#SentieonCommandLine: /lustre8/home/ykawai-tnproj-pg/packages/sentieon-genomics-201911/libexec/driver -t 8 -r /lustre8/home/ncbn-pg/data/resource/Homo_sapiens_assembly38.fasta -i HGDP/HGDP00814/HGDP00814.cram --algo InsertSizeMetricAlgo HGDP/HGDP00814/QCmetrics/HGDP00814.InsertSizeMetricAlgo.txt MEDIAN_INSERT_SIZE MEDIAN_ABSOLUTE_DEVIATION MIN_INSERT_SIZE MAX_INSERT_SIZE MEAN_INSERT_SIZE STANDARD_DEVIATION READ_PAIRS PAIR_ORIENTATION WIDTH_OF_10_PERCENT WIDTH_OF_20_PERCENT WIDTH_OF_30_PERCENT WIDTH_OF_40_PERCENT WIDTH_OF_50_PERCENT WIDTH_OF_60_PERCENT WIDTH_OF_70_PERCENT WIDTH_OF_80_PERCENT WIDTH_OF_90_PERCENT WIDTH_OF_99_PERCENT 447.000000 63.000000 2 246665518 456.980046 103.729055 332551259 FR 25 49 73 99 127 159 195 243 329 701 insert_size All_Reads.fr_count 2 355 3 357 4 372 5 383 6 339 7 463 8 510 9 468 10 621 11 666 12 616 13 832 14 958 15 895 16 1111 17 994 18 1259 19 2512 20 3257 21 3766 22 4127 23 4712 24 5342 25 6098 26 6594 27 6496 28 6747 29 7116 30 7604 31 8135 32 8549 33 9120 34 9656 35 10239 36 10695 37 11023 38 11449 39 12038 40 12247 41 12678 42 13145 43 14026 44 14554 45 14619 46 15214 47 15548 48 16630 49 16779 50 16963 51 17388 52 17658 53 18777 54 19735 55 19773 56 20163 57 20323 58 21357 59 22535 60 22147 61 22605 62 22858 63 22679 64 24090 65 23809 66 23655 67 23346 68 24393 69 25011 70 24808 71 24694 72 24474 73 25011 74 25782 75 25494 76 25196 77 24989 78 25535 79 25807 80 26023 81 25586 82 25372 83 26416 84 27579 85 27306 86 26830 87 26332 88 27283 89 28159 90 27434 91 26850 92 26488 93 26905 94 27806 95 26923 96 26851 97 26183 98 26704 99 27004 100 26334 101 26064 102 25856 103 26619 104 26847 105 26096 106 26069 107 25589 108 26395 109 26404 110 25969 111 25378 112 25567 113 25774 114 26624 115 25909 116 26419 117 25596 118 26025 119 26415 120 26442 121 25912 122 25486 123 25510 124 25678 125 25283 126 24887 127 24096 128 24263 129 24617 130 24191 131 24050 132 23434 133 23852 134 23878 135 23372 136 23146 137 22892 138 23010 139 23044 140 23129 141 22449 142 22684 143 22507 144 22400 145 22269 146 22013 147 21649 148 22203 149 22114 150 21714 151 21455 152 21599 153 22057 154 21508 155 21309 156 21077 157 20459 158 20758 159 20304 160 20037 161 19829 162 19819 163 19464 164 19394 165 19248 166 19131 167 18747 168 18677 169 18808 170 18589 171 18398 172 18127 173 17954 174 17935 175 17648 176 17584 177 17336 178 17009 179 17177 180 17023 181 16640 182 16791 183 16723 184 16911 185 16613 186 16608 187 16736 188 16394 189 16602 190 16685 191 16308 192 16414 193 16223 194 16408 195 15874 196 15963 197 15987 198 15779 199 15999 200 15598 201 15693 202 15462 203 15412 204 15665 205 15635 206 15609 207 15648 208 15609 209 15816 210 15846 211 15822 212 15714 213 16184 214 16090 215 16275 216 16291 217 16535 218 16799 219 16962 220 17180 221 17481 222 17619 223 17927 224 17852 225 18654 226 18814 227 19425 228 19673 229 20088 230 21038 231 21711 232 22458 233 22860 234 23436 235 24075 236 24943 237 25644 238 26067 239 27181 240 27663 241 28667 242 29747 243 30797 244 31999 245 32970 246 34077 247 35084 248 36387 249 37834 250 38939 251 41014 252 42289 253 44104 254 45904 255 47174 256 49119 257 51203 258 53102 259 55150 260 57374 261 59726 262 62086 263 64580 264 67156 265 69250 266 72931 267 75411 268 78268 269 82190 270 85582 271 88628 272 92393 273 96445 274 101102 275 105478 276 110919 277 114804 278 118604 279 123056 280 127081 281 132240 282 136773 283 142695 284 148231 285 152827 286 158185 287 164512 288 169206 289 175575 290 182251 291 188667 292 196079 293 202417 294 209125 295 216377 296 223840 297 231195 298 239107 299 247481 300 255358 301 265209 302 272650 303 282174 304 291302 305 300580 306 309375 307 319618 308 329014 309 339002 310 351820 311 360773 312 370875 313 381912 314 393133 315 405089 316 417559 317 427792 318 439612 319 450939 320 463478 321 476476 322 488866 323 502524 