#SentieonCommandLine: /lustre8/home/ykawai-tnproj-pg/packages/sentieon-genomics-201911/libexec/driver -t 8 -r /lustre8/home/ncbn-pg/data/resource/Homo_sapiens_assembly38.fasta -i HGDP/HGDP00281/HGDP00281.cram --algo InsertSizeMetricAlgo HGDP/HGDP00281/QCmetrics/HGDP00281.InsertSizeMetricAlgo.txt MEDIAN_INSERT_SIZE MEDIAN_ABSOLUTE_DEVIATION MIN_INSERT_SIZE MAX_INSERT_SIZE MEAN_INSERT_SIZE STANDARD_DEVIATION READ_PAIRS PAIR_ORIENTATION WIDTH_OF_10_PERCENT WIDTH_OF_20_PERCENT WIDTH_OF_30_PERCENT WIDTH_OF_40_PERCENT WIDTH_OF_50_PERCENT WIDTH_OF_60_PERCENT WIDTH_OF_70_PERCENT WIDTH_OF_80_PERCENT WIDTH_OF_90_PERCENT WIDTH_OF_99_PERCENT 498.000000 73.000000 2 246616293 497.175767 114.409100 346429987 FR 29 57 85 115 147 183 225 279 361 771 insert_size All_Reads.fr_count 2 2166 3 2373 4 2319 5 2393 6 2343 7 2561 8 2390 9 2548 10 2476 11 2533 12 2574 13 2712 14 2778 15 2764 16 2863 17 2840 18 3134 19 6864 20 7230 21 6781 22 7171 23 7669 24 8344 25 8470 26 8681 27 8603 28 9004 29 9277 30 9418 31 9699 32 10273 33 10748 34 11810 35 12164 36 12458 37 12547 38 13507 39 13626 40 14611 41 14311 42 15074 43 15935 44 16661 45 16507 46 16825 47 17174 48 18534 49 18920 50 18990 51 19237 52 19479 53 20872 54 21874 55 21855 56 22034 57 21844 58 23049 59 23881 60 23608 61 24027 62 24341 63 25068 64 25928 65 25856 66 25982 67 25740 68 26652 69 27922 70 27375 71 27209 72 27462 73 27935 74 28680 75 28320 76 27997 77 27644 78 28970 79 29993 80 29200 81 28571 82 28020 83 29757 84 31145 85 30707 86 30169 87 29257 88 30267 89 31029 90 31111 91 29689 92 29455 93 30018 94 31351 95 30749 96 29765 97 29484 98 30364 99 30773 100 30391 101 30044 102 29167 103 30496 104 30959 105 30105 106 30299 107 29913 108 30590 109 31250 110 30459 111 29664 112 29945 113 30441 114 31096 115 29963 116 30619 117 29643 118 30199 119 30582 120 30373 121 30028 122 29967 123 29882 124 30300 125 30347 126 29692 127 29186 128 29346 129 29839 130 30679 131 29063 132 28979 133 29590 134 29153 135 29198 136 28842 137 28684 138 28795 139 28858 140 28942 141 28557 142 28726 143 28250 144 29308 145 28810 146 28678 147 28619 148 28383 149 28671 150 28148 151 28302 152 28417 153 28846 154 28543 155 28160 156 28080 157 27323 158 27732 159 27868 160 27665 161 27542 162 27436 163 26923 164 27102 165 26815 166 26925 167 26691 168 26834 169 26768 170 26751 171 26594 172 25920 173 25999 174 26247 175 25956 176 26085 177 25724 178 25965 179 25977 180 25390 181 25269 182 25825 183 25212 184 25386 185 25298 186 25015 187 25121 188 24830 189 24922 190 25286 191 24992 192 24635 193 25092 194 24727 195 24951 196 24581 197 24568 198 24912 199 25161 200 25140 201 25219 202 25218 203 25384 204 25415 205 25248 206 25707 207 25865 208 26299 209 26389 210 26402 211 26623 212 26722 213 26831 214 27275 215 27315 216 27494 217 27871 218 28717 219 29171 220 29598 221 29760 222 30378 223 30636 224 31229 225 31578 226 32357 227 32966 228 33474 229 34526 230 35264 231 35908 232 36197 233 37304 234 38253 235 39085 236 39597 237 40388 238 41475 239 43149 240 43803 241 44765 242 45810 243 47276 244 48101 245 49301 246 50293 247 52144 248 53851 249 55311 250 56447 251 57862 252 59696 253 60825 254 62348 255 63976 256 65219 257 66918 258 69381 259 71207 260 73158 261 75115 262 76912 263 78956 264 80735 