#SentieonCommandLine: /lustre8/home/ykawai-tnproj-pg/packages/sentieon-genomics-201911/libexec/driver -t 8 -r /lustre8/home/ncbn-pg/data/resource/Homo_sapiens_assembly38.fasta -i HGDP/HGDP00624/HGDP00624.cram --algo InsertSizeMetricAlgo HGDP/HGDP00624/QCmetrics/HGDP00624.InsertSizeMetricAlgo.txt MEDIAN_INSERT_SIZE MEDIAN_ABSOLUTE_DEVIATION MIN_INSERT_SIZE MAX_INSERT_SIZE MEAN_INSERT_SIZE STANDARD_DEVIATION READ_PAIRS PAIR_ORIENTATION WIDTH_OF_10_PERCENT WIDTH_OF_20_PERCENT WIDTH_OF_30_PERCENT WIDTH_OF_40_PERCENT WIDTH_OF_50_PERCENT WIDTH_OF_60_PERCENT WIDTH_OF_70_PERCENT WIDTH_OF_80_PERCENT WIDTH_OF_90_PERCENT WIDTH_OF_99_PERCENT 435.000000 60.000000 2 247531716 446.171017 96.512697 366470116 FR 23 47 69 95 121 149 183 229 307 645 insert_size All_Reads.fr_count 2 418 3 437 4 501 5 461 6 486 7 554 8 464 9 549 10 501 11 484 12 454 13 565 14 522 15 518 16 766 17 765 18 774 19 1097 20 1279 21 1236 22 1676 23 1807 24 1970 25 2330 26 2468 27 2943 28 2992 29 3436 30 4168 31 4364 32 4651 33 5398 34 5868 35 6403 36 7509 37 7721 38 8325 39 8769 40 9072 41 9312 42 9748 43 9983 44 10608 45 10926 46 11243 47 11381 48 12256 49 12382 50 12315 51 12964 52 12904 53 13579 54 14186 55 14358 56 14375 57 14679 58 15098 59 15399 60 15927 61 15881 62 15949 63 16588 64 17358 65 17115 66 17179 67 17213 68 17907 69 18610 70 18433 71 18487 72 18491 73 18745 74 19615 75 18991 76 18979 77 18775 78 19143 79 19759 80 19194 81 18678 82 18707 83 18969 84 19644 85 19533 86 19134 87 18894 88 19304 89 19791 90 19788 91 19368 92 19213 93 19844 94 20551 95 19906 96 20048 97 19669 98 20147 99 20742 100 20342 101 20318 102 19698 103 20253 104 20531 105 20060 106 19821 107 19716 108 19958 109 20225 110 19857 111 19569 112 19500 113 19527 114 19878 115 19496 116 19148 117 18863 118 19282 119 19242 120 19100 121 19013 122 18549 123 18991 124 19296 125 19136 126 18684 127 18703 128 18883 129 18944 130 19062 131 18513 132 18427 133 18413 134 18693 135 18243 136 18181 137 17858 138 17825 139 18153 140 17918 141 17887 142 17723 143 17876 144 17833 145 17660 146 17299 147 17108 148 17166 149 17079 150 17181 151 17085 152 16851 153 17118 154 17260 155 16851 156 16884 157 16785 158 17244 159 16972 160 16892 161 16685 162 16694 163 16572 164 16618 165 16326 166 16248 167 16211 168 16255 169 16258 170 16274 171 16299 172 15780 173 15857 174 15814 175 15679 176 15355 177 15545 178 15769 179 15541 180 15262 181 15156 182 15273 183 15253 184 14879 185 14969 186 14790 187 14775 188 14975 189 14801 190 14844 191 14864 192 14757 193 14849 194 15131 195 14977 196 14985 197 14885 198 14806 199 14856 200 14649 201 14823 202 14543 203 14817 204 14771 205 14669 206 14648 207 14773 208 15054 209 15117 210 14902 211 14964 212 15089 213 15387 214 15220 215 15519 216 15441 217 15756 218 15956 219 16339 220 16341 221 16695 222 16853 223 17210 224 17668 225 17678 226 18231 227 18794 228 19366 229 19700 230 20419 231 21075 232 21674 233 22335 234 23145 235 23817 236 24431 237 25578 238 26101 239 27425 240 28218 241 29348 242 30193 243 31688 244 32479 245 33543 246 35074 247 36966 248 38149 249 39559 250 41434 251 43118 252 45435 253 46951 254 49247 255 51392 256 53335 257 56000 258 58177 259 60870 260 63994 261 66445 262 69734 263 72172 264 75486 265 78844 266 82911 267 86654 268 90690 269 94249 270 98412 271 103288 272 108101 273 113176 274 117877 275 123521 276 130195 277 135650 278 141425 279 147314 280 151689 281 158990 282 165361 283 172969 284 179829 285 187426 286 194114 287 201804 288 209016 289 216691 290 226225 291 234794 292 243282 293 255114 294 262286 295 271943 296 281190 297 291795 298 302963 299 314041 300 325122 301 336973 302 348042 303 361103 304 373208 305 385957 306 398052 307 410920 308 422682 309 438341 310 453274 311 