#SentieonCommandLine: /lustre8/home/ykawai-tnproj-pg/packages/sentieon-genomics-201911/libexec/driver -t 8 -r /lustre8/home/ncbn-pg/data/resource/Homo_sapiens_assembly38.fasta -i HGDP/HGDP00708/HGDP00708.cram --algo InsertSizeMetricAlgo HGDP/HGDP00708/QCmetrics/HGDP00708.InsertSizeMetricAlgo.txt MEDIAN_INSERT_SIZE MEDIAN_ABSOLUTE_DEVIATION MIN_INSERT_SIZE MAX_INSERT_SIZE MEAN_INSERT_SIZE STANDARD_DEVIATION READ_PAIRS PAIR_ORIENTATION WIDTH_OF_10_PERCENT WIDTH_OF_20_PERCENT WIDTH_OF_30_PERCENT WIDTH_OF_40_PERCENT WIDTH_OF_50_PERCENT WIDTH_OF_60_PERCENT WIDTH_OF_70_PERCENT WIDTH_OF_80_PERCENT WIDTH_OF_90_PERCENT WIDTH_OF_99_PERCENT 420.000000 62.000000 2 242609284 432.222934 99.359521 368144822 FR 25 49 73 99 125 155 189 235 317 647 insert_size All_Reads.fr_count 2 1612 3 1600 4 1654 5 1650 6 1658 7 1749 8 1620 9 1676 10 1721 11 1630 12 1702 13 1835 14 1824 15 1759 16 1999 17 1765 18 2096 19 3519 20 3664 21 3551 22 3845 23 4154 24 4403 25 4701 26 4779 27 4876 28 5081 29 5419 30 5515 31 5876 32 6051 33 6408 34 7106 35 7312 36 7685 37 7838 38 8621 39 8934 40 9295 41 9630 42 9842 43 10465 44 10801 45 10953 46 11145 47 11291 48 11969 49 12262 50 12275 51 12537 52 12849 53 13447 54 13698 55 13882 56 14091 57 14011 58 14604 59 15271 60 15392 61 15584 62 15623 63 16623 64 16841 65 16785 66 17171 67 16832 68 17566 69 18240 70 18256 71 17752 72 17937 73 18373 74 18766 75 18195 76 18152 77 18021 78 18302 79 18862 80 18476 81 18011 82 17615 83 18232 84 18513 85 18634 86 18480 87 17879 88 18352 89 18403 90 18417 91 18309 92 18138 93 18606 94 19003 95 18775 96 18803 97 18381 98 18741 99 19129 100 19219 101 18967 102 18531 103 18559 104 19014 105 18385 106 18058 107 18246 108 18342 109 18459 110 18120 111 17702 112 17680 113 17700 114 18184 115 17369 116 17368 117 16947 118 17090 119 16963 120 16809 121 16720 122 16475 123 16688 124 16392 125 16559 126 16039 127 15898 128 15821 129 16533 130 16481 131 16065 132 15990 133 16280 134 16098 135 15778 136 15575 137 15458 138 15159 139 15599 140 15309 141 15116 142 14987 143 14686 144 14903 145 14544 146 14375 147 14147 148 14273 149 14082 150 13947 151 13567 152 13455 153 13407 154 13306 155 12913 156 12942 157 12508 158 12542 159 12455 160 12269 161 11936 162 12028 163 11915 164 11996 165 11935 166 11796 167 11918 168 11779 169 11738 170 11754 171 11681 172 11424 173 11330 174 11454 175 11421 176 11159 177 11041 178 11052 179 10996 180 10732 181 10676 182 10832 183 10720 184 10627 185 10444 186 10578 187 10453 188 10577 189 10361 190 10476 191 10503 192 10238 193 10575 194 10856 195 10557 196 10716 197 10701 198 10899 199 10818 200 10999 201 10983 202 11368 203 11585 204 11638 205 11850 206 12262 207 12635 208 13016 209 13361 210 13733 211 14344 212 14653 213 15160 214 15647 215 16231 216 16606 217 17219 218 17850 219 18315 220 19182 221 19922 222 20883 223 21927 224 22627 225 23568 226 24500 227 26068 228 26991 229 28366 230 29724 231 31256 232 33109 233 34601 234 36352 235 38003 236 40395 237 42178 238 44192 239 46603 240 48960 241 51498 242 54740 243 57008 244 60105 245 63364 246 66223 247 69434 248 73190 249 76996 250 80855 251 85455 252 90112 253 94197 254 98495 255 103415 256 109510 257 114271 258 120295 259 126512 260 132420 261 138977 262 145477 263 152412 264 159523 265 167072 266 173686 267 181630 268 190687 269 199031 270 208127 271 217941 272 225666 273 236597 274 247692 275 258100 276 270520 277 280526 278 291881 279 302012 280 313466 281 326572 282 336289 283 349899 284 363383 285 375578 286 388776 287 402247 288 415701 289 429806 290 446065 291 460337 292 475955 293 493196 294 507218 295 523021 296 539238 297 554990 298 572142 299 588886 300 605787 301 625287 302 642604 303 660795 304 677437 305 696918 306 714296 307 731173 308 752429 309 770052 310 788783 