#SentieonCommandLine: /lustre8/home/ykawai-tnproj-pg/packages/sentieon-genomics-201911/libexec/driver -t 8 -r /lustre8/home/ncbn-pg/data/resource/Homo_sapiens_assembly38.fasta -i HGDP/HGDP00859/HGDP00859.cram --algo InsertSizeMetricAlgo HGDP/HGDP00859/QCmetrics/HGDP00859.InsertSizeMetricAlgo.txt MEDIAN_INSERT_SIZE MEDIAN_ABSOLUTE_DEVIATION MIN_INSERT_SIZE MAX_INSERT_SIZE MEAN_INSERT_SIZE STANDARD_DEVIATION READ_PAIRS PAIR_ORIENTATION WIDTH_OF_10_PERCENT WIDTH_OF_20_PERCENT WIDTH_OF_30_PERCENT WIDTH_OF_40_PERCENT WIDTH_OF_50_PERCENT WIDTH_OF_60_PERCENT WIDTH_OF_70_PERCENT WIDTH_OF_80_PERCENT WIDTH_OF_90_PERCENT WIDTH_OF_99_PERCENT 421.000000 62.000000 2 245550303 433.097469 99.352655 427352195 FR 25 49 73 99 125 155 189 235 317 653 insert_size All_Reads.fr_count 2 1803 3 1876 4 1925 5 2035 6 2006 7 1920 8 2032 9 2055 10 2058 11 2014 12 2041 13 2234 14 2163 15 2148 16 2257 17 2314 18 2523 19 4244 20 4566 21 4420 22 4414 23 5198 24 5501 25 5718 26 5821 27 5996 28 6248 29 6515 30 6671 31 6970 32 7415 33 8229 34 8959 35 9104 36 9495 37 9995 38 10564 39 11090 40 11668 41 11760 42 12277 43 13058 44 13784 45 13834 46 14198 47 14093 48 15457 49 15650 50 15567 51 16047 52 15785 53 16878 54 17518 55 17525 56 17529 57 17581 58 18554 59 19262 60 19271 61 19561 62 19825 63 20536 64 21136 65 21470 66 21474 67 21228 68 22558 69 23250 70 22822 71 23113 72 23526 73 23686 74 24370 75 23795 76 23357 77 22924 78 23866 79 24268 80 23925 81 23305 82 22747 83 23881 84 24272 85 23978 86 23401 87 22544 88 23510 89 24023 90 23887 91 22692 92 22647 93 23633 94 24524 95 23815 96 23359 97 23432 98 23934 99 24063 100 23603 101 23754 102 23636 103 24412 104 24555 105 23810 106 23569 107 22827 108 23634 109 23706 110 23131 111 22529 112 22575 113 22568 114 22905 115 22428 116 22107 117 21356 118 21801 119 21936 120 21657 121 21206 122 20806 123 20679 124 20869 125 20538 126 20405 127 19965 128 19957 129 20478 130 20494 131 20010 132 19811 133 19745 134 20450 135 20132 136 19524 137 19288 138 19484 139 19659 140 19420 141 18710 142 18662 143 18333 144 18723 145 18462 146 18356 147 17956 148 17555 149 17726 150 17349 151 16783 152 16855 153 17061 154 17067 155 16395 156 16552 157 15966 158 15914 159 15565 160 15434 161 15048 162 14877 163 14813 164 15016 165 14751 166 14674 167 14704 168 14778 169 14562 170 14660 171 14615 172 14329 173 14461 174 14582 175 14295 176 13964 177 13856 178 14055 179 13677 180 13705 181 13504 182 13451 183 13520 184 13150 185 13176 186 13181 187 13102 188 13041 189 13429 190 13130 191 13079 192 13162 193 13109 194 13427 195 13262 196 13218 197 13435 198 13418 199 13686 200 13800 201 13848 202 14048 203 14065 204 14466 205 14397 206 14718 207 15230 208 15527 209 15973 210 16259 211 16549 212 17344 213 18150 214 18787 215 18735 216 19845 217 20468 218 21329 219 21672 220 22564 221 23376 222 24504 223 25294 224 26539 225 27373 226 28626 227 30131 228 31359 229 32931 230 34194 231 35918 232 37802 233 39124 234 41511 235 43403 236 45270 237 47455 238 50093 239 53167 240 55337 241 58126 242 61149 243 63537 244 67246 245 70638 246 74485 247 78059 248 82303 249 87045 250 90584 251 94565 252 99861 253 104892 254 110224 255 115238 256 120676 257 126416 258 133130 259 140175 260 146920 261 153461 262 160627 263 168175 264 176480 265 184675 266 193038 267 201817 268 209942 269 219980 270 230294 271 240713 272 250770 273 260650 274 273818 275 284755 276 299743 277 310565 278 322396 279 335199 280 347872 281 359980 282 374204 283 387956 284 403683 285 416579 286 431481 287 446315 288 462331 289 479561 290 494630 291 512386 292 529514 293 548072 294 564835 295 583793 296 599810 297 619992 298 637736 299 657947 300 677188 301 697337 302 716438 303 737455 304 758673 305 778061 306 798596 307 818292 308 840971 309 860755 310 883327 311 904466 312 