#SentieonCommandLine: /lustre8/home/ykawai-tnproj-pg/packages/sentieon-genomics-201911/libexec/driver -t 8 -r /lustre8/home/ncbn-pg/data/resource/Homo_sapiens_assembly38.fasta -i HGDP/HGDP00201/HGDP00201.cram --algo InsertSizeMetricAlgo HGDP/HGDP00201/QCmetrics/HGDP00201.InsertSizeMetricAlgo.txt MEDIAN_INSERT_SIZE MEDIAN_ABSOLUTE_DEVIATION MIN_INSERT_SIZE MAX_INSERT_SIZE MEAN_INSERT_SIZE STANDARD_DEVIATION READ_PAIRS PAIR_ORIENTATION WIDTH_OF_10_PERCENT WIDTH_OF_20_PERCENT WIDTH_OF_30_PERCENT WIDTH_OF_40_PERCENT WIDTH_OF_50_PERCENT WIDTH_OF_60_PERCENT WIDTH_OF_70_PERCENT WIDTH_OF_80_PERCENT WIDTH_OF_90_PERCENT WIDTH_OF_99_PERCENT 435.000000 60.000000 2 246803142 443.076229 98.012154 357836152 FR 23 47 71 95 121 151 185 233 311 657 insert_size All_Reads.fr_count 2 1177 3 1135 4 1200 5 1240 6 1239 7 1438 8 1206 9 1241 10 1203 11 1231 12 1202 13 1331 14 1340 15 1314 16 1514 17 1442 18 1703 19 2208 20 2399 21 2914 22 3659 23 3958 24 4175 25 4971 26 5186 27 5204 28 5679 29 5852 30 6926 31 7919 32 8076 33 8494 34 9241 35 9841 36 10132 37 10279 38 11215 39 11375 40 11910 41 12252 42 12546 43 13007 44 13606 45 14142 46 13910 47 14312 48 15319 49 15503 50 15608 51 16164 52 16378 53 17261 54 17911 55 17971 56 18115 57 18492 58 19308 59 20151 60 20351 61 20724 62 21112 63 21909 64 22414 65 22096 66 22487 67 22542 68 23044 69 23664 70 23533 71 23268 72 23634 73 23898 74 24288 75 23883 76 23975 77 23718 78 24311 79 25241 80 24589 81 24166 82 23668 83 24824 84 25826 85 25082 86 25349 87 25195 88 25918 89 26237 90 26520 91 26108 92 26086 93 26632 94 27479 95 26798 96 26217 97 26037 98 26396 99 26911 100 26771 101 26204 102 25974 103 26673 104 26880 105 26460 106 26201 107 25848 108 26597 109 26997 110 26522 111 26286 112 26296 113 26312 114 26511 115 26805 116 26445 117 26032 118 26837 119 26916 120 26707 121 26623 122 26723 123 27128 124 27242 125 26816 126 26440 127 25609 128 26222 129 26630 130 26780 131 25841 132 25889 133 26113 134 26274 135 26116 136 25739 137 25455 138 25414 139 25902 140 25930 141 26231 142 25889 143 25885 144 26030 145 25850 146 25946 147 25569 148 25710 149 25970 150 25972 151 26228 152 26197 153 26423 154 26290 155 26256 156 26347 157 25988 158 25834 159 25993 160 25848 161 26184 162 26187 163 25872 164 26027 165 25873 166 25653 167 25918 168 25998 169 25647 170 25610 171 25629 172 25503 173 25723 174 25527 175 25108 176 25396 177 24993 178 24902 179 25524 180 24989 181 25127 182 25175 183 25129 184 24897 185 24637 186 24702 187 24630 188 24707 189 24969 190 24958 191 24880 192 24855 193 24910 194 25032 195 24959 196 24666 197 24699 198 24950 199 24745 200 24896 201 24827 202 24807 203 25178 204 25023 205 25024 206 25238 207 25380 208 25363 209 25591 210 25799 211 25822 212 26284 213 26478 214 26710 215 26862 216 27442 217 27654 218 28296 219 29093 220 29279 221 29729 222 30223 223 30665 224 31183 225 31778 226 32579 227 33043 228 34227 229 35138 230 35597 231 36949 232 38194 233 39390 234 40310 235 41246 236 42542 237 43687 238 44794 239 46963 240 48039 241 49589 242 51395 243 53072 244 54319 245 56376 246 58094 247 60356 248 62294 249 64470 250 66944 251 69245 252 71423 253 74177 254 76628 255 79409 256 82576 257 85064 258 87987 259 92134 260 95072 261 98201 262 102816 263 105865 264 109470 265 113183 266 117632 267 121332 268 126365 269 130116 270 135774 271 140364 272 145951 273 150827 274 157066 275 162164 276 170771 277 175857 278 181613 279 187153 280 192586 281 200107 282 206210 283 213087 284 219580 285 228264 286 234287 287 242153 288 248594 289 257859 290 265878 291 273997 292 282107 293 291297 294 300618 295 309380 296 318375 297 328817 298 338490 299 348393 300 358856 301 369069 302 381952 303 392379 304 403829 305 415664 306 425512 307 436409 308 