311 808059 312 826209 313 845747 314 865071 315 884682 316 901479 317 919916 318 940460 319 959199 320 977521 321 996430 322 1017157 323 1037009 324 1053613 325 1073963 326 1091421 327 1111813 328 1127197 329 1145626 330 1165160 331 1183046 332 1200503 333 1218055 334 1237906 335 1253792 336 1266062 337 1282764 338 1299202 339 1314146 340 1328344 341 1344824 342 1359401 343 1375797 344 1392753 345 1401878 346 1416473 347 1428473 348 1441685 349 1451940 350 1465931 351 1478604 352 1491364 353 1502836 354 1514899 355 1523009 356 1534309 357 1542531 358 1552209 359 1556424 360 1567630 361 1573654 362 1584127 363 1591127 364 1599434 365 1607168 366 1614433 367 1618398 368 1625640 369 1629272 370 1634417 371 1639462 372 1642508 373 1647680 374 1652894 375 1657330 376 1657974 377 1663070 378 1664046 379 1665066 380 1665557 381 1667505 382 1668363 383 1671885 384 1673464 385 1673769 386 1672021 387 1672921 388 1674088 389 1670544 390 1672932 391 1672247 392 1665472 393 1666424 394 1665523 395 1662876 396 1664429 397 1661548 398 1656857 399 1655542 400 1648760 401 1648657 402 1644748 403 1640384 404 1637849 405 1633010 406 1633570 407 1626192 408 1625217 409 1618150 410 1615259 411 1607057 412 1601960 413 1595378 414 1592866 415 1586673 416 1581400 417 1576371 418 1571436 419 1563165 420 1556251 421 1548907 422 1544921 423 1534337 424 1529652 425 1523485 426 1517298 427 1510919 428 1505289 429 1495665 430 1488469 431 1483293 432 1474245 433 1464303 434 1459093 435 1451772 436 1443235 437 1438047 438 1429136 439 1422589 440 1415413 441 1406207 442 1399042 443 1392097 444 1383009 445 1374487 446 1369667 447 1359246 448 1351011 449 1344006 450 1337020 451 1328452 452 1317233 453 1309313 454 1302686 455 1293214 456 1288590 457 1278525 458 1270941 459 1262869 460 1252559 461 1243757 462 1237671 463 1228924 464 1219390 465 1213231 466 1204387 467 1195888 468 1187442 469 1180295 470 1171463 471 1163408 472 1154242 473 1147098 474 1139312 475 1129286 476 1121364 477 1111747 478 1104923 479 1098104 480 1089421 481 1079438 482 1073714 483 1064638 484 1058154 485 1050588 486 1042969 487 1032353 488 1026339 489 1017849 490 1010165 491 1002955 492 994672 493 987403 494 979086 495 970775 496 962759 497 953878 498 948214 499 938721 500 933360 501 924847 502 916706 503 911856 504 902239 505 894811 506 884570 507 880399 508 872047 509 864716 510 859628 511 850529 512 844250 513 837159 514 829070 515 820573 516 814761 517 807389 518 799675 519 793225 520 786641 521 778806 522 771127 523 765527 524 758438 525 752498 526 744094 527 733865 528 728713 529 722167 530 715526 531 709906 532 703726 533 695878 534 690974 535 680995 536 676170 537 667408 538 661477 539 656787 540 650010 541 643164 542 636844 543 633024 544 626513 545 616515 546 613149 547 607748 548 599733 549 593396 550 585125 551 580812 552 575406 553 569029 554 563756 555 558804 556 553236 557 546982 558 540483 559 534140 560 530493 561 524233 562 518806 563 512403 564 506961 565 501343 566 496088 567 490566 568 486000 569 480628 570 474937 571 468731 572 463371 573 459860 574 455530 575 449093 576 443784 577 441105 578 435150 579 428229 580 424604 581 419505 582 414539 583 409345 584 405172 585 400570 586 396516 587 392259 588 386231 589 382807 590 376933 591 373348 592 368054 593 363545 594 359608 595 356198 596 351124 597 347503 598 342022 599 337711 600 332844 601 329454 602 323852 603 321097 604 316422 605 312381 606 309240 607 305211 608 301691 609 297166 610 292672 611 288948 612 285582 613 282079 614 279646 615 274743 616 271654 617 267897 618 264433 619 260186 620 256304 621 253737 622 249202 623 246937 624 243829 625 240662 626 236328 627 235395 628 230500 629 227840 630 223919 631 221659 632 218349 633 214483 634 211297 635 209344 636 206268 637 203872 