#SentieonCommandLine: /lustre8/home/ykawai-tnproj-pg/packages/sentieon-genomics-201911/libexec/driver -t 8 -r /lustre8/home/ncbn-pg/data/resource/Homo_sapiens_assembly38.fasta -i HGDP/HGDP00828/HGDP00828.cram --algo InsertSizeMetricAlgo HGDP/HGDP00828/QCmetrics/HGDP00828.InsertSizeMetricAlgo.txt MEDIAN_INSERT_SIZE MEDIAN_ABSOLUTE_DEVIATION MIN_INSERT_SIZE MAX_INSERT_SIZE MEAN_INSERT_SIZE STANDARD_DEVIATION READ_PAIRS PAIR_ORIENTATION WIDTH_OF_10_PERCENT WIDTH_OF_20_PERCENT WIDTH_OF_30_PERCENT WIDTH_OF_40_PERCENT WIDTH_OF_50_PERCENT WIDTH_OF_60_PERCENT WIDTH_OF_70_PERCENT WIDTH_OF_80_PERCENT WIDTH_OF_90_PERCENT WIDTH_OF_99_PERCENT 456.000000 61.000000 2 247299336 465.227534 100.118021 373627873 FR 23 47 71 97 123 153 189 235 317 687 insert_size All_Reads.fr_count 2 474 3 542 4 534 5 548 6 540 7 633 8 532 9 557 10 554 11 582 12 593 13 589 14 581 15 597 16 625 17 619 18 639 19 627 20 626 21 676 22 646 23 721 24 663 25 742 26 696 27 808 28 989 29 1123 30 2066 31 2715 32 3049 33 3236 34 3378 35 5436 36 6068 37 7929 38 8309 39 9154 40 9522 41 9913 42 10054 43 11154 44 12521 45 13031 46 13268 47 14027 48 14949 49 15399 50 16526 51 16836 52 17290 53 18038 54 18920 55 18857 56 18778 57 19492 58 20323 59 20939 60 20835 61 21103 62 21476 63 22085 64 22280 65 21915 66 22440 67 22274 68 22877 69 23424 70 23256 71 23408 72 23756 73 24384 74 24965 75 24629 76 24926 77 24878 78 25551 79 25614 80 25861 81 25488 82 25279 83 25676 84 26707 85 26355 86 26065 87 25543 88 25615 89 26514 90 26109 91 25578 92 25354 93 25656 94 26120 95 25528 96 25576 97 24671 98 25592 99 25808 100 25898 101 25664 102 25278 103 26032 104 26643 105 26550 106 26264 107 26584 108 27053 109 27614 110 26875 111 26446 112 26067 113 26402 114 26847 115 26440 116 26087 117 25607 118 25697 119 26014 120 25597 121 25525 122 25245 123 25235 124 25341 125 25174 126 24634 127 24156 128 24307 129 24022 130 24264 131 24734 132 23953 133 24432 134 24331 135 24514 136 24052 137 24125 138 24179 139 24353 140 24318 141 23896 142 23763 143 23830 144 23830 145 23332 146 22898 147 22943 148 22604 149 22371 150 22382 151 22102 152 22187 153 21900 154 21519 155 21297 156 21038 157 20582 158 20551 159 20127 160 20205 161 19859 162 19740 163 19606 164 19498 165 19207 166 19046 167 19225 168 18996 169 19025 170 19255 171 19010 172 18538 173 18569 174 18608 175 18386 176 18285 177 17957 178 17833 179 17865 180 17157 181 17108 182 17254 183 16812 184 16749 185 16666 186 16600 187 16536 188 16137 189 15911 190 16052 191 15594 192 15782 193 15423 194 15530 195 15218 196 15103 197 15014 198 14884 199 15023 200 14718 201 14471 202 14571 203 14660 204 14786 205 14935 206 15180 207 15134 208 15153 209 14970 210 15252 211 15007 212 14870 213 15106 214 14949 215 15326 216 15168 217 15186 218 15404 219 15608 220 15552 221 15678 222 15816 223 15983 224 16215 225 16106 226 16337 227 16555 228 16883 229 16995 230 17530 231 17562 232 18012 233 18482 234 19135 235 19322 236 19963 237 19962 238 20683 239 20884 240 21980 241 22494 242 22829 243 23847 244 24622 245 25436 246 26209 247 27290 248 28270 249 29157 250 30475 251 31253 252 32343 253 33698 254 34991 255 35912 256 37206 257 38210 258 39850 259 41160 260 43219 261 45013 262 46561 263 48021 264 49995 265 52040 266 54238 267 55987 268 58806 269 60905 270 63407 271 65727 272 69242 273 71286 274 75968 275 79295 276 83934 277 86319 278 90298 279 93136 280 95492 281 98905 282 103461 283 107087 284 110318 285 115511 286 119077 287 125188 288 128113 289 133586 290 138402 291 143845 292 149380 293 154945 294 160784 295 166774 296 174139 297 179627 298 187020 299 193539 300 201140 301 209469 302 215694 303 223511 304 232395 305 238966 306 247995 307 255705 308 264466 309 273374 310 282596 311 292277 312 302581 313 311741 314 321237 315 332992 316 342058 317 353023 318 363249 319 374382 320 385715 321 397587 322 410404 323 