449137 309 462167 310 475564 311 487463 312 501039 313 515316 314 528764 315 542052 316 555214 317 569529 318 582017 319 596860 320 612461 321 626444 322 644074 323 658234 324 674709 325 690352 326 704697 327 719986 328 735897 329 752596 330 768770 331 783792 332 802195 333 818400 334 835154 335 851188 336 869931 337 884784 338 902010 339 917542 340 934651 341 952535 342 972524 343 987692 344 1005086 345 1023714 346 1041449 347 1056578 348 1074193 349 1088389 350 1106977 351 1121105 352 1138070 353 1156137 354 1174514 355 1190217 356 1204212 357 1218525 358 1234346 359 1248392 360 1265928 361 1279679 362 1294376 363 1309921 364 1326238 365 1336658 366 1351274 367 1363418 368 1378324 369 1390154 370 1402898 371 1415306 372 1429329 373 1441024 374 1451661 375 1462539 376 1472832 377 1483777 378 1493464 379 1507153 380 1514857 381 1524088 382 1530125 383 1539476 384 1549799 385 1557008 386 1564414 387 1571563 388 1578961 389 1585681 390 1589893 391 1593046 392 1601038 393 1604972 394 1613316 395 1616077 396 1620142 397 1624159 398 1630132 399 1633553 400 1636872 401 1639290 402 1641440 403 1644973 404 1649829 405 1647149 406 1648838 407 1651184 408 1652178 409 1652135 410 1650107 411 1649810 412 1648855 413 1650177 414 1648944 415 1648394 416 1648187 417 1645514 418 1640735 419 1640799 420 1638479 421 1633992 422 1630733 423 1627484 424 1625975 425 1619762 426 1619231 427 1615986 428 1610715 429 1606264 430 1603812 431 1599673 432 1592964 433 1587350 434 1584598 435 1577817 436 1572244 437 1566276 438 1560699 439 1557401 440 1553853 441 1545662 442 1539556 443 1533028 444 1523513 445 1521080 446 1514309 447 1505616 448 1500182 449 1495720 450 1485395 451 1482120 452 1470903 453 1463702 454 1460685 455 1449656 456 1444806 457 1435527 458 1427471 459 1418201 460 1411873 461 1406806 462 1399504 463 1390235 464 1381677 465 1374351 466 1365889 467 1359054 468 1348995 469 1339856 470 1334791 471 1326625 472 1315295 473 1309883 474 1301018 475 1293713 476 1283941 477 1275920 478 1267389 479 1258878 480 1249518 481 1241860 482 1233100 483 1225906 484 1217062 485 1206781 486 1198429 487 1190280 488 1181989 489 1174309 490 1164891 491 1157386 492 1147522 493 1142989 494 1131787 495 1122226 496 1116305 497 1107875 498 1098482 499 1090548 500 1082116 501 1072117 502 1063117 503 1058273 504 1049033 505 1040452 506 1029382 507 1020975 508 1013653 509 1005872 510 997340 511 991102 512 980278 513 972004 514 964715 515 955586 516 947403 517 937670 518 930699 519 920318 520 914780 521 905664 522 898725 523 889015 524 879963 525 870609 526 865962 527 856317 528 846819 529 838656 530 831490 531 824090 532 815165 533 808352 534 799416 535 791485 536 783738 537 775847 538 769022 539 761580 540 752629 541 743109 542 734892 543 730048 544 721529 545 714060 546 707333 547 696927 548 690342 549 683623 550 676438 551 668117 552 660278 553 652803 554 642667 555 637571 556 630849 557 622642 558 616167 559 608752 560 600739 561 594622 562 587959 563 580560 564 573295 565 567317 566 560761 567 553578 568 546442 569 540536 570 532661 571 525624 572 520037 573 514717 574 507321 575 500375 576 495254 577 487359 578 483183 579 474487 580 468555 581 462834 582 455980 583 449871 584 444550 585 438715 586 432852 587 426718 588 420730 589 413354 590 409286 591 403663 592 398140 593 392365 594 386742 595 381684 596 377180 597 371644 598 366784 599 360999 600 356178 601 350213 602 345364 603 340655 604 334945 605 331791 606 326696 607 320064 608 317663 609 312855 610 307006 611 303523 612 298492 613 294823 614 290707 615 284948 616 281920 617 276983 618 271437 619 266810 620 264226 621 259619 622 255232 623 251624 624 248155 625 244495 626 240373 627 236439 628 232975 629 229912 630 226065 631 222919 632 218046 633 216039 