#SentieonCommandLine: /lustre8/home/ykawai-tnproj-pg/packages/sentieon-genomics-201911/libexec/driver -t 8 -r /lustre8/home/ncbn-pg/data/resource/Homo_sapiens_assembly38.fasta -i HGDP/HGDP00646/HGDP00646.cram --algo InsertSizeMetricAlgo HGDP/HGDP00646/QCmetrics/HGDP00646.InsertSizeMetricAlgo.txt MEDIAN_INSERT_SIZE MEDIAN_ABSOLUTE_DEVIATION MIN_INSERT_SIZE MAX_INSERT_SIZE MEAN_INSERT_SIZE STANDARD_DEVIATION READ_PAIRS PAIR_ORIENTATION WIDTH_OF_10_PERCENT WIDTH_OF_20_PERCENT WIDTH_OF_30_PERCENT WIDTH_OF_40_PERCENT WIDTH_OF_50_PERCENT WIDTH_OF_60_PERCENT WIDTH_OF_70_PERCENT WIDTH_OF_80_PERCENT WIDTH_OF_90_PERCENT WIDTH_OF_99_PERCENT 442.000000 58.000000 2 244071362 451.937484 94.892977 336696108 FR 23 45 69 93 117 147 179 223 301 643 insert_size All_Reads.fr_count 2 177 3 212 4 187 5 228 6 201 7 241 8 246 9 234 10 229 11 244 12 259 13 258 14 278 15 266 16 271 17 274 18 299 19 329 20 346 21 318 22 390 23 430 24 445 25 459 26 482 27 505 28 573 29 633 30 1426 31 1517 32 1506 33 1967 34 2809 35 3287 36 3932 37 4220 38 4534 39 4952 40 5349 41 5811 42 6473 43 6666 44 7129 45 7523 46 8128 47 9168 48 9932 49 10359 50 10680 51 11311 52 11307 53 12001 54 13069 55 13202 56 13297 57 13738 58 14537 59 14927 60 14961 61 15114 62 15402 63 15818 64 16426 65 16323 66 16236 67 16052 68 16631 69 17192 70 16932 71 16751 72 17038 73 17072 74 17864 75 17939 76 17628 77 17645 78 18146 79 18457 80 17830 81 17904 82 17863 83 18374 84 18970 85 18856 86 18562 87 18396 88 18575 89 19021 90 18613 91 18385 92 18117 93 18346 94 19024 95 18654 96 18281 97 18035 98 18422 99 18633 100 18154 101 18711 102 18554 103 19017 104 19331 105 18678 106 18709 107 18467 108 18918 109 19094 110 19354 111 18944 112 18504 113 18900 114 19240 115 18714 116 18500 117 17898 118 18323 119 18121 120 18137 121 17950 122 18040 123 17756 124 17808 125 17812 126 17337 127 16757 128 17013 129 17144 130 17101 131 16858 132 17149 133 17079 134 17114 135 16877 136 16925 137 16763 138 16942 139 16977 140 16993 141 16700 142 16366 143 16329 144 16464 145 16224 146 16086 147 15987 148 15699 149 15684 150 15752 151 15282 152 14974 153 15194 154 15068 155 14567 156 14601 157 14540 158 14405 159 14129 160 14184 161 13900 162 13725 163 13614 164 13745 165 13752 166 13640 167 13539 168 13757 169 13704 170 13325 171 13599 172 13552 173 13386 174 13365 175 12807 176 12812 177 12865 178 12851 179 12708 180 12418 181 12661 182 12230 183 12377 184 11940 185 11981 186 11846 187 11748 188 11977 189 11711 190 11840 191 11562 192 11456 193 11256 194 11640 195 11563 196 11408 197 11220 198 11448 199 11350 200 11573 201 11642 202 11259 203 11865 204 11846 205 11849 206 11866 207 11723 208 11799 209 12245 210 12119 211 11947 212 12039 213 12031 214 12084 215 12302 216 12290 217 12502 218 12766 219 12765 220 12816 221 13329 222 13360 223 13714 224 13613 225 13913 226 14203 227 14244 228 14889 229 15262 230 15506 231 15589 232 16288 233 16947 234 17293 235 17448 236 18069 237 18674 238 19359 239 19881 240 20386 241 21238 242 21972 243 23112 244 23700 245 24722 246 25670 247 26538 248 27402 249 28463 250 29608 251 30913 252 32005 253 33433 254 34668 255 36084 256 37322 257 38725 258 40364 259 42467 260 43816 261 45524 262 47583 263 49461 264 51599 265 53889 266 56149 267 58652 268 61565 269 63802 270 66409 271 69794 272 72392 273 76189 274 80324 275 82970 276 89464 277 92137 278 95981 279 99597 280 103356 281 107288 282 111961 283 116762 284 120558 285 126720 286 131030 287 136195 288 141871 289 148728 290 154344 291 160537 292 167121 293 174277 294 181396 295 187674 296 195366 297 202291 298 211765 299 219535 300 227669 301 236191 302 244478 303 254387 304 264067 305 273178 306 283776 307 292637 308 303654 