549510 401 1548422 402 1550772 403 1550152 404 1549835 405 1553108 406 1551770 407 1550673 408 1550470 409 1551026 410 1543824 411 1542788 412 1538534 413 1539364 414 1538037 415 1534396 416 1529479 417 1529250 418 1525546 419 1522358 420 1517250 421 1512009 422 1507604 423 1499938 424 1497845 425 1491890 426 1488717 427 1481689 428 1479896 429 1469736 430 1464552 431 1458690 432 1453813 433 1444208 434 1440541 435 1431511 436 1426947 437 1419657 438 1412634 439 1408256 440 1397252 441 1389958 442 1378923 443 1373545 444 1366001 445 1357903 446 1350148 447 1341438 448 1333910 449 1327000 450 1319596 451 1309433 452 1301883 453 1292393 454 1283625 455 1276175 456 1265354 457 1259517 458 1248813 459 1239153 460 1231035 461 1221415 462 1213435 463 1203924 464 1194760 465 1186034 466 1175396 467 1166235 468 1156958 469 1149097 470 1139349 471 1131152 472 1120146 473 1111850 474 1101947 475 1093487 476 1083896 477 1073970 478 1065652 479 1057365 480 1047810 481 1036994 482 1028026 483 1018016 484 1008613 485 999806 486 991259 487 981915 488 974427 489 964097 490 955364 491 944161 492 935949 493 927496 494 920464 495 909204 496 899453 497 891999 498 884268 499 875190 500 867451 501 856977 502 849712 503 839908 504 831941 505 822801 506 813428 507 806040 508 796527 509 789525 510 779685 511 769258 512 764535 513 754017 514 747321 515 739521 516 727670 517 718069 518 709931 519 702772 520 695997 521 687809 522 680380 523 671811 524 664250 525 657520 526 650032 527 641404 528 634169 529 627489 530 620782 531 611022 532 606930 533 597518 534 591805 535 583615 536 575770 537 568240 538 561386 539 555190 540 548642 541 541548 542 534041 543 527984 544 522271 545 515432 546 508951 547 502402 548 494889 549 488820 550 483056 551 475704 552 471115 553 463864 554 458241 555 452961 556 443952 557 439971 558 434481 559 428747 560 423075 561 416455 562 411508 563 406436 564 399607 565 394965 566 388451 567 383865 568 377469 569 372896 570 367439 571 362749 572 356056 573 351910 574 345566 575 339402 576 335405 577 330272 578 324214 579 320296 580 317306 581 311139 582 306909 583 303229 584 298554 585 293414 586 289737 587 284315 588 280123 589 275893 590 272949 591 267820 592 263756 593 260283 594 255769 595 251754 596 249014 597 245007 598 240927 599 236981 600 233407 601 229778 602 225696 603 221785 604 218250 605 215403 606 210948 607 207907 608 204861 609 201444 610 198293 611 195547 612 191317 613 188301 614 185270 615 181911 616 179641 617 175568 618 173522 619 170611 620 167232 621 163608 622 161266 623 158481 624 156328 625 154036 626 150785 627 148374 628 145815 629 142789 630 141265 631 138235 632 135380 633 133089 634 131313 635 129181 636 127042 637 124471 638 122841 639 121096 640 118187 641 116269 642 113345 643 112307 644 110160 645 108219 646 106154 647 104307 648 102911 649 100091 650 98890 651 96977 652 95376 653 93050 654 91196 655 90091 656 88757 657 87173 658 85237 659 83035 660 82508 661 80287 662 78503 663 77489 664 76016 665 74612 666 72811 667 72148 668 70936 669 68983 670 67966 671 66030 672 65304 673 64116 674 63377 675 61799 676 60851 677 59753 678 58574 679 57202 680 56392 681 55487 682 54272 683 53404 684 52167 685 51302 686 50106 687 49203 688 47798 689 47094 690 46377 691 45303 692 44566 693 43350 694 42580 695 41450 696 40755 697 40095 698 39444 699 38732 700 37995 701 37272 702 36820 703 35844 704 34986 705 34295 706 33964 707 32789 708 32261 709 32018 710 31170 711 30798 712 29917 713 29456 714 28785 715 28316 716 27522 717 26937 718 26368 719 26252 720 25654 721 25173 722 24402 723 24015 724 23632 725 22996 726 22374 727 22001 728 21762 729 21033 730 20875 731 20408 732 20222 733 19695 734 19110 735 18661 736 18605 737 18007 738 18065 739 17809 740 17193 741 16920 742 16634 743 16302 744 16062 745 15918 746 15190 747 15061 748 14706 749 14297 750 13905 751 13480 752 13204 753 13005 754 12513 755 12188 756 11946 757 11903 758 11673 759 11385 760 10941 761 11195 762 10637 763 10484 764 10385 765 10084 766 9904 767 9773 768 9523 769 9299 770 9199 771 9060 772 8703 773 8530 774 8503 775 8091 776 7916 777 7751 778 7681 779 7499 780 7353 781 7212 782 6950 783 6872 784 6873 785 6691 786 6648 787 6732 788 6300 789 6013 790 6023 791 5916 792 5734 793 5677 794 5781 795 5387 796 5833 797 5207 798 4841 799 5034 800 4434 801 4276 802 4600 803 3914 804 3726 805 3566 806 3727 807 3406 808 3335 809 3252 810 3183 811 3180 812 3148 813 3089 814 3042 815 2943 816 2828 817 2732 818 2729 819 2691 820 2513 821 2557 822 2428 823 2410 824 2411 825 2289 826 2284 827 2310 828 2180 829 2220 830 2111 831 2080 832 2018 833 1968 834 1895 835 1865 836 1932 837 1870 838 1760 839 1790 840 1797 841 1574 842 1654 843 1636 844 1648 845 1624 846 1551 847 1548 848 1512 849 1458 850 1417 851 1426 852 1268 853 1239 854 1177 855 1243 856 1205 857 1135 858 1149 859 1122 860 1075 861 1130 862 1023 863 943 864 955 865 866 866 842 867 856 868 842 869 863 870 850 871 795 872 777 873 749 874 711 875 705 876 735 877 723 878 687 879 724 880 674 881 649 882 622 883 619 884 612 885 569 886 561 887 546 888 603 889 576 890 531 891 538 892 513 893 479 894 500 895 495 896 501 897 499 898 436 899 444 900 485 901 417 902 424 903 458 904 396 905 406 906 403 907 416 908 410 909 370 910 396 911 397 912 393 913 385 914 391 915 312 916 330 917 337 918 283 919 333 920 333 921 350 922 282 923 293 924 306 925 324 926 280 927 289 928 270 929 260 930 245 931 256 932 258 933 272 934 266 935 257 936 246 937 228 938 246 939 251 940 271 941 248 942 240 943 202 944 222 945 272 946 229 947 232 948 211 949 207 950 202 951 191 952 215 953 226 954 205 955 214 956 182 957 180 958 183 959 183 960 186 961 186 962 166 963 186 964 175 965 162 966 179 967 180 968 145 969 176 970 171 971 137 972 134 973 154 974 171 975 149 976 162 977 130 978 140 979 133 980 143 981 157 982 142 983 136 984 133 985 121 986 119 987 154 988 114 989 127 990 122 991 121 992 113