#SentieonCommandLine: /lustre8/home/ykawai-tnproj-pg/packages/sentieon-genomics-201911/libexec/driver -t 8 -r /lustre8/home/ncbn-pg/data/resource/Homo_sapiens_assembly38.fasta -i HGDP/HGDP00697/HGDP00697.cram --algo InsertSizeMetricAlgo HGDP/HGDP00697/QCmetrics/HGDP00697.InsertSizeMetricAlgo.txt MEDIAN_INSERT_SIZE MEDIAN_ABSOLUTE_DEVIATION MIN_INSERT_SIZE MAX_INSERT_SIZE MEAN_INSERT_SIZE STANDARD_DEVIATION READ_PAIRS PAIR_ORIENTATION WIDTH_OF_10_PERCENT WIDTH_OF_20_PERCENT WIDTH_OF_30_PERCENT WIDTH_OF_40_PERCENT WIDTH_OF_50_PERCENT WIDTH_OF_60_PERCENT WIDTH_OF_70_PERCENT WIDTH_OF_80_PERCENT WIDTH_OF_90_PERCENT WIDTH_OF_99_PERCENT 456.000000 71.000000 2 246630357 476.367909 123.869967 373973717 FR 27 55 83 111 143 177 217 275 397 851 insert_size All_Reads.fr_count 2 1414 3 1538 4 1537 5 1577 6 1560 7 1605 8 1586 9 1623 10 1664 11 1649 12 1623 13 1743 14 1767 15 1708 16 1934 17 1699 18 2051 19 4367 20 4804 21 4731 22 5016 23 5484 24 6084 25 6403 26 6584 27 6767 28 7062 29 7544 30 7899 31 8185 32 8625 33 9282 34 10035 35 10309 36 10629 37 11023 38 11739 39 12355 40 12789 41 12919 42 13261 43 14053 44 14845 45 14725 46 15030 47 15189 48 16502 49 16942 50 16866 51 17384 52 17336 53 18342 54 19192 55 18937 56 18888 57 19356 58 20184 59 20847 60 21083 61 21143 62 21146 63 21909 64 22305 65 22119 66 22369 67 22255 68 23150 69 24128 70 23483 71 23981 72 24069 73 24827 74 25212 75 24359 76 24654 77 24221 78 24894 79 25458 80 24744 81 24347 82 24004 83 25003 84 25975 85 25533 86 25415 87 24696 88 25070 89 25307 90 25296 91 24817 92 24357 93 24995 94 25582 95 25101 96 24572 97 24165 98 24771 99 25014 100 24523 101 24239 102 23841 103 24815 104 24919 105 24385 106 23841 107 23653 108 24229 109 24477 110 23953 111 23584 112 23881 113 23919 114 24558 115 23749 116 23718 117 23186 118 23632 119 23666 120 23400 121 23016 122 22383 123 22992 124 23007 125 22628 126 22184 127 21698 128 22083 129 22100 130 22124 131 21676 132 21239 133 21581 134 21422 135 21191 136 20994 137 20920 138 20989 139 21198 140 20702 141 20804 142 20079 143 20339 144 20315 145 19764 146 19738 147 19463 148 19280 149 19026 150 18868 151 18657 152 18778 153 18599 154 18862 155 18282 156 17932 157 17691 158 17954 159 17924 160 17382 161 17316 162 17239 163 17067 164 16863 165 16755 166 16491 167 16408 168 16498 169 16085 170 16274 171 16129 172 15960 173 15913 174 15608 175 15530 176 15514 177 15666 178 15375 179 15138 180 14923 181 14820 182 14709 183 14550 184 14665 185 14031 186 14344 187 14230 188 14339 189 14025 190 13916 191 13594 192 13512 193 13616 194 13552 195 12968 196 13109 197 13225 198 13078 199 13061 200 12767 201 12951 202 13001 203 12885 204 12994 205 12504 206 12534 207 12651 208 12725 209 13005 210 13014 211 13015 212 13091 213 13029 214 12998 215 13003 216 13361 217 13178 218 13522 219 13570 220 13477 221 13925 222 13903 223 14143 224 14451 225 14357 226 14578 227 14757 228 15004 229 15259 230 15573 231 15989 232 16359 233 16442 234 16969 235 17267 236 17698 237 18125 238 18851 239 19358 240 19907 241 20633 242 20952 243 21851 244 22735 245 23591 246 24316 247 25151 248 25974 249 27347 250 28537 251 29899 252 30800 253 32362 254 33660 255 34825 256 36651 257 38262 258 39985 259 41824 260 44017 261 