#SentieonCommandLine: /lustre8/home/ykawai-tnproj-pg/packages/sentieon-genomics-201911/libexec/driver -t 8 -r /lustre8/home/ncbn-pg/data/resource/Homo_sapiens_assembly38.fasta -i HGDP/HGDP00744/HGDP00744.cram --algo InsertSizeMetricAlgo HGDP/HGDP00744/QCmetrics/HGDP00744.InsertSizeMetricAlgo.txt MEDIAN_INSERT_SIZE MEDIAN_ABSOLUTE_DEVIATION MIN_INSERT_SIZE MAX_INSERT_SIZE MEAN_INSERT_SIZE STANDARD_DEVIATION READ_PAIRS PAIR_ORIENTATION WIDTH_OF_10_PERCENT WIDTH_OF_20_PERCENT WIDTH_OF_30_PERCENT WIDTH_OF_40_PERCENT WIDTH_OF_50_PERCENT WIDTH_OF_60_PERCENT WIDTH_OF_70_PERCENT WIDTH_OF_80_PERCENT WIDTH_OF_90_PERCENT WIDTH_OF_99_PERCENT 420.000000 62.000000 2 245695243 430.715655 101.643034 315251950 FR 25 49 73 99 125 157 193 241 327 661 insert_size All_Reads.fr_count 2 1421 3 1525 4 1706 5 1785 6 1619 7 1821 8 1771 9 1730 10 1937 11 1928 12 1776 13 2023 14 1845 15 1633 16 2164 17 1766 18 2103 19 3838 20 4101 21 4063 22 4118 23 4641 24 5133 25 5245 26 5259 27 5443 28 5572 29 5907 30 5966 31 6210 32 6534 33 6798 34 7358 35 7784 36 8057 37 8060 38 8685 39 9192 40 9591 41 9686 42 9913 43 10458 44 11051 45 11003 46 11164 47 11454 48 12062 49 12799 50 12783 51 13494 52 13540 53 13992 54 14779 55 14903 56 15246 57 15010 58 15601 59 16639 60 16543 61 16772 62 17181 63 17658 64 18450 65 18332 66 18210 67 18211 68 18601 69 19299 70 18793 71 19078 72 19349 73 19111 74 19757 75 19519 76 19641 77 19197 78 19337 79 20313 80 20121 81 19894 82 19641 83 20524 84 21354 85 21303 86 21168 87 20598 88 21179 89 21642 90 21461 91 21199 92 20886 93 21359 94 22006 95 21774 96 21611 97 20899 98 21687 99 21915 100 21778 101 21439 102 21100 103 21471 104 22131 105 21551 106 21388 107 21178 108 21262 109 21544 110 21335 111 22085 112 21215 113 20998 114 21531 115 21351 116 21006 117 20448 118 20845 119 21041 120 20940 121 20837 122 21031 123 20862 124 21442 125 21148 126 20952 127 20481 128 20320 129 21210 130 20613 131 20849 132 20327 133 20467 134 20787 135 20508 136 20370 137 20152 138 20148 139 20605 140 20303 141 20228 142 19980 143 20038 144 20307 145 20051 146 19817 147 19625 148 19526 149 19843 150 19391 151 19453 152 19574 153 19360 154 19820 155 19313 156 19523 157 19165 158 19176 159 19188 160 19370 161 19520 162 19123 163 18969 164 19547 165 19127 166 19553 167 19044 168 19150 169 18908 170 19109 171 19041 172 19003 173 18863 174 19249 175 19143 176 19190 177 18837 178 18839 179 19160 180 19039 181 19219 182 19275 183 19506 184 19430 185 19406 186 19460 187 19618 188 19684 189 19915 190 19903 191 20578 192 20464 193 20650 194 20790 195 21052 196 21252 197 21600 198 22155 199 22694 200 22634 201 23616 202 23636 203 24460 204 24783 205 25256 206 25994 207 26538 208 26840 209 27617 210 28345 211 28849 212 29900 213 30400 214 31323 215 32264 216 33337 217 34259 218 35459 219 36633 220 37127 221 38544 222 39736 223 41417 224 42659 225 43700 226 45637 227 47662 228 48373 229 50895 230 52687 231 54506 232 56323 233 58350 234 60860 235 63142 236 64907 237 67423 238 70205 239 72820 240 75883 241 78525 242 81668 243 84069 244 87595 245 91511 246 94428 247 97466 248 101283 249 105041 250 109231 251 113235 252 117107 253 120667 254 126412 255 130351 256 135639 257 139935 258 144089 259 150100 260 155703 261 160992 262 165956 263 172415 264 178280 265 184436 266 190822 267 197465 268 203881 269 211186 270 217344 271 226211 272 232678 273 238967 274 247359 275 257342 276 266653 277 274539 278 282769 279 289885 280 297866 281 306713 282 314824 283 325306 284 335568 285 344294 286 354374 287 363248 288 373252 289 384651 290 395899 291 406655 292 417351 293 427844 294 439670 295 451007 296 461944 297 473589 298 485440 299 498429 300 510278 301 524077 302 537699 303 549131 304 563072 305 578145 306 589148 307 601494 308 