468483 312 483070 313 496144 314 513192 315 528631 316 542909 317 559002 318 574485 319 591614 320 608998 321 624894 322 642957 323 658537 324 677623 325 695711 326 712093 327 729441 328 749320 329 766111 330 783612 331 804855 332 823153 333 842999 334 862651 335 881217 336 901163 337 921137 338 939805 339 958902 340 977506 341 999215 342 1017081 343 1036700 344 1060036 345 1078994 346 1098416 347 1115567 348 1135728 349 1152269 350 1174042 351 1191076 352 1208303 353 1229812 354 1247432 355 1266702 356 1284246 357 1302889 358 1318833 359 1336406 360 1352318 361 1367606 362 1385720 363 1403068 364 1419085 365 1436313 366 1450526 367 1465295 368 1476562 369 1493858 370 1506311 371 1517881 372 1529590 373 1544015 374 1554838 375 1568078 376 1580482 377 1591581 378 1604325 379 1612195 380 1620010 381 1629237 382 1637003 383 1648433 384 1654374 385 1665083 386 1674189 387 1682385 388 1688035 389 1690458 390 1696958 391 1700969 392 1706986 393 1713036 394 1717089 395 1721719 396 1726376 397 1729703 398 1733089 399 1735600 400 1736175 401 1736961 402 1737789 403 1736668 404 1741608 405 1737114 406 1741475 407 1740614 408 1738105 409 1738424 410 1738682 411 1737706 412 1732739 413 1729727 414 1726867 415 1724462 416 1722145 417 1721195 418 1717409 419 1715384 420 1709450 421 1701878 422 1698401 423 1694413 424 1689485 425 1685004 426 1679059 427 1676627 428 1671221 429 1665616 430 1659392 431 1650096 432 1644468 433 1637168 434 1631201 435 1624976 436 1618135 437 1611355 438 1606291 439 1596893 440 1590565 441 1585045 442 1576511 443 1569220 444 1561231 445 1553738 446 1546475 447 1538255 448 1530484 449 1523632 450 1514710 451 1505962 452 1496706 453 1488417 454 1482265 455 1469513 456 1463075 457 1455762 458 1445766 459 1437828 460 1432547 461 1420769 462 1414971 463 1404847 464 1394883 465 1388656 466 1378622 467 1368646 468 1358953 469 1352168 470 1342539 471 1334012 472 1325610 473 1318780 474 1305817 475 1297221 476 1292908 477 1279897 478 1270480 479 1262950 480 1252816 481 1244570 482 1237635 483 1226704 484 1218015 485 1209352 486 1200503 487 1190174 488 1185026 489 1175206 490 1165650 491 1158639 492 1149359 493 1139504 494 1131227 495 1121957 496 1113388 497 1104668 498 1096691 499 1088463 500 1079292 501 1071305 502 1062992 503 1053741 504 1043858 505 1036704 506 1028002 507 1020409 508 1011729 509 1003388 510 995079 511 987440 512 981147 513 969996 514 961465 515 953365 516 944055 517 937498 518 929568 519 922544 520 913390 521 905414 522 895489 523 890698 524 883735 525 874906 526 865887 527 858125 528 848565 529 842804 530 834826 531 826702 532 818807 533 812185 534 803986 535 795960 536 786982 537 780230 538 772860 539 764762 540 757871 541 750785 542 743666 543 736331 544 728263 545 720675 546 711975 547 705842 548 700381 549 690139 550 683766 551 676553 552 668625 553 664084 554 656544 555 649212 556 641640 557 634325 558 625563 559 620200 560 615583 561 607882 562 601452 563 595215 564 587409 565 581324 566 575831 567 569114 568 562308 569 555824 570 549726 571 542987 572 535217 573 530105 574 523682 575 518473 576 511670 577 505409 578 499870 579 492543 580 485193 581 481997 582 474763 583 469973 584 464480 585 457336 586 454116 587 446928 588 440521 589 435601 590 430546 591 424024 592 419961 593 414582 594 409672 595 404330 596 397561 597 393205 598 387114 599 382664 600 378403 601 373500 602 367872 603 363302 604 358313 605 351380 606 348584 607 342906 608 338522 609 334671 610 329876 611 325144 612 319946 613 315608 614 310626 615 307487 616 304101 617 298946 618 295274 619 291511 620 285129 621 281033 622 278300 623 273313 624 270205 625 266416 626 261797 627 258812 628 255321 629 252145 630 247980 631 243170 632 241433 633 236800 634 234136 635 230284 636 