#SentieonCommandLine: /lustre8/home/ykawai-tnproj-pg/packages/sentieon-genomics-201911/libexec/driver -t 8 -r /lustre8/home/ncbn-pg/data/resource/Homo_sapiens_assembly38.fasta -i HGDP/HGDP00675/HGDP00675.cram --algo InsertSizeMetricAlgo HGDP/HGDP00675/QCmetrics/HGDP00675.InsertSizeMetricAlgo.txt MEDIAN_INSERT_SIZE MEDIAN_ABSOLUTE_DEVIATION MIN_INSERT_SIZE MAX_INSERT_SIZE MEAN_INSERT_SIZE STANDARD_DEVIATION READ_PAIRS PAIR_ORIENTATION WIDTH_OF_10_PERCENT WIDTH_OF_20_PERCENT WIDTH_OF_30_PERCENT WIDTH_OF_40_PERCENT WIDTH_OF_50_PERCENT WIDTH_OF_60_PERCENT WIDTH_OF_70_PERCENT WIDTH_OF_80_PERCENT WIDTH_OF_90_PERCENT WIDTH_OF_99_PERCENT 443.000000 63.000000 2 245834711 453.672819 101.144689 394579619 FR 25 49 73 99 127 157 193 241 323 673 insert_size All_Reads.fr_count 2 455 3 486 4 505 5 510 6 508 7 628 8 694 9 730 10 802 11 861 12 1015 13 1045 14 1028 15 1218 16 1172 17 1212 18 1459 19 2773 20 3716 21 3576 22 3938 23 4149 24 4881 25 5184 26 5471 27 5562 28 5867 29 6198 30 6824 31 7052 32 7323 33 7612 34 8240 35 8416 36 8830 37 9086 38 9732 39 10212 40 10528 41 11077 42 10902 43 11619 44 12171 45 12534 46 12551 47 13073 48 13524 49 14240 50 13839 51 14367 52 15157 53 15790 54 16345 55 16207 56 16990 57 16984 58 17707 59 18531 60 18269 61 18392 62 18936 63 18927 64 19626 65 19686 66 19672 67 19590 68 19790 69 20537 70 20148 71 20292 72 20345 73 20432 74 21207 75 21237 76 20989 77 20683 78 21038 79 21318 80 20954 81 21375 82 21249 83 22166 84 22553 85 22765 86 22648 87 22641 88 22581 89 22629 90 22631 91 21974 92 22179 93 22596 94 22764 95 22462 96 22072 97 21859 98 22134 99 22286 100 22081 101 22243 102 21465 103 22111 104 22595 105 21806 106 21906 107 21617 108 21876 109 22243 110 21620 111 21475 112 21356 113 22060 114 22581 115 22428 116 22435 117 21784 118 22282 119 22049 120 22203 121 21783 122 21335 123 21797 124 21497 125 21140 126 21054 127 20681 128 20565 129 20759 130 20316 131 20216 132 20074 133 20137 134 20301 135 19754 136 19702 137 19365 138 19245 139 19449 140 19454 141 19258 142 18876 143 18980 144 18965 145 18448 146 18243 147 18596 148 18639 149 19071 150 18522 151 18478 152 18272 153 18156 154 18210 155 17668 156 17688 157 17383 158 17061 159 17339 160 17016 161 16508 162 16784 163 16455 164 16242 165 15879 166 16127 167 15935 168 15767 169 15687 170 15615 171 15570 172 15161 173 14962 174 14795 175 14714 176 14770 177 14518 178 14605 179 14606 180 14218 181 14281 182 14171 183 14267 184 14170 185 14301 186 14194 187 14254 188 14363 189 14456 190 14163 191 13992 192 14161 193 14001 194 14017 195 14096 196 13911 197 14114 198 14280 199 14164 200 14119 201 14061 202 14174 203 14184 204 14152 205 14255 206 14551 207 14613 208 14711 209 14719 210 14815 211 15035 212 15542 213 15751 214 15967 215 16172 216 16433 217 16626 218 16867 219 17385 220 18005 221 18142 222 18684 223 19362 224 20148 225 20276 226 21087 227 21929 228 22892 229 23460 230 24448 231 25215 232 26274 233 27079 234 28163 235 28574 236 30552 237 30951 238 32781 239 34144 240 34990 241 36380 242 37658 243 39746 244 41456 245 42013 246 44480 247 45672 248 48145 249 50167 250 52298 251 54550 252 56719 253 59600 254 61414 255 64424 256 67119 257 69610 258 72687 259 76289 260 79246 261 82352 262 85552 263 89714 264 93519 265 97433 266 101009 267 105639 268 109984 269 114530 270 118940 271 124285 272 129857 273 134710 274 140850 275 146727 276 154480 277 159825 278 166566 279 172440 280 178272 281 185132 282 191697 283 199321 284 206140 285 213827 286 220152 287 229645 288 237087 289 246177 290 253539 291 262949 292 272388 293 281138 294 290765 295 301016 296 309999 297 321812 298 331453 299 342203 300 353503 301 364594 302 374938 303 388295 304 399216 305 411056 306 423617 307 437180 308 448572 309 461781 310 474921 311 489501 312 504019 313 517329 314 531674 315 544907 316 560111 317 573897 318 589749 319 603539 320 621616 321 634136 322 652284 323 