#SentieonCommandLine: /lustre8/home/ykawai-tnproj-pg/packages/sentieon-genomics-201911/libexec/driver -t 8 -r /lustre8/home/ncbn-pg/data/resource/Homo_sapiens_assembly38.fasta -i HGDP/HGDP00699/HGDP00699.cram --algo InsertSizeMetricAlgo HGDP/HGDP00699/QCmetrics/HGDP00699.InsertSizeMetricAlgo.txt MEDIAN_INSERT_SIZE MEDIAN_ABSOLUTE_DEVIATION MIN_INSERT_SIZE MAX_INSERT_SIZE MEAN_INSERT_SIZE STANDARD_DEVIATION READ_PAIRS PAIR_ORIENTATION WIDTH_OF_10_PERCENT WIDTH_OF_20_PERCENT WIDTH_OF_30_PERCENT WIDTH_OF_40_PERCENT WIDTH_OF_50_PERCENT WIDTH_OF_60_PERCENT WIDTH_OF_70_PERCENT WIDTH_OF_80_PERCENT WIDTH_OF_90_PERCENT WIDTH_OF_99_PERCENT 436.000000 68.000000 2 242919786 455.562450 118.121334 342582960 FR 27 53 79 107 137 169 209 265 379 809 insert_size All_Reads.fr_count 2 1342 3 1388 4 1364 5 1489 6 1429 7 1492 8 1463 9 1523 10 1546 11 1570 12 1575 13 1584 14 1601 15 1893 16 1699 17 1608 18 1938 19 4018 20 4315 21 4108 22 4342 23 4753 24 5332 25 5574 26 5892 27 6024 28 6249 29 6797 30 6973 31 7302 32 7693 33 8110 34 8456 35 8721 36 9339 37 9618 38 9972 39 10904 40 11159 41 11236 42 11791 43 12334 44 13042 45 12881 46 13297 47 13593 48 14529 49 14730 50 14499 51 15256 52 14910 53 15882 54 16551 55 16528 56 16839 57 17299 58 17923 59 18532 60 18472 61 18259 62 18553 63 19368 64 19950 65 19440 66 19479 67 19569 68 20427 69 20820 70 20411 71 20549 72 20549 73 21058 74 21748 75 21431 76 21579 77 21562 78 21996 79 22472 80 21927 81 21617 82 21208 83 21847 84 22133 85 22308 86 21688 87 21514 88 21638 89 22654 90 22281 91 21665 92 21581 93 21743 94 22105 95 21627 96 21274 97 21237 98 21409 99 21934 100 21550 101 21056 102 20516 103 21008 104 21610 105 21467 106 21155 107 20717 108 21062 109 21225 110 20855 111 20527 112 20687 113 21105 114 21296 115 20620 116 20520 117 20123 118 20540 119 20250 120 20097 121 19708 122 19451 123 19565 124 19886 125 19592 126 19010 127 18725 128 18941 129 19037 130 18826 131 18523 132 18309 133 18587 134 18316 135 18124 136 17846 137 17705 138 17597 139 17878 140 17800 141 17104 142 17013 143 17059 144 16691 145 16746 146 16481 147 16290 148 16414 149 16328 150 16168 151 15980 152 15517 153 15842 154 15885 155 15481 156 15650 157 15350 158 15151 159 15093 160 14706 161 14561 162 14703 163 14610 164 14486 165 14348 166 14126 167 14130 168 13858 169 13845 170 13605 171 13488 172 13318 173 13263 174 13230 175 13177 176 13009 177 12648 178 12916 179 12739 180 12553 181 12575 182 12445 183 12353 184 12497 185 12309 186 12153 187 11928 188 12239 189 12233 190 12028 191 12050 192 11880 193 11817 194 11810 195 11846 196 11928 197 11684 198 11695 199 11788 200 11869 201 12039 202 12332 203 12384 204 12491 205 12795 206 12602 207 12853 208 13114 209 13514 210 13417 211 13582 212 13810 213 14110 214 14426 215 14674 216 14854 217 15197 218 15487 219 15870 220 16207 221 17003 222 17175 223 17588 224 18023 225 18494 226 19231 227 20047 228 20995 229 21789 230 22348 231 23412 232 24213 233 25456 234 26233 235 27280 236 28692 237 29719 238 30983 239 32672 240 34399 241 35293 242 37017 243 39224 244 40968 245 42708 246 44652 