#SentieonCommandLine: /lustre8/home/ykawai-tnproj-pg/packages/sentieon-genomics-201911/libexec/driver -t 8 -r /lustre8/home/ncbn-pg/data/resource/Homo_sapiens_assembly38.fasta -i HGDP/HGDP00672/HGDP00672.cram --algo InsertSizeMetricAlgo HGDP/HGDP00672/QCmetrics/HGDP00672.InsertSizeMetricAlgo.txt MEDIAN_INSERT_SIZE MEDIAN_ABSOLUTE_DEVIATION MIN_INSERT_SIZE MAX_INSERT_SIZE MEAN_INSERT_SIZE STANDARD_DEVIATION READ_PAIRS PAIR_ORIENTATION WIDTH_OF_10_PERCENT WIDTH_OF_20_PERCENT WIDTH_OF_30_PERCENT WIDTH_OF_40_PERCENT WIDTH_OF_50_PERCENT WIDTH_OF_60_PERCENT WIDTH_OF_70_PERCENT WIDTH_OF_80_PERCENT WIDTH_OF_90_PERCENT WIDTH_OF_99_PERCENT 451.000000 57.000000 2 246323429 457.597136 91.770404 358851243 FR 23 43 67 89 115 143 177 219 291 621 insert_size All_Reads.fr_count 2 249 3 262 4 313 5 298 6 326 7 355 8 299 9 337 10 317 11 298 12 290 13 329 14 359 15 323 16 355 17 380 18 386 19 355 20 366 21 376 22 352 23 400 24 424 25 433 26 452 27 495 28 561 29 665 30 1320 31 1393 32 1566 33 1723 34 1880 35 2131 36 2289 37 2478 38 2650 39 2782 40 3040 41 3152 42 3441 43 3739 44 4057 45 4064 46 4158 47 4310 48 4580 49 4779 50 4713 51 5000 52 5628 53 6427 54 7857 55 8113 56 8408 57 8528 58 9770 59 9646 60 10839 61 13050 62 13354 63 14260 64 15260 65 15297 66 16258 67 16495 68 17598 69 18002 70 17929 71 17938 72 18146 73 18734 74 19529 75 18993 76 19184 77 18795 78 19318 79 19675 80 19392 81 19212 82 18827 83 19476 84 20038 85 20022 86 19745 87 19391 88 19460 89 20028 90 19695 91 19371 92 19420 93 19740 94 20297 95 20012 96 20047 97 19940 98 20346 99 20755 100 20603 101 20304 102 20246 103 20756 104 20868 105 20161 106 20119 107 20112 108 20653 109 20637 110 20160 111 19800 112 19701 113 20098 114 20293 115 19923 116 19703 117 19086 118 19775 119 20126 120 20296 121 19886 122 19850 123 20097 124 20432 125 20360 126 19941 127 19740 128 19778 129 19697 130 19666 131 19228 132 19327 133 19217 134 19557 135 19081 136 18849 137 18915 138 18814 139 18887 140 18849 141 18423 142 18026 143 18284 144 17975 145 17886 146 17687 147 17516 148 17863 149 17959 150 17916 151 17734 152 17686 153 18021 154 18434 155 17359 156 17606 157 17011 158 17222 159 17076 160 16760 161 16614 162 16334 163 16217 164 16389 165 16012 166 15629 167 15879 168 15524 169 15509 170 15628 171 15437 172 15099 173 15070 174 15104 175 15022 176 14798 177 14498 178 14572 179 14432 180 14503 181 14578 182 14775 183 14885 184 14909 185 14625 186 14209 187 13968 188 14163 189 14086 190 14139 191 13875 192 13954 193 13967 194 13856 195 13802 196 13543 197 13261 198 13704 199 13585 200 13375 201 13679 202 13173 203 13227 204 13102 205 13442 206 13338 207 13291 208 13396 209 13336 210 13544 211 13302 212 13469 213 13455 214 13688 215 13987 216 14412 217 14675 218 14816 219 15213 220 15048 221 15076 222 15228 223 15219 224 15551 225 15885 226 16344 227 16173 228 16624 229 17050 230 17660 231 18133 232 18452 233 18480 234 19046 235 19622 236 20412 237 20511 238 21425 239 21970 240 22321 241 23367 242 23787 243 24862 244 25548 245 26404 246 27124 247 28065 248 28991 249 30438 250 31455 251 32465 252 33586 253 35311 254 36522 255 37901 256 39363 257 41336 258 42732 259 44252 260 46022 261 48019 262 49879 263 51378 264 53960 265 56207 266 57712 267 60113 268 63027 269 65593 270 67929 271 71104 272 73931 273 76875 274 80023 275 83453 276 87881 277 91323 278 94814 279 97619 280 101198 281 104638 282 108894 283 112436 284 117071 285 121210 286 125479 287 130303 288 134525 289 139129 290 144446 291 150427 292 154870 293 161323 294 166303 295 173028 296 179021 297 185900 298 192324 299 198515 300 205891 301 213305 302 220617 303 228878 304 236716 305 244386 306 252556 307 260010 308 