668913 324 685323 325 699206 326 715607 327 729432 328 747052 329 762974 330 779957 331 797371 332 814092 333 831345 334 847540 335 865678 336 884628 337 900364 338 917645 339 933912 340 951925 341 969100 342 987761 343 1005031 344 1023477 345 1041210 346 1057858 347 1074143 348 1093472 349 1109291 350 1124575 351 1142039 352 1160881 353 1176298 354 1197452 355 1210951 356 1227434 357 1244972 358 1259752 359 1274715 360 1290258 361 1305268 362 1320934 363 1338136 364 1350813 365 1370119 366 1383844 367 1397243 368 1411235 369 1424853 370 1438152 371 1448948 372 1463816 373 1476481 374 1492965 375 1504109 376 1516780 377 1531209 378 1539449 379 1549489 380 1561302 381 1570262 382 1581481 383 1592885 384 1606087 385 1613172 386 1624480 387 1632108 388 1642028 389 1648554 390 1657978 391 1663935 392 1671557 393 1680212 394 1687029 395 1693996 396 1702149 397 1707048 398 1714730 399 1721148 400 1726575 401 1728300 402 1732304 403 1737108 404 1741905 405 1743341 406 1749719 407 1753134 408 1755823 409 1755993 410 1758440 411 1761115 412 1761599 413 1761035 414 1762967 415 1763985 416 1764333 417 1765502 418 1766814 419 1763940 420 1762659 421 1761775 422 1760352 423 1756970 424 1759632 425 1753117 426 1749788 427 1751564 428 1746625 429 1747290 430 1741725 431 1735883 432 1733836 433 1728221 434 1725146 435 1719199 436 1717586 437 1713175 438 1709442 439 1706766 440 1698732 441 1692542 442 1685282 443 1680631 444 1675760 445 1669556 446 1665175 447 1658345 448 1653308 449 1648050 450 1636820 451 1632208 452 1624644 453 1615785 454 1610974 455 1603728 456 1594612 457 1587722 458 1581726 459 1573918 460 1567256 461 1556602 462 1550341 463 1542098 464 1532991 465 1523777 466 1515835 467 1509676 468 1500453 469 1491405 470 1484732 471 1476293 472 1467261 473 1459032 474 1447861 475 1440197 476 1433518 477 1423651 478 1414810 479 1404695 480 1397113 481 1387354 482 1380147 483 1371330 484 1360612 485 1352307 486 1343302 487 1334570 488 1327649 489 1317638 490 1307451 491 1298812 492 1287561 493 1280799 494 1271969 495 1260686 496 1253181 497 1241736 498 1235385 499 1227031 500 1217744 501 1208062 502 1199429 503 1191100 504 1182751 505 1172674 506 1162139 507 1152162 508 1144108 509 1136005 510 1127799 511 1119440 512 1109393 513 1099425 514 1091472 515 1083054 516 1075601 517 1064784 518 1056513 519 1048504 520 1038326 521 1031726 522 1021520 523 1013084 524 1006011 525 996687 526 988053 527 980550 528 969941 529 962560 530 953864 531 945723 532 937499 533 929894 534 920648 535 914525 536 906286 537 898045 538 888915 539 880463 540 870779 541 863181 542 855354 543 848776 544 841809 545 833245 546 825606 547 817287 548 807785 549 802266 550 795900 551 788068 552 776701 553 769826 554 763248 555 753702 556 745438 557 739246 558 732974 559 724413 560 718298 561 710046 562 702042 563 696119 564 688265 565 681377 566 675358 567 666586 568 659508 569 652647 570 645095 571 638393 572 632430 573 625358 574 619096 575 612976 576 607063 577 599768 578 593671 579 586319 580 580768 581 573960 582 566599 583 562394 584 555394 585 548004 586 542290 587 537575 588 529742 589 525540 590 518782 591 511909 592 507359 593 500902 594 494503 595 489618 596 482808 597 479253 598 473046 599 466972 600 462738 601 455726 602 450591 603 446373 604 440426 605 434416 606 429715 607 424861 608 418972 609 413769 610 408976 611 404613 612 399320 613 394574 614 390325 615 385661 616 381715 617 374873 618 371562 619 367445 620 361139 621 355376 622 352209 623 347227 624 343841 625 338590 626 334791 627 329566 628 324449 629 322223 630 316991 631 312704 632 308254 633 303562 634 299751 635 296328 636 293284 637 288449 638 285758 639 280656 640 277520 641 273889 642 269903 643 266318 644 261761 645 259987 646 255492 647 252418 648 249128 649 245961 650 242012 651 237836 652 234913 653 231539 654 228781 655 226074 656 221789 657 219266 658 215760 659 213449 660 210134 