227440 637 223940 638 219958 639 217238 640 214274 641 211119 642 207286 643 204214 644 200862 645 199162 646 194987 647 192532 648 189259 649 186472 650 183618 651 180785 652 178287 653 175119 654 173240 655 170635 656 167296 657 164875 658 162499 659 160565 660 157852 661 154806 662 153284 663 150001 664 148636 665 145937 666 143088 667 141261 668 138916 669 136529 670 134493 671 131869 672 129765 673 128070 674 126521 675 123864 676 122579 677 120558 678 118178 679 116446 680 114187 681 113028 682 111088 683 108873 684 107753 685 105271 686 103847 687 101679 688 100445 689 98902 690 97050 691 95578 692 94397 693 92135 694 90200 695 89014 696 87579 697 85721 698 84922 699 82809 700 81933 701 80700 702 78907 703 77755 704 76497 705 74898 706 73925 707 72380 708 71256 709 70263 710 68464 711 67304 712 66926 713 65185 714 64063 715 62740 716 62142 717 61075 718 60211 719 58531 720 57500 721 56559 722 55767 723 54686 724 53999 725 53097 726 51804 727 50955 728 50371 729 49188 730 48429 731 47461 732 46515 733 45611 734 45375 735 44078 736 43630 737 42949 738 42223 739 41321 740 40063 741 39671 742 39034 743 38192 744 37635 745 37053 746 36313 747 35950 748 35300 749 34490 750 33391 751 32810 752 32204 753 31838 754 30789 755 30739 756 30036 757 29575 758 29163 759 28708 760 28413 761 27763 762 27332 763 26392 764 25994 765 25587 766 25100 767 24378 768 23822 769 23705 770 23053 771 22895 772 22217 773 21638 774 21386 775 20728 776 20614 777 20006 778 19757 779 19189 780 18859 781 18505 782 18167 783 17618 784 17334 785 16902 786 16577 787 16367 788 16210 789 15917 790 15482 791 14927 792 14634 793 14647 794 14234 795 13747 796 13686 797 13578 798 13212 799 12947 800 12586 801 12207 802 12130 803 11803 804 11720 805 11470 806 11166 807 11061 808 10910 809 10554 810 10312 811 10084 812 9961 813 10023 814 9686 815 9338 816 9411 817 8963 818 8808 819 9050 820 8434 821 8285 822 8082 823 8019 824 7781 825 7833 826 7475 827 7328 828 7431 829 7188 830 7276 831 6757 832 6808 833 6722 834 6324 835 6156 836 6027 837 6098 838 5851 839 6027 840 5636 841 5367 842 5371 843 5323 844 5092 845 5159 846 4938 847 4815 848 4938 849 4578 850 4633 851 4346 852 4513 853 4289 854 3912 855 3848 856 3770 857 3812 858 3780 859 3831 860 3536 861 3630 862 3608 863 3165 864 3134 865 3103 866 2979 867 2927 868 2854 869 2864 870 2805 871 2670 872 2617 873 2721 874 2707 875 2651 876 2707 877 2359 878 2230 879 2218 880 2136 881 2092 882 2175 883 2048 884 1951 885 1963 886 1875 887 1834 888 1828 889 1775 890 1780 891 1815 892 1734 893 1716 894 1705 895 1566 896 1567 897 1615 898 1455 899 1515 900 1420 901 1418 902 1422 903 1387 904 1420 905 1339 906 1266 907 1218 908 1240 909 1261 910 1184 911 1235 912 1202 913 1130 914 1092 915 1093 916 1029 917 1169 918 1032 919 932 920 936 921 956 922 935 923 880 924 906 925 925 926 858 927 853 928 868 929 819 930 781 931 781 932 827 933 798 934 788 935 753 936 751 937 740 938 740 939 731 940 673 941 656 942 654 943 705 944 618 945 653 946 636 947 618 948 601 949 615 950 587 951 576 952 542 953 562 954 564 955 557 956 581 957 515 958 511 959 503 960 493 961 514 962 489 963 492 964 486 965 486 966 426 967 457 968 458 969 414 970 440 971 397 972 405 973 418 974 401 975 406 976 404 977 408 978 362 979 361 980 359 981 331 982 331 983 361 984 367 985 331 986 314 987 303 988 308 989 313 990 314 991 302 992 291 993 302 994 303 995 312 996 269 997 279 998 276 999 273 1000 230 1001 283 1002 294 1003 268 1004 223 1005 265 1006 258 1007 228 1008 226 1009 243 1010 242 1011 248 1012 242 1013 227 1014 210 1015 231 1016 224 1017 229 1018 202 1019 226 1020 223 1021 186 1022 194 1023 208 1024 192 1025 187 1026 189 1027 186 1028 193 1029 210 1030 168 1031 190 1032 155 1033 160 1034 172 1035 171