#SentieonCommandLine: /lustre8/home/ykawai-tnproj-pg/packages/sentieon-genomics-201911/libexec/driver -t 8 -r /lustre8/home/ncbn-pg/data/resource/Homo_sapiens_assembly38.fasta -i HGDP/HGDP00210/HGDP00210.cram --algo InsertSizeMetricAlgo HGDP/HGDP00210/QCmetrics/HGDP00210.InsertSizeMetricAlgo.txt MEDIAN_INSERT_SIZE MEDIAN_ABSOLUTE_DEVIATION MIN_INSERT_SIZE MAX_INSERT_SIZE MEAN_INSERT_SIZE STANDARD_DEVIATION READ_PAIRS PAIR_ORIENTATION WIDTH_OF_10_PERCENT WIDTH_OF_20_PERCENT WIDTH_OF_30_PERCENT WIDTH_OF_40_PERCENT WIDTH_OF_50_PERCENT WIDTH_OF_60_PERCENT WIDTH_OF_70_PERCENT WIDTH_OF_80_PERCENT WIDTH_OF_90_PERCENT WIDTH_OF_99_PERCENT 415.000000 56.000000 2 245565379 421.413389 92.139354 454754718 FR 21 43 65 87 113 141 175 219 295 619 insert_size All_Reads.fr_count 2 1135 3 1145 4 1175 5 1173 6 1207 7 1243 8 1210 9 1221 10 1257 11 1187 12 1179 13 1265 14 1191 15 1261 16 1174 17 1233 18 1278 19 1689 20 1707 21 1689 22 2328 23 2405 24 2583 25 2772 26 3171 27 3805 28 3853 29 5234 30 6256 31 7240 32 8916 33 9908 34 10886 35 12200 36 13607 37 14550 38 15029 39 16226 40 16878 41 17156 42 17864 43 18828 44 19608 45 19758 46 20092 47 20460 48 22227 49 22129 50 22193 51 23230 52 23437 53 24716 54 25382 55 25809 56 26201 57 26936 58 28217 59 29754 60 29791 61 30101 62 30384 63 31432 64 32634 65 32179 66 32751 67 33101 68 33626 69 34411 70 33847 71 34124 72 34339 73 34549 74 35357 75 34723 76 34947 77 34633 78 35126 79 36280 80 35719 81 35409 82 35484 83 36055 84 37621 85 37687 86 37809 87 37274 88 37766 89 38346 90 38281 91 37200 92 37445 93 38256 94 38271 95 38260 96 37518 97 36994 98 37672 99 37708 100 37321 101 36800 102 37070 103 37365 104 37591 105 36688 106 36994 107 36013 108 37177 109 37438 110 37294 111 37027 112 37139 113 37443 114 37860 115 37285 116 37627 117 36686 118 37864 119 37627 120 37445 121 37486 122 36709 123 36783 124 36629 125 36155 126 35619 127 35119 128 35562 129 35883 130 35522 131 35198 132 34946 133 34977 134 34861 135 35073 136 33977 137 34341 138 34164 139 34412 140 33955 141 34458 142 34419 143 34407 144 34380 145 34384 146 34209 147 34051 148 34320 149 34376 150 33671 151 34030 152 33903 153 33678 154 33740 155 33298 156 32984 157 32508 158 32611 159 32526 160 32266 161 32346 162 32229 163 32161 164 32004 165 31937 166 31664 167 31751 168 31614 169 31701 170 31624 171 31342 172 31377 173 31285 174 31495 175 31547 176 31439 177 31806 178 32122 179 32123 180 32371 181 31560 182 32199 183 32510 184 32849 185 32316 186 32620 187 33006 188 33283 189 33465 190 33282 191 33715 192 33695 193 34059 194 34243 195 34138 196 34771 197 35204 198 35837 199 36163 200 36508 201 37080 202 37311 203 38252 204 38894 205 39430 206 40279 207 41144 208 41894 209 42858 210 43610 211 44808 212 45651 213 46537 214 48216 215 49365 216 51092 217 52511 218 54271 219 55640 220 57173 221 58907 222 60404 223 62542 224 64673 225 66454 226 68599 227 70642 228 72901 229 75272 230 77440 231 80550 232 82733 233 86059 234 88886 235 91239 236 94770 237 97683 238 101528 239 105097 240 108100 241 111540 242 115851 243 119963 244 124413 245 128448 246 132298 247 137544 248 141946 249 147515 250 152250 251 157469 252 163844 253 168120 254 174095 255 179962 256 185863 257 192129 258 199577 259 206559 260 214514 261 221610 262 228570 263 236490 264 244743 265 252235 266 260675 267 269704 268 278345 269 287567 270 297098 271 306476 272 316520 273 327359 274 339497 275 349957 276 365913 277 375533 278 384909 279 396184 280 406226 281 419083 282 430542 283 442947 284 456732 285 469295 286 481426 287 495267 288 508350 289 