#SentieonCommandLine: /lustre8/home/ykawai-tnproj-pg/packages/sentieon-genomics-201911/libexec/driver -t 8 -r /lustre8/home/ncbn-pg/data/resource/Homo_sapiens_assembly38.fasta -i HGDP/HGDP00638/HGDP00638.cram --algo InsertSizeMetricAlgo HGDP/HGDP00638/QCmetrics/HGDP00638.InsertSizeMetricAlgo.txt MEDIAN_INSERT_SIZE MEDIAN_ABSOLUTE_DEVIATION MIN_INSERT_SIZE MAX_INSERT_SIZE MEAN_INSERT_SIZE STANDARD_DEVIATION READ_PAIRS PAIR_ORIENTATION WIDTH_OF_10_PERCENT WIDTH_OF_20_PERCENT WIDTH_OF_30_PERCENT WIDTH_OF_40_PERCENT WIDTH_OF_50_PERCENT WIDTH_OF_60_PERCENT WIDTH_OF_70_PERCENT WIDTH_OF_80_PERCENT WIDTH_OF_90_PERCENT WIDTH_OF_99_PERCENT 417.000000 60.000000 2 243849417 430.015824 98.060795 323679697 FR 23 47 71 95 121 151 185 231 315 647 insert_size All_Reads.fr_count 2 1027 3 1051 4 1081 5 1105 6 1162 7 1163 8 1186 9 1256 10 1290 11 1232 12 1303 13 1399 14 1387 15 1463 16 1785 17 1565 18 1896 19 3458 20 3629 21 3537 22 3752 23 4148 24 4294 25 4477 26 4751 27 4864 28 5128 29 5174 30 5257 31 5558 32 5873 33 6043 34 6531 35 6870 36 7112 37 7500 38 7949 39 8249 40 8683 41 8756 42 9090 43 9474 44 10136 45 10254 46 10249 47 10526 48 11525 49 11531 50 11656 51 11906 52 12277 53 12621 54 13347 55 13170 56 13143 57 13540 58 13818 59 14498 60 14297 61 14448 62 14693 63 15149 64 15484 65 15735 66 16058 67 15706 68 16192 69 16591 70 16678 71 16454 72 16781 73 16800 74 17247 75 17038 76 17185 77 17018 78 17308 79 17820 80 17444 81 17372 82 16919 83 17594 84 18044 85 17730 86 17530 87 17158 88 17344 89 17778 90 17462 91 17440 92 16708 93 17139 94 17808 95 17426 96 17228 97 17260 98 17179 99 17725 100 17348 101 16985 102 16914 103 16997 104 17531 105 17286 106 17312 107 17115 108 17436 109 17472 110 17281 111 16587 112 16608 113 16658 114 16816 115 16557 116 16246 117 16044 118 15964 119 15897 120 16182 121 15746 122 15589 123 15799 124 15643 125 15435 126 15138 127 14602 128 14751 129 15066 130 15166 131 15159 132 14773 133 15000 134 14801 135 14601 136 15078 137 14822 138 14833 139 14687 140 14674 141 14492 142 14194 143 14151 144 14096 145 14027 146 13851 147 13799 148 13491 149 13490 150 13373 151 13228 152 13255 153 13015 154 12977 155 12686 156 12539 157 12365 158 12336 159 12196 160 11978 161 11959 162 11674 163 11777 164 11702 165 11577 166 11617 167 11611 168 11633 169 11742 170 11689 171 11451 172 11423 173 11405 174 11468 175 11303 176 11159 177 11162 178 11010 179 10947 180 11090 181 10666 182 10664 183 10754 184 10873 185 10632 186 10725 187 10796 188 10845 189 10874 190 10574 191 10835 192 10650 193 10742 194 10674 195 10909 196 11045 197 10836 198 11184 199 11141 200 11227 201 11619 202 11502 203 11449 204 11626 205 11870 206 12083 207 12411 208 12740 209 12953 210 13738 211 13894 212 14288 213 14785 214 15355 215 15832 216 16256 217 16682 218 17108 219 17789 220 18524 221 19020 222 19490 223 20600 224 21299 225 22303 226 23467 227 24134 228 25559 229 26234 230 27615 231 28906 232 30419 233 31735 234 33033 235 34571 236 36802 237 37935 238 40081 239 41894 240 43725 241 46122 242 48245 243 50503 244 53168 245 55953 246 58396 247 60897 248 63974 249 67531 250 71122 251 73907 252 77383 253 81077 254 85713 255 89548 256 93601 257 97684 258 103446 259 108075 260 113242 261 119205 262 124032 263 130316 264 136444 265 140991 266 147924 267 154318 268 161735 269 168322 270 175807 271 183526 272 191158 273 199395 274 208591 275 218412 276 228226 277 236602 278 246172 279 254727 280 264208 281 274465 282 284394 283 295720 284 305925 285 317195 286 327324 287 339511 288 350491 289 364804 290 376554 291 389874 292 403787 293 416309 294 430884 295 444470 296 456060 297 472443 298 487888 299 502088 300 516398 301 533068 302 549557 