#SentieonCommandLine: /lustre8/home/ykawai-tnproj-pg/packages/sentieon-genomics-201911/libexec/driver -t 8 -r /lustre8/home/ncbn-pg/data/resource/Homo_sapiens_assembly38.fasta -i HGDP/HGDP00364/HGDP00364.cram --algo InsertSizeMetricAlgo HGDP/HGDP00364/QCmetrics/HGDP00364.InsertSizeMetricAlgo.txt MEDIAN_INSERT_SIZE MEDIAN_ABSOLUTE_DEVIATION MIN_INSERT_SIZE MAX_INSERT_SIZE MEAN_INSERT_SIZE STANDARD_DEVIATION READ_PAIRS PAIR_ORIENTATION WIDTH_OF_10_PERCENT WIDTH_OF_20_PERCENT WIDTH_OF_30_PERCENT WIDTH_OF_40_PERCENT WIDTH_OF_50_PERCENT WIDTH_OF_60_PERCENT WIDTH_OF_70_PERCENT WIDTH_OF_80_PERCENT WIDTH_OF_90_PERCENT WIDTH_OF_99_PERCENT 445.000000 59.000000 2 247299336 454.207109 98.195708 310674771 FR 23 45 69 93 119 149 185 231 311 675 insert_size All_Reads.fr_count 2 352 3 362 4 356 5 360 6 395 7 443 8 382 9 380 10 382 11 426 12 395 13 442 14 407 15 436 16 466 17 432 18 460 19 431 20 429 21 479 22 487 23 472 24 523 25 508 26 545 27 931 28 940 29 1061 30 2375 31 2623 32 2696 33 2929 34 3310 35 4132 36 4207 37 5786 38 7573 39 8602 40 9425 41 9667 42 10327 43 10850 44 11412 45 11979 46 12200 47 12704 48 14374 49 14862 50 14672 51 15141 52 15147 53 16024 54 16746 55 16833 56 17059 57 17585 58 17902 59 18701 60 18485 61 18839 62 18899 63 19620 64 20004 65 19957 66 20386 67 19879 68 20764 69 21335 70 21057 71 21462 72 21930 73 22229 74 23125 75 22662 76 22504 77 22279 78 22740 79 22951 80 22700 81 22609 82 22532 83 22873 84 23674 85 23198 86 23192 87 22559 88 22980 89 23409 90 23143 91 22639 92 22333 93 22607 94 23423 95 22749 96 22636 97 22674 98 23373 99 23483 100 23829 101 23667 102 23326 103 24150 104 24418 105 24160 106 23382 107 23557 108 24221 109 24109 110 23549 111 23173 112 22685 113 23133 114 23404 115 23091 116 22652 117 22028 118 22707 119 22622 120 22285 121 22004 122 21884 123 21851 124 21847 125 21543 126 21559 127 21164 128 21384 129 21982 130 21784 131 21433 132 21244 133 21363 134 21442 135 21206 136 20946 137 20518 138 20667 139 20572 140 20547 141 20107 142 20228 143 19984 144 19755 145 19940 146 19278 147 19104 148 19233 149 18954 150 18721 151 18664 152 18148 153 18224 154 18122 155 17595 156 17607 157 17367 158 17192 159 17373 160 17266 161 17363 162 17106 163 16747 164 17034 165 16850 166 16493 167 16493 168 16505 169 16269 170 16045 171 15828 172 15789 173 15612 174 15514 175 15314 176 15324 177 14926 178 15128 179 15051 180 14530 181 14396 182 14660 183 14328 184 13982 185 13932 186 13692 187 13732 188 13890 189 13669 190 13382 191 13316 192 13404 193 13256 194 13178 195 13488 196 13486 197 13623 198 13577 199 13523 200 13637 201 13624 202 13593 203 13534 204 13501 205 13665 206 13500 207 13763 208 13541 209 13791 210 13574 211 13662 212 13484 213 13910 214 13948 215 13892 216 13948 217 14483 218 14390 219 14588 220 14943 221 14856 222 14997 223 15365 224 15716 225 15800 226 16081 227 16809 228 17020 229 17240 230 17849 231 18278 232 18778 233 19171 234 19604 235 20248 236 21150 237 21751 238 22550 239 23474 240 24148 241 24952 242 25643 243 26752 244 27684 245 28510 246 29251 247 30150 248 31364 249 32763 250 33909 251 35105 252 36304 253 37649 254 39205 255 40512 256 41878 257 43869 258 45180 259 47284 260 49683 261 51302 262 53012 263 55343 264 57433 265 59578 266 61119 267 64378 268 67106 269 69939 270 72256 271 75244 272 78705 273 81955 274 86197 275 89358 276 95209 277 98107 278 102087 279 105798 280 109567 281 112469 282 116578 283 120868 284 125924 285 130791 286 134671 287 139422 288 145701 289 151141 290 155842 291 162022 292 167314 293 174095 294 180656 295 185236 296 192486 297 199046 298 205638 299 212829 300 220357 301 227189 302 234977 303 244279 304 252008 305 261035 306 267831 307 276156 308 284833 309 293339 310 302763 311 