#SentieonCommandLine: /lustre8/home/ykawai-tnproj-pg/packages/sentieon-genomics-201911/libexec/driver -t 8 -r /lustre8/home/ncbn-pg/data/resource/Homo_sapiens_assembly38.fasta -i HGDP/HGDP00302/HGDP00302.cram --algo InsertSizeMetricAlgo HGDP/HGDP00302/QCmetrics/HGDP00302.InsertSizeMetricAlgo.txt MEDIAN_INSERT_SIZE MEDIAN_ABSOLUTE_DEVIATION MIN_INSERT_SIZE MAX_INSERT_SIZE MEAN_INSERT_SIZE STANDARD_DEVIATION READ_PAIRS PAIR_ORIENTATION WIDTH_OF_10_PERCENT WIDTH_OF_20_PERCENT WIDTH_OF_30_PERCENT WIDTH_OF_40_PERCENT WIDTH_OF_50_PERCENT WIDTH_OF_60_PERCENT WIDTH_OF_70_PERCENT WIDTH_OF_80_PERCENT WIDTH_OF_90_PERCENT WIDTH_OF_99_PERCENT 418.000000 57.000000 2 243805962 426.867243 92.955967 346630166 FR 23 43 65 89 115 143 175 219 295 629 insert_size All_Reads.fr_count 2 899 3 959 4 884 5 1031 6 979 7 1074 8 948 9 980 10 954 11 940 12 961 13 1038 14 1025 15 1011 16 907 17 1128 18 1142 19 1387 20 1275 21 1645 22 1611 23 2083 24 2376 25 2519 26 3114 27 3198 28 3700 29 4388 30 5058 31 5254 32 6564 33 6776 34 7417 35 7686 36 8030 37 8872 38 9101 39 9920 40 10876 41 11315 42 11714 43 12460 44 12829 45 13190 46 13466 47 13685 48 14837 49 15227 50 15105 51 15542 52 15555 53 16728 54 17264 55 16736 56 17430 57 17949 58 18473 59 19582 60 19653 61 19583 62 20149 63 20791 64 21440 65 21533 66 21873 67 22172 68 22526 69 23206 70 22986 71 22896 72 22880 73 23110 74 23531 75 22960 76 23107 77 22930 78 23545 79 23901 80 23840 81 23743 82 23319 83 24075 84 24438 85 24492 86 24808 87 24092 88 24598 89 24857 90 24836 91 25127 92 24580 93 25638 94 25644 95 25507 96 25005 97 25026 98 25183 99 25044 100 24957 101 24836 102 24445 103 25057 104 25055 105 24781 106 24663 107 24282 108 24896 109 24699 110 24274 111 24313 112 24222 113 24085 114 24427 115 24154 116 24151 117 23698 118 24040 119 24286 120 24325 121 24490 122 24429 123 24146 124 24112 125 23858 126 23542 127 23181 128 23253 129 23380 130 23240 131 22991 132 22386 133 22641 134 22581 135 22063 136 22016 137 22306 138 21930 139 22127 140 21799 141 21490 142 21491 143 21395 144 21247 145 21148 146 20658 147 20827 148 20838 149 20945 150 20827 151 20991 152 20684 153 20414 154 20387 155 20162 156 20010 157 19448 158 19472 159 19534 160 19158 161 18946 162 18897 163 18754 164 18709 165 18426 166 18246 167 18035 168 18056 169 17543 170 17742 171 17618 172 17574 173 17493 174 17355 175 17115 176 16941 177 17175 178 17085 179 17477 180 16863 181 16618 182 16851 183 16963 184 16994 185 17037 186 17062 187 16930 188 17237 189 17067 190 16930 191 16839 192 16632 193 16710 194 16862 195 16769 196 16657 197 16823 198 17087 199 16822 200 17113 201 17068 202 17407 203 17111 204 17313 205 17659 206 17923 207 18463 208 18365 209 18881 210 18871 211 19333 212 19560 213 20244 214 20436 215 20913 216 21482 217 22131 218 22817 219 23288 220 23857 221 24959 222 25669 223 26347 224 27539 225 28560 226 29791 227 30584 228 31776 229 32736 230 33935 231 35552 232 36505 233 38391 234 39832 235 41322 236 43175 237 45220 238 47070 239 48909 240 51293 241 53132 242 55728 243 57771 244 60857 245 63176 246 65998 247 68855 248 72148 249 74793 250 78610 251 81935 252 85817 253 90106 254 93108 255 97604 256 101678 257 106415 258 110837 259 116184 260 120658 261 125070 262 131626 263 136141 264 142422 265 148489 266 154837 267 160932 268 167266 269 175213 270 181410 271 189162 272 197264 273 205424 274 214414 275 222884 276 235278 277 242335 278 249711 279 258258 280 266179 281 275933 282 286354 283 295149 284 305084 285 316241 286 325114 287 336250 288 346791 289 358260 290 370334 291 383194 292 394803 293 408399 