615415 309 627399 310 642221 311 655816 312 670354 313 687572 314 700043 315 713975 316 726472 317 741465 318 755681 319 768914 320 785852 321 800405 322 813872 323 828956 324 845664 325 859970 326 873748 327 888176 328 899458 329 915365 330 931140 331 942774 332 958584 333 971177 334 987102 335 1000087 336 1015683 337 1026454 338 1039767 339 1054168 340 1065432 341 1076959 342 1090988 343 1104303 344 1116331 345 1131177 346 1142152 347 1155856 348 1165256 349 1176686 350 1185872 351 1194463 352 1207641 353 1219164 354 1229963 355 1241087 356 1251236 357 1260025 358 1268733 359 1278508 360 1286295 361 1292295 362 1302887 363 1310949 364 1319332 365 1326401 366 1332419 367 1341074 368 1346025 369 1353392 370 1358544 371 1366260 372 1370680 373 1374729 374 1380677 375 1384127 376 1389679 377 1392948 378 1398297 379 1400811 380 1404751 381 1405988 382 1404940 383 1410699 384 1413698 385 1417956 386 1421087 387 1420348 388 1419753 389 1419575 390 1420722 391 1422236 392 1420844 393 1419113 394 1423365 395 1420691 396 1420087 397 1421745 398 1420002 399 1419833 400 1415851 401 1413825 402 1412432 403 1409140 404 1409998 405 1406231 406 1402196 407 1403244 408 1396341 409 1394360 410 1390978 411 1385193 412 1383859 413 1376861 414 1373861 415 1370243 416 1366168 417 1359084 418 1357343 419 1352197 420 1346736 421 1340717 422 1334313 423 1330607 424 1325401 425 1318166 426 1313819 427 1307166 428 1301354 429 1298059 430 1291446 431 1285166 432 1276410 433 1272057 434 1264917 435 1260457 436 1250749 437 1244509 438 1239931 439 1235786 440 1226610 441 1219431 442 1211728 443 1203193 444 1199122 445 1191799 446 1186742 447 1178134 448 1170498 449 1163889 450 1158867 451 1148891 452 1141613 453 1132447 454 1125120 455 1121159 456 1111777 457 1104189 458 1100371 459 1092956 460 1085303 461 1077063 462 1069501 463 1061890 464 1052833 465 1048020 466 1040027 467 1031796 468 1024622 469 1019370 470 1010432 471 1002506 472 996008 473 988467 474 980551 475 974564 476 965689 477 958127 478 953550 479 946542 480 937834 481 932353 482 924746 483 916775 484 910331 485 901760 486 894624 487 886947 488 880784 489 874652 490 866179 491 860414 492 852934 493 844661 494 840171 495 832452 496 824310 497 818575 498 810846 499 805181 500 798834 501 791167 502 785950 503 781024 504 771528 505 764916 506 759965 507 753043 508 746490 509 738933 510 732258 511 728321 512 722141 513 715812 514 707051 515 700923 516 695906 517 688825 518 681132 519 676370 520 669198 521 664145 522 657473 523 651766 524 645863 525 638722 526 634781 527 628015 528 621469 529 615516 530 610337 531 604459 532 596584 533 593720 534 586454 535 581064 536 575586 537 569798 538 564992 539 559380 540 554580 541 547915 542 542977 543 535000 544 530453 545 524956 546 519296 547 515287 548 509546 549 503979 550 499264 551 493166 552 489076 553 482817 554 478726 555 474677 556 468506 557 463506 558 457648 559 452839 560 449325 561 444749 562 439147 563 435131 564 430505 565 424722 566 420820 567 417021 568 412170 569 407063 570 404618 571 398019 572 392521 573 388879 574 385263 575 380832 576 375366 577 371936 578 367763 579 363399 580 358752 581 355631 582 350406 583 345947 584 342528 585 339208 586 334677 587 330469 588 326565 589 322699 590 319002 591 315051 592 311243 593 307123 594 303635 595 299517 596 296446 597 292418 598 288522 599 285929 600 281194 601 277986 602 275036 603 270726 604 267816 605 264553 606 260752 607 258134 608 254498 609 250401 610 248097 611 243642 612 239798 613 238242 614 234009 615 230991 616 228533 617 225983 618 223140 619 220140 620 216274 621 214375 622 211275 623 208512 624 205611 625 201976 626 198750 627 196595 628 194393 629 192461 630 189026 631 186510 632 184209 633 181655 634 179088 635 176891 636 174378 