269841 309 277905 310 286466 311 296877 312 305831 313 314482 314 325524 315 335662 316 345051 317 356380 318 366766 319 376834 320 388640 321 399549 322 411994 323 424781 324 435765 325 447701 326 459956 327 472303 328 484682 329 498533 330 512271 331 525844 332 540019 333 553878 334 567350 335 582503 336 597275 337 610318 338 626090 339 641867 340 656207 341 671868 342 687429 343 704400 344 721227 345 736533 346 752518 347 767246 348 783729 349 801808 350 817468 351 834730 352 850597 353 869385 354 886936 355 905494 356 922352 357 938170 358 954725 359 970733 360 990547 361 1007330 362 1022542 363 1043526 364 1061226 365 1078011 366 1093984 367 1112536 368 1130322 369 1148066 370 1163819 371 1179956 372 1197187 373 1213229 374 1228652 375 1245849 376 1262135 377 1278892 378 1293362 379 1310925 380 1322872 381 1339961 382 1354545 383 1369882 384 1384382 385 1400015 386 1413939 387 1429176 388 1442533 389 1452249 390 1465803 391 1479347 392 1491200 393 1506763 394 1518138 395 1529456 396 1540708 397 1552158 398 1564852 399 1573435 400 1585180 401 1594727 402 1605119 403 1614652 404 1622678 405 1632816 406 1641234 407 1652036 408 1657830 409 1665756 410 1671618 411 1678839 412 1685152 413 1689849 414 1694996 415 1701311 416 1708397 417 1710107 418 1715866 419 1720865 420 1722499 421 1725497 422 1729174 423 1729888 424 1731620 425 1732810 426 1737636 427 1739571 428 1739715 429 1740449 430 1740804 431 1742675 432 1740271 433 1738782 434 1738748 435 1737602 436 1735892 437 1736005 438 1734623 439 1734111 440 1731131 441 1726381 442 1722677 443 1720831 444 1714885 445 1709754 446 1707358 447 1703871 448 1702926 449 1696116 450 1690262 451 1688151 452 1680108 453 1674512 454 1669047 455 1663266 456 1657155 457 1652011 458 1643628 459 1638025 460 1631178 461 1625376 462 1619788 463 1610309 464 1602994 465 1596610 466 1589171 467 1581362 468 1575406 469 1564008 470 1557315 471 1549290 472 1540694 473 1533866 474 1523714 475 1513002 476 1505974 477 1497547 478 1489081 479 1478932 480 1472191 481 1461573 482 1453338 483 1442485 484 1433429 485 1425283 486 1414484 487 1404290 488 1395517 489 1385418 490 1375729 491 1365552 492 1358047 493 1347201 494 1335712 495 1325181 496 1316319 497 1307286 498 1297004 499 1287726 500 1278050 501 1267764 502 1258943 503 1249420 504 1236914 505 1226719 506 1216932 507 1207760 508 1197619 509 1188543 510 1175874 511 1166096 512 1155668 513 1146195 514 1136678 515 1125157 516 1114698 517 1107833 518 1095066 519 1086151 520 1075823 521 1065377 522 1055687 523 1046766 524 1035408 525 1026945 526 1015852 527 1003569 528 997034 529 986567 530 976393 531 965316 532 956588 533 944364 534 937810 535 926048 536 919052 537 908883 538 899087 539 890060 540 879702 541 869604 542 858901 543 852145 544 843547 545 833586 546 823766 547 813929 548 805739 549 796458 550 788405 551 779346 552 768101 553 759335 554 750106 555 740785 556 732299 557 722666 558 715136 559 706588 560 698861 561 690579 562 680931 563 675028 564 665279 565 657125 566 647936 567 639055 568 632822 569 624379 570 617495 571 609282 572 601715 573 594307 574 585802 575 577182 576 570048 577 563177 578 556375 579 548328 580 541246 581 533994 582 526833 583 519016 584 511653 585 505402 586 497774 587 491589 588 484111 589 477825 590 470737 591 465224 592 458175 593 451570 594 444968 595 439442 596 433215 597 427139 598 421414 599 413266 600 408257 601 401031 602 397166 603 389814 604 384768 605 378589 606 373146 607 368784 608 360699 609 357936 610 351766 611 344777 612 339230 613 334916 614 329989 615 323236 616 319470 617 314181 618 309524 619 304268 620 300591 621 295722 622 289310 623 286271 624 280843 625 275579 626 272449 627 