#SentieonCommandLine: /lustre8/home/ykawai-tnproj-pg/packages/sentieon-genomics-201911/libexec/driver -t 8 -r /lustre8/home/ncbn-pg/data/resource/Homo_sapiens_assembly38.fasta -i HGDP/HGDP00668/HGDP00668.cram --algo InsertSizeMetricAlgo HGDP/HGDP00668/QCmetrics/HGDP00668.InsertSizeMetricAlgo.txt MEDIAN_INSERT_SIZE MEDIAN_ABSOLUTE_DEVIATION MIN_INSERT_SIZE MAX_INSERT_SIZE MEAN_INSERT_SIZE STANDARD_DEVIATION READ_PAIRS PAIR_ORIENTATION WIDTH_OF_10_PERCENT WIDTH_OF_20_PERCENT WIDTH_OF_30_PERCENT WIDTH_OF_40_PERCENT WIDTH_OF_50_PERCENT WIDTH_OF_60_PERCENT WIDTH_OF_70_PERCENT WIDTH_OF_80_PERCENT WIDTH_OF_90_PERCENT WIDTH_OF_99_PERCENT 442.000000 57.000000 2 242742616 450.414305 91.355820 296806570 FR 23 45 67 89 115 143 175 219 291 605 insert_size All_Reads.fr_count 2 148 3 172 4 181 5 173 6 189 7 181 8 206 9 169 10 202 11 187 12 190 13 205 14 188 15 203 16 215 17 194 18 224 19 224 20 235 21 237 22 240 23 243 24 264 25 299 26 244 27 301 28 355 29 411 30 953 31 976 32 1032 33 1112 34 1255 35 1404 36 1503 37 1557 38 1779 39 1829 40 1983 41 2118 42 2431 43 2559 44 2606 45 2812 46 3304 47 3385 48 3915 49 5089 50 5887 51 6647 52 7595 53 8564 54 9488 55 9430 56 9874 57 9785 58 10381 59 10539 60 10766 61 10891 62 10879 63 11756 64 12149 65 12118 66 12123 67 12159 68 12489 69 12773 70 12896 71 12594 72 12904 73 13044 74 13153 75 13342 76 12913 77 12785 78 13173 79 13715 80 13320 81 13220 82 13229 83 13580 84 13829 85 13852 86 14138 87 13770 88 14272 89 14643 90 14865 91 14544 92 14331 93 14382 94 14972 95 14482 96 14202 97 13923 98 14378 99 14661 100 14496 101 14259 102 14083 103 14535 104 14441 105 14134 106 14360 107 14108 108 14470 109 14774 110 14394 111 14161 112 14435 113 14416 114 15169 115 14962 116 15030 117 14683 118 15235 119 14972 120 14736 121 14459 122 14442 123 14459 124 14843 125 14237 126 14172 127 14073 128 14443 129 14176 130 14041 131 13891 132 13834 133 14000 134 14135 135 14052 136 13799 137 13762 138 13770 139 13743 140 13732 141 13686 142 13673 143 14063 144 14220 145 13986 146 13966 147 13944 148 13831 149 13893 150 13624 151 13482 152 13390 153 13453 154 13515 155 13342 156 13119 157 12800 158 12967 159 12919 160 12752 161 12654 162 12430 163 12456 164 12464 165 12322 166 12455 167 12320 168 12277 169 12186 170 12248 171 11975 172 11990 173 11772 174 11968 175 12115 176 12377 177 12073 178 12090 179 12230 180 12102 181 11665 182 11796 183 11827 184 11528 185 11510 186 11423 187 11331 188 11332 189 11418 190 11515 191 11338 192 11065 193 11169 194 11089 195 11064 196 11281 197 10871 198 10998 199 10987 200 11113 201 11050 202 11132 203 11082 204 11269 205 11213 206 11514 207 11446 208 11568 209 11805 210 11931 211 11927 212 12068 213 12145 214 12450 215 12322 216 12460 217 12903 218 12993 219 13198 220 13395 221 13621 222 13621 223 13906 224 14236 225 14638 226 14789 227 15219 228 15713 229 16028 230 16418 231 16888 232 17359 233 17734 234 17968 235 18736 236 19353 237 20097 238 20628 239 21512 240 22147 241 22638 242 23686 243 24371 244 25413 245 26168 246 27289 247 27972 248 29304 249 30143 250 31745 251 33050 252 34180 253 35466 254 36748 255 38273 256 39110 257 41648 258 43248 259 44060 260 46336 261 48011 262 49234 263 51846 264 53517 265 55998 266 58198 267 60618 268 63242 269 65725 270 67938 271 70881 272 73669 273 76866 274 80279 275 83739 276 88032 277 90957 278 94114 279 97336 280 101174 281 105085 282 108775 283 113005 284 117068 285 121918 286 126369 287 130997 288 135546 289 140645 290 146398 291 152521 292 157442 293 162397 294 170064 295 174597 296 181474 297 188634 298 194971 299 201479 300 208547 301 216546 302 223505 303 231209 