924450 313 949001 314 969088 315 992140 316 1013100 317 1034491 318 1052665 319 1079571 320 1098058 321 1121844 322 1144725 323 1164716 324 1190139 325 1210100 326 1231162 327 1249763 328 1274847 329 1292175 330 1314731 331 1336452 332 1358742 333 1378075 334 1402868 335 1419225 336 1439369 337 1456300 338 1475159 339 1493221 340 1511028 341 1527472 342 1548201 343 1566148 344 1583756 345 1601247 346 1613838 347 1631194 348 1645009 349 1659081 350 1673639 351 1689058 352 1701006 353 1719388 354 1731407 355 1744089 356 1758675 357 1768024 358 1779073 359 1788751 360 1798615 361 1811244 362 1818669 363 1831150 364 1839729 365 1848553 366 1856502 367 1863706 368 1871409 369 1880185 370 1885315 371 1888939 372 1894336 373 1900432 374 1909891 375 1913667 376 1917925 377 1921878 378 1923937 379 1926955 380 1929459 381 1927865 382 1932010 383 1935227 384 1939756 385 1939267 386 1940939 387 1942991 388 1940783 389 1941035 390 1939615 391 1939098 392 1936312 393 1935633 394 1935559 395 1935134 396 1931039 397 1930011 398 1930459 399 1927890 400 1924771 401 1916620 402 1915124 403 1912318 404 1908883 405 1905093 406 1903293 407 1896361 408 1893989 409 1890525 410 1882997 411 1874700 412 1870154 413 1865564 414 1857972 415 1850931 416 1845289 417 1841153 418 1836357 419 1826791 420 1818621 421 1812421 422 1804016 423 1796398 424 1790173 425 1781597 426 1773880 427 1767091 428 1761228 429 1752058 430 1742651 431 1735291 432 1727331 433 1715248 434 1708858 435 1701414 436 1692600 437 1683945 438 1676989 439 1667700 440 1661905 441 1648814 442 1639132 443 1632521 444 1623427 445 1610505 446 1604722 447 1594325 448 1585409 449 1577607 450 1568740 451 1557773 452 1546690 453 1539805 454 1529434 455 1520943 456 1508289 457 1498744 458 1491959 459 1482489 460 1471717 461 1463743 462 1454640 463 1443564 464 1434463 465 1426354 466 1414260 467 1406793 468 1396961 469 1388175 470 1378950 471 1368110 472 1360347 473 1349520 474 1338100 475 1329414 476 1321469 477 1310519 478 1303996 479 1292758 480 1282665 481 1273072 482 1265613 483 1255886 484 1246868 485 1235812 486 1226561 487 1217509 488 1206424 489 1197384 490 1189933 491 1180308 492 1172497 493 1162312 494 1154265 495 1143557 496 1134400 497 1126240 498 1116584 499 1106533 500 1102065 501 1090912 502 1081769 503 1072856 504 1064889 505 1056479 506 1045534 507 1037417 508 1027263 509 1019572 510 1011827 511 1004558 512 994685 513 986199 514 978733 515 969372 516 959643 517 952728 518 944387 519 937399 520 927878 521 919715 522 910881 523 903825 524 895614 525 887034 526 878188 527 870347 528 861815 529 852190 530 846581 531 837723 532 829704 533 822781 534 815370 535 807682 536 795924 537 790116 538 781694 539 773584 540 767300 541 760489 542 752612 543 745668 544 737983 545 729799 546 721753 547 715983 548 707295 549 700060 550 692282 551 686161 552 678697 553 672487 554 665294 555 657895 556 650442 557 644819 558 637009 559 630177 560 622804 561 617299 562 610665 563 605172 564 598842 565 590077 566 585373 567 578365 568 571293 569 566579 570 559402 571 552919 572 546937 573 540145 574 535908 575 528864 576 523370 577 517102 578 510855 579 505096 580 499187 581 493504 582 486933 583 480937 584 477139 585 469124 586 464327 587 460281 588 454410 589 448121 590 441697 591 436889 592 430978 593 426120 594 421044 595 416439 596 410354 597 406978 598 400972 599 396212 600 389693 601 383585 602 379520 603 374317 604 370173 605 365331 606 360004 607 355888 608 350975 609 347758 610 342694 611 336838 612 333150 613 328442 614 322980 615 319425 616 315779 617 312278 618 306989 619 301745 620 299091 621 294370 622 290870 623 287013 624 283427 625 279370 626 274663 627 271063 628 267508 629 263596 630 259586 631 256342 632 252372 633 249482 634 246724 635 242593 636 239102 637 235876 638 232114 639 