#SentieonCommandLine: /lustre8/home/ykawai-tnproj-pg/packages/sentieon-genomics-201911/libexec/driver -t 8 -r /lustre8/home/ncbn-pg/data/resource/Homo_sapiens_assembly38.fasta -i HGDP/HGDP00864/HGDP00864.cram --algo InsertSizeMetricAlgo HGDP/HGDP00864/QCmetrics/HGDP00864.InsertSizeMetricAlgo.txt MEDIAN_INSERT_SIZE MEDIAN_ABSOLUTE_DEVIATION MIN_INSERT_SIZE MAX_INSERT_SIZE MEAN_INSERT_SIZE STANDARD_DEVIATION READ_PAIRS PAIR_ORIENTATION WIDTH_OF_10_PERCENT WIDTH_OF_20_PERCENT WIDTH_OF_30_PERCENT WIDTH_OF_40_PERCENT WIDTH_OF_50_PERCENT WIDTH_OF_60_PERCENT WIDTH_OF_70_PERCENT WIDTH_OF_80_PERCENT WIDTH_OF_90_PERCENT WIDTH_OF_99_PERCENT 418.000000 64.000000 2 244631963 432.715513 103.590776 351625186 FR 25 51 75 101 129 161 197 245 335 671 insert_size All_Reads.fr_count 2 1432 3 1532 4 1475 5 1553 6 1460 7 1486 8 1477 9 1555 10 1491 11 1514 12 1427 13 1590 14 1553 15 1607 16 1686 17 1607 18 1782 19 3249 20 3590 21 3527 22 3887 23 4286 24 4692 25 4835 26 5113 27 5184 28 5489 29 5720 30 5909 31 6137 32 6648 33 6925 34 7468 35 7769 36 7789 37 8214 38 8774 39 9299 40 9369 41 9657 42 9855 43 10519 44 10823 45 11192 46 11346 47 11602 48 12305 49 12930 50 13234 51 13897 52 13865 53 14800 54 15612 55 15335 56 15393 57 15495 58 16544 59 16757 60 16765 61 16846 62 17125 63 17327 64 18039 65 18055 66 17900 67 17547 68 18339 69 18727 70 18649 71 18180 72 18472 73 18565 74 19361 75 18863 76 18659 77 18407 78 19338 79 19944 80 19530 81 19252 82 19400 83 20301 84 20908 85 21119 86 20805 87 20328 88 20713 89 20858 90 20522 91 20453 92 19680 93 20235 94 20727 95 20096 96 19680 97 19315 98 19884 99 20093 100 19342 101 19519 102 18960 103 19581 104 19709 105 19129 106 18780 107 18582 108 19124 109 19324 110 18944 111 18776 112 18321 113 18788 114 18905 115 18636 116 18533 117 18104 118 19003 119 19220 120 18848 121 18676 122 18349 123 18341 124 18311 125 18201 126 17592 127 17455 128 17539 129 17509 130 17423 131 17131 132 17118 133 17121 134 17048 135 16879 136 16570 137 16605 138 16377 139 16890 140 16658 141 16078 142 16312 143 16494 144 16111 145 15918 146 15654 147 15546 148 15418 149 15580 150 15033 151 15183 152 15079 153 15234 154 15135 155 15183 156 14980 157 15159 158 15365 159 15319 160 14975 161 14992 162 14745 163 14484 164 14571 165 14787 166 14744 167 14458 168 14091 169 14288 170 14152 171 14071 172 13762 173 13943 174 14100 175 13839 176 13816 177 13614 178 13647 179 13608 180 13461 181 13602 182 13259 183 13516 184 13335 185 13202 186 13322 187 13177 188 13374 189 13205 190 13486 191 13454 192 13535 193 13569 194 13625 195 13635 196 13573 197 13991 198 14159 199 14255 200 14562 201 14967 202 15302 203 15451 204 15784 205 15874 206 16369 207 16598 208 16849 209 17248 210 17697 211 18245 212 18259 213 18972 214 19372 215 19968 216 20880 217 21131 218 21963 219 22856 220 23966 221 24387 222 25398 223 26621 224 27264 225 28813 226 29558 227 30973 228 32322 229 33940 230 35720 231 36915 232 38744 233 40584 234 42588 235 44556 236 46589 237 48471 238 50747 239 53800 240 56257 241 59166 242 62190 243 65068 244 68007 245 71297 246 74799 247 78915 248 82107 249 86081 250 90908 251 95112 252 100594 253 105218 254 109405 255 115047 256 120462 257 126020 258 132373 259 138747 260 144048 261 150929 262 157462 263 164683 264 171670 265 179007 266 186491 267 195523 268 203037 269 212639 270 221009 271 229593 272 239875 273 250257 274 260922 275 270007 276 285890 277 294754 278 304676 279 317183 280 326759 281 338925 282 351378 283 364230 284 376382 285 389573 286 401223 287 415684 288 429612 289 443869 290 457797 