247 46382 248 49015 249 51126 250 53903 251 55984 252 59164 253 61459 254 64832 255 67336 256 70884 257 73862 258 78184 259 81572 260 86537 261 89873 262 93821 263 98720 264 103097 265 108214 266 111938 267 116826 268 121968 269 127327 270 133186 271 139495 272 144272 273 151717 274 157785 275 164389 276 173759 277 180101 278 187273 279 194090 280 199844 281 208465 282 215704 283 224108 284 233058 285 241780 286 250486 287 258972 288 266634 289 276139 290 287331 291 297537 292 308089 293 318606 294 328921 295 340222 296 350608 297 362288 298 374687 299 385580 300 398001 301 410527 302 423073 303 435931 304 449016 305 461402 306 474475 307 488725 308 500847 309 514960 310 529326 311 544809 312 560144 313 573948 314 588602 315 602975 316 618429 317 632062 318 648518 319 664476 320 680419 321 695192 322 711627 323 726913 324 742080 325 758506 326 776699 327 789959 328 806414 329 821006 330 835754 331 853272 332 869524 333 887855 334 904961 335 919356 336 934466 337 950588 338 967101 339 982785 340 995744 341 1008379 342 1027536 343 1040992 344 1058649 345 1071928 346 1086296 347 1101537 348 1114812 349 1126900 350 1142876 351 1152335 352 1166671 353 1181469 354 1195587 355 1206796 356 1220576 357 1230916 358 1241114 359 1253316 360 1262692 361 1272901 362 1284889 363 1295192 364 1306966 365 1316245 366 1328939 367 1334150 368 1343179 369 1351806 370 1359481 371 1368600 372 1376116 373 1381413 374 1389280 375 1397744 376 1404662 377 1408926 378 1415832 379 1419176 380 1425737 381 1429413 382 1434571 383 1438296 384 1441781 385 1447348 386 1450431 387 1454077 388 1456767 389 1460260 390 1463104 391 1463427 392 1462558 393 1465237 394 1468602 395 1469076 396 1469927 397 1472883 398 1473614 399 1470752 400 1470893 401 1469672 402 1470655 403 1469023 404 1465858 405 1465778 406 1466925 407 1464136 408 1461104 409 1458814 410 1457778 411 1453662 412 1450774 413 1449822 414 1444039 415 1441466 416 1436069 417 1432396 418 1432536 419 1428799 420 1422574 421 1418314 422 1412737 423 1408301 424 1402674 425 1396728 426 1393710 427 1386866 428 1385543 429 1377345 430 1372207 431 1364983 432 1360999 433 1352632 434 1350409 435 1342548 436 1335825 437 1331136 438 1323732 439 1319709 440 1312607 441 1304905 442 1297678 443 1293086 444 1287092 445 1277584 446 1274422 447 1266067 448 1260394 449 1253280 450 1248418 451 1240391 452 1233017 453 1222957 454 1216436 455 1211779 456 1202986 457 1197235 458 1189755 459 1185290 460 1176448 461 1168999 462 1162010 463 1154608 464 1148552 465 1139951 466 1131396 467 1124667 468 1116995 469 1113077 470 1103762 471 1096949 472 1089640 473 1082062 474 1072880 475 1065858 476 1060457 477 1052038 478 1045276 479 1038715 480 1031816 481 1024877 482 1018322 483 1011178 484 1003629 485 996148 486 988778 487 981065 488 975745 489 967294 490 960727 491 956196 492 949738 493 940370 494 934208 495 926710 496 919775 497 914230 498 905826 499 899852 500 893436 501 887232 502 880804 503 872324 504 866357 505 861482 506 854850 507 847591 508 840336 509 835593 510 828217 511 821708 512 815588 513 809769 514 805208 