#SentieonCommandLine: /lustre8/home/ykawai-tnproj-pg/packages/sentieon-genomics-201911/libexec/driver -t 8 -r /lustre8/home/ncbn-pg/data/resource/Homo_sapiens_assembly38.fasta -i HGDP/HGDP00604/HGDP00604.cram --algo InsertSizeMetricAlgo HGDP/HGDP00604/QCmetrics/HGDP00604.InsertSizeMetricAlgo.txt MEDIAN_INSERT_SIZE MEDIAN_ABSOLUTE_DEVIATION MIN_INSERT_SIZE MAX_INSERT_SIZE MEAN_INSERT_SIZE STANDARD_DEVIATION READ_PAIRS PAIR_ORIENTATION WIDTH_OF_10_PERCENT WIDTH_OF_20_PERCENT WIDTH_OF_30_PERCENT WIDTH_OF_40_PERCENT WIDTH_OF_50_PERCENT WIDTH_OF_60_PERCENT WIDTH_OF_70_PERCENT WIDTH_OF_80_PERCENT WIDTH_OF_90_PERCENT WIDTH_OF_99_PERCENT 428.000000 61.000000 2 243232668 435.553632 99.384897 331183246 FR 23 47 71 97 123 153 189 235 317 659 insert_size All_Reads.fr_count 2 664 3 721 4 723 5 713 6 792 7 892 8 1061 9 1029 10 1098 11 1187 12 1184 13 1382 14 1320 15 1341 16 1499 17 1426 18 1726 19 3955 20 4372 21 4370 22 4729 23 5093 24 5447 25 5715 26 5963 27 5823 28 6330 29 6720 30 6973 31 7377 32 7627 33 8083 34 8523 35 9013 36 9262 37 9723 38 10330 39 10844 40 11259 41 11277 42 11743 43 12163 44 13020 45 13246 46 13721 47 13925 48 15098 49 15322 50 15945 51 16211 52 16146 53 16882 54 17278 55 17659 56 17877 57 18101 58 19340 59 20071 60 20125 61 20012 62 20399 63 20893 64 21805 65 21561 66 21785 67 21491 68 22508 69 23398 70 23195 71 23212 72 23192 73 23631 74 24591 75 23922 76 24352 77 24151 78 24914 79 26063 80 26151 81 25462 82 24539 83 25182 84 26415 85 26040 86 25864 87 25349 88 26258 89 27111 90 27476 91 27224 92 26941 93 27089 94 27567 95 27144 96 26722 97 26903 98 27370 99 28070 100 27630 101 27538 102 27218 103 27507 104 28173 105 27990 106 28155 107 27830 108 28571 109 29019 110 28719 111 28515 112 28073 113 27911 114 28238 115 27977 116 27741 117 27537 118 28461 119 28272 120 27857 121 27506 122 27016 123 26918 124 27327 125 27023 126 27395 127 27115 128 27012 129 27673 130 27184 131 27064 132 26451 133 26629 134 26671 135 26391 136 26569 137 26523 138 27263 139 27244 140 27146 141 26701 142 26590 143 26541 144 26068 145 26121 146 26301 147 26107 148 26575 149 26646 150 25980 151 25727 152 25194 153 25594 154 25273 155 24975 156 25234 157 25110 158 25382 159 25183 160 24762 161 24560 162 24639 163 24302 164 24434 165 24333 166 24071 167 24478 168 24718 169 24821 170 24796 171 24607 172 24140 173 24197 174 23719 175 24146 176 24183 177 23751 178 24365 179 24749 180 24550 181 24149 182 23888 183 23935 184 23585 185 23937 186 23837 187 23644 188 23980 189 24329 190 24300 191 24282 192 24252 193 24094 194 24090 195 23795 196 24308 197 24531 198 24470 199 25165 200 25143 201 25290 202 25435 203 25644 204 25839 205 25777 206 26283 207 26430 208 27462 209 27917 210 28958 211 28668 212 29320 213 29315 214 29684 215 30119 216 30706 217 31368 218 32385 219 33692 220 34565 221 35777 222 36116 223 36999 224 37596 225 38062 226 38852 227 40354 228 41858 229 43490 230 44898 231 46529 232 47556 233 48964 234 49969 235 51230 236 52585 237 54607 238 56389 239 58809 240 60775 241 63196 242 65262 243 67509 244 69316 245 71502 246 74030 247 76669 248 79464 249 81734 250 85448 251 88832 252 91625 253 94790 254 98563 255 101556 256 104599 257 108933 258 113461 259 117242 260 121626 261 126145 262 130437 263 135019 264 138605 265 144144 266 149277 267 154287 268 160618 269 167347 270 172722 271 178052 272 185070 273 191281 274 198567 275 204945 276 213920 277 221342 278 227566 279 235230 280 241717 281 250020 282 257177 283 264145 284 272595 285 282225 286 290206 287 298751 288 307759 289 317753 290 327582 291 337527 292 346822 293 356764 294 366834 295 377925 296 388946 297 399441 298 410120 299 422737 300 434282 301 446904 302 458049 303 469602 304 481158 305 493893 306 506176 307 519414 308 