46043 262 48111 263 50598 264 52977 265 55298 266 57886 267 60433 268 63938 269 67305 270 70362 271 74821 272 78334 273 82350 274 87543 275 91750 276 97765 277 101783 278 106229 279 110402 280 114348 281 118611 282 124829 283 129793 284 135032 285 140995 286 146279 287 153202 288 159501 289 165643 290 172798 291 180762 292 187605 293 195175 294 203204 295 211372 296 219154 297 228308 298 236622 299 245001 300 256471 301 265576 302 274339 303 284823 304 295523 305 305651 306 314877 307 326049 308 338625 309 349601 310 361402 311 373016 312 384430 313 397638 314 411447 315 424593 316 436706 317 449658 318 462962 319 476290 320 490357 321 504306 322 517078 323 534054 324 548338 325 562790 326 576048 327 591699 328 607084 329 623020 330 638799 331 653809 332 669690 333 686054 334 703460 335 718682 336 734758 337 749826 338 764165 339 780987 340 797621 341 814447 342 832714 343 849290 344 864431 345 884926 346 899820 347 916565 348 932257 349 947898 350 964740 351 977408 352 997570 353 1012862 354 1026974 355 1042913 356 1059573 357 1074367 358 1088031 359 1105259 360 1119352 361 1134267 362 1147140 363 1163056 364 1176482 365 1192707 366 1205858 367 1220189 368 1231254 369 1243515 370 1255361 371 1269522 372 1279286 373 1292086 374 1305016 375 1317779 376 1331708 377 1339567 378 1350886 379 1358084 380 1369382 381 1377638 382 1387183 383 1394182 384 1407223 385 1416986 386 1427558 387 1433931 388 1440458 389 1446158 390 1455000 391 1457880 392 1465081 393 1472957 394 1477286 395 1482779 396 1491268 397 1495292 398 1500480 399 1507363 400 1511013 401 1513742 402 1516948 403 1517182 404 1523028 405 1526108 406 1527983 407 1531840 408 1533471 409 1536156 410 1536066 411 1537339 412 1535434 413 1538342 414 1538556 415 1536523 416 1537215 417 1537979 418 1537775 419 1540078 420 1537110 421 1535558 422 1533513 423 1528343 424 1525788 425 1525140 426 1523534 427 1520201 428 1522717 429 1519034 430 1513928 431 1509661 432 1507234 433 1502063 434 1496114 435 1492748 436 1493542 437 1489220 438 1484388 439 1480385 440 1474853 441 1469499 442 1465480 443 1460518 444 1455659 445 1450330 446 1444348 447 1440662 448 1438073 449 1431638 450 1426602 451 1420220 452 1414213 453 1405752 454 1398943 455 1392611 456 1388169 457 1382545 458 1379335 459 1371974 460 1364622 461 1359171 462 1353459 463 1343234 464 1337802 465 1332355 466 1323773 467 1318686 468 1312697 469 1307736 470 1300964 471 1293218 472 1287003 473 1281303 474 1272013 475 1264047 476 1256215 477 1251805 478 1245537 479 1239777 480 1231589 481 1225417 482 1216597 483 1211829 484 1202513 485 1195286 486 1190352 487 1181051 488 1173977 489 1169593 490 1161541 491 1155535 492 1148094 493 1140901 494 1135680 495 1123851 496 1119892 497 1112220 498 1104729 499 1097153 500 1092449 501 1086067 502 1079330 503 1070951 504 1064036 505 1058689 506 1049028 507 1042585 508 1037272 509 1031006 510 1023694 511 1016502 512 1009212 513 1002273 514 998282 515 989204 516 982136 517 974753 518 968312 519 963626 520 955952 521 949152 522 943277 523 936867 524 929736 525 922700 526 915277 527 908158 528 902164 529 895121 530 891748 531 883607 532 878145 533 872552 534 865430 535 858129 536 853963 537 846196 538 838999 539 833855 540 824574 541 822231 