#SentieonCommandLine: /lustre8/home/ykawai-tnproj-pg/packages/sentieon-genomics-201911/libexec/driver -t 8 -r /lustre8/home/ncbn-pg/data/resource/Homo_sapiens_assembly38.fasta -i HGDP/HGDP00549/HGDP00549.cram --algo InsertSizeMetricAlgo HGDP/HGDP00549/QCmetrics/HGDP00549.InsertSizeMetricAlgo.txt MEDIAN_INSERT_SIZE MEDIAN_ABSOLUTE_DEVIATION MIN_INSERT_SIZE MAX_INSERT_SIZE MEAN_INSERT_SIZE STANDARD_DEVIATION READ_PAIRS PAIR_ORIENTATION WIDTH_OF_10_PERCENT WIDTH_OF_20_PERCENT WIDTH_OF_30_PERCENT WIDTH_OF_40_PERCENT WIDTH_OF_50_PERCENT WIDTH_OF_60_PERCENT WIDTH_OF_70_PERCENT WIDTH_OF_80_PERCENT WIDTH_OF_90_PERCENT WIDTH_OF_99_PERCENT 387.000000 53.000000 2 247299336 400.356684 89.601784 687083157 FR 21 41 63 85 107 133 165 207 285 609 insert_size All_Reads.fr_count 2 2395 3 2408 4 2450 5 2587 6 2446 7 2503 8 2470 9 2365 10 2681 11 2463 12 2413 13 2760 14 2449 15 2294 16 2963 17 2438 18 2898 19 3976 20 4197 21 4046 22 4181 23 4695 24 4835 25 4994 26 5040 27 5277 28 5402 29 5654 30 5850 31 6063 32 6466 33 6731 34 7147 35 7536 36 7780 37 7991 38 8720 39 9002 40 9341 41 9428 42 9703 43 10154 44 10710 45 10752 46 10864 47 10847 48 11959 49 11974 50 12023 51 12678 52 12494 53 13495 54 13880 55 13815 56 13820 57 13776 58 14677 59 15457 60 15455 61 15399 62 15814 63 16521 64 16855 65 16757 66 17195 67 17181 68 17508 69 18397 70 18205 71 17732 72 17938 73 18296 74 21225 75 20598 76 20739 77 20356 78 20415 79 21277 80 21142 81 20571 82 20125 83 21090 84 22001 85 21782 86 21681 87 21239 88 21923 89 22366 90 22501 91 21698 92 21718 93 22112 94 22811 95 22354 96 22237 97 21677 98 22019 99 22767 100 22051 101 22225 102 21905 103 22721 104 23059 105 22160 106 22124 107 21786 108 22360 109 22506 110 21746 111 21497 112 21019 113 21571 114 21858 115 21496 116 21182 117 20583 118 21094 119 20954 120 20796 121 20363 122 21090 123 21071 124 20988 125 21271 126 20716 127 20477 128 20886 129 20848 130 20717 131 20405 132 20110 133 20119 134 20296 135 20081 136 19499 137 19597 138 19540 139 19737 140 19265 141 19199 142 18862 143 19532 144 19752 145 19059 146 19177 147 18603 148 18552 149 18449 150 18169 151 17943 152 17876 153 18238 154 18015 155 17530 156 17356 157 16933 158 17036 159 16727 160 17008 161 16605 162 16486 163 16829 164 16945 165 16844 166 17088 167 16591 168 16946 169 16758 170 16699 171 16602 172 16310 173 16433 174 16286 175 16656 176 16471 177 16125 178 16743 179 16534 180 16213 181 16278 182 16448 183 16661 184 16506 185 16390 186 16656 187 16722 188 17267 189 17316 190 17504 191 17996 192 18131 193 18569 194 19050 195 19487 196 19616 197 19824 198 20811 199 21296 200 21718 201 22403 202 23316 203 24183 204 25012 205 26374 206 27693 207 28865 208 30446 209 31592 210 32902 211 34510 212 36542 213 37814 214 39808 215 42276 216 44340 217 47289 218 49782 219 52930 220 56152 221 59786 222 62966 223 66797 224 70649 225 74825 226 79407 227 84042 228 89603 229 95407 230 101114 231 107449 232 114201 233 120391 234 128601 235 135975 236 145086 237 153017 238 162662 239 172836 240 183423 241 194030 242 204526 243 216700 244 229276 245 242341 246 255549 247 269588 248 284738 249 301259 250 316724 251 335116 252 352869 253 373604 254 392095 255 412137 256 432918 257 454665 258 478185 259 501346 260 525428 261 550638 262 575022 263 603504 264 629760 265 657792 266 686491 267 717525 268 746171 269 778577 270 811705 271 844660 272 877972 273 914833 274 951129 275 983619 276 1023153 277 1060948 278 1100444 279 