421322 324 435082 325 447202 326 460219 327 470666 328 486138 329 498120 330 511788 331 525513 332 540076 333 553357 334 570023 335 584758 336 597966 337 611685 338 627749 339 643031 340 655516 341 674503 342 689212 343 704248 344 721791 345 736040 346 752936 347 768230 348 783849 349 799305 350 816385 351 834878 352 852167 353 868404 354 885814 355 900557 356 916096 357 935147 358 953374 359 967771 360 985080 361 1004025 362 1020589 363 1035767 364 1053961 365 1071819 366 1085960 367 1100971 368 1119155 369 1131927 370 1152157 371 1166217 372 1181344 373 1198300 374 1213216 375 1231822 376 1244063 377 1259384 378 1275232 379 1287141 380 1304417 381 1317123 382 1331640 383 1346299 384 1359604 385 1374672 386 1387444 387 1399969 388 1411535 389 1426748 390 1438683 391 1451907 392 1460319 393 1472148 394 1484215 395 1498055 396 1508770 397 1519012 398 1531075 399 1541798 400 1550174 401 1559256 402 1571153 403 1579297 404 1590526 405 1597079 406 1604871 407 1615192 408 1620615 409 1627540 410 1632495 411 1639184 412 1648362 413 1651005 414 1658178 415 1665811 416 1666251 417 1672607 418 1679726 419 1682174 420 1682849 421 1687910 422 1687276 423 1693442 424 1695173 425 1699456 426 1698350 427 1699362 428 1702990 429 1704400 430 1703138 431 1703611 432 1701255 433 1702516 434 1704508 435 1701610 436 1701475 437 1701492 438 1702677 439 1698742 440 1694732 441 1693054 442 1690799 443 1688411 444 1685869 445 1685409 446 1678986 447 1678604 448 1674634 449 1671470 450 1667390 451 1661634 452 1658611 453 1652382 454 1647240 455 1642131 456 1634956 457 1634384 458 1623905 459 1618863 460 1615438 461 1608934 462 1603408 463 1596936 464 1590959 465 1582111 466 1575232 467 1567792 468 1563196 469 1554983 470 1549576 471 1541799 472 1530793 473 1527272 474 1519035 475 1509875 476 1503172 477 1492751 478 1486721 479 1480736 480 1471482 481 1464505 482 1455654 483 1445570 484 1437402 485 1430537 486 1420342 487 1411599 488 1405357 489 1396310 490 1387416 491 1378390 492 1372418 493 1363188 494 1351535 495 1345117 496 1331295 497 1323103 498 1318027 499 1307735 500 1296580 501 1289505 502 1279002 503 1272986 504 1263275 505 1253082 506 1243726 507 1234675 508 1227050 509 1216269 510 1207303 511 1197363 512 1189802 513 1179897 514 1172158 515 1162185 516 1152859 517 1144248 518 1133686 519 1126713 520 1114899 521 1108704 522 1097334 523 1089583 524 1077681 525 1069542 526 1063350 527 1052329 528 1044027 529 1034632 530 1024475 531 1017753 532 1007985 533 999757 534 990064 535 980491 536 971323 537 962604 538 955258 539 945544 540 937501 541 929344 542 921524 543 912981 544 905112 545 896466 546 888334 547 877919 548 869225 549 859803 550 853669 551 845853 552 835948 553 829269 554 820107 555 813400 556 804956 557 796734 558 786337 559 779908 560 770929 561 765774 562 757563 563 749972 564 739824 565 733766 566 724799 567 716574 568 709183 569 704110 570 696012 571 687855 572 680039 573 670937 574 663486 575 659482 576 650257 577 643742 578 636168 579 629853 580 623467 581 614812 582 609438 583 601521 584 595909 585 589200 586 583636 587 573187 588 569631 589 562662 590 556391 591 549285 592 544474 593 538645 594 531490 595 525170 596 519737 597 513838 598 507783 599 501958 600 495496 601 490307 602 482581 603 478425 604 472459 605 465381 606 461319 607 456089 608 449541 609 444119 610 437448 611 431934 612 427694 613 422627 614 417064 615 412517 616 408043 617 403050 618 396635 619 392612 620 386465 621 380963 622 375485 623 371481 624 366779 625 361937 626 357069 627 352610 628 347411 629 343865 630 338224 631 333820 632 330131 633 325036 634 322037 635 317104 636 312050 637 306736 638 301467 639 298773 640 294944 641 291383 642 287043 643 284636 644 279939 645 275490 646 270794 647 268420 648 264030 649 261382 650 256705 651 253323 652 251042 653 246327 654 243568 655 239624 656 236288 657 232622 658 