638 200070 639 197768 640 194777 641 191584 642 189170 643 186240 644 182530 645 180450 646 178320 647 175850 648 172778 649 170832 650 167999 651 165319 652 162076 653 160707 654 157438 655 155463 656 153143 657 151149 658 149026 659 147172 660 144196 661 142052 662 140132 663 137262 664 135357 665 133402 666 131205 667 129536 668 126966 669 125881 670 123490 671 121453 672 119674 673 117683 674 116315 675 113763 676 111985 677 110230 678 109379 679 107201 680 105253 681 103687 682 101630 683 99889 684 99037 685 96768 686 95385 687 94028 688 92948 689 90775 690 89198 691 88138 692 86558 693 84817 694 83299 695 82066 696 80497 697 79252 698 78197 699 76250 700 75223 701 73973 702 72380 703 71655 704 70514 705 69178 706 67657 707 66790 708 65254 709 64506 710 63404 711 62529 712 60934 713 59696 714 59855 715 58238 716 56754 717 56139 718 55079 719 54126 720 53294 721 51984 722 51547 723 50444 724 50339 725 49018 726 48073 727 46951 728 46532 729 46142 730 45026 731 43641 732 42687 733 42276 734 41462 735 40809 736 40603 737 39594 738 38821 739 38599 740 37243 741 37000 742 36550 743 35940 744 35331 745 34478 746 34108 747 33303 748 32724 749 32038 750 31331 751 31165 752 30190 753 29759 754 28814 755 28599 756 28149 757 27706 758 27370 759 26927 760 26041 761 25643 762 25251 763 24857 764 24139 765 23585 766 23255 767 22662 768 22445 769 21926 770 21639 771 21255 772 20875 773 20173 774 19903 775 19434 776 19319 777 19174 778 18737 779 18103 780 17683 781 17577 782 16999 783 16787 784 16565 785 16483 786 16031 787 15523 788 15337 789 15336 790 14878 791 14614 792 14160 793 13881 794 13974 795 13402 796 13237 797 12879 798 12739 799 12501 800 12278 801 11741 802 11660 803 11744 804 11444 805 11216 806 10987 807 10944 808 10430 809 10568 810 10126 811 9983 812 9739 813 9717 814 9537 815 9305 816 9157 817 9104 818 9011 819 8638 820 8643 821 8240 822 8210 823 7986 824 7967 825 7801 826 7817 827 7577 828 7298 829 7256 830 7215 831 7128 832 6896 833 6815 834 6733 835 6713 836 6901 837 6323 838 6451 839 6167 840 5857 841 5594 842 5455 843 5461 844 5621 845 5184 846 5181 847 5137 848 4875 849 4811 850 4851 851 4601 852 4465 853 4495 854 4510 855 4395 856 3904 857 4051 858 3981 859 4316 860 3982 861 3452 862 3348 863 3271 864 3161 865 3175 866 3124 867 3115 868 2961 869 2884 870 2852 871 2784 872 2739 873 2759 874 2765 875 2885 876 2592 877 2445 878 2507 879 2382 880 2292 881 2225 882 2190 883 2180 884 2165 885 2073 886 2112 887 2183 888 2026 889 1815 890 1847 891 1749 892 1758 893 1717 894 1698 895 1618 896 1615 897 1635 898 1571 899 1557 900 1549 901 1499 902 1524 903 1459 904 1412 905 1358 906 1336 907 1415 908 1335 909 1292 910 1291 911 1226 912 1198 913 1236 914 1233 915 1193 916 1122 917 1170 918 1107 919 1155 920 1056 921 1075 922 1026 923 1037 924 1048 925 931 926 955 927 934 928 959 929 918 930 894 931 890 932 891 933 871 934 937 935 814 936 776 937 817 938 833 939 773 940 765 941 740 942 740 943 771 944 746 945 722 946 723 947 719 948 691 949 633 950 679 951 604 952 628 953 619 954 637 955 615 956 621 957 638 958 600 959 614 960 566 961 537 962 584 963 537 964 542 965 502 966 512 967 496 968 508 969 484 970 495 971 489 972 482 973 460 974 500 975 453 976 420 977 435 978 415 979 424 980 428 981 422 982 434 983 424 984 381 985 412 986 367 987 357 988 359 989 362 990 344 991 346 992 333 993 364 994 337 995 372 996 316 997 344 998 314 999 309 1000 314 1001 330 1002 313 1003 306 1004 303 1005 299 1006 281 1007 306 1008 268 1009 284 1010 300 1011 275 1012 262 1013 250 1014 270 1015 275 1016 252 1017 246 1018 235 1019 252 1020 246 1021 241 1022 241 1023 242 1024 225 1025 254 1026 232 1027 229 1028 204 1029 216 1030 239 1031 194 1032 179 1033 214 1034 212 1035 216 1036 203 1037 187 1038 178 1039 203 1040 191