#SentieonCommandLine: /lustre8/home/ykawai-tnproj-pg/packages/sentieon-genomics-201911/libexec/driver -t 8 -r /lustre8/home/ncbn-pg/data/resource/Homo_sapiens_assembly38.fasta -i HGDP/HGDP00626/HGDP00626.cram --algo InsertSizeMetricAlgo HGDP/HGDP00626/QCmetrics/HGDP00626.InsertSizeMetricAlgo.txt MEDIAN_INSERT_SIZE MEDIAN_ABSOLUTE_DEVIATION MIN_INSERT_SIZE MAX_INSERT_SIZE MEAN_INSERT_SIZE STANDARD_DEVIATION READ_PAIRS PAIR_ORIENTATION WIDTH_OF_10_PERCENT WIDTH_OF_20_PERCENT WIDTH_OF_30_PERCENT WIDTH_OF_40_PERCENT WIDTH_OF_50_PERCENT WIDTH_OF_60_PERCENT WIDTH_OF_70_PERCENT WIDTH_OF_80_PERCENT WIDTH_OF_90_PERCENT WIDTH_OF_99_PERCENT 431.000000 60.000000 2 245835069 441.392578 97.491952 361168034 FR 23 47 71 95 121 151 185 231 311 649 insert_size All_Reads.fr_count 2 322 3 341 4 398 5 430 6 433 7 561 8 634 9 778 10 797 11 723 12 778 13 875 14 801 15 1017 16 991 17 882 18 1045 19 1969 20 2279 21 2208 22 2727 23 3141 24 3503 25 4046 26 4222 27 4622 28 4816 29 4969 30 5285 31 5392 32 5832 33 6145 34 6509 35 7501 36 7772 37 8088 38 8655 39 8734 40 9190 41 9502 42 9627 43 10267 44 10792 45 10787 46 11011 47 11260 48 12219 49 12336 50 12612 51 13029 52 13138 53 14086 54 14867 55 14532 56 14482 57 14684 58 15771 59 16144 60 16302 61 16605 62 16995 63 17176 64 17934 65 17595 66 17803 67 18063 68 18484 69 19043 70 18885 71 18753 72 18957 73 19085 74 19490 75 19164 76 18833 77 19050 78 19664 79 20412 80 19975 81 19805 82 19643 83 20032 84 20824 85 20765 86 20229 87 20133 88 20912 89 21358 90 21101 91 20653 92 20529 93 20520 94 21546 95 20719 96 20731 97 20302 98 20607 99 20810 100 20697 101 20554 102 20257 103 20699 104 21100 105 20429 106 20307 107 19977 108 20138 109 21007 110 20690 111 20578 112 20479 113 20714 114 21024 115 20728 116 20217 117 19824 118 20290 119 20541 120 20363 121 20099 122 20146 123 20208 124 20113 125 19659 126 19484 127 19064 128 19062 129 19081 130 19075 131 18720 132 18608 133 18648 134 18992 135 18670 136 18263 137 18235 138 18313 139 18688 140 18646 141 18110 142 18087 143 18267 144 18438 145 18324 146 18128 147 17986 148 18044 149 18034 150 17903 151 17716 152 17491 153 17979 154 17787 155 17385 156 17261 157 17134 158 17100 159 16974 160 16889 161 16595 162 16679 163 16538 164 16458 165 16258 166 16173 167 16169 168 16225 169 15935 170 15801 171 15688 172 15685 173 15623 174 15650 175 15343 176 15322 177 15159 178 15496 179 15200 180 15041 181 15243 182 15038 183 15287 184 15399 185 15346 186 15153 187 15160 188 15036 189 15539 190 15350 191 15014 192 15391 193 15149 194 15237 195 14837 196 15413 197 15148 198 15330 199 15437 200 15316 201 15441 202 15626 203 15693 204 15849 205 15894 206 16101 207 16063 208 16449 209 16800 210 16758 211 17076 212 17397 213 17465 214 17983 215 18096 216 18387 217 18963 218 19342 219 19834 220 20225 221 20436 222 21481 223 22095 224 22831 225 23687 226 24067 227 25175 228 25980 229 27136 230 27761 231 28526 232 29784 233 30976 234 31779 235 32926 236 34113 237 35189 238 37175 239 38470 240 39810 241 41433 242 42968 243 44582 244 46361 245 47827 246 50206 247 52261 248 54301 249 56679 250 58885 251 62089 252 64112 253 67080 254 69620 255 72509 256 75480 257 79224 258 81778 259 85555 260 89048 261 93271 262 96847 263 101383 264 105808 265 109940 266 112925 267 118153 268 123305 269 128806 270 134129 271 139586 272 145541 273 152109 274 159036 275 166000 276 174252 277 181354 278 187714 279 193576 280 200050 281 207432 282 214930 283 223133 284 232063 285 240334 286 248419 287 258005 288 265891 289 275660 290 284395 291 295149 292 304823 293 316085 294 327872 295 336901 296 347526 297 359887 298 371515 299 384880 300 397552 301 409311 302 422659 303 435503 304 449547 305 461942 306 475209 307 487812 308 502994 309 