533695 309 546045 310 561333 311 572971 312 587749 313 602176 314 615096 315 627637 316 642333 317 656080 318 669447 319 685339 320 699598 321 715890 322 729410 323 744385 324 758747 325 774047 326 787810 327 802592 328 817098 329 831644 330 847128 331 864658 332 880351 333 894591 334 909522 335 922975 336 938618 337 952945 338 967988 339 981901 340 996166 341 1012182 342 1025312 343 1039329 344 1056407 345 1065742 346 1082038 347 1093277 348 1106774 349 1118845 350 1135033 351 1147494 352 1160796 353 1173561 354 1185511 355 1197827 356 1208633 357 1219921 358 1231700 359 1244154 360 1253629 361 1265205 362 1276128 363 1288821 364 1299335 365 1309248 366 1317495 367 1326954 368 1335373 369 1345592 370 1354154 371 1358394 372 1370576 373 1376151 374 1385332 375 1392434 376 1400387 377 1408252 378 1415368 379 1422314 380 1428206 381 1432017 382 1439184 383 1442601 384 1447752 385 1453306 386 1459296 387 1461736 388 1466228 389 1470141 390 1472921 391 1478395 392 1479289 393 1484545 394 1484314 395 1486265 396 1489986 397 1492203 398 1492479 399 1497243 400 1496659 401 1497817 402 1496709 403 1500229 404 1501194 405 1500768 406 1501037 407 1499845 408 1499191 409 1498024 410 1497739 411 1495166 412 1492700 413 1491088 414 1489690 415 1486170 416 1486988 417 1483075 418 1483281 419 1478205 420 1477166 421 1471470 422 1468458 423 1463209 424 1459680 425 1457071 426 1450565 427 1447103 428 1445820 429 1439936 430 1435316 431 1429990 432 1425861 433 1416495 434 1415196 435 1408529 436 1404004 437 1399043 438 1389204 439 1388131 440 1382604 441 1376766 442 1368465 443 1363876 444 1354672 445 1348823 446 1342296 447 1338399 448 1332826 449 1323150 450 1319077 451 1310378 452 1304649 453 1293830 454 1290863 455 1280938 456 1275067 457 1270747 458 1261488 459 1254656 460 1246836 461 1238717 462 1231056 463 1222940 464 1216551 465 1208484 466 1199295 467 1191271 468 1185653 469 1177567 470 1172264 471 1160946 472 1155483 473 1147361 474 1139608 475 1130294 476 1123176 477 1114987 478 1108164 479 1099048 480 1093003 481 1083952 482 1075268 483 1068237 484 1060639 485 1050623 486 1042559 487 1033264 488 1027390 489 1018131 490 1011284 491 1001536 492 995286 493 986563 494 979395 495 969577 496 963613 497 956091 498 946932 499 939060 500 932707 501 925562 502 916893 503 908289 504 902477 505 892971 506 886877 507 878073 508 870981 509 861074 510 854695 511 847968 512 839392 513 834335 514 824385 515 816746 516 806591 517 801838 518 795285 519 788114 520 776612 521 773210 522 765372 523 756760 524 749700 525 740486 526 734244 527 726077 528 720888 529 712140 530 706016 531 698517 532 691551 533 683784 534 677041 535 671049 536 662398 537 654631 538 649453 539 642513 540 635046 541 626734 542 620409 543 612798 544 606621 545 600414 546 592615 547 587234 548 582636 549 574288 550 566126 551 561505 552 554707 553 550026 554 541802 555 536617 556 530788 557 524534 558 518368 559 510130 560 505903 561 501016 562 493844 563 488828 564 481752 565 477582 566 471264 567 465419 568 460094 569 454048 570 448609 571 444049 572 436940 573 432708 574 427125 575 421227 576 417139 577 410232 578 405626 579 399866 580 395137 581 390091 582 385152 583 380186 584 375409 585 370695 586 365165 587 361363 588 356811 589 350773 590 347093 591 342178 592 337358 593 332804 594 329180 595 323358 596 318314 597 314575 598 310801 599 306991 600 302169 601 297199 602 293778 603 289925 604 285531 605 281508 606 277269 607 272983 608 269142 609 265593 610 261224 611 258599 612 253812 613 250951 614 247325 615 243427 616 240892 617 237187 618 234007 619 229973 620 226697 621 222335 622 220102 623 216417 624 214280 625 210936 626 207570 627 204471 628 201686 629 197518 630 195591 631 192314 632 189693 633 185987 634 