291 472733 292 488486 293 503305 294 518986 295 534454 296 550941 297 564493 298 582078 299 598880 300 615328 301 632935 302 650868 303 668834 304 686450 305 701604 306 719412 307 737390 308 753892 309 773135 310 790092 311 808388 312 827100 313 846922 314 863904 315 882222 316 899502 317 915903 318 934202 319 950758 320 969506 321 988435 322 1007910 323 1025205 324 1042338 325 1062667 326 1078428 327 1092201 328 1111010 329 1124700 330 1143758 331 1159446 332 1174819 333 1195182 334 1207627 335 1222865 336 1238741 337 1252466 338 1266524 339 1279248 340 1294149 341 1307688 342 1321475 343 1336834 344 1346071 345 1361387 346 1371323 347 1384532 348 1394955 349 1405214 350 1415248 351 1425716 352 1435599 353 1442846 354 1454631 355 1465634 356 1475330 357 1482589 358 1489007 359 1496011 360 1501560 361 1507830 362 1512347 363 1520616 364 1527419 365 1530520 366 1536717 367 1541567 368 1543981 369 1547961 370 1551801 371 1553779 372 1558928 373 1560547 374 1564558 375 1566242 376 1572071 377 1570608 378 1572439 379 1570487 380 1573920 381 1570971 382 1572113 383 1571464 384 1569215 385 1572986 386 1570082 387 1568403 388 1566217 389 1563735 390 1557394 391 1555837 392 1556355 393 1554171 394 1549676 395 1549076 396 1545804 397 1542801 398 1538854 399 1535205 400 1532208 401 1524842 402 1522538 403 1517880 404 1512497 405 1510461 406 1506583 407 1500299 408 1495655 409 1491152 410 1483880 411 1477928 412 1471734 413 1465767 414 1460825 415 1456232 416 1451661 417 1442694 418 1437860 419 1430734 420 1422444 421 1416452 422 1407936 423 1402488 424 1396632 425 1388065 426 1381299 427 1377304 428 1370287 429 1365777 430 1356461 431 1346219 432 1340584 433 1333343 434 1323648 435 1315667 436 1312768 437 1304813 438 1296667 439 1292300 440 1283469 441 1275947 442 1268897 443 1261357 444 1251622 445 1247998 446 1239254 447 1231338 448 1224601 449 1218359 450 1210587 451 1203334 452 1195048 453 1188215 454 1182391 455 1175597 456 1162980 457 1158361 458 1150392 459 1143616 460 1136460 461 1130898 462 1121853 463 1113304 464 1107064 465 1099785 466 1092329 467 1083456 468 1077651 469 1071149 470 1063902 471 1055928 472 1051232 473 1043030 474 1036020 475 1028209 476 1019125 477 1013943 478 1006064 479 1000793 480 993955 481 987821 482 981781 483 972748 484 966236 485 957111 486 950876 487 945141 488 940196 489 930716 490 925224 491 920190 492 912894 493 906974 494 898652 495 892732 496 884075 497 877184 498 873004 499 865887 500 860387 501 854063 502 848256 503 842191 504 833693 505 827205 506 823112 507 812866 508 808609 509 803035 510 797128 511 789373 512 784049 513 779479 514 772710 515 766059 516 758613 517 752617 518 747088 519 741768 520 735381 521 729877 522 724392 523 718473 524 711968 525 705335 526 700053 527 695525 528 688832 529 684270 530 677636 531 670547 532 664967 533 659379 534 653759 535 648958 536 641877 537 637591 538 629808 539 625494 540 618527 541 613719 542 608950 543 603931 544 596276 545 591459 546 585349 547 579951 548 576049 549 571328 550 565329 551 559698 552 554466 553 549523 554 544484 555 538052 556 533298 557 527662 558 523792 559 518360 560 513121 561 508290 562 503045 563 498769 564 494591 565 488026 566 484068 567 478326 568 475033 569 470573 570 465224 571 460149 572 456408 573 452157 574 446179 575 441329 576 436722 577 432770 578 428988 579 422984 580 418698 581 413598 582 410637 583 406618 584 402403 585 397593 586 392902 587 387815 588 385569 589 380757 590 376336 591 373069 592 368210 593 364095 594 360105 595 356513 596 351089 597 346202 598 342892 599 