268293 628 263880 629 258016 630 255112 631 250941 632 246082 633 242130 634 238200 635 234197 636 230231 637 226855 638 223416 639 219177 640 215071 641 211602 642 209008 643 204525 644 201824 645 198423 646 195039 647 191514 648 187568 649 184195 650 180877 651 178035 652 176244 653 172598 654 169494 655 166704 656 164455 657 160770 658 156268 659 155398 660 152375 661 149219 662 146820 663 144749 664 142285 665 139299 666 136667 667 134421 668 132239 669 129143 670 127400 671 124805 672 122423 673 120216 674 118175 675 116420 676 113381 677 111733 678 109571 679 107299 680 105741 681 103431 682 102031 683 99225 684 97932 685 96254 686 94144 687 92534 688 90855 689 89307 690 87496 691 85632 692 83898 693 82229 694 81140 695 79831 696 78318 697 76119 698 75136 699 72983 700 71651 701 70839 702 69094 703 68040 704 66717 705 65545 706 64182 707 62866 708 61532 709 60617 710 59304 711 57772 712 57579 713 55553 714 55033 715 53564 716 52616 717 51415 718 50594 719 49812 720 48649 721 47930 722 46845 723 46132 724 45159 725 44711 726 43369 727 42150 728 42043 729 40973 730 39997 731 39711 732 38494 733 38190 734 37131 735 36260 736 35933 737 35008 738 34266 739 33534 740 33275 741 32329 742 31875 743 31433 744 30734 745 29954 746 29368 747 28889 748 28346 749 27691 750 27060 751 26647 752 26122 753 25441 754 24741 755 24647 756 24220 757 23764 758 23213 759 22542 760 22389 761 21552 762 21118 763 20702 764 20369 765 19825 766 19576 767 19366 768 18947 769 18463 770 18255 771 17911 772 17552 773 17260 774 16911 775 16411 776 16127 777 15799 778 15342 779 14937 780 14727 781 14436 782 14147 783 14132 784 13690 785 13234 786 12971 787 12945 788 12619 789 12421 790 12012 791 11517 792 11451 793 11189 794 11023 795 10602 796 10545 797 10224 798 9854 799 9725 800 9599 801 9578 802 9258 803 9017 804 8857 805 8774 806 8600 807 8470 808 8213 809 8173 810 7907 811 7770 812 7597 813 7534 814 7394 815 7269 816 7034 817 6931 818 6712 819 6540 820 6439 821 6499 822 6097 823 5966 824 5727 825 5697 826 5679 827 5550 828 5460 829 5164 830 5107 831 5041 832 4888 833 4868 834 4867 835 4736 836 4579 837 4657 838 4594 839 4494 840 4491 841 4237 842 4180 843 4359 844 4498 845 3751 846 3621 847 3595 848 3424 849 3303 850 3153 851 3253 852 2931 853 2772 854 2708 855 2683 856 2589 857 2631 858 2580 859 2524 860 2430 861 2394 862 2352 863 2544 864 2253 865 2171 866 2177 867 2014 868 1916 869 1870 870 1938 871 1990 872 1767 873 1683 874 1681 875 1644 876 1572 877 1554 878 1583 879 1443 880 1461 881 1519 882 1373 883 1373 884 1313 885 1284 886 1256 887 1208 888 1246 889 1255 890 1238 891 1151 892 1134 893 1178 894 1108 895 1081 896 1075 897 1024 898 1028 899 1008 900 1013 901 995 902 938 903 913 904 956 905 893 906 878 907 822 908 841 909 863 910 820 911 796 912 815 913 786 914 788 915 737 916 796 917 701 918 721 919 674 920 729 921 710 922 610 923 677 924 669 925 609 926 644 927 632 928 642 929 574 930 559 931 622 932 592 933 555 934 500 935 495 936 534 937 497 938 543 939 522 940 528 941 504 942 470 943 456 944 457 945 428 946 446 947 449 948 428 949 423 950 414 951 411 952 396 953 416 954 374 955 403 956 358 957 409 958 376 959 377 960 377 961 326 962 366 963 334 964 362 965 350 966 341 967 310 968 340 969 299 970 323 971 308 972 295 973 296 974 313 975 298 976 300 977 314 978 317 979 279 980 290 981 281 982 235 983 260 984 251 985 249 986 269 987 255 988 258 989 267 990 218 991 236 992 246 993 225 994 228 995 226 996 213 997 203 998 237 999 209 1000 215 1001 222 1002 216 1003 191 1004 239 1005 189 1006 225 1007 211 1008 178 1009 212 1010 191 1011 163 1012 171 1013 193 1014 178 1015 156 1016 175 1017 179 1018 158 1019 156 1020 166 1021 139