637 172395 638 169249 639 167173 640 164864 641 162492 642 160226 643 158093 644 154981 645 153305 646 150660 647 149112 648 146987 649 144753 650 142267 651 140581 652 139283 653 136753 654 134251 655 132423 656 130943 657 129014 658 126986 659 125447 660 123861 661 121445 662 119750 663 116856 664 116485 665 114138 666 111556 667 110459 668 109093 669 107598 670 105218 671 104481 672 102497 673 100888 674 99062 675 97830 676 96859 677 94834 678 92951 679 92113 680 90980 681 88866 682 87878 683 85883 684 84783 685 83289 686 82502 687 80562 688 79766 689 78611 690 77580 691 76456 692 74503 693 73201 694 72853 695 71072 696 69771 697 68558 698 67673 699 66514 700 65707 701 64048 702 63356 703 62388 704 61635 705 60161 706 59540 707 57822 708 57306 709 56144 710 54957 711 53879 712 53030 713 52401 714 51130 715 50404 716 49967 717 48745 718 48263 719 47164 720 46555 721 45736 722 45179 723 44287 724 43352 725 43167 726 42001 727 41163 728 40718 729 39955 730 39233 731 38560 732 37763 733 37432 734 36598 735 35758 736 35907 737 34667 738 34032 739 33478 740 33209 741 32337 742 32123 743 31405 744 30556 745 29918 746 29553 747 29157 748 28905 749 28157 750 27434 751 27069 752 26487 753 26386 754 25611 755 25161 756 24633 757 24251 758 23492 759 23205 760 22947 761 22579 762 21893 763 21511 764 21012 765 20865 766 20408 767 19677 768 19788 769 19478 770 18688 771 18601 772 18085 773 18020 774 17670 775 17269 776 16876 777 16779 778 16280 779 15965 780 15626 781 15455 782 15249 783 14807 784 14533 785 14234 786 14072 787 13888 788 13492 789 13425 790 12987 791 12610 792 12295 793 12397 794 11761 795 11705 796 11527 797 11257 798 11180 799 10992 800 10739 801 10446 802 10147 803 9998 804 9889 805 9674 806 9505 807 9369 808 9260 809 9202 810 9098 811 8873 812 8464 813 8348 814 8343 815 8077 816 7818 817 7585 818 7731 819 7229 820 7248 821 7052 822 6812 823 6685 824 6702 825 6483 826 6373 827 6232 828 6096 829 5934 830 5761 831 6003 832 5699 833 5352 834 5410 835 5421 836 5210 837 5094 838 4909 839 5124 840 4629 841 4587 842 4438 843 4409 844 4235 845 4295 846 4088 847 4099 848 4035 849 3908 850 3794 851 3752 852 3716 853 3668 854 3577 855 3663 856 3410 857 3469 858 3495 859 3188 860 3180 861 3125 862 3084 863 2823 864 2772 865 2791 866 2786 867 2834 868 2901 869 2705 870 2587 871 2552 872 2778 873 2355 874 2172 875 2180 876 2393 877 2059 878 2006 879 1855 880 1812 881 1843 882 1763 883 1807 884 1747 885 1645 886 1613 887 1689 888 1614 889 1528 890 1516 891 1526 892 1454 893 1455 894 1420 895 1384 896 1333 897 1339 898 1294 899 1253 900 1239 901 1178 902 1145 903 1164 904 1156 905 1128 906 1175 907 1074 908 1081 909 1094 910 1034 911 989 912 997 913 985 914 934 915 915 916 911 917 867 918 839 919 924 920 848 921 756 922 854 923 835 924 749 925 787 926 779 927 710 928 758 929 704 930 714 931 729 932 690 933 705 934 679 935 643 936 627 937 671 938 590 939 581 940 613 941 611 942 568 943 554 944 571 945 517 946 525 947 522 948 540 949 523 950 460 951 454 952 516 953 448 954 492 955 464 956 424 957 441 958 446 959 432 960 401 961 427 962 386 963 424 964 389 965 382 966 384 967 346 968 353 969 404 970 345 971 330 972 373 973 347 974 342 975 335 976 333 977 306 978 304 979 334 980 297 981 299 982 307 983 288 984 316 985 301 986 278 987 250 988 281 989 265 990 252 991 250 992 237 993 257 994 246 995 238 996 231 997 221 998 225 999 251 1000 253 1001 246 1002 212 1003 198 1004 187 1005 222 1006 198 1007 193 1008 185 1009 199 1010 197 1011 181 1012 204 1013 170 1014 191 1015 196 1016 187 1017 200 1018 170 1019 185 1020 181 1021 166 1022 155 1023 163 1024 147 1025 150 1026 179 1027 142 1028 157 1029 136 1030 155 1031 155 1032 144 1033 150 1034 141 1035 158 1036 147 1037 139 1038 136 1039 155 1040 138