1137369 280 1177555 281 1220102 282 1257686 283 1301371 284 1338967 285 1383544 286 1423666 287 1467860 288 1509391 289 1553714 290 1600370 291 1644660 292 1691085 293 1737344 294 1781894 295 1825744 296 1869001 297 1917091 298 1962085 299 2009864 300 2057517 301 2102348 302 2150293 303 2195525 304 2241024 305 2286278 306 2326432 307 2369832 308 2413856 309 2458372 310 2503940 311 2544674 312 2587652 313 2633838 314 2678130 315 2714470 316 2756319 317 2796023 318 2832416 319 2870695 320 2913118 321 2944037 322 2985870 323 3021463 324 3056298 325 3091474 326 3123109 327 3152283 328 3185555 329 3212518 330 3244778 331 3269968 332 3302318 333 3331558 334 3361046 335 3383459 336 3404029 337 3429589 338 3445734 339 3464317 340 3487265 341 3509312 342 3524602 343 3541595 344 3562784 345 3575508 346 3589361 347 3600368 348 3613683 349 3621341 350 3631468 351 3638631 352 3646288 353 3659722 354 3666109 355 3673954 356 3675783 357 3674377 358 3676619 359 3679324 360 3680718 361 3677270 362 3677661 363 3675052 364 3674756 365 3670978 366 3668280 367 3663924 368 3655468 369 3651836 370 3638693 371 3633772 372 3621019 373 3616126 374 3604670 375 3592513 376 3582176 377 3573403 378 3559487 379 3548472 380 3530328 381 3517729 382 3503007 383 3485480 384 3472937 385 3458784 386 3439224 387 3423997 388 3405840 389 3388446 390 3365416 391 3348677 392 3328536 393 3312247 394 3294336 395 3274999 396 3254817 397 3237218 398 3213274 399 3193498 400 3171635 401 3148723 402 3127270 403 3106839 404 3087493 405 3063043 406 3043011 407 3022084 408 2998910 409 2973633 410 2950920 411 2925646 412 2901333 413 2879777 414 2856920 415 2836311 416 2813485 417 2790635 418 2767945 419 2742970 420 2722844 421 2698430 422 2671493 423 2650222 424 2623557 425 2600504 426 2580660 427 2557046 428 2535722 429 2509569 430 2485599 431 2460661 432 2440145 433 2417234 434 2393850 435 2374375 436 2348987 437 2330507 438 2296077 439 2277584 440 2259379 441 2235880 442 2212921 443 2187404 444 2167616 445 2146974 446 2129034 447 2104551 448 2083440 449 2059344 450 2041380 451 2019096 452 1996284 453 1973540 454 1955920 455 1932388 456 1914184 457 1894382 458 1874598 459 1855668 460 1834703 461 1814484 462 1795207 463 1773684 464 1756049 465 1738388 466 1716531 467 1700629 468 1682290 469 1664760 470 1645981 471 1627978 472 1606905 473 1591118 474 1574982 475 1556554 476 1539125 477 1521410 478 1505786 479 1490306 480 1473795 481 1455387 482 1435124 483 1420823 484 1402237 485 1388782 486 1372584 487 1356885 488 1341989 489 1327914 490 1312869 491 1295645 492 1283483 493 1266304 494 1251271 495 1236824 496 1222218 497 1210286 498 1196787 499 1182197 500 1167636 501 1155526 502 1141505 503 1128852 504 1117106 505 1102711 506 1088793 507 1076407 508 1066075 509 1050465 510 1039986 511 1029164 512 1014202 513 1002825 514 991509 515 979069 516 965049 517 954393 518 943469 519 930053 520 920359 521 909173 522 898848 523 888474 524 878477 525 867294 526 857201 527 847924 528 837289 529 825279 530 817143 531 805693 532 798709 533 786408 534 778606 535 768626 536 759542 537 749898 538 738891 539 731309 540 723126 541 714841 542 706692 543 697054 544 686500 545 680000 546 670612 547 660321 548 654557 549 646587 550 637743 551 629942 552 622535 553 614283 554 607818 555 598741 556 592339 557 584902 558 576724 559 570550 560 562777 561 558015 562 549074 563 542287 564 534400 565 528877 566 522710 567 515701 568 509482 569 502674 570 494956 571 489148 572 