542 816052 543 809541 544 804113 545 797511 546 791318 547 785110 548 778432 549 772145 550 767446 551 761679 552 755906 553 749940 554 745288 555 738900 556 732324 557 726897 558 720416 559 715127 560 710387 561 703319 562 697274 563 692454 564 686573 565 682015 566 675723 567 669467 568 666347 569 659247 570 652475 571 648005 572 643170 573 639334 574 630439 575 628994 576 622557 577 615973 578 610064 579 607052 580 602116 581 596120 582 591117 583 586535 584 581432 585 577374 586 571064 587 565452 588 562945 589 556012 590 551491 591 545898 592 541506 593 536419 594 531785 595 529363 596 523957 597 519767 598 512912 599 510926 600 504299 601 501590 602 496852 603 491597 604 487183 605 482662 606 478710 607 476070 608 470317 609 466069 610 461957 611 457399 612 454471 613 450351 614 445257 615 443432 616 439313 617 435348 618 430992 619 428317 620 422637 621 420066 622 416361 623 412440 624 408690 625 405432 626 401203 627 397556 628 393746 629 390201 630 387184 631 382564 632 380498 633 376259 634 373306 635 369554 636 366688 637 363216 638 359804 639 357032 640 354611 641 350730 642 347807 643 343991 644 341771 645 339052 646 335467 647 331821 648 329703 649 326334 650 323161 651 319368 652 316778 653 315134 654 311656 655 308651 656 306211 657 303833 658 301076 659 298835 660 296509 661 293214 662 291022 663 288680 664 284741 665 282743 666 281552 667 277917 668 274893 669 272535 670 270717 671 268500 672 265668 673 263291 674 260469 675 258075 676 257427 677 254857 678 252196 679 249279 680 248034 681 244194 682 242984 683 240708 684 238588 685 236253 686 233657 687 231181 688 228911 689 227891 690 225733 691 223338 692 221302 693 218950 694 217372 695 215669 696 213267 697 211501 698 210220 699 207214 700 204451 701 203526 702 202274 703 200034 704 198660 705 196998 706 193950 707 192856 708 190425 709 189887 710 187358 711 185131 712 184635 713 182584 714 181469 715 178851 716 177098 717 175444 718 174763 719 173141 720 171500 721 170048 722 167540 723 166692 724 165403 725 163517 726 162201 727 160229 728 158725 729 157770 730 155450 731 154370 732 153846 733 151882 734 150513 735 148561 736 147140 737 146239 738 144686 739 143637 740 142136 741 141406 742 140241 743 138310 744 136357 745 136065 746 134204 747 134015 748 131287 749 130671 750 129038 751 127738 752 126786 753 125098 754 124857 755 123499 756 121967 757 120706 758 119120 759 119285 760 117491 761 116504 762 115574 763 114081 764 113810 765 112110 766 111056 767 109937 768 108336 769 107588 770 106087 771 105430 772 104607 773 103150 774 102710 775 100765 776 99977 777 99685 778 98646 779 97187 780 96185 781 95958 782 93777 783 93198 784 92078 785 91378 786 89950 787 90198 788 89413 789 87645 790 87187 791 86007 792 85117 793 84502 794 83505 795 82559 796 81863 797 80781 798 79873 799 79163 800 78106 801 77777 802 76311 803 75623 804 74683 805 74397 806 73683 807 72587 808 72002 809 71219 810 70563 811 69800 812 69080 813 68422 814 67538 815 66833 816 66192 817 65459 818 64928 819 64095 820 63196 821 62725 822 61995 823 62039 824 61399 825 60289 826 59678 827 59381 828 58748 829 57969 830 57677 831 56836 832 56111 833 55871 834 55424 835 54664 836 53771 837 53238 838 52914 839 52031 840 52019 841 51586 