304 239447 305 246982 306 255466 307 263033 308 271323 309 280901 310 290162 311 298416 312 307969 313 318128 314 327944 315 338231 316 347484 317 358425 318 369756 319 379102 320 390234 321 403022 322 415569 323 425771 324 439165 325 451547 326 462547 327 474667 328 486180 329 499893 330 512566 331 527215 332 539502 333 553461 334 566432 335 580826 336 595442 337 607706 338 621588 339 634949 340 650745 341 666563 342 681213 343 696305 344 712375 345 727256 346 739476 347 754598 348 771736 349 785281 350 798501 351 814652 352 833565 353 848559 354 861413 355 877919 356 893739 357 907894 358 921205 359 936283 360 951376 361 966147 362 983781 363 998579 364 1011731 365 1025722 366 1041949 367 1053679 368 1067058 369 1078469 370 1094399 371 1107291 372 1119319 373 1132599 374 1149434 375 1159666 376 1174439 377 1183892 378 1194468 379 1206663 380 1218635 381 1230048 382 1239722 383 1250329 384 1263048 385 1273399 386 1283838 387 1293550 388 1302234 389 1309105 390 1316294 391 1326989 392 1333885 393 1343121 394 1349458 395 1358542 396 1367012 397 1372050 398 1378375 399 1385332 400 1391625 401 1396088 402 1399985 403 1406579 404 1413756 405 1416980 406 1419355 407 1424625 408 1427960 409 1431132 410 1432979 411 1436182 412 1437711 413 1440013 414 1443187 415 1442527 416 1443451 417 1446162 418 1447709 419 1448813 420 1446091 421 1447485 422 1445640 423 1444222 424 1441545 425 1440327 426 1438532 427 1440186 428 1439664 429 1438615 430 1437207 431 1431732 432 1428557 433 1423516 434 1421857 435 1419271 436 1416421 437 1411984 438 1411317 439 1405081 440 1401264 441 1399045 442 1392374 443 1386757 444 1383226 445 1378208 446 1372169 447 1367563 448 1361334 449 1357001 450 1353566 451 1346745 452 1336487 453 1334616 454 1328377 455 1320514 456 1314776 457 1308554 458 1300858 459 1297371 460 1291949 461 1285446 462 1277289 463 1267789 464 1262283 465 1254411 466 1248088 467 1240117 468 1235802 469 1227614 470 1219452 471 1210575 472 1204414 473 1195850 474 1188124 475 1181506 476 1171324 477 1164207 478 1157991 479 1151234 480 1141613 481 1134446 482 1126374 483 1117967 484 1110282 485 1102064 486 1093759 487 1084741 488 1078041 489 1069519 490 1061339 491 1054463 492 1045785 493 1037539 494 1029629 495 1022301 496 1012887 497 1004946 498 995652 499 987688 500 980720 501 971319 502 963828 503 957299 504 948352 505 939874 506 931668 507 922423 508 914814 509 906724 510 899339 511 891302 512 883405 513 876085 514 867691 515 859301 516 851229 517 841406 518 835926 519 826444 520 820360 521 812356 522 803821 523 795429 524 788890 525 780934 526 772431 527 763931 528 757291 529 747902 530 741014 531 733962 532 724813 533 718502 534 710901 535 703546 536 694719 537 687846 538 680213 539 673046 540 667005 541 657443 542 651944 543 643626 544 635758 545 630538 546 620982 547 613122 548 605571 549 600294 550 592913 551 585857 552 579282 553 571564 554 565110 555 559770 556 550891 557 543421 558 537669 559 531815 560 525581 561 518427 562 511809 563 505957 564 500132 565 493348 566 486425 567 480174 568 474869 569 467216 570 461370 571 455988 572 450199 573 443393 574 438387 575 432829 576 427045 577 421975 578 415366 579 409904 580 404318 581 397893 582 393814 583 387859 584 382242 585 376908 586 371885 587 365580 588 361765 589 356321 590 351613 591 346830 592 340030 593 335342 594 330376 595 326182 596 322037 597 317211 598 312147 599 306648 600 302548 601 299021 602 293621 603 288883 604 283996 605 280700 606 275282 607 271093 608 268018 609 263718 610 258636 611 255516 612 251097 613 246494 614 243187 615 238748 616 236422 617 232794 618 228522 619 224397 620 221585 621 