515 797468 516 790376 517 785744 518 777599 519 772783 520 766246 521 760400 522 753844 523 748606 524 743322 525 738110 526 731732 527 724778 528 717875 529 711932 530 705392 531 700560 532 696003 533 690342 534 684429 535 678923 536 672677 537 667957 538 662046 539 655712 540 650402 541 646710 542 639980 543 635503 544 629810 545 625604 546 619654 547 614209 548 607726 549 603360 550 598180 551 592648 552 588022 553 583865 554 577979 555 572382 556 568344 557 564278 558 557269 559 554307 560 549759 561 544694 562 540411 563 534090 564 531014 565 527099 566 521772 567 517510 568 512691 569 508276 570 504616 571 498913 572 493542 573 489111 574 485913 575 480983 576 476684 577 472713 578 469475 579 465454 580 460140 581 456195 582 451752 583 448920 584 444462 585 440496 586 435475 587 431566 588 428496 589 423115 590 421652 591 416052 592 413366 593 408876 594 405136 595 400140 596 397864 597 394596 598 391440 599 386499 600 383541 601 379603 602 377286 603 372944 604 369286 605 366788 606 363171 607 359112 608 355686 609 353196 610 348898 611 346837 612 343751 613 340747 614 336827 615 333271 616 331679 617 328091 618 324871 619 321163 620 319038 621 314939 622 311873 623 308904 624 306001 625 304349 626 301486 627 298334 628 296281 629 292472 630 288946 631 286013 632 285052 633 282031 634 279111 635 276319 636 273665 637 270647 638 269331 639 265988 640 263632 641 260332 642 258013 643 255712 644 253112 645 249781 646 247985 647 245775 648 243242 649 241217 650 238400 651 235702 652 234369 653 232318 654 230054 655 227662 656 225844 657 223033 658 220933 659 218837 660 217046 661 214375 662 213432 663 210083 664 208378 665 206645 666 204755 667 201949 668 200498 669 198895 670 197661 671 195246 672 192945 673 190025 674 189094 675 186987 676 185880 677 183265 678 181841 679 180180 680 178358 681 176464 682 174609 683 173457 684 171170 685 169757 686 167828 687 166400 688 164512 689 162688 690 161389 691 160467 692 158318 693 156830 694 155461 695 153833 696 152946 697 150838 698 149019 699 147935 700 146171 701 145194 702 143064 703 141284 704 139424 705 138672 706 137509 707 136122 708 134044 709 133267 710 132193 711 130501 712 129091 713 127886 714 126614 715 125653 716 124971 717 123019 718 121729 719 120610 720 118562 721 117608 722 117391 723 116156 724 114965 725 113373 726 111796 727 111063 728 110272 729 108679 730 107691 731 106523 732 106215 733 104036 734 103632 735 102624 736 101578 737 100957 738 99604 739 98323 740 97855 741 97032 742 96077 743 94741 744 94145 745 92566 746 90814 747 90830 748 89320 749 88860 750 88044 751 87356 752 85823 753 85395 754 84634 755 83562 756 83033 757 81416 758 80757 759 79961 760 79257 761 78713 762 77994 763 76850 764 76189 765 75192 766 74841 767 73649 768 72436 769 71481 770 71302 771 70370 772 70220 773 69269 774 68358 775 67720 776 66859 777 66443 778 65522 779 64974 780 63575 781 63086 782 62930 783 61744 784 61172 785 61007 786 59887 787 59056 788 58303 789 57550 790 57386 791 56664 792 56013 793 55492 794 54652 795 53600 796 53117 797 52912 798 52516 799 51772 800 51486 