309 315175 310 325557 311 336335 312 349067 313 361390 314 372199 315 384703 316 397812 317 410391 318 423477 319 436480 320 449639 321 464976 322 479682 323 492893 324 509035 325 523808 326 539184 327 552870 328 569217 329 583397 330 599907 331 615755 332 633958 333 649210 334 667711 335 684424 336 702501 337 716603 338 733471 339 749873 340 770132 341 786624 342 803513 343 822314 344 840028 345 858523 346 876482 347 895139 348 912425 349 930038 350 947014 351 965610 352 982141 353 1000236 354 1021283 355 1040166 356 1054436 357 1073489 358 1088758 359 1106310 360 1123040 361 1139056 362 1156631 363 1170153 364 1188721 365 1206081 366 1222512 367 1238416 368 1252496 369 1267414 370 1280043 371 1295161 372 1311830 373 1325352 374 1339842 375 1354308 376 1366836 377 1381589 378 1391684 379 1404637 380 1415819 381 1425282 382 1439106 383 1448157 384 1462215 385 1471267 386 1480891 387 1492832 388 1500175 389 1508594 390 1515492 391 1522131 392 1529667 393 1538713 394 1545809 395 1554793 396 1561309 397 1568423 398 1574013 399 1580444 400 1583013 401 1588596 402 1591342 403 1596839 404 1600583 405 1608131 406 1609095 407 1612875 408 1616213 409 1619705 410 1618775 411 1620863 412 1617677 413 1619808 414 1621773 415 1621750 416 1622572 417 1620558 418 1621291 419 1620333 420 1620479 421 1613769 422 1614694 423 1610637 424 1607796 425 1605841 426 1603679 427 1602082 428 1600230 429 1598667 430 1591552 431 1585293 432 1581447 433 1577977 434 1574802 435 1567342 436 1564258 437 1558971 438 1553682 439 1549926 440 1545466 441 1537616 442 1530603 443 1525326 444 1517862 445 1513375 446 1505498 447 1499832 448 1493035 449 1488604 450 1481022 451 1473796 452 1466052 453 1458546 454 1453082 455 1442365 456 1435365 457 1428883 458 1419582 459 1413219 460 1403736 461 1398674 462 1388928 463 1382938 464 1373986 465 1364305 466 1355810 467 1347064 468 1337665 469 1331013 470 1324018 471 1315781 472 1306280 473 1298569 474 1286767 475 1279421 476 1271320 477 1263815 478 1252889 479 1246968 480 1237353 481 1229724 482 1219035 483 1212811 484 1201896 485 1192894 486 1183508 487 1176386 488 1166780 489 1156866 490 1148882 491 1140022 492 1132642 493 1123317 494 1115313 495 1106787 496 1097522 497 1089193 498 1079821 499 1070730 500 1064769 501 1052591 502 1046627 503 1037802 504 1025826 505 1018347 506 1009583 507 1002747 508 994375 509 985118 510 977170 511 968709 512 960974 513 952054 514 943241 515 935838 516 928201 517 917977 518 909544 519 902328 520 892725 521 885596 522 877432 523 871197 524 862458 525 851953 526 843925 527 838141 528 829266 529 820192 530 813545 531 804776 532 798519 533 790713 534 783376 535 775531 536 767013 537 758981 538 753173 539 743253 540 736641 541 730598 542 718672 543 713093 544 706582 545 699494 546 691821 547 686140 548 677196 549 669575 550 663377 551 656974 552 650322 553 641966 554 635188 555 626355 556 622292 557 612887 558 605261 559 598332 560 593272 561 585785 562 579914 563 573089 564 568017 565 560520 566 556276 567 547271 568 542186 569 536285 570 531452 571 523462 572 516444 573 510934 574 504646 575 500510 576 493946 577 488117 578 481383 579 474751 580 469916 581 463183 582 459106 583 452004 584 447503 585 443438 586 436456 587 431910 588 425763 589 418795 590 413994 591 410418 592 403054 593 398632 594 393919 595 388302 596 383718 597 378786 598 373878 599 368952 600 362690 601 359648 602 354320 603 348205 604 344069 605 340655 606 335400 607 331476 608 327110 609 323215 610 317542 611 313704 612 309671 613 305970 614 301634 615 297019 616 293239 617 288739 618 284980 619 279875 620 275423 621 272784 622 267798 623 264388 624 260551 625 257034 626 253327 627 249400 628 245272 629 242855 