265 82423 266 85082 267 86503 268 89466 269 91975 270 93727 271 96526 272 98830 273 101634 274 104306 275 106455 276 109826 277 112063 278 114795 279 117660 280 119726 281 123656 282 126263 283 129842 284 132320 285 135403 286 138186 287 142184 288 145260 289 147839 290 151512 291 155326 292 158142 293 162396 294 166869 295 169880 296 173660 297 176729 298 180594 299 186094 300 189936 301 193769 302 198641 303 202920 304 208041 305 212696 306 217021 307 221273 308 226908 309 231797 310 236505 311 241159 312 245620 313 250647 314 256549 315 262417 316 267529 317 272920 318 278410 319 282440 320 289024 321 293962 322 300488 323 306049 324 311282 325 318730 326 323805 327 329388 328 335946 329 342008 330 349023 331 355222 332 360826 333 367908 334 375086 335 381464 336 388545 337 394568 338 401326 339 408035 340 416028 341 421829 342 428914 343 436841 344 443652 345 450660 346 458261 347 464645 348 473293 349 480352 350 487260 351 495399 352 502829 353 509690 354 518237 355 526747 356 532581 357 541607 358 548565 359 556961 360 565462 361 571991 362 579448 363 590393 364 596118 365 603571 366 612916 367 619145 368 626785 369 635588 370 643614 371 650560 372 658053 373 666991 374 675259 375 684400 376 694174 377 700142 378 708882 379 715146 380 724217 381 733217 382 739605 383 748243 384 753982 385 763746 386 769939 387 780270 388 788435 389 797048 390 803432 391 810273 392 817015 393 828007 394 836663 395 842335 396 848519 397 858002 398 863780 399 871621 400 879006 401 887720 402 895367 403 902938 404 910045 405 916549 406 923560 407 931615 408 937746 409 944894 410 951241 411 957910 412 963318 413 971037 414 978523 415 985075 416 992322 417 995884 418 1004082 419 1011004 420 1017877 421 1023178 422 1029158 423 1034199 424 1042198 425 1047315 426 1052366 427 1060005 428 1067267 429 1072051 430 1076721 431 1081108 432 1086506 433 1091885 434 1096047 435 1102378 436 1108000 437 1111628 438 1116886 439 1124749 440 1127876 441 1132107 442 1134413 443 1139682 444 1145617 445 1148675 446 1153952 447 1158908 448 1161890 449 1166077 450 1169055 451 1173375 452 1177337 453 1181175 454 1186827 455 1189409 456 1195446 457 1196867 458 1197476 459 1202948 460 1208078 461 1210197 462 1211115 463 1214981 464 1218441 465 1218983 466 1222012 467 1226720 468 1230073 469 1232249 470 1233800 471 1234606 472 1239358 473 1238864 474 1240020 475 1242775 476 1246839 477 1248251 478 1247117 479 1249090 480 1251397 481 1251479 482 1255412 483 1256575 484 1257398 485 1258033 486 1260287 487 1258161 488 1260797 489 1262432 490 1261492 491 1263479 492 1261580 493 1264044 494 1263073 495 1263126 496 1263399 497 1262156 498 1261154 499 1263487 500 1263856 501 1261103 502 1260863 503 1259282 504 1258931 505 1258517 506 1256487 507 1256677 508 1255630 509 1254782 510 1252887 511 1251785 512 1250639 513 1249925 514 1246861 515 1243708 516 1242761 517 1241244 518 1236870 519 1236048 520 1234553 521 1233005 522 1230735 523 1227759 524 1223667 525 1224704 526 1216021 527 1213531 528 1212096 529 1212295 530 1206273 531 1205948 532 1201652 533 1199415 534 1193933 535 1190719 536 1184673 537 1180917 538 1178255 539 1175666 540 1170294 541 1164341 542 1163377 543 1156721 544 1151796 545 1148067 546 1142480 547 1140331 548 1135105 549 1132515 550 