217345 622 213497 623 210961 624 207437 625 203714 626 201054 627 196940 628 193847 629 191655 630 187231 631 184598 632 181467 633 178319 634 175197 635 171968 636 170182 637 166456 638 163844 639 160961 640 158496 641 155672 642 153820 643 150264 644 148694 645 146106 646 143350 647 140999 648 138106 649 136302 650 133749 651 130891 652 128403 653 125985 654 124081 655 122056 656 119483 657 118000 658 115721 659 113738 660 111362 661 108917 662 107996 663 105619 664 104404 665 101380 666 99332 667 98539 668 96440 669 95229 670 93670 671 91769 672 89986 673 88622 674 86336 675 84765 676 83820 677 81706 678 80587 679 78909 680 77583 681 76221 682 74302 683 73823 684 72293 685 71112 686 68959 687 67677 688 66874 689 65522 690 64516 691 63198 692 61879 693 60689 694 59266 695 58181 696 57390 697 55946 698 55451 699 54169 700 52958 701 52018 702 51351 703 49820 704 49379 705 48163 706 47164 707 46091 708 45095 709 44674 710 44004 711 43062 712 42245 713 41416 714 40675 715 40041 716 39247 717 38705 718 37524 719 37202 720 36398 721 35625 722 35208 723 34409 724 33586 725 32967 726 32080 727 31462 728 31079 729 30412 730 29334 731 29167 732 28540 733 27826 734 27441 735 26721 736 26663 737 25889 738 25557 739 25052 740 24599 741 24039 742 23721 743 23300 744 22601 745 22470 746 22188 747 21479 748 20888 749 20973 750 20299 751 19894 752 19375 753 19188 754 18984 755 18214 756 18153 757 17715 758 17546 759 16935 760 16782 761 16293 762 15814 763 15644 764 15180 765 14989 766 14849 767 14555 768 14234 769 13896 770 13602 771 13597 772 13096 773 12828 774 12624 775 12120 776 12144 777 12036 778 11839 779 11343 780 11441 781 10711 782 10688 783 10652 784 10606 785 9987 786 9904 787 9728 788 9631 789 9205 790 8907 791 8896 792 8772 793 8621 794 8492 795 8155 796 8012 797 7774 798 7835 799 7609 800 7348 801 7174 802 7127 803 7053 804 6925 805 6784 806 6487 807 6692 808 6364 809 6338 810 6031 811 6006 812 6089 813 5690 814 5585 815 5604 816 5519 817 5337 818 5275 819 5014 820 4978 821 5126 822 4822 823 4692 824 4681 825 4438 826 4407 827 4352 828 4334 829 4156 830 4063 831 4147 832 4035 833 4041 834 3910 835 3969 836 4147 837 3625 838 3569 839 3573 840 3240 841 3269 842 3008 843 3019 844 3076 845 2788 846 2823 847 2609 848 2549 849 2503 850 2374 851 2354 852 2324 853 2510 854 2224 855 2172 856 2077 857 2072 858 1987 859 2236 860 1941 861 1828 862 1787 863 1766 864 1743 865 1671 866 1609 867 1580 868 1608 869 1502 870 1507 871 1516 872 1450 873 1462 874 1381 875 1394 876 1336 877 1255 878 1304 879 1260 880 1307 881 1283 882 1190 883 1151 884 1189 885 1173 886 1163 887 1100 888 1150 889 1096 890 1066 891 1086 892 1013 893 985 894 997 895 962 896 959 897 972 898 937 899 906 900 803 901 901 902 869 903 868 904 832 905 831 906 878 907 773 908 791 909 788 910 803 911 721 912 746 913 736 914 688 915 738 916 672 917 712 918 671 919 710 920 657 921 633 922 697 923 641 924 579 925 572 926 590 927 575 928 571 929 558 930 572 931 567 932 495 933 515 934 579 935 498 936 519 937 502 938 498 939 518 940 479 941 427 942 487 943 433 944 459 945 426 946 418 947 419 948 421 949 402 950 403 951 409 952 429 953 403 954 406 955 392 956 370 957 434 958 369 959 373 960 379 961 327 962 366 963 361 964 348 965 316 966 318 967 322 968 354 969 312 970 305 971 290 972 291 973 292 974 290 975 282 976 310 977 350 978 298 979 271 980 254 981 277 982 248 983 248 984 285 985 219 986 257 987 264 988 255 989 241 990 252 991 255 992 243 993 226 994 209 995 196 996 226 997 240 998 193 999 194 1000 227 1001 227 1002 174 1003 192 1004 216 1005 176 1006 195 1007 193 1008 189 1009 177 1010 203 1011 189 1012 172