294 420716 295 431466 296 444189 297 458891 298 472118 299 485651 300 499402 301 515231 302 530618 303 544705 304 560500 305 576195 306 590328 307 605624 308 620913 309 637738 310 653376 311 668603 312 684889 313 702474 314 720907 315 737392 316 754375 317 771287 318 787845 319 805127 320 822170 321 840517 322 859132 323 876867 324 892993 325 913912 326 930136 327 946055 328 965803 329 986435 330 1002692 331 1020203 332 1038372 333 1059409 334 1077583 335 1094818 336 1110924 337 1125994 338 1143708 339 1160407 340 1177685 341 1196540 342 1214844 343 1230599 344 1249382 345 1264842 346 1283285 347 1294991 348 1310302 349 1328090 350 1340337 351 1357862 352 1373246 353 1388331 354 1401800 355 1415635 356 1428949 357 1442478 358 1453970 359 1466113 360 1478686 361 1490254 362 1505015 363 1516228 364 1525694 365 1538294 366 1550848 367 1558735 368 1567207 369 1577357 370 1583933 371 1594500 372 1604554 373 1611298 374 1621701 375 1628661 376 1636167 377 1641750 378 1649994 379 1651680 380 1659080 381 1663976 382 1663965 383 1672166 384 1677307 385 1682871 386 1688299 387 1689922 388 1693172 389 1694511 390 1695886 391 1694726 392 1696461 393 1699203 394 1701757 395 1700241 396 1702610 397 1705665 398 1701311 399 1703616 400 1701584 401 1699322 402 1697837 403 1694981 404 1695344 405 1694932 406 1693113 407 1689324 408 1687121 409 1683583 410 1675601 411 1669244 412 1668959 413 1663189 414 1658878 415 1655909 416 1648083 417 1644179 418 1639862 419 1633187 420 1626522 421 1619039 422 1611364 423 1603692 424 1597662 425 1592887 426 1585212 427 1579193 428 1570702 429 1565156 430 1552964 431 1547231 432 1537523 433 1529144 434 1519694 435 1512532 436 1504371 437 1496065 438 1488242 439 1481103 440 1471440 441 1458227 442 1450920 443 1442048 444 1432619 445 1422926 446 1414884 447 1406693 448 1395538 449 1388221 450 1377333 451 1367568 452 1355621 453 1345971 454 1337947 455 1329014 456 1316769 457 1309218 458 1299672 459 1287056 460 1280030 461 1270817 462 1259554 463 1247828 464 1240322 465 1228234 466 1217974 467 1209277 468 1198933 469 1188962 470 1181040 471 1173206 472 1160396 473 1152099 474 1139567 475 1131613 476 1120950 477 1111422 478 1101866 479 1092258 480 1083122 481 1072583 482 1062952 483 1052805 484 1043133 485 1034268 486 1023269 487 1015105 488 1005175 489 994589 490 986977 491 976400 492 968866 493 958780 494 950061 495 939418 496 929811 497 920849 498 913167 499 902702 500 894661 501 886603 502 876549 503 868248 504 859919 505 850097 506 840961 507 832685 508 825550 509 816116 510 807414 511 798060 512 789933 513 784265 514 774178 515 766207 516 757699 517 749019 518 742171 519 734906 520 724860 521 718084 522 707610 523 700814 524 689804 525 682951 526 674981 527 667060 528 661150 529 653397 530 645360 531 638410 532 631411 533 624318 534 615915 535 608436 536 602268 537 595744 538 586926 539 581619 540 573875 541 566746 542 560891 543 552681 544 547606 545 540267 546 534040 547 524509 548 520759 549 513916 550 506627 551 500927 552 493523 553 490884 554 483600 555 476931 556 469736 557 464609 558 458676 559 451348 560 448390 561 441504 562 435229 563 429548 564 424955 565 418247 566 412329 567 408109 568 400727 569 395615 570 390930 571 384876 572 379492 573 376267 574 371069 575 365503 576 360990 577 356323 578 351231 579 345459 580 340565 581 335498 582 329683 583 326198 584 319561 585 315029 586 310735 587 307288 588 303030 589 298707 590 293339 591 289563 592 284378 593 281797 594 277102 595 273013 596 270292 597 265254 598 262180 599 257089 600 253582 601 249462 602 245721 603 242161 604 