1125446 551 1120000 552 1114854 553 1108966 554 1104999 555 1098785 556 1094033 557 1087314 558 1083610 559 1077755 560 1071807 561 1067632 562 1059909 563 1054735 564 1049115 565 1044159 566 1034886 567 1029152 568 1024155 569 1021353 570 1011801 571 1005619 572 1000430 573 992733 574 988369 575 981093 576 972725 577 967749 578 960651 579 955986 580 947740 581 939790 582 933682 583 926125 584 918724 585 911687 586 906068 587 899655 588 889587 589 884941 590 878795 591 868252 592 863126 593 856826 594 848441 595 842834 596 834577 597 827862 598 819153 599 814936 600 807592 601 800106 602 793398 603 783139 604 778690 605 772132 606 765357 607 757434 608 750240 609 744225 610 734469 611 727376 612 720568 613 714925 614 705782 615 697951 616 692633 617 686113 618 676947 619 670503 620 662792 621 655277 622 649096 623 641795 624 633747 625 628146 626 620286 627 613825 628 606693 629 598372 630 593917 631 585985 632 579585 633 570389 634 566259 635 557594 636 552207 637 547145 638 539335 639 532336 640 527108 641 519432 642 512483 643 506960 644 500607 645 494219 646 488599 647 481784 648 476304 649 469902 650 462458 651 457660 652 452255 653 445385 654 439375 655 433309 656 428032 657 422161 658 415822 659 412827 660 405238 661 399670 662 394516 663 389737 664 383368 665 377117 666 373252 667 367572 668 362348 669 357964 670 352538 671 347079 672 341773 673 336950 674 331796 675 327217 676 323028 677 317724 678 312867 679 308764 680 304907 681 299880 682 294822 683 290160 684 286688 685 279904 686 276286 687 272071 688 268946 689 263468 690 259810 691 256099 692 250811 693 246869 694 242347 695 239107 696 233976 697 231126 698 227716 699 223450 700 219573 701 215850 702 212368 703 207848 704 205434 705 201175 706 197671 707 194634 708 191864 709 188153 710 185978 711 181575 712 179312 713 175631 714 172550 715 170308 716 166843 717 163562 718 160287 719 157567 720 155319 721 153609 722 150173 723 147601 724 144256 725 141807 726 139959 727 136942 728 135337 729 132304 730 129450 731 127832 732 125052 733 123306 734 121448 735 119069 736 117184 737 114423 738 111998 739 110230 740 108599 741 106072 742 105073 743 102784 744 100591 745 98749 746 96692 747 94635 748 93263 749 91370 750 89782 751 87587 752 86133 753 85147 754 84006 755 81160 756 80365 757 78807 758 77072 759 75297 760 74505 761 71977 762 70401 763 70081 764 68720 765 67047 766 65489 767 64625 768 63336 769 62303 770 61036 771 59493 772 58747 773 57687 774 56480 775 55407 776 54233 777 53157 778 52091 779 51048 780 49670 781 49347 782 48540 783 46715 784 46536 785 45859 786 44422 787 43739 788 42841 789 42321 790 40831 791 39980 792 39689 793 38666 794 38096 795 37281 796 36398 797 35401 798 34794 799 33983 800 33377 801 32572 802 32041 803 31357 804 31042 805 30548 806 29679 807 29260 808 28977 809 27689 810 27341 811 26597 812 26212 813 25699 814 25308 815 24985 816 24296 817 23917 818 23334 819 22949 820 22649 821 22268 822 21830 823 21441 824 20851 825 20495 826 20154 827 19566 828 19148 829 18785 830 18492 831 17939 832 17739 833 17797 834 17195 835 16655 836 16306 837 16189 838 15696 839 15317 840 15188 841 14861 842 14550 843 14128 844 13784 845 13640 846 13317 847 13046 848 12875 849 12639 850 12337 851 12288 852 11912 853 11554 854 11406 855 