312864 312 322601 313 333138 314 343845 315 353116 316 363656 317 372124 318 383275 319 394090 320 406248 321 417367 322 429149 323 441397 324 453318 325 464840 326 478041 327 490228 328 501379 329 514017 330 526433 331 540075 332 553922 333 567700 334 580085 335 595626 336 608431 337 620583 338 634082 339 648123 340 662481 341 678751 342 690262 343 706423 344 720198 345 736785 346 751680 347 765821 348 782290 349 796087 350 810123 351 824767 352 839546 353 855096 354 869870 355 883715 356 899873 357 913087 358 926288 359 941056 360 954363 361 967426 362 982808 363 997305 364 1011635 365 1025518 366 1040343 367 1055385 368 1065649 369 1081255 370 1091620 371 1105027 372 1118063 373 1134080 374 1144818 375 1157970 376 1170160 377 1182297 378 1195041 379 1203585 380 1214571 381 1225832 382 1236947 383 1248654 384 1259210 385 1269400 386 1280401 387 1289574 388 1297680 389 1306364 390 1315961 391 1322975 392 1332462 393 1340709 394 1351298 395 1356228 396 1366910 397 1372240 398 1380769 399 1385876 400 1392087 401 1400785 402 1403026 403 1410530 404 1414220 405 1421437 406 1423806 407 1429223 408 1436792 409 1438068 410 1440804 411 1441674 412 1444128 413 1446293 414 1449689 415 1453258 416 1453013 417 1455346 418 1458790 419 1458176 420 1456997 421 1458188 422 1458403 423 1456666 424 1455075 425 1454070 426 1456764 427 1454788 428 1457190 429 1454261 430 1452128 431 1447984 432 1443823 433 1443179 434 1440281 435 1437331 436 1435248 437 1431476 438 1428901 439 1426337 440 1422345 441 1416741 442 1411529 443 1406890 444 1404028 445 1398390 446 1393057 447 1389998 448 1385373 449 1379967 450 1373496 451 1367569 452 1361990 453 1354844 454 1349515 455 1343030 456 1337595 457 1330591 458 1326189 459 1319767 460 1312955 461 1307075 462 1300687 463 1293146 464 1284165 465 1277763 466 1270687 467 1264590 468 1257215 469 1249243 470 1244811 471 1235867 472 1228170 473 1221393 474 1211391 475 1204946 476 1198234 477 1188711 478 1181790 479 1174335 480 1167235 481 1160146 482 1153978 483 1143956 484 1134883 485 1125820 486 1117244 487 1111136 488 1103246 489 1095627 490 1089208 491 1081769 492 1072719 493 1063194 494 1057552 495 1045840 496 1039836 497 1032884 498 1024137 499 1015584 500 1007082 501 1000414 502 990770 503 983714 504 976842 505 968977 506 959434 507 951948 508 944351 509 937828 510 928764 511 921176 512 913299 513 904095 514 896365 515 889604 516 881042 517 873120 518 864638 519 858102 520 848239 521 843524 522 835112 523 826540 524 818978 525 812520 526 805007 527 797115 528 787977 529 782336 530 774879 531 767077 532 759251 533 754074 534 744159 535 739114 536 731311 537 724817 538 716826 539 708171 540 702031 541 694208 542 688842 543 682304 544 675192 545 665195 546 659393 547 649792 548 643772 549 637333 550 632392 551 624568 552 618186 553 613509 554 606161 555 599585 556 594093 557 584899 558 579591 559 573077 560 566681 561 559925 562 554984 563 549283 564 543460 565 536280 566 530386 567 523852 568 518166 569 513106 570 505435 571 500611 572 494482 573 490242 574 484311 575 477007 576 473401 577 466185 578 463220 579 455160 580 450690 581 446714 582 440705 583 434812 584 429857 585 425491 586 419235 587 415255 588 409577 589 405800 590 399771 591 394068 592 389690 593 385145 594 380489 595 375563 596 370158 597 366707 598 362569 599 357672 600 352637 601 347510 602 343445 603 339004 604 334817 605 330993 606 325611 607 320931 608 317086 609 310383 610 307117 611 303745 612 299219 613 295629 614 292616 615 288675 616 284741 617 282089 618 277406 619 274334 620 267583 621 264401 622 262383 623 258535 624 254354 625 251280 626 248109 627 243784 628 240964 629 237661 630 233991 631 231152 632 228007 633 224152 634 220416 635 218427 636 214276 637 