523213 290 539006 291 554081 292 569118 293 584288 294 600068 295 615208 296 631360 297 647039 298 663461 299 681874 300 700609 301 716376 302 737401 303 755866 304 774030 305 792853 306 812001 307 829790 308 848972 309 869863 310 889146 311 910051 312 932876 313 952657 314 973850 315 994735 316 1013526 317 1036483 318 1056340 319 1081154 320 1103045 321 1125649 322 1147418 323 1172281 324 1195116 325 1215445 326 1237567 327 1259922 328 1281425 329 1305092 330 1327279 331 1350750 332 1375672 333 1399543 334 1422989 335 1444632 336 1466322 337 1490110 338 1510812 339 1533760 340 1554287 341 1575961 342 1599218 343 1622365 344 1642427 345 1665515 346 1686191 347 1707471 348 1728381 349 1746412 350 1766217 351 1786164 352 1807616 353 1826604 354 1847574 355 1864983 356 1883164 357 1899865 358 1914618 359 1930737 360 1951270 361 1966642 362 1983460 363 1998448 364 2014609 365 2031567 366 2044505 367 2058370 368 2069089 369 2081378 370 2091007 371 2105336 372 2118249 373 2131758 374 2141857 375 2152736 376 2159568 377 2171270 378 2177403 379 2187355 380 2192034 381 2200792 382 2208033 383 2215739 384 2220362 385 2227524 386 2233467 387 2239508 388 2243352 389 2243848 390 2245923 391 2249084 392 2250197 393 2253625 394 2251131 395 2253756 396 2256793 397 2256051 398 2255870 399 2256034 400 2253633 401 2251384 402 2253116 403 2250394 404 2248471 405 2242578 406 2240565 407 2237950 408 2233076 409 2230980 410 2222909 411 2210595 412 2208017 413 2202229 414 2193676 415 2186886 416 2181529 417 2174914 418 2165861 419 2160615 420 2151999 421 2141867 422 2131144 423 2121033 424 2112687 425 2104586 426 2095069 427 2080941 428 2077074 429 2062493 430 2053297 431 2041718 432 2029014 433 2019509 434 2007154 435 1996316 436 1984756 437 1974427 438 1961192 439 1949191 440 1939355 441 1925991 442 1910211 443 1897035 444 1887073 445 1872636 446 1860720 447 1850903 448 1836146 449 1822610 450 1809728 451 1797464 452 1784237 453 1771231 454 1754959 455 1742400 456 1727242 457 1714927 458 1701814 459 1690664 460 1676240 461 1664112 462 1649661 463 1634988 464 1619461 465 1607795 466 1593130 467 1581935 468 1568751 469 1553992 470 1542266 471 1528048 472 1513964 473 1500074 474 1488440 475 1473443 476 1457486 477 1446663 478 1432378 479 1419929 480 1408211 481 1394491 482 1378705 483 1366592 484 1351076 485 1341520 486 1326513 487 1313744 488 1301252 489 1290170 490 1275651 491 1265418 492 1252337 493 1238933 494 1226560 495 1212181 496 1200816 497 1186736 498 1175919 499 1164468 500 1152708 501 1140437 502 1126149 503 1116725 504 1103692 505 1090643 506 1078682 507 1066954 508 1052980 509 1041774 510 1030340 511 1019949 512 1008313 513 995277 514 985378 515 971713 516 961369 517 951250 518 938683 519 929854 520 919532 521 907551 522 899178 523 887713 524 877871 525 870005 526 854722 527 845190 528 834432 529 823293 530 814597 531 806110 532 793660 533 785298 534 774775 535 765059 536 755641 537 746154 538 734780 539 726529 540 718527 541 707039 542 698097 543 690011 544 681672 545 672787 546 663877 547 653277 548 645903 549 636990 550 627783 551 619155 552 612430 553 603273 554 595720 555 587105 556 579153 557 571621 558 560976 559 553978 560 546363 561 538702 562 532077 563 523893 564 517623 565 508207 566 499001 567 493387 568 485795 569 479179 570 471683 571 464613 572 457639 573 450933 574 443961 575 436462 576 429713 577 424417 578 417283 579 410567 580 405253 581 398178 582 393260 583 386471 584 380666 585 375016 586 368722 587 362797 588 356945 589 351076 590 345008 591 339145 592 333804 593 329643 594 324641 