630 238735 631 236100 632 232349 633 228564 634 224871 635 221777 636 218965 637 215016 638 212092 639 208937 640 205670 641 202876 642 200010 643 196878 644 192789 645 191306 646 188661 647 184830 648 182404 649 179303 650 176830 651 174468 652 171713 653 168410 654 166032 655 162958 656 161317 657 158563 658 155763 659 152757 660 150505 661 148279 662 147314 663 144588 664 141882 665 139604 666 137651 667 134552 668 133274 669 130833 670 127981 671 126088 672 124121 673 122641 674 119857 675 118209 676 115713 677 114090 678 112880 679 110985 680 109023 681 107342 682 105858 683 103446 684 101774 685 100390 686 98251 687 96577 688 95005 689 93388 690 91747 691 90410 692 88205 693 87650 694 85214 695 83761 696 82910 697 81716 698 79976 699 78999 700 77231 701 76088 702 74648 703 72866 704 71934 705 70791 706 69782 707 68210 708 67259 709 66156 710 64775 711 63632 712 62339 713 61480 714 60127 715 58956 716 58132 717 57382 718 56296 719 54748 720 54819 721 53354 722 51937 723 50934 724 50281 725 49597 726 48769 727 47766 728 47025 729 45852 730 45379 731 44550 732 43538 733 42540 734 42414 735 41200 736 40364 737 40370 738 38963 739 38283 740 37846 741 37420 742 36404 743 35870 744 35234 745 34353 746 33808 747 33172 748 32792 749 31890 750 31410 751 30761 752 30558 753 29320 754 29039 755 28782 756 28289 757 27381 758 27033 759 26987 760 25995 761 25804 762 24707 763 24862 764 24191 765 23647 766 23190 767 22795 768 22539 769 21791 770 21318 771 21214 772 20680 773 20368 774 20069 775 19539 776 19164 777 18908 778 18280 779 18086 780 17536 781 17354 782 16921 783 16382 784 16239 785 15891 786 15726 787 15306 788 15039 789 14880 790 14369 791 14166 792 13805 793 13522 794 13161 795 13166 796 12946 797 12753 798 12276 799 12055 800 11876 801 11434 802 11240 803 11093 804 10817 805 10743 806 10371 807 10354 808 10209 809 9925 810 9798 811 9445 812 9289 813 9367 814 8958 815 8990 816 8644 817 8420 818 8166 819 8125 820 7901 821 7712 822 7405 823 7519 824 7342 825 6980 826 6953 827 6840 828 6737 829 6572 830 6401 831 6364 832 6454 833 6220 834 5877 835 5911 836 5843 837 5474 838 5186 839 5123 840 5228 841 5053 842 4922 843 4929 844 4803 845 4663 846 4602 847 4592 848 4543 849 4310 850 4402 851 4303 852 4225 853 4145 854 3923 855 3872 856 3733 857 3718 858 3648 859 3687 860 3619 861 3624 862 3394 863 3115 864 3046 865 3161 866 3259 867 2700 868 2678 869 2566 870 2494 871 2399 872 2453 873 2371 874 2240 875 2218 876 2281 877 2101 878 2182 879 2118 880 2157 881 2037 882 1880 883 1992 884 1966 885 1875 886 1937 887 1819 888 1807 889 1770 890 1693 891 1740 892 1720 893 1613 894 1550 895 1595 896 1539 897 1538 898 1481 899 1503 900 1412 901 1396 902 1319 903 1328 904 1325 905 1295 906 1260 907 1213 908 1168 909 1117 910 1234 911 1110 912 1071 913 1058 914 1078 915 999 916 1028 917 995 918 971 919 947 920 963 921 943 922 935 923 897 924 900 925 867 926 828 927 860 928 788 929 849 930 768 931 761 932 796 933 779 934 772 935 737 936 733 937 682 938 790 939 721 940 650 941 676 942 661 943 654 944 649 945 644 946 627 947 637 948 669 949 570 950 609 951 608 952 590 953 550 954 540 955 522 956 560 957 529 958 545 959 527 960 503 961 526 962 473 963 509 964 469 965 489 966 445 967 480 968 471 969 460 970 446 971 413 972 449 973 403 974 408 975 400 976 394 977 372 978 376 979 380 980 386 981 315 982 361 983 366 984 347 985 339 986 333 987 319 988 353 989 289 990 292 991 311 992 298 993 316 994 316 995 290 996 271 997 267 998 277 999 297 1000 280 1001 310 1002 280 1003 230 1004 251 1005 259 1006 253 1007 265 1008 262 1009 250 1010 224 1011 238 1012 238 1013 235 1014 232 1015 226 1016 211 1017 221 1018 225 1019 210 1020 211 1021 210 1022 218