661 206317 662 203757 663 201792 664 198500 665 195431 666 192930 667 189596 668 186919 669 184095 670 181659 671 179270 672 176021 673 174391 674 171926 675 168828 676 166468 677 163379 678 161099 679 159380 680 156900 681 154280 682 152099 683 149982 684 145909 685 144864 686 142683 687 141069 688 138880 689 136561 690 134802 691 132296 692 130063 693 127924 694 126563 695 124265 696 122843 697 120036 698 118130 699 116245 700 114294 701 112824 702 110488 703 109199 704 107549 705 106151 706 103411 707 102443 708 100887 709 99029 710 97310 711 96217 712 94429 713 93212 714 90877 715 89921 716 88309 717 86666 718 85739 719 84138 720 82818 721 81650 722 79526 723 79120 724 77200 725 75747 726 74930 727 73906 728 71933 729 71077 730 69808 731 68958 732 68220 733 66860 734 65498 735 64523 736 63883 737 62225 738 61196 739 60684 740 59649 741 58586 742 57682 743 56983 744 55748 745 54359 746 53845 747 52621 748 51662 749 51294 750 49990 751 49365 752 48303 753 47483 754 46430 755 45721 756 44910 757 44434 758 43692 759 42966 760 42000 761 41223 762 40638 763 39981 764 38963 765 38334 766 37900 767 36575 768 36091 769 35827 770 34740 771 34523 772 33801 773 33278 774 32780 775 31852 776 31397 777 30895 778 30405 779 29853 780 29264 781 28648 782 28447 783 27612 784 27273 785 26851 786 25997 787 25778 788 25150 789 24759 790 24090 791 23727 792 23031 793 22772 794 22262 795 21735 796 21439 797 21279 798 20817 799 20189 800 19997 801 19449 802 18891 803 18654 804 18697 805 18322 806 17790 807 17760 808 17252 809 16856 810 16433 811 16349 812 16055 813 15551 814 15470 815 15373 816 14960 817 14307 818 14335 819 14082 820 13856 821 13480 822 13360 823 12900 824 12747 825 12703 826 12423 827 12164 828 11870 829 11605 830 11563 831 11308 832 11176 833 10866 834 10678 835 10517 836 10236 837 10150 838 10018 839 9772 840 9792 841 9615 842 9399 843 9009 844 8961 845 9142 846 8441 847 8291 848 8067 849 7852 850 7748 851 7640 852 7643 853 7496 854 7462 855 7136 856 7045 857 6897 858 6700 859 6544 860 6512 861 6330 862 6154 863 6048 864 6072 865 5955 866 5719 867 5714 868 5620 869 5688 870 5523 871 5273 872 5039 873 4954 874 4934 875 4874 876 4776 877 4843 878 4615 879 4213 880 4078 881 4034 882 3941 883 3909 884 3810 885 3788 886 3860 887 3609 888 3573 889 3506 890 3366 891 3330 892 3365 893 3155 894 3102 895 3311 896 3220 897 2867 898 2831 899 2719 900 2543 901 2597 902 2598 903 2483 904 2508 905 2426 906 2393 907 2320 908 2285 909 2198 910 2250 911 2122 912 2049 913 2015 914 1958 915 1946 916 1880 917 1873 918 1879 919 1891 920 1748 921 1788 922 1716 923 1679 924 1718 925 1679 926 1592 927 1535 928 1580 929 1528 930 1513 931 1543 932 1457 933 1408 934 1469 935 1383 936 1341 937 1297 938 1313 939 1190 940 1198 941 1156 942 1184 943 1166 944 1121 945 1086 946 1072 947 1103 948 1044 949 1031 950 1018 951 983 952 958 953 958 954 973 955 977 956 887 957 912 958 873 959 843 960 886 961 842 962 872 963 913 964 778 965 791 966 844 967 764 968 782 969 765 970 728 971 724 972 678 973 723 974 649 975 689 976 701 977 679 978 660 979 633 980 631 981 585 982 657 983 551 984 607 985 555 986 559 987 609 988 562 989 534 990 544 991 512 992 535 993 518 994 507 995 477 996 485 997 508 998 422 999 477 1000 467 1001 466 1002 475 1003 437 1004 428 1005 443 1006 431 1007 479 1008 451 1009 405 1010 396 1011 382 1012 389 1013 358 1014 384 1015 393 1016 380 1017 373 1018 361 1019 358 1020 351 1021 301 1022 323 1023 304 1024 329 1025 297 1026 282 1027 311 1028 302 1029 284 1030 282 1031 285 1032 301 1033 296 1034 298 1035 272 1036 280 1037 292 1038 280 1039 305 1040 249 1041 269 1042 274 1043 254 1044 268 1045 245 1046 219 1047 243 1048 229 1049 232 1050 196 1051 240 1052 195 1053 209 1054 209 1055 229 1056 220 1057 210 1058 201 1059 203 1060 189 1061 201 1062 196 1063 178 1064 182 1065 191 1066 181 1067 199 1068 184 1069 196 1070 185 1071 179 1072 167 1073 155