517490 310 532277 311 548727 312 563533 313 580357 314 594763 315 611372 316 627513 317 642286 318 659510 319 675997 320 692093 321 709574 322 727696 323 744576 324 761868 325 779802 326 798179 327 813515 328 831445 329 850637 330 866459 331 886506 332 905748 333 924753 334 945177 335 961466 336 979179 337 995742 338 1013372 339 1033553 340 1051038 341 1070328 342 1089819 343 1109841 344 1126517 345 1144087 346 1159516 347 1178659 348 1195235 349 1211587 350 1228150 351 1245327 352 1260891 353 1278693 354 1296578 355 1311952 356 1326632 357 1343588 358 1357048 359 1373063 360 1384553 361 1400134 362 1416612 363 1429523 364 1442647 365 1456555 366 1468942 367 1480660 368 1493050 369 1504849 370 1516907 371 1525583 372 1539218 373 1546636 374 1556421 375 1567221 376 1579175 377 1588288 378 1596414 379 1601060 380 1610676 381 1616560 382 1623950 383 1632558 384 1636579 385 1642957 386 1650316 387 1655348 388 1660447 389 1664267 390 1668132 391 1670167 392 1672478 393 1674941 394 1680278 395 1684257 396 1686029 397 1687828 398 1689165 399 1691775 400 1691668 401 1691456 402 1692493 403 1693740 404 1692346 405 1690951 406 1690343 407 1690848 408 1688836 409 1688203 410 1686285 411 1680013 412 1676822 413 1674846 414 1672115 415 1669698 416 1663724 417 1662383 418 1657595 419 1652174 420 1649333 421 1644614 422 1637570 423 1632907 424 1626935 425 1622295 426 1617628 427 1612536 428 1608705 429 1601615 430 1598047 431 1586129 432 1579098 433 1569656 434 1568119 435 1559481 436 1552374 437 1548402 438 1535616 439 1533980 440 1526834 441 1519306 442 1510216 443 1501675 444 1493185 445 1487544 446 1480530 447 1472577 448 1464452 449 1457444 450 1449235 451 1441578 452 1431680 453 1422747 454 1414858 455 1407034 456 1398135 457 1390083 458 1382085 459 1373064 460 1364060 461 1356275 462 1345964 463 1338027 464 1329780 465 1321733 466 1314216 467 1301703 468 1296819 469 1288783 470 1279812 471 1268508 472 1261938 473 1253520 474 1243024 475 1234061 476 1225376 477 1215236 478 1209706 479 1200419 480 1190745 481 1181723 482 1175879 483 1166604 484 1158495 485 1147845 486 1138722 487 1130401 488 1121896 489 1115060 490 1105301 491 1098151 492 1090852 493 1081410 494 1073117 495 1062189 496 1053189 497 1045011 498 1038975 499 1029602 500 1022008 501 1013297 502 1004925 503 999448 504 990520 505 981497 506 972039 507 963379 508 956392 509 949106 510 940094 511 932251 512 924262 513 918011 514 908522 515 902395 516 893800 517 885478 518 878306 519 868655 520 861135 521 853061 522 846809 523 838791 524 831573 525 822097 526 815461 527 809168 528 800784 529 791976 530 784690 531 776131 532 770818 533 761716 534 757165 535 750048 536 741966 537 734178 538 726523 539 720297 540 710700 541 705022 542 696753 543 691791 544 683109 545 676015 546 667736 547 662883 548 656965 549 649117 550 642839 551 634938 552 627994 553 619658 554 614886 555 608077 556 600828 557 595234 558 588683 559 581350 560 575495 561 569818 562 563073 563 558833 564 549734 565 543575 566 538681 567 530909 568 526182 569 518917 570 513133 571 507869 572 501108 573 497285 574 490397 575 483425 576 478201 577 474095 578 467469 579 463199 580 456089 581 448748 582 444128 583 438226 584 434371 585 428479 586 423658 587 419224 588 412751 589 406966 590 402251 591 397172 592 391294 593 387150 594 382340 595 375522 596 371838 597 368943 598 364485 599 356455 600 354180 601 348420 602 343417 603 338813 604 333678 605 329485 606 325539 607 321736 608 316703 609 311637 610 307443 611 302978 612 299405 613 295286 614 291090 615 287960 616 284801 617 279185 618 275258 619 272061 620 267414 621 263689 622 259769 623 256052 624 252891 625 249829 626 245073 627 241798 628 239097 629 235560 630 231878 631 228306 632 225520 633 