324 515378 325 527024 326 541631 327 552941 328 568363 329 579890 330 593362 331 608523 332 622441 333 636967 334 652249 335 665094 336 681361 337 694207 338 708822 339 725247 340 738729 341 753470 342 769292 343 784172 344 799978 345 814118 346 829158 347 845431 348 857180 349 875663 350 889419 351 901644 352 918032 353 933706 354 948114 355 962406 356 978959 357 991882 358 1006881 359 1020598 360 1034182 361 1046098 362 1060007 363 1075552 364 1088251 365 1100309 366 1115706 367 1129410 368 1141098 369 1153850 370 1167218 371 1176567 372 1190240 373 1200883 374 1215386 375 1224896 376 1237386 377 1249000 378 1256861 379 1269104 380 1278688 381 1288114 382 1295847 383 1306611 384 1315170 385 1327244 386 1334464 387 1340955 388 1351135 389 1358960 390 1368404 391 1372543 392 1379379 393 1385315 394 1397847 395 1399743 396 1409896 397 1415131 398 1420667 399 1424864 400 1431876 401 1433125 402 1438369 403 1443395 404 1447647 405 1450194 406 1456074 407 1461441 408 1463201 409 1463930 410 1467147 411 1466092 412 1469029 413 1471706 414 1471292 415 1471827 416 1476606 417 1472935 418 1473590 419 1475664 420 1475235 421 1472506 422 1473645 423 1473210 424 1469355 425 1470840 426 1468254 427 1466129 428 1467837 429 1463462 430 1460562 431 1458510 432 1455522 433 1453857 434 1450045 435 1446496 436 1443419 437 1442902 438 1437404 439 1432982 440 1431529 441 1426469 442 1419900 443 1414893 444 1410596 445 1407131 446 1402251 447 1399266 448 1394561 449 1387271 450 1385886 451 1377535 452 1372957 453 1365621 454 1360811 455 1355832 456 1350749 457 1342072 458 1339146 459 1335522 460 1328286 461 1319679 462 1313822 463 1308293 464 1300394 465 1293665 466 1286150 467 1282635 468 1274525 469 1269078 470 1261589 471 1256152 472 1249800 473 1242189 474 1234000 475 1227465 476 1219077 477 1215253 478 1207101 479 1198479 480 1194097 481 1186418 482 1178765 483 1170369 484 1163690 485 1158133 486 1149812 487 1142745 488 1132770 489 1127984 490 1120168 491 1114326 492 1106029 493 1099348 494 1093496 495 1083567 496 1075943 497 1070358 498 1062137 499 1057152 500 1047262 501 1042883 502 1033439 503 1027940 504 1019244 505 1012529 506 1005583 507 999536 508 988551 509 984673 510 975941 511 967354 512 962348 513 954873 514 948203 515 940954 516 933072 517 925397 518 916734 519 911386 520 905044 521 897832 522 890399 523 881886 524 876265 525 870207 526 860052 527 854750 528 847764 529 839782 530 834084 531 825438 532 819027 533 813577 534 806922 535 799764 536 790955 537 785711 538 778233 539 772124 540 764456 541 757796 542 752326 543 743730 544 737083 545 731967 546 725068 547 717761 548 709129 549 703729 550 695637 551 690976 552 684369 553 676477 554 672540 555 666435 556 657894 557 652096 558 645536 559 638660 560 629635 561 626534 562 621020 563 612043 564 604727 565 599403 566 593900 567 588345 568 582845 569 576074 570 570018 571 564212 572 560235 573 552198 574 548003 575 542184 576 534436 577 530217 578 524019 579 518644 580 512503 581 507660 582 501825 583 496646 584 491390 585 486141 586 480742 587 474852 588 470475 589 463915 590 459151 591 454077 592 448242 593 443627 594 438548 595 433312 596 429964 597 423161 598 418784 599 414576 600 410399 601 405258 602 400099 603 394836 604 389727 605 385691 606 381612 607 376498 608 371935 609 366088 610 364047 611 359103 612 355442 613 350823 614 344887 615 341150 616 338964 617 334051 618 329264 619 325944 620 321073 621 317796 622 313765 623 309484 624 305209 625 301580 626 296246 627 292752 628 289862 629 285445 630 281034 631 276748 632 273370 633 270646 634 267322 635 264531 636 262059 637 258492 638 254307 639 250747 640 247896 641 244126 642 241819 643 238883 644 235401 645 232477 646 227939 647 226477 648 221569 649 219729 650 217415 651 214312 652 210892 653 209074 654 205185 655 202908 656 200305 657 197176 658 194449 659 191358 660 189311 661 186109 662 184300 663 