238376 605 234158 606 231105 607 227630 608 223313 609 221695 610 217377 611 214104 612 210754 613 207235 614 205138 615 201228 616 198028 617 194602 618 192318 619 188296 620 185552 621 183121 622 180061 623 176494 624 173499 625 171248 626 169426 627 165247 628 162786 629 160313 630 157649 631 153696 632 151842 633 149496 634 147187 635 144237 636 141688 637 138949 638 137215 639 135273 640 133134 641 130458 642 127814 643 126180 644 123822 645 122004 646 119597 647 117985 648 116267 649 113529 650 112160 651 109968 652 108206 653 105754 654 105013 655 102613 656 100299 657 99001 658 97123 659 96000 660 93797 661 92194 662 90807 663 89296 664 87269 665 86157 666 84638 667 82531 668 81411 669 80116 670 78290 671 77235 672 75415 673 73800 674 72781 675 71706 676 69555 677 68692 678 67256 679 66274 680 65145 681 64002 682 62812 683 61474 684 60737 685 59209 686 58581 687 57322 688 55770 689 55215 690 54066 691 53192 692 52431 693 50855 694 50098 695 49154 696 48153 697 47045 698 46321 699 45439 700 44804 701 43638 702 42790 703 42204 704 41498 705 40544 706 39691 707 38893 708 38135 709 37318 710 36614 711 36092 712 35577 713 34901 714 34022 715 33158 716 32259 717 31848 718 31519 719 30657 720 30067 721 29884 722 28807 723 29018 724 27979 725 27166 726 26875 727 26434 728 26039 729 25420 730 25147 731 24541 732 24117 733 23637 734 23189 735 22730 736 22232 737 21621 738 21497 739 20852 740 20549 741 20295 742 20029 743 19550 744 19056 745 18475 746 18370 747 17976 748 17752 749 17232 750 17070 751 16755 752 16504 753 16144 754 15654 755 15444 756 15352 757 14859 758 14510 759 14243 760 13945 761 13781 762 13161 763 13142 764 12662 765 12573 766 12142 767 12053 768 11587 769 11170 770 11070 771 10751 772 10497 773 10290 774 10122 775 9950 776 9710 777 9429 778 9231 779 8948 780 9198 781 8830 782 8687 783 8671 784 8257 785 8216 786 8026 787 7739 788 7523 789 7512 790 7408 791 7103 792 7132 793 6816 794 6791 795 6726 796 6465 797 6445 798 6185 799 6055 800 5907 801 5853 802 5668 803 5557 804 5494 805 5424 806 5316 807 5273 808 5446 809 5009 810 4918 811 5029 812 4823 813 4636 814 4334 815 4426 816 4244 817 3850 818 3736 819 3605 820 3654 821 3538 822 3339 823 3162 824 3120 825 3205 826 3028 827 2847 828 2937 829 2746 830 2583 831 2607 832 2512 833 2463 834 2395 835 2371 836 2283 837 2159 838 2184 839 2095 840 2088 841 2022 842 1989 843 1984 844 1966 845 1853 846 1961 847 1804 848 1739 849 1857 850 1643 851 1688 852 1695 853 1579 854 1596 855 1559 856 1485 857 1474 858 1491 859 1402 860 1354 861 1397 862 1285 863 1346 864 1297 865 1246 866 1244 867 1173 868 1177 869 1180 870 1183 871 1078 872 1104 873 1076 874 1076 875 1044 876 1012 877 971 878 1012 879 950 880 891 881 926 882 873 883 880 884 859 885 818 886 814 887 871 888 819 889 777 890 743 891 727 892 739 893 751 894 692 895 679 896 642 897 628 898 672 899 637 900 670 901 567 902 586 903 604 904 604 905 573 906 593 907 597 908 545 909 511 910 517 911 533 912 485 913 507 914 479 915 452 916 477 917 449 918 430 919 438 920 441 921 428 922 378 923 434 924 402 925 394 926 389 927 390 928 395 929 376 930 393 931 340 932 370 933 360 934 344 935 356 936 348 937 309 938 345 939 301 940 349 941 290 942 294 943 313 944 269 945 305 946 260 947 252 948 284 949 280 950 253 951 224 952 245 953 278 954 283 955 241 956 242 957 245 958 255 959 224 960 236 961 249 962 208 963 193 964 231 965 220 966 217 967 212 968 245 969 197 970 178 971 197 972 189 973 167 974 193 975 189 976 172 977 183 978 172 979 167 980 157 981 185 982 179 983 155 984 148 985 166 986 169 987 171 988 175