228823 640 225254 641 222377 642 218638 643 214891 644 212789 645 209717 646 205717 647 203781 648 199135 649 197283 650 194265 651 190453 652 188673 653 184742 654 182512 655 178954 656 176951 657 173773 658 171845 659 168984 660 166263 661 164244 662 160881 663 158406 664 156047 665 153504 666 152216 667 149432 668 146939 669 143744 670 142606 671 139612 672 137693 673 135429 674 133820 675 131169 676 130168 677 127593 678 125214 679 123472 680 120260 681 118529 682 116811 683 115897 684 113148 685 111418 686 109508 687 108118 688 106322 689 103437 690 102883 691 100666 692 99628 693 97496 694 95954 695 93381 696 92334 697 91096 698 88832 699 88208 700 85982 701 85220 702 83743 703 81808 704 81058 705 80113 706 78161 707 76199 708 75408 709 74388 710 73444 711 71706 712 70248 713 69585 714 68166 715 66390 716 65336 717 64284 718 63590 719 61975 720 61902 721 60154 722 58772 723 58347 724 56880 725 56001 726 54917 727 53892 728 53291 729 51967 730 51266 731 50283 732 49766 733 48586 734 47493 735 47284 736 46446 737 45483 738 44623 739 44056 740 43358 741 42662 742 42070 743 41424 744 40143 745 39543 746 38901 747 38191 748 37572 749 36816 750 36154 751 35365 752 34842 753 33665 754 33774 755 32904 756 32328 757 31672 758 31136 759 30473 760 29783 761 29512 762 28956 763 28636 764 27450 765 27191 766 26614 767 25995 768 25480 769 25256 770 24820 771 24588 772 24176 773 23403 774 23179 775 22804 776 22042 777 21939 778 21666 779 20843 780 20419 781 20013 782 19692 783 19565 784 19374 785 18887 786 18209 787 18015 788 17525 789 17430 790 17069 791 16861 792 16365 793 15920 794 16047 795 15684 796 15504 797 14993 798 14706 799 14516 800 14253 801 14074 802 13674 803 13471 804 13175 805 12862 806 12690 807 12612 808 12254 809 12030 810 11830 811 11531 812 11440 813 11287 814 11013 815 10934 816 10595 817 10256 818 10438 819 9938 820 9771 821 9533 822 9607 823 9399 824 9116 825 9282 826 8931 827 8552 828 8696 829 8523 830 8326 831 8237 832 8028 833 8176 834 7886 835 7753 836 7815 837 7838 838 7471 839 7405 840 6870 841 6912 842 6512 843 6359 844 6441 845 6195 846 6365 847 5965 848 5704 849 5643 850 5537 851 5486 852 5708 853 5181 854 5012 855 4966 856 4929 857 4760 858 4643 859 4594 860 5076 861 4377 862 4110 863 3794 864 3754 865 3860 866 3638 867 3511 868 3529 869 3412 870 3358 871 3246 872 3342 873 3194 874 3132 875 3118 876 3318 877 2907 878 2784 879 2681 880 2679 881 2687 882 2593 883 2585 884 2573 885 2707 886 2287 887 2350 888 2089 889 2284 890 2151 891 2083 892 2116 893 1994 894 1945 895 1976 896 1907 897 1832 898 1839 899 1808 900 1795 901 1774 902 1755 903 1632 904 1665 905 1622 906 1626 907 1521 908 1504 909 1523 910 1572 911 1552 912 1509 913 1413 914 1448 915 1361 916 1403 917 1387 918 1342 919 1333 920 1302 921 1269 922 1191 923 1188 924 1260 925 1170 926 1205 927 1103 928 1128 929 1138 930 1066 931 1098 932 1085 933 1044 934 979 935 1008 936 1029 937 919 938 949 939 924 940 979 941 955 942 923 943 888 944 875 945 896 946 847 947 933 948 864 949 831 950 793 951 800 952 787 953 735 954 757 955 734 956 731 957 679 958 710 959 680 960 701 961 641 962 642 963 659 964 635 965 610 966 671 967 622 968 617 969 615 970 574 971 589 972 585 973 548 974 595 975 540 976 557 977 599 978 597 979 525 980 471 981 496 982 515 983 531 984 506 985 500 986 495 987 461 988 475 989 474 990 439 991 443 992 446 993 423 994 438 995 423 996 399 997 427 998 372 999 393 1000 397 1001 410 1002 365 1003 365 1004 390 1005 398 1006 372 1007 354 1008 334 1009 409 1010 351 1011 360 1012 357 1013 354 1014 316 1015 316 1016 334 1017 335 1018 314 1019 309 1020 310 1021 291 1022 318 1023 299 1024 304 1025 257 1026 258 1027 249 1028 293 1029 270 1030 279 1031 251 1032 271 1033 257 1034 258 1035 235 1036 269 1037 240 1038 248 1039 246 1040 242 1041 260