212931 638 208802 639 206395 640 203601 641 200005 642 197343 643 194450 644 191750 645 188935 646 186033 647 183824 648 180367 649 178325 650 175912 651 174054 652 169669 653 167285 654 165828 655 162296 656 159821 657 157779 658 154625 659 152535 660 150054 661 148442 662 146026 663 143204 664 142059 665 139495 666 137466 667 135185 668 134048 669 131259 670 128647 671 127234 672 125481 673 123715 674 120906 675 119836 676 117672 677 115773 678 114068 679 112233 680 110742 681 109016 682 106531 683 105155 684 103624 685 102375 686 99996 687 98424 688 96833 689 95715 690 93671 691 92562 692 91559 693 89354 694 86947 695 86270 696 85236 697 83115 698 82205 699 80623 700 79164 701 78353 702 76323 703 75304 704 74304 705 73185 706 71963 707 70544 708 69154 709 68719 710 67199 711 65555 712 64437 713 63212 714 62528 715 60949 716 60492 717 59739 718 58361 719 57987 720 56244 721 55440 722 54627 723 53502 724 52470 725 51421 726 51019 727 49993 728 49221 729 48317 730 47656 731 46550 732 45646 733 45239 734 44052 735 43026 736 42546 737 42059 738 41149 739 40343 740 40003 741 39345 742 38974 743 37798 744 37419 745 36971 746 36121 747 35647 748 34627 749 34181 750 33826 751 32934 752 32112 753 31572 754 31362 755 30627 756 30012 757 29657 758 29406 759 28153 760 28206 761 27493 762 26783 763 26481 764 26066 765 25576 766 25014 767 24413 768 23959 769 23357 770 23088 771 22606 772 22302 773 22440 774 21621 775 21040 776 20873 777 20331 778 19914 779 19351 780 19071 781 18800 782 18327 783 17825 784 17577 785 17183 786 16860 787 16501 788 16422 789 16135 790 15615 791 15181 792 14841 793 14729 794 14372 795 13998 796 13654 797 13448 798 13150 799 13044 800 13002 801 12428 802 12368 803 12280 804 11817 805 11667 806 11480 807 11415 808 10951 809 11024 810 10664 811 10463 812 10214 813 10012 814 9822 815 9500 816 9566 817 9199 818 8999 819 8799 820 8637 821 8438 822 8472 823 8468 824 8302 825 8069 826 7649 827 7632 828 7366 829 7300 830 7199 831 7138 832 7084 833 6760 834 6581 835 6623 836 6396 837 6232 838 6100 839 6187 840 6033 841 5695 842 6288 843 5755 844 5352 845 5191 846 5007 847 4842 848 5413 849 4537 850 4191 851 4003 852 4059 853 3966 854 3832 855 3792 856 3719 857 3805 858 3496 859 3640 860 3486 861 3413 862 3349 863 3374 864 3151 865 3080 866 3010 867 3144 868 2869 869 2912 870 2848 871 2615 872 2384 873 2628 874 2493 875 2345 876 2247 877 2300 878 2211 879 2092 880 2098 881 1985 882 2010 883 1976 884 1897 885 1944 886 1834 887 1842 888 1712 889 1710 890 1740 891 1777 892 1599 893 1592 894 1548 895 1507 896 1515 897 1467 898 1523 899 1464 900 1355 901 1347 902 1349 903 1326 904 1314 905 1248 906 1277 907 1248 908 1179 909 1146 910 1152 911 1157 912 1095 913 1064 914 1049 915 1079 916 1029 917 952 918 980 919 1001 920 981 921 917 922 887 923 905 924 922 925 909 926 820 927 790 928 792 929 807 930 751 931 734 932 764 933 747 934 704 935 692 936 704 937 678 938 678 939 711 940 630 941 687 942 617 943 611 944 602 945 589 946 597 947 610 948 582 949 497 950 532 951 514 952 573 953 525 954 482 955 485 956 502 957 439 958 471 959 448 960 499 961 444 962 422 963 442 964 411 965 401 966 410 967 394 968 350 969 341 970 373 971 378 972 356 973 356 974 332 975 345 976 333 977 314 978 311 979 296 980 308 981 328 982 282 983 306 984 300 985 297 986 285 987 277 988 266 989 275 990 292 991 268 992 276 993 215 994 277 995 242 996 248 997 227 998 226 999 252 1000 220 1001 223 1002 200 1003 224 1004 214 1005 224 1006 211 1007 189 1008 176 1009 228 1010 207 1011 194 1012 195 1013 176 1014 199 1015 151 1016 181 1017 207 1018 197 1019 159 1020 178 1021 171 1022 168 1023 177 1024 152 1025 147 1026 137 1027 143 1028 169 1029 157 1030 119 1031 137 1032 151 1033 170 1034 136 1035 129