184706 635 180921 636 178389 637 175250 638 171877 639 169522 640 167672 641 164451 642 161818 643 158977 644 157050 645 154080 646 152728 647 149942 648 148420 649 144987 650 143238 651 140449 652 138151 653 136298 654 134224 655 130899 656 129705 657 127219 658 125095 659 122864 660 121035 661 119265 662 116891 663 115726 664 113333 665 111144 666 109267 667 108138 668 106816 669 104204 670 102427 671 100757 672 99768 673 97651 674 96017 675 95072 676 93041 677 92056 678 89487 679 88066 680 86451 681 85053 682 83743 683 82945 684 80721 685 79634 686 77646 687 76173 688 74999 689 74002 690 72859 691 71705 692 70138 693 68984 694 68110 695 66656 696 65626 697 64348 698 62596 699 61737 700 60878 701 59962 702 58349 703 57757 704 56133 705 55458 706 54693 707 53074 708 52854 709 51688 710 50274 711 49989 712 49263 713 48430 714 47146 715 46402 716 45321 717 44603 718 43569 719 43364 720 42056 721 41421 722 40821 723 39862 724 39191 725 38576 726 37697 727 37593 728 36500 729 35662 730 34996 731 34432 732 33940 733 33463 734 32335 735 31712 736 31299 737 30628 738 30219 739 29836 740 29131 741 28616 742 27934 743 27480 744 27260 745 26929 746 26365 747 25514 748 25091 749 24889 750 24478 751 23753 752 23034 753 23083 754 22586 755 22075 756 21208 757 20903 758 20726 759 20201 760 20150 761 19620 762 19131 763 18873 764 18489 765 18061 766 17666 767 17403 768 16953 769 16429 770 16217 771 15976 772 15656 773 15328 774 15062 775 14776 776 14420 777 14465 778 13937 779 13587 780 13404 781 12920 782 12874 783 12676 784 12294 785 11943 786 11887 787 11569 788 11362 789 11249 790 11094 791 10619 792 10643 793 10393 794 10369 795 9960 796 9819 797 9807 798 9571 799 9091 800 9046 801 9017 802 8826 803 8393 804 8453 805 8282 806 7937 807 7891 808 7728 809 7596 810 7413 811 7418 812 7086 813 7127 814 6898 815 6797 816 6709 817 6467 818 6477 819 6467 820 6344 821 6247 822 6112 823 6106 824 5717 825 5672 826 5811 827 5887 828 5509 829 5035 830 5046 831 5416 832 4862 833 4751 834 4623 835 4360 836 4436 837 4491 838 4310 839 4097 840 4203 841 4050 842 3844 843 3793 844 3731 845 3608 846 3615 847 3570 848 3594 849 3490 850 3448 851 3271 852 3276 853 3216 854 3051 855 3210 856 3032 857 2523 858 2416 859 2654 860 2568 861 2315 862 2344 863 2191 864 2142 865 2156 866 2069 867 2007 868 1933 869 1990 870 1899 871 1836 872 1860 873 1801 874 1742 875 1708 876 1690 877 1637 878 1634 879 1499 880 1575 881 1508 882 1482 883 1450 884 1503 885 1370 886 1385 887 1368 888 1387 889 1315 890 1238 891 1302 892 1216 893 1246 894 1292 895 1273 896 1202 897 1148 898 1117 899 1122 900 1189 901 1024 902 1024 903 1016 904 984 905 987 906 903 907 850 908 886 909 867 910 898 911 896 912 876 913 839 914 762 915 815 916 754 917 735 918 795 919 673 920 734 921 708 922 692 923 685 924 659 925 681 926 666 927 567 928 693 929 616 930 636 931 613 932 614 933 606 934 543 935 537 936 566 937 536 938 561 939 525 940 517 941 549 942 515 943 498 944 492 945 475 946 468 947 463 948 456 949 427 950 459 951 430 952 421 953 443 954 420 955 412 956 419 957 396 958 407 959 400 960 403 961 366 962 406 963 371 964 345 965 369 966 328 967 348 968 361 969 348 970 345 971 326 972 338 973 320 974 340 975 317 976 327 977 291 978 298 979 293 980 279 981 282 982 255 983 256 984 297 985 250 986 270 987 267 988 247 989 269 990 266 991 244 992 246 993 251 994 262 995 215 996 236 997 204 998 261 999 230 1000 215 1001 225 1002 211 1003 210 1004 220 1005 203 1006 211 1007 194 1008 198 1009 220 1010 174 1011 178 1012 218 1013 195 1014 209 1015 199 1016 158 1017 181 1018 181 1019 172 1020 170 1021 151 1022 168 1023 169 1024 155 1025 163 1026 140 1027 183 1028 178 1029 149 1030 142 1031 131 1032 164 1033 147 1034 146 1035 178 1036 160 1037 150 1038 137