303 565661 304 581248 305 597548 306 612719 307 627854 308 645917 309 661851 310 680214 311 696774 312 714452 313 731992 314 750250 315 766352 316 785232 317 802830 318 819590 319 834920 320 855800 321 872273 322 889678 323 909760 324 926041 325 944435 326 963710 327 978964 328 995178 329 1011426 330 1030872 331 1047157 332 1065259 333 1081574 334 1096537 335 1115683 336 1131565 337 1147643 338 1160058 339 1174197 340 1188508 341 1205340 342 1222111 343 1234840 344 1247631 345 1264355 346 1275338 347 1288661 348 1301468 349 1313369 350 1322953 351 1335646 352 1347815 353 1358912 354 1369347 355 1381926 356 1389896 357 1401120 358 1410212 359 1418650 360 1426634 361 1434842 362 1442669 363 1451910 364 1456437 365 1465603 366 1471452 367 1478607 368 1482322 369 1489167 370 1493021 371 1496450 372 1500419 373 1503780 374 1507157 375 1514003 376 1517161 377 1519559 378 1521421 379 1524016 380 1523149 381 1522557 382 1523881 383 1525540 384 1526651 385 1527553 386 1528195 387 1529402 388 1526751 389 1526747 390 1527132 391 1522048 392 1519114 393 1517513 394 1517437 395 1517423 396 1514069 397 1512654 398 1506951 399 1506215 400 1499970 401 1497099 402 1495233 403 1489853 404 1483312 405 1480697 406 1481951 407 1473523 408 1471026 409 1464635 410 1457028 411 1451819 412 1444756 413 1440871 414 1433305 415 1428073 416 1423321 417 1418473 418 1411385 419 1406546 420 1400347 421 1391968 422 1384836 423 1379225 424 1369715 425 1364312 426 1357545 427 1351328 428 1345145 429 1337678 430 1330969 431 1319996 432 1313633 433 1308599 434 1295659 435 1291402 436 1282597 437 1275446 438 1267558 439 1261014 440 1251827 441 1248858 442 1239436 443 1230735 444 1221334 445 1213395 446 1206718 447 1199112 448 1193510 449 1185645 450 1176685 451 1167915 452 1158679 453 1150822 454 1144516 455 1135471 456 1128214 457 1118878 458 1114561 459 1104368 460 1098536 461 1088698 462 1081138 463 1072405 464 1066113 465 1058028 466 1048865 467 1042943 468 1033363 469 1025947 470 1017477 471 1011017 472 1003747 473 995504 474 987495 475 980420 476 972005 477 965376 478 957656 479 948700 480 942810 481 936298 482 927417 483 919649 484 913272 485 905432 486 897362 487 891398 488 882647 489 875975 490 869452 491 862167 492 855007 493 846387 494 838985 495 833726 496 825990 497 818441 498 813352 499 806096 500 799225 501 792291 502 785583 503 778106 504 772329 505 763840 506 757907 507 751132 508 746409 509 736786 510 732712 511 724960 512 718214 513 711803 514 705562 515 697617 516 693508 517 684669 518 679807 519 673401 520 667789 521 661582 522 655711 523 647699 524 643017 525 638392 526 631229 527 626239 528 617815 529 611851 530 605663 531 600208 532 594628 533 590355 534 585365 535 579736 536 571390 537 564777 538 559399 539 554986 540 547329 541 543937 542 537433 543 532074 544 527966 545 522310 546 516957 547 509733 548 506106 549 499687 550 494397 551 489098 552 484348 553 479152 554 475388 555 468982 556 465047 557 458212 558 455170 559 450433 560 444958 561 441029 562 436385 563 429842 564 425405 565 420956 566 415706 567 413304 568 408277 569 402343 570 398521 571 393986 572 388343 573 385294 574 379623 575 374849 576 370685 577 366540 578 363514 579 358427 580 354533 581 350019 582 346769 583 343809 584 337699 585 334955 586 329258 587 325861 588 322380 589 318348 590 314457 591 311422 592 306808 593 302378 594 298672 595 295645 596 291569 597 287267 598 285169 599 281481 600 278446 601 274069 602 271051 603 267075 604 263162 605 259477 606 256601 607 253123 608 250203 609 247112 610 245341 611 240196 612 237131 613 234193 614 232122 615 227536 616 225587 617 222836 618 219159 619 216189 620 213310 621 210151 622 207701 623 204690 