180904 664 178937 665 175465 666 173801 667 171044 668 169628 669 167352 670 164867 671 161857 672 159225 673 158131 674 156244 675 153401 676 151508 677 148905 678 146910 679 144945 680 142727 681 140197 682 138413 683 136551 684 134611 685 132649 686 130038 687 128643 688 126833 689 124233 690 122942 691 121464 692 119371 693 117553 694 115960 695 114411 696 112488 697 110315 698 109353 699 107785 700 105722 701 103522 702 102478 703 100897 704 99137 705 97969 706 96592 707 95124 708 93500 709 92585 710 90757 711 88569 712 87651 713 86267 714 85198 715 84382 716 82433 717 81045 718 80206 719 78525 720 78109 721 76298 722 74927 723 73456 724 72783 725 71504 726 70839 727 69233 728 68078 729 66985 730 66346 731 65085 732 64357 733 63090 734 62362 735 60829 736 60069 737 59441 738 58667 739 57570 740 57108 741 55824 742 54929 743 53689 744 52794 745 51718 746 50896 747 50349 748 49703 749 48957 750 47894 751 47075 752 46277 753 45388 754 44557 755 43847 756 43373 757 42904 758 42101 759 41452 760 40366 761 40101 762 39153 763 38148 764 37540 765 37155 766 36207 767 35741 768 35071 769 34858 770 34283 771 32995 772 32729 773 32368 774 31581 775 31152 776 30356 777 29887 778 29486 779 28899 780 28142 781 27824 782 27207 783 26758 784 26181 785 26273 786 25285 787 24642 788 24364 789 23921 790 23745 791 23284 792 22901 793 22119 794 21879 795 21350 796 20846 797 20597 798 20174 799 19868 800 19713 801 19151 802 18604 803 18386 804 18135 805 17644 806 17308 807 17099 808 16737 809 16659 810 16040 811 15756 812 15624 813 15420 814 15070 815 14799 816 14606 817 14334 818 14080 819 14004 820 13785 821 13268 822 13184 823 12759 824 12566 825 12286 826 12032 827 11869 828 11639 829 11427 830 11237 831 11054 832 10734 833 10572 834 10426 835 10049 836 10187 837 9937 838 9674 839 9334 840 9345 841 9234 842 9209 843 9049 844 8792 845 8579 846 8619 847 8196 848 7918 849 7881 850 7748 851 7628 852 7319 853 7415 854 7199 855 7269 856 7165 857 7133 858 6544 859 6577 860 6277 861 6312 862 6102 863 5874 864 5843 865 5775 866 5490 867 5698 868 5432 869 5366 870 5054 871 4921 872 4993 873 5172 874 4702 875 4447 876 4418 877 4392 878 4455 879 4279 880 4334 881 4275 882 4390 883 4002 884 3847 885 3884 886 3719 887 3689 888 3663 889 3108 890 3070 891 3161 892 3022 893 2900 894 2818 895 2747 896 2703 897 2643 898 2540 899 2449 900 2461 901 2498 902 2271 903 2409 904 2214 905 2276 906 2178 907 2195 908 2189 909 2053 910 2101 911 1995 912 1931 913 1940 914 1810 915 1815 916 1918 917 1800 918 1745 919 1709 920 1854 921 1581 922 1538 923 1525 924 1461 925 1463 926 1491 927 1403 928 1463 929 1419 930 1314 931 1365 932 1284 933 1283 934 1226 935 1270 936 1213 937 1221 938 1156 939 1091 940 1118 941 1117 942 1096 943 1070 944 985 945 1054 946 974 947 952 948 926 949 929 950 966 951 878 952 856 953 837 954 917 955 861 956 821 957 812 958 747 959 759 960 720 961 721 962 751 963 698 964 740 965 695 966 669 967 689 968 649 969 722 970 639 971 585 972 608 973 614 974 562 975 606 976 551 977 546 978 525 979 547 980 530 981 513 982 535 983 478 984 479 985 461 986 474 987 437 988 475 989 469 990 444 991 429 992 409 993 435 994 419 995 395 996 379 997 359 998 414 999 384 1000 422 1001 355 1002 382 1003 334 1004 352 1005 329 1006 294 1007 313 1008 326 1009 358 1010 351 1011 293 1012 287 1013 290 1014 286 1015 280 1016 262 1017 284 1018 303 1019 261 1020 274 1021 263 1022 259 1023 226 1024 233 1025 240 1026 245 1027 215 1028 212 1029 203 1030 256 1031 211 1032 214 1033 219 1034 195 1035 217 1036 209 1037 205 1038 216 1039 203 1040 199 1041 201 1042 185 1043 188 1044 193 1045 185 1046 184 1047 178 1048 177 1049 188 1050 175 1051 160 1052 147 1053 159 1054 155 1055 154 1056 168 1057 160 1058 162 1059 140 1060 142 1061 141 1062 133 1063 127 1064 127 1065 160 1066 116 1067 145 1068 141 1069 150 1070 122 1071 124 1072 104 1073 97 1074 124 1075 107 1076 112 1077 118