595 318850 596 313432 597 307989 598 303116 599 298624 600 292800 601 287799 602 284620 603 279224 604 272732 605 268522 606 265479 607 260702 608 256103 609 253132 610 247274 611 242965 612 237943 613 234443 614 230810 615 226735 616 223286 617 218989 618 215388 619 209965 620 206914 621 202841 622 200159 623 196764 624 193296 625 189342 626 185534 627 182721 628 180071 629 176667 630 173340 631 170467 632 167383 633 164558 634 161287 635 158448 636 154364 637 152325 638 149128 639 147382 640 144567 641 141521 642 138848 643 136332 644 134004 645 131030 646 128917 647 126577 648 124535 649 121697 650 119370 651 117686 652 115449 653 112978 654 111380 655 108789 656 106418 657 103936 658 102340 659 100810 660 98450 661 96580 662 94985 663 93485 664 91311 665 89558 666 88161 667 86798 668 84729 669 82813 670 81429 671 79695 672 78981 673 77016 674 75339 675 74001 676 72402 677 71267 678 70072 679 68258 680 66647 681 65420 682 63862 683 62794 684 61714 685 60545 686 59051 687 58008 688 57267 689 55666 690 54927 691 53666 692 52117 693 51685 694 50664 695 49210 696 48356 697 47705 698 46346 699 45255 700 44518 701 44078 702 43039 703 42429 704 41099 705 40227 706 39432 707 38852 708 38226 709 37435 710 36418 711 36019 712 35133 713 34195 714 33442 715 32990 716 32205 717 31665 718 30726 719 29962 720 29971 721 28979 722 28617 723 27965 724 27279 725 26857 726 26446 727 25653 728 25463 729 25003 730 24263 731 23761 732 23185 733 22762 734 22452 735 22046 736 21546 737 21214 738 20947 739 20592 740 20164 741 19855 742 18926 743 18989 744 18102 745 17801 746 17478 747 16859 748 16908 749 16197 750 15906 751 15696 752 15213 753 14999 754 14690 755 14427 756 14184 757 13902 758 13783 759 13452 760 12903 761 12721 762 12535 763 12284 764 11729 765 11631 766 11160 767 11161 768 10862 769 10659 770 10260 771 10199 772 10228 773 9962 774 9595 775 9542 776 9382 777 8810 778 8633 779 8726 780 8356 781 8265 782 8215 783 8059 784 7784 785 7650 786 7670 787 7551 788 7085 789 6734 790 6549 791 6583 792 6108 793 5783 794 5710 795 5759 796 5628 797 5287 798 5383 799 4891 800 4844 801 4726 802 4571 803 4345 804 4365 805 4340 806 4204 807 4072 808 3978 809 4020 810 3818 811 3752 812 3725 813 3609 814 3552 815 3496 816 3495 817 3336 818 3345 819 3136 820 3208 821 3213 822 3074 823 2860 824 2833 825 2733 826 3015 827 2641 828 2514 829 2384 830 2428 831 2239 832 2282 833 2180 834 2171 835 2028 836 1983 837 2019 838 1998 839 1932 840 1878 841 1836 842 1768 843 1809 844 1675 845 1780 846 1761 847 1670 848 1621 849 1612 850 1469 851 1664 852 1402 853 1380 854 1275 855 1219 856 1239 857 1224 858 1182 859 1153 860 1195 861 1147 862 1070 863 1143 864 1102 865 1070 866 1025 867 988 868 938 869 971 870 967 871 970 872 912 873 903 874 871 875 865 876 838 877 808 878 820 879 835 880 794 881 785 882 712 883 746 884 689 885 696 886 748 887 689 888 697 889 618 890 632 891 645 892 602 893 596 894 632 895 600 896 528 897 578 898 583 899 572 900 513 901 498 902 518 903 523 904 512 905 500 906 486 907 459 908 496 909 444 910 449 911 458 912 387 913 432 914 445 915 410 916 361 917 355 918 377 919 404 920 326 921 376 922 331 923 348 924 354 925 344 926 355 927 356 928 315 929 320 930 289 931 330 932 326 933 337 934 314 935 294 936 297 937 297 938 295 939 311 940 282 941 288 942 288 943 266 944 268 945 291 946 261 947 286 948 258 949 272 950 260 951 243 952 255 953 238 954 221 955 248 956 216 957 243 958 200 959 236 960 249 961 207 962 222 963 211 964 262 965 208 966 190 967 215 968 202 969 190 970 170 971 233 972 192 973 183 974 211 975 204