221622 634 218784 635 216589 636 211415 637 209545 638 205494 639 202082 640 199215 641 196862 642 194088 643 190946 644 188401 645 185763 646 183025 647 179436 648 177921 649 174383 650 172763 651 169520 652 166676 653 164804 654 162200 655 160266 656 157674 657 154258 658 152231 659 149946 660 147686 661 145101 662 143333 663 140810 664 139046 665 135862 666 133978 667 132366 668 130355 669 128571 670 126191 671 124008 672 122277 673 120519 674 118635 675 116775 676 114413 677 113010 678 110958 679 108720 680 107020 681 105087 682 103433 683 101881 684 100219 685 98790 686 97587 687 95149 688 93914 689 92962 690 90473 691 89077 692 87895 693 86393 694 85039 695 83410 696 82084 697 80659 698 79692 699 77942 700 77153 701 75223 702 73890 703 73269 704 71317 705 70359 706 69459 707 68038 708 67071 709 65544 710 64603 711 63422 712 62392 713 60955 714 60100 715 58947 716 58040 717 56819 718 55901 719 55236 720 53729 721 53014 722 51943 723 51608 724 50714 725 49425 726 48738 727 47820 728 47061 729 46239 730 45285 731 44253 732 43682 733 42890 734 42287 735 41557 736 40751 737 40215 738 39343 739 38859 740 38229 741 37193 742 36833 743 35941 744 35568 745 34964 746 34100 747 33772 748 32635 749 31960 750 31548 751 31047 752 30345 753 29936 754 29422 755 28847 756 28045 757 27734 758 27483 759 26865 760 26298 761 25801 762 25139 763 24563 764 23969 765 23505 766 23124 767 23047 768 22290 769 22106 770 21576 771 21166 772 20788 773 20132 774 19785 775 19392 776 19164 777 18913 778 18365 779 18103 780 17555 781 17515 782 17023 783 16600 784 16396 785 15934 786 15685 787 15482 788 15024 789 14696 790 14476 791 14294 792 13644 793 13554 794 13121 795 13215 796 12846 797 12629 798 12471 799 12278 800 11893 801 11768 802 11605 803 11191 804 11371 805 10797 806 10433 807 10359 808 10177 809 9954 810 9936 811 9366 812 9388 813 9262 814 8841 815 8888 816 8636 817 8620 818 8299 819 8221 820 8029 821 7857 822 7840 823 7476 824 7936 825 7327 826 6934 827 7050 828 6833 829 6821 830 6468 831 6429 832 6177 833 6011 834 5930 835 5731 836 5657 837 5514 838 5508 839 5363 840 5369 841 5183 842 5243 843 5100 844 4874 845 4685 846 4754 847 4996 848 4441 849 4230 850 4204 851 4120 852 3876 853 3756 854 3725 855 3709 856 3595 857 3688 858 3611 859 3462 860 3357 861 3280 862 3409 863 3137 864 3044 865 2924 866 2848 867 2903 868 2830 869 2685 870 2727 871 2647 872 2606 873 2497 874 2741 875 2526 876 2541 877 2335 878 2204 879 2109 880 2038 881 2202 882 2016 883 2007 884 1864 885 1882 886 1806 887 1810 888 1767 889 1677 890 1578 891 1591 892 1598 893 1652 894 1535 895 1621 896 1567 897 1513 898 1527 899 1450 900 1347 901 1318 902 1358 903 1473 904 1236 905 1259 906 1199 907 1231 908 1169 909 1167 910 1094 911 1096 912 1136 913 1043 914 992 915 1050 916 923 917 1002 918 991 919 916 920 917 921 906 922 879 923 873 924 878 925 892 926 812 927 803 928 844 929 792 930 790 931 731 932 756 933 764 934 758 935 702 936 698 937 692 938 698 939 676 940 659 941 663 942 677 943 621 944 587 945 599 946 623 947 590 948 595 949 596 950 540 951 556 952 579 953 513 954 531 955 485 956 482 957 523 958 487 959 480 960 476 961 442 962 423 963 480 964 410 965 422 966 476 967 401 968 422 969 423 970 408 971 365 972 403 973 424 974 385 975 420 976 392 977 382 978 388 979 356 980 362 981 325 982 333 983 335 984 340 985 331 986 333 987 314 988 322 989 323 990 322 991 281 992 305 993 271 994 271 995 288 996 254 997 279 998 266 999 235 1000 286 1001 249 1002 290 1003 228 1004 235 1005 265 1006 237 1007 242 1008 249 1009 271 1010 221 1011 223 1012 233 1013 231 1014 244 1015 210 1016 222 1017 207 1018 193 1019 214 1020 195 1021 182 1022 198 1023 195 1024 175 1025 198 1026 182 1027 161 1028 165 1029 174 1030 176 1031 178