624 201857 625 199265 626 196561 627 193160 628 191483 629 188093 630 185867 631 183831 632 180445 633 177844 634 175431 635 172643 636 170852 637 168466 638 165967 639 163664 640 161243 641 158655 642 156991 643 154212 644 151929 645 149416 646 147767 647 145209 648 143991 649 142195 650 138995 651 137738 652 134623 653 133731 654 131062 655 129276 656 126123 657 125236 658 123322 659 121785 660 119538 661 117851 662 116165 663 113715 664 112640 665 111028 666 108582 667 107826 668 106285 669 104262 670 102107 671 100688 672 99609 673 97429 674 96523 675 95429 676 93779 677 91262 678 90517 679 88415 680 87171 681 86427 682 84925 683 83380 684 82036 685 80479 686 79942 687 78233 688 76927 689 75988 690 75125 691 73149 692 72213 693 70979 694 69734 695 68020 696 67105 697 66217 698 65189 699 63759 700 62434 701 61614 702 60494 703 59877 704 58579 705 57597 706 56791 707 56090 708 55194 709 53884 710 52298 711 52255 712 50755 713 50351 714 49433 715 48304 716 48029 717 46958 718 46520 719 45136 720 44464 721 43819 722 43195 723 42322 724 41134 725 40844 726 40023 727 39103 728 38715 729 38068 730 37421 731 36938 732 36241 733 35437 734 35028 735 33965 736 33543 737 32721 738 32278 739 31450 740 30947 741 30707 742 30183 743 29403 744 29260 745 28552 746 28461 747 27893 748 27222 749 26724 750 25967 751 25583 752 25008 753 24691 754 24099 755 23855 756 23201 757 22961 758 22386 759 22089 760 21502 761 21433 762 20923 763 20805 764 20107 765 19561 766 19129 767 19034 768 18159 769 17999 770 17759 771 17322 772 16875 773 16663 774 16350 775 15933 776 15673 777 15490 778 15282 779 14982 780 14649 781 14449 782 13979 783 13929 784 13491 785 13389 786 13058 787 12897 788 12785 789 12509 790 12061 791 12005 792 11488 793 11435 794 11229 795 11030 796 10799 797 10625 798 10506 799 10582 800 9968 801 9757 802 9344 803 9508 804 8964 805 9165 806 8786 807 8605 808 8194 809 8135 810 7940 811 7712 812 7584 813 7593 814 7559 815 7238 816 7241 817 7052 818 6962 819 6661 820 6720 821 6378 822 6073 823 6242 824 6209 825 5906 826 5916 827 5571 828 5388 829 5478 830 5267 831 5145 832 5083 833 4928 834 4837 835 4854 836 4758 837 4587 838 4617 839 4415 840 4471 841 4228 842 4167 843 4339 844 3980 845 3826 846 3801 847 3612 848 3657 849 3664 850 3665 851 3530 852 3537 853 3385 854 3302 855 3378 856 3165 857 3134 858 3052 859 3089 860 2877 861 2668 862 2549 863 2534 864 2611 865 2378 866 2375 867 2243 868 2103 869 2158 870 2061 871 2063 872 2079 873 2048 874 2001 875 1978 876 1863 877 1932 878 1858 879 1736 880 1639 881 1658 882 1612 883 1605 884 1637 885 1590 886 1512 887 1593 888 1462 889 1395 890 1439 891 1369 892 1388 893 1392 894 1252 895 1324 896 1227 897 1281 898 1192 899 1158 900 1063 901 1088 902 1103 903 1110 904 1038 905 1087 906 1071 907 1016 908 1004 909 961 910 950 911 887 912 948 913 875 914 870 915 882 916 859 917 841 918 835 919 806 920 783 921 799 922 750 923 754 924 724 925 733 926 702 927 714 928 691 929 742 930 663 931 640 932 660 933 620 934 649 935 639 936 572 937 619 938 597 939 566 940 536 941 564 942 606 943 534 944 534 945 495 946 489 947 464 948 460 949 473 950 436 951 430 952 467 953 472 954 423 955 458 956 398 957 435 958 406 959 429 960 412 961 386 962 359 963 431 964 396 965 351 966 378 967 335 968 363 969 348 970 344 971 314 972 317 973 336 974 318 975 307 976 310 977 309 978 270 979 288 980 296 981 287 982 267 983 276 984 287 985 239 986 271 987 253 988 226 989 273 990 244 991 231 992 274 993 247 994 217 995 213 996 222 997 203 998 225 999 237 1000 235 1001 207 1002 177 1003 197 1004 194 1005 199 1006 192 1007 186 1008 183 1009 176 1010 188 1011 206 1012 159 1013 187 1014 174 1015 168 1016 169 1017 164