11165 856 11028 857 10626 858 10558 859 10539 860 10328 861 10036 862 9909 863 9659 864 9479 865 9311 866 9094 867 8955 868 8854 869 8708 870 8531 871 8401 872 8238 873 8095 874 7916 875 7671 876 7482 877 7435 878 7489 879 7123 880 7135 881 6922 882 6833 883 6762 884 6522 885 6399 886 6335 887 6210 888 6042 889 5930 890 5896 891 5745 892 5606 893 5465 894 5408 895 5343 896 5200 897 5156 898 5068 899 4970 900 4790 901 4761 902 4761 903 4628 904 4453 905 4497 906 4505 907 4488 908 4272 909 4222 910 4207 911 4066 912 3991 913 3897 914 3951 915 3828 916 3689 917 3583 918 3645 919 3513 920 3529 921 3416 922 3364 923 3233 924 3272 925 3196 926 3145 927 3182 928 2961 929 3031 930 2939 931 2916 932 2909 933 2934 934 2794 935 2795 936 2693 937 2660 938 2567 939 2637 940 2590 941 2545 942 2605 943 2387 944 2437 945 2436 946 2393 947 2314 948 2372 949 2185 950 2209 951 2103 952 2090 953 2107 954 2099 955 2127 956 2068 957 2071 958 1954 959 1947 960 1874 961 1977 962 1867 963 1813 964 1863 965 1779 966 1724 967 1730 968 1728 969 1817 970 1705 971 1760 972 1689 973 1622 974 1664 975 1735 976 1575 977 1447 978 1564 979 1594 980 1574 981 1475 982 1504 983 1435 984 1420 985 1447 986 1290 987 1366 988 1437 989 1228 990 1247 991 1153 992 1060 993 1381 994 1090 995 989 996 945 997 1023 998 958 999 767 1000 799 1001 786 1002 820 1003 712 1004 736 1005 696 1006 668 1007 633 1008 682 1009 683 1010 621 1011 670 1012 529 1013 490 1014 479 1015 494 1016 478 1017 472 1018 413 1019 442 1020 487 1021 459 1022 460 1023 391 1024 446 1025 435 1026 420 1027 399 1028 422 1029 405 1030 414 1031 398 1032 365 1033 387 1034 362 1035 450 1036 321 1037 333 1038 307 1039 274 1040 292 1041 297 1042 329 1043 267 1044 281 1045 284 1046 276 1047 288 1048 269 1049 243 1050 269 1051 225 1052 264 1053 267 1054 243 1055 242 1056 244 1057 242 1058 226 1059 226 1060 205 1061 241 1062 234 1063 196 1064 190 1065 209 1066 202 1067 232 1068 211 1069 191 1070 196 1071 219 1072 178 1073 214 1074 197 1075 160 1076 184 1077 180 1078 163 1079 170 1080 154 1081 184 1082 173 1083 161 1084 169 1085 147 1086 154 1087 151 1088 131 1089 126 1090 144 1091 160 1092 136 1093 127 1094 127 1095 137 1096 160 1097 145 1098 141 1099 135 1100 134 1101 114 1102 142 1103 132 1104 130 1105 127 1106 131 1107 122 1108 110 1109 113 1110 132 1111 103 1112 118 1113 123 1114 107 1115 130 1116 100 1117 97 1118 83 1119 110 1120 120 1121 128 1122 109 1123 94 1124 95 1125 101 1126 98 1127 112 1128 95 1129 115 1130 98 1131 100 1132 104 1133 98 1134 102 1135 89 1136 103 1137 110 1138 99 1139 74 1140 89 1141 94 1142 98 1143 105 1144 93 1145 95 1146 109 1147 77 1148 77 1149 71 1150 85 1151 98 1152 105 1153 95 1154 84 1155 92 1156 85 1157 92 1158 90 1159 90 1160 83 1161 80 1162 96 1163 100 1164 80 1165 84 1166 97 1167 93 1168 86 1169 87 1170 90 1171 82 1172 77 1173 74 1174 74 1175 94 1176 104 1177 85 1178 76 1179 89 1180 72 1181 76 1182 79 1183 76 1184 74 1185 90 1186 74 1187 62 1188 75 1189 68 1190 64 1191 66 1192 86 1193 64 1194 69 1195 75 1196 84 1197 86 1198 74 1199 71 1200 67 1201 80 1202 74 1203 77 1204 76 1205 97 1206 61 1207 72 1208 61 1209 72 1210 67 1211 72 1212 64 1213 78 1214 70 1215 74 1216 87 1217 66 1218 79 1219 75 1220 64 1221 72 1222 67 1223 79 1224 81 1225 64 1226 72 1227 84 1228 71