842 51080 843 50237 844 49731 845 49089 846 48641 847 48014 848 47744 849 46934 850 46707 851 46335 852 45902 853 45458 854 44605 855 43979 856 44131 857 43790 858 43029 859 42698 860 42187 861 41699 862 41027 863 40810 864 40474 865 40132 866 39313 867 39370 868 38485 869 38086 870 37784 871 37142 872 37223 873 36439 874 36577 875 36117 876 35646 877 35306 878 34832 879 34498 880 34443 881 34394 882 33421 883 33659 884 33084 885 32702 886 32255 887 32726 888 31592 889 30922 890 31217 891 30371 892 29833 893 29035 894 29609 895 28809 896 28376 897 28237 898 27977 899 27473 900 27228 901 28137 902 26507 903 25876 904 25993 905 25645 906 25410 907 24908 908 24798 909 24546 910 24354 911 23926 912 23695 913 23445 914 23108 915 23243 916 22864 917 22391 918 22592 919 22173 920 21857 921 21666 922 21596 923 21353 924 21189 925 20717 926 21532 927 21239 928 19447 929 19065 930 19073 931 18769 932 18912 933 18513 934 18306 935 18082 936 18031 937 17817 938 17601 939 17427 940 16903 941 16977 942 16600 943 16728 944 16420 945 16342 946 15965 947 16158 948 15706 949 15542 950 15499 951 15214 952 14926 953 15127 954 14536 955 14664 956 14599 957 14272 958 14519 959 13955 960 13896 961 13631 962 14219 963 13318 964 12946 965 12832 966 12734 967 12353 968 12976 969 12123 970 11759 971 11499 972 11570 973 11611 974 11290 975 11367 976 11197 977 10980 978 10913 979 10904 980 11003 981 10791 982 10608 983 10818 984 10476 985 10091 986 10776 987 10809 988 9527 989 9067 990 9249 991 9156 992 10055 993 8624 994 8619 995 8543 996 8475 997 8035 998 7644 999 7821 1000 7719 1001 7543 1002 7425 1003 7448 1004 7203 1005 7087 1006 7078 1007 6915 1008 7008 1009 6938 1010 6799 1011 6758 1012 6623 1013 6532 1014 6584 1015 6457 1016 6259 1017 6258 1018 6241 1019 6147 1020 6075 1021 5852 1022 5802 1023 5701 1024 5763 1025 5558 1026 5562 1027 5468 1028 5476 1029 5438 1030 5346 1031 5268 1032 5158 1033 5125 1034 5102 1035 5221 1036 4903 1037 4864 1038 4699 1039 4715 1040 4696 1041 4673 1042 4647 1043 4658 1044 4461 1045 4497 1046 4351 1047 4252 1048 4291 1049 4178 1050 4100 1051 4133 1052 4105 1053 4067 1054 3983 1055 3889 1056 3848 1057 3824 1058 3704 1059 3760 1060 3700 1061 3678 1062 3665 1063 3623 1064 3502 1065 3433 1066 3393 1067 3434 1068 3345 1069 3303 1070 3237 1071 3182 1072 3208 1073 3371 1074 3102 1075 3097 1076 3050 1077 3049 1078 2827 1079 2820 1080 2651 1081 2755 1082 2676 1083 2709 1084 2803 1085 2681 1086 2567 1087 2470 1088 2546 1089 2405 1090 2412 1091 2337 1092 2339 1093 2394 1094 2354 1095 2342 1096 2316 1097 2235 1098 2114 1099 2200 1100 2168 1101 2052 1102 2131 1103 2083 1104 2046 1105 1973 1106 2005 1107 2014 1108 2035 1109 1891 1110 1950 1111 1780 1112 1840 1113 1827 1114 1851 1115 1796 1116 1762 1117 1717 1118 1715 1119 1624 1120 1629 1121 1566 1122 1635 1123 1616 1124 1554 1125 1537 1126 1514 1127 1483 1128 1526 1129 1481 1130 1438 1131 1496 1132 1392 1133 1418 1134 1422 1135 1317 1136 1342 1137 1305 1138 1282 1139 1321 1140 1230 1141 1216 1142 1253 1143 1257 1144 1213 1145 1149 1146 1216 1147 1125 1148 1103 1149 1098 1150 1115 1151 1174 1152 1142 1153 1036 1154 1102 1155 1100 1156 1070 1157 1009 1158 1003 1159 972 1160 994 1161 949 1162 952 1163 908 1164 961 1165 920 1166 942