634 211808 635 208624 636 205866 637 201416 638 199775 639 196286 640 192961 641 189443 642 186968 643 184722 644 181241 645 178399 646 175093 647 173249 648 169980 649 167750 650 165010 651 161620 652 159575 653 156580 654 153819 655 151480 656 149455 657 147653 658 144409 659 141687 660 138737 661 137161 662 135427 663 133493 664 130858 665 128208 666 126172 667 124035 668 121559 669 119735 670 118271 671 116314 672 114131 673 111885 674 110813 675 108494 676 106872 677 104850 678 102448 679 101396 680 99608 681 97629 682 96198 683 94361 684 92966 685 91603 686 89488 687 88715 688 86628 689 85921 690 84223 691 81950 692 80909 693 79864 694 78673 695 77054 696 75020 697 73836 698 72730 699 71557 700 69875 701 69451 702 67938 703 66968 704 65134 705 64373 706 63374 707 62305 708 61116 709 59423 710 57888 711 57490 712 56453 713 55380 714 54837 715 53508 716 52542 717 51457 718 50450 719 49647 720 48264 721 47748 722 47039 723 46628 724 45806 725 45001 726 43665 727 42971 728 42289 729 41390 730 40693 731 40155 732 39314 733 38971 734 37902 735 37240 736 36684 737 35946 738 35487 739 34748 740 34268 741 33740 742 33282 743 32309 744 31998 745 31078 746 30316 747 29691 748 29589 749 28874 750 28612 751 27858 752 27166 753 26665 754 26337 755 25862 756 25406 757 24686 758 24354 759 23815 760 23684 761 22752 762 22778 763 22108 764 21514 765 21184 766 21066 767 20421 768 20051 769 19570 770 19166 771 18846 772 18698 773 18195 774 18104 775 17380 776 17161 777 16742 778 16483 779 16019 780 15641 781 15317 782 14835 783 14907 784 14406 785 14039 786 13907 787 13552 788 13099 789 13151 790 12769 791 12417 792 12162 793 11999 794 11830 795 11563 796 11469 797 10994 798 10723 799 10863 800 10628 801 10335 802 10051 803 9917 804 9796 805 9554 806 9464 807 9352 808 9037 809 8676 810 8350 811 8559 812 8260 813 8385 814 7767 815 7521 816 7481 817 7352 818 7233 819 7011 820 6976 821 6683 822 6695 823 6433 824 6379 825 6341 826 6060 827 5927 828 5933 829 5764 830 5603 831 5457 832 5590 833 5429 834 5265 835 5279 836 5138 837 5057 838 4875 839 4843 840 4619 841 4498 842 4775 843 4381 844 4289 845 4269 846 4128 847 4115 848 3998 849 3893 850 3944 851 3712 852 3668 853 3724 854 3772 855 3550 856 3401 857 3446 858 3223 859 3190 860 3086 861 2996 862 3002 863 3007 864 2979 865 2778 866 2757 867 2860 868 2721 869 2697 870 2456 871 2497 872 2164 873 2360 874 1981 875 1931 876 1866 877 1849 878 1881 879 1842 880 1982 881 1684 882 1613 883 1603 884 1538 885 1530 886 1473 887 1501 888 1422 889 1414 890 1339 891 1367 892 1331 893 1350 894 1240 895 1177 896 1219 897 1267 898 1263 899 1171 900 1166 901 1129 902 1063 903 1157 904 1068 905 1080 906 1028 907 1023 908 1071 909 918 910 1034 911 967 912 873 913 952 914 867 915 876 916 870 917 821 918 830 919 816 920 813 921 815 922 755 923 728 924 711 925 764 926 680 927 724 928 692 929 742 930 666 931 664 932 691 933 632 934 629 935 634 936 627 937 603 938 580 939 597 940 549 941 578 942 543 943 568 944 585 945 509 946 511 947 512 948 538 949 474 950 484 951 476 952 510 953 474 954 472 955 397 956 445 957 455 958 443 959 437 960 384 961 429 962 427 963 388 964 391 965 392 966 346 967 353 968 350 969 312 970 363 971 315 972 318 973 349 974 359 975 342 976 322 977 366 978 309 979 298 980 330 981 306 982 305 983 291 984 286 985 292 986 306 987 252 988 233 989 238 990 268 991 240 992 266 993 258 994 247 995 250 996 237 997 244 998 225 999 217 1000 207 1001 246 1002 212 1003 225 1004 207 1005 197 1006 197 1007 201 1008 185 1009 213 1010 176 1011 186 1012 183 1013 170 1014 192 1015 204 1016 181 1017 175 1018 187 1019 179 1020 155 1021 177 1022 179 1023 147 1024 174 1025 168 1026 157 1027 154 1028 150 1029 169 1030 164 1031 173 1032 133 1033 159 1034 165 1035 157