801 50613 802 50403 803 49647 804 49398 805 48700 806 48287 807 47760 808 46414 809 46643 810 45974 811 45364 812 45205 813 44522 814 44268 815 43683 816 43136 817 42473 818 41869 819 41370 820 40962 821 41094 822 40281 823 39809 824 39296 825 38974 826 38356 827 38010 828 37353 829 37166 830 36517 831 36042 832 36193 833 35769 834 35149 835 34797 836 34116 837 33634 838 33528 839 33074 840 32725 841 32423 842 31949 843 31521 844 31420 845 30571 846 30603 847 30204 848 29818 849 29656 850 29303 851 28711 852 28781 853 28301 854 27862 855 27747 856 27632 857 27242 858 26671 859 26456 860 26798 861 25733 862 25291 863 24970 864 24270 865 24875 866 24913 867 23573 868 23471 869 23308 870 22907 871 22377 872 22436 873 22262 874 21529 875 22564 876 21219 877 20842 878 20364 879 20100 880 20126 881 19792 882 19656 883 19416 884 19226 885 19018 886 18678 887 18932 888 18494 889 18115 890 17926 891 17716 892 17503 893 17246 894 17404 895 16767 896 16679 897 16495 898 16490 899 16099 900 15962 901 15815 902 15637 903 15195 904 15147 905 14869 906 14850 907 14783 908 14347 909 14288 910 14365 911 14120 912 13841 913 14142 914 13640 915 13693 916 13594 917 13356 918 14040 919 13276 920 12910 921 12454 922 12516 923 12805 924 12157 925 11505 926 11367 927 11191 928 12008 929 10735 930 10402 931 10291 932 10119 933 9868 934 9847 935 9774 936 9563 937 9491 938 9308 939 9235 940 9216 941 8929 942 9016 943 8992 944 8750 945 8555 946 8629 947 8494 948 8387 949 8329 950 8045 951 8056 952 7925 953 7923 954 7867 955 7754 956 7762 957 7661 958 7762 959 7423 960 7240 961 7027 962 7406 963 6815 964 6730 965 6625 966 6506 967 6837 968 6381 969 6186 970 6118 971 6047 972 5915 973 6019 974 5732 975 5586 976 5543 977 5436 978 5416 979 5408 980 5339 981 5388 982 5004 983 5182 984 5104 985 4854 986 4908 987 4985 988 4960 989 4757 990 4498 991 4619 992 4502 993 4436 994 4434 995 4331 996 4397 997 4249 998 4369 999 4103 1000 4073 1001 4052 1002 3892 1003 3816 1004 3834 1005 3790 1006 3694 1007 3856 1008 3719 1009 3609 1010 3580 1011 3495 1012 3496 1013 3391 1014 3320 1015 3450 1016 3410 1017 3279 1018 3250 1019 3277 1020 3177 1021 3093 1022 3120 1023 2964 1024 2895 1025 2945 1026 2916 1027 2787 1028 2883 1029 2853 1030 2835 1031 2785 1032 2765 1033 2680 1034 2593 1035 2725 1036 2590 1037 2595 1038 2482 1039 2542 1040 2324 1041 2319 1042 2142 1043 2223 1044 2226 1045 2163 1046 2167 1047 2115 1048 2123 1049 2071 1050 2018 1051 2048 1052 1978 1053 1936 1054 1901 1055 1962 1056 1918 1057 1830 1058 1846 1059 1804 1060 1773 1061 1841 1062 1785 1063 1728 1064 1637 1065 1681 1066 1655 1067 1564 1068 1602 1069 1510 1070 1503 1071 1479 1072 1546 1073 1536 1074 1454 1075 1451 1076 1448 1077 1315 1078 1398 1079 1308 1080 1320 1081 1366 1082 1267 1083 1306 1084 1328 1085 1202 1086 1148 1087 1179 1088 1255 1089 1172 1090 1145 1091 1101 1092 1121 1093 1118 1094 1115 1095 1085 1096 1135 1097 1041 1098 1029 1099 1022 1100 1024 1101 981 1102 989 1103 925 1104 963 1105 915 1106 933 1107 905 1108 925 1109 880 1110 914 1111 870 1112 846 1113 850 1114 808 1115 802 1116 788