481942 573 478018 574 471348 575 464531 576 457564 577 452981 578 446850 579 441111 580 435666 581 427785 582 423439 583 418448 584 413475 585 408202 586 402420 587 396742 588 390700 589 385951 590 381729 591 376342 592 372165 593 365788 594 361766 595 356744 596 351219 597 347233 598 342474 599 336182 600 332426 601 328042 602 324884 603 318199 604 315162 605 309346 606 305809 607 302125 608 299274 609 294260 610 290519 611 285537 612 281670 613 277439 614 273219 615 268992 616 266687 617 262695 618 258761 619 254719 620 251544 621 248181 622 243839 623 239847 624 237390 625 233655 626 230374 627 226530 628 224806 629 220888 630 217066 631 213329 632 210858 633 207543 634 205305 635 201853 636 198487 637 196119 638 193273 639 189770 640 186723 641 184721 642 181845 643 177985 644 175827 645 173152 646 170938 647 168738 648 165901 649 163062 650 161288 651 158197 652 156145 653 153822 654 152636 655 148043 656 146356 657 143520 658 141268 659 140023 660 136898 661 134900 662 132886 663 130742 664 128690 665 126422 666 123846 667 122319 668 120965 669 118509 670 117172 671 115044 672 113844 673 110774 674 109564 675 108022 676 105547 677 104061 678 102673 679 100823 680 99194 681 97235 682 96243 683 94542 684 92913 685 91170 686 90324 687 88284 688 86910 689 85245 690 83767 691 82838 692 81317 693 79840 694 78463 695 77183 696 75774 697 74944 698 73766 699 72535 700 71157 701 69530 702 68557 703 67535 704 65981 705 64946 706 63846 707 63038 708 61867 709 60314 710 59522 711 58675 712 57593 713 56469 714 55112 715 54745 716 53751 717 52593 718 51751 719 51118 720 50049 721 49283 722 48277 723 47247 724 47230 725 45988 726 44844 727 44411 728 43549 729 43007 730 42053 731 41272 732 40411 733 39622 734 39420 735 38525 736 37827 737 36772 738 36333 739 35930 740 34974 741 34294 742 33817 743 33205 744 33150 745 32353 746 31605 747 30987 748 30313 749 30103 750 29404 751 29001 752 28730 753 27850 754 27107 755 26701 756 26505 757 25846 758 25275 759 24598 760 24646 761 23886 762 23600 763 23288 764 22583 765 22256 766 21790 767 21400 768 21060 769 20754 770 20132 771 19878 772 19398 773 19311 774 18736 775 18643 776 17878 777 17645 778 17387 779 17244 780 16571 781 16506 782 16369 783 15798 784 15781 785 15262 786 15206 787 14782 788 14627 789 14203 790 14270 791 13687 792 13379 793 13063 794 12948 795 12642 796 12626 797 12261 798 12109 799 11931 800 11621 801 11405 802 11069 803 11001 804 10822 805 10499 806 10326 807 10244 808 10031 809 10006 810 9748 811 9547 812 9687 813 9551 814 8997 815 8906 816 8687 817 8715 818 8214 819 8184 820 8296 821 7787 822 7537 823 7658 824 7451 825 7167 826 7151 827 7068 828 7280 829 6640 830 6530 831 6234 832 6165 833 6077 834 6065 835 5937 836 5815 837 5788 838 5564 839 5488 840 5310 841 5306 842 5052 843 5208 844 4948 845 5029 846 4918 847 4774 848 4681 849 4778 850 4465 851 4402 852 4365 853 4480 854 4025 855 3966 856 3870 857 3922 858 3895 859 3947 860 3658 861 3588 862 3726 863 3388 864 3302 865 3323 866 3137 867 3207 868 3210 869 2989 870 2944 871 2924 872 2935 873 2850 874 2721 875 2730 876 2565 877 2523 878 2680 879 2609 880 2428 881 2434 882 2570 883 2339 884 2209 885 2193 886 2242 887 2104 888 2282 889 1983 890 1942 891 1906 892 1900 893 1892 894 1823 895 1729 896 1736 897 1715 898 1681 899 1676 900 1620 901 1695 902 1555 903 1577 904 1489 905 1369 906 1388 907 1446 908 1401 909 1387 910 1419 911 1326 912 1314 913 1318 914 1206 915 1241 916 1248 917 1240