229591 659 226871 660 223225 661 220110 662 216503 663 214007 664 210675 665 207796 666 204441 667 201326 668 198563 669 196256 670 192295 671 189965 672 186949 673 184575 674 181745 675 180091 676 176221 677 172931 678 170549 679 168103 680 165919 681 163733 682 161178 683 158913 684 156583 685 152472 686 151732 687 147996 688 145895 689 143844 690 141630 691 139251 692 137123 693 135124 694 134038 695 131061 696 128745 697 127073 698 124457 699 122708 700 120473 701 119904 702 116310 703 115288 704 113436 705 111676 706 109352 707 107687 708 106305 709 104139 710 102993 711 100396 712 99273 713 98290 714 95778 715 94657 716 92655 717 91762 718 89875 719 88366 720 87234 721 85415 722 84208 723 83250 724 81165 725 79868 726 78578 727 77632 728 76240 729 74959 730 73120 731 71922 732 71022 733 70053 734 68864 735 67591 736 66639 737 65453 738 64016 739 63684 740 61740 741 61333 742 60606 743 59376 744 58621 745 57476 746 56196 747 55063 748 54809 749 53645 750 52544 751 52283 752 50944 753 50080 754 49357 755 48279 756 47115 757 46663 758 45899 759 44863 760 44337 761 43787 762 42592 763 41831 764 41572 765 40705 766 39832 767 38842 768 38465 769 37477 770 37056 771 36206 772 35206 773 34931 774 34640 775 33950 776 33087 777 32397 778 31909 779 31344 780 30744 781 30192 782 29682 783 29048 784 28546 785 27904 786 27503 787 26772 788 26346 789 25768 790 25445 791 24934 792 24069 793 23907 794 23547 795 22775 796 22638 797 22184 798 21861 799 21395 800 20890 801 20189 802 20009 803 19597 804 19299 805 18927 806 18382 807 18100 808 17924 809 17386 810 16914 811 16777 812 16175 813 16322 814 15798 815 15859 816 15435 817 14876 818 14791 819 14470 820 14160 821 13863 822 13648 823 13144 824 13209 825 12957 826 12671 827 12593 828 12307 829 11838 830 11808 831 11459 832 11376 833 11098 834 10850 835 10686 836 10477 837 10248 838 10077 839 9933 840 9929 841 9602 842 9213 843 9024 844 9041 845 8743 846 8548 847 8329 848 8275 849 8162 850 7905 851 7668 852 7764 853 7620 854 7387 855 7310 856 7149 857 7062 858 6887 859 6759 860 6597 861 6629 862 6426 863 5801 864 5674 865 5721 866 5591 867 5566 868 5395 869 5188 870 5295 871 5120 872 5044 873 4995 874 5103 875 4551 876 4662 877 4393 878 4301 879 4218 880 4056 881 4387 882 3935 883 3852 884 3790 885 3744 886 3688 887 3530 888 3746 889 3402 890 3642 891 3239 892 2945 893 2782 894 2686 895 2753 896 2619 897 2513 898 2460 899 2340 900 2322 901 2310 902 2203 903 2240 904 2095 905 2173 906 2071 907 2106 908 2019 909 2030 910 1929 911 1944 912 1808 913 1829 914 1798 915 1709 916 1757 917 1678 918 1625 919 1689 920 1580 921 1583 922 1468 923 1415 924 1474 925 1438 926 1384 927 1350 928 1388 929 1300 930 1269 931 1268 932 1253 933 1285 934 1278 935 1261 936 1190 937 1162 938 1162 939 1061 940 1102 941 1064 942 1029 943 1035 944 1025 945 1003 946 941 947 956 948 986 949 914 950 876 951 897 952 894 953 864 954 849 955 821 956 821 957 781 958 800 959 761 960 772 961 714 962 727 963 696 964 638 965 680 966 704 967 649 968 634 969 659 970 594 971 595 972 596 973 606 974 554 975 587 976 560 977 550 978 542 979 536 980 534 981 503 982 539 983 460 984 545 985 444 986 481 987 481 988 434 989 439 990 436 991 427 992 438 993 433 994 444 995 396 996 386 997 408 998 383 999 380 1000 372 1001 376 1002 339 1003 325 1004 365 1005 315 1006 332 1007 320 1008 342 1009 340 1010 357 1011 304 1012 288 1013 320 1014 324 1015 329 1016 289 1017 269 1018 288 1019 255 1020 264 1021 241 1022 275 1023 268 1024 239 1025 239 1026 230 1027 255 1028 225 1029 243 1030 241 1031 229 1032 225 1033 204 1034 221 1035 206 1036 208 1037 180 1038 216 1039 201 1040 207 1041 195 1042 210 1043 189 1044 196 1045 176 1046 212 1047 183 1048 203 1049 199 1050 162 1051 172 1052 155 1053 157 1054 174 1055 177 1056 153 1057 171 1058 150 1059 165 1060 157 1061 149 1062 136 1063 142 1064 166 1065 164 1066 162