340261 600 336610 601 331234 602 328106 603 322825 604 320002 605 316100 606 312296 607 309734 608 304695 609 301347 610 297620 611 294467 612 289637 613 287141 614 282210 615 280467 616 277714 617 274402 618 269948 619 267388 620 264546 621 261267 622 256046 623 253163 624 250488 625 247864 626 244946 627 241717 628 238285 629 235510 630 232042 631 229638 632 226958 633 223337 634 221208 635 217627 636 215455 637 211897 638 209822 639 207416 640 205120 641 202100 642 199073 643 197086 644 194659 645 191275 646 188907 647 186886 648 183899 649 181621 650 179443 651 176186 652 173877 653 172560 654 169011 655 167361 656 164415 657 163475 658 160818 659 158801 660 156142 661 153930 662 151621 663 149993 664 147895 665 145697 666 143567 667 141243 668 139647 669 138026 670 135990 671 134076 672 132039 673 130813 674 128154 675 126960 676 124637 677 122526 678 121387 679 118836 680 118015 681 115636 682 114097 683 112855 684 110314 685 109445 686 107506 687 106665 688 104964 689 103229 690 101548 691 99336 692 97986 693 97211 694 95028 695 94086 696 92439 697 91008 698 89579 699 88080 700 86644 701 85429 702 84249 703 82743 704 81686 705 80089 706 78697 707 78499 708 76837 709 75521 710 74987 711 72796 712 72140 713 70627 714 69752 715 68305 716 67435 717 66727 718 65873 719 64153 720 63597 721 62403 722 61171 723 60919 724 59473 725 58187 726 57330 727 56789 728 55574 729 54552 730 53940 731 52720 732 52188 733 51567 734 50578 735 49813 736 48499 737 48776 738 47603 739 46644 740 45740 741 45472 742 44664 743 43452 744 42843 745 41870 746 41031 747 40422 748 39778 749 39428 750 38407 751 37931 752 37676 753 36662 754 36173 755 35479 756 34848 757 34560 758 33633 759 32815 760 32864 761 32069 762 31403 763 30658 764 29946 765 29473 766 28961 767 28359 768 28137 769 27539 770 26674 771 26442 772 25914 773 25541 774 25017 775 24596 776 24266 777 23607 778 23544 779 22720 780 22276 781 21962 782 21509 783 21240 784 20937 785 20347 786 19943 787 19576 788 19430 789 18945 790 18771 791 18347 792 18017 793 17804 794 17235 795 17063 796 16647 797 16407 798 16376 799 15671 800 15561 801 15489 802 15099 803 14650 804 14292 805 14273 806 13879 807 13690 808 13076 809 13083 810 12790 811 12464 812 12239 813 12144 814 11825 815 11557 816 11462 817 11264 818 11044 819 10788 820 10643 821 10390 822 10190 823 10159 824 9924 825 9516 826 9409 827 9112 828 9223 829 8989 830 8993 831 8789 832 8563 833 8227 834 8262 835 7899 836 7913 837 7958 838 7593 839 7467 840 7357 841 7114 842 6944 843 6803 844 6784 845 6566 846 6493 847 6415 848 6453 849 6388 850 6168 851 6217 852 6053 853 5751 854 5798 855 5916 856 5516 857 5337 858 5062 859 5104 860 4907 861 4814 862 4619 863 4522 864 4442 865 4407 866 4752 867 4145 868 3930 869 4041 870 3924 871 3771 872 3834 873 3643 874 3886 875 3506 876 3549 877 3471 878 3075 879 3006 880 2981 881 2935 882 2908 883 2695 884 2754 885 2691 886 2625 887 2524 888 2426 889 2379 890 2378 891 2285 892 2272 893 2185 894 2241 895 2127 896 2034 897 2062 898 2114 899 2013 900 1936 901 2092 902 1877 903 1793 904 1710 905 1766 906 1652 907 1713 908 1629 909 1591 910 1564 911 1503 912 1552 913 1664 914 1410 915 1435 916 1299 917 1301 918 1243 919 1140 920 1243 921 1261 922 1135 923 1115 924 1108 925 1113 926 1137 927 1053 928 1073 929 987 930 1017 931 938 932 995 933 990 934 901 935 936 936 866 937 858 938 913 939 852 940 846 941 823 942 805 943 856 944 761 945 792 946 756 947 751 948 766 949 740 950 708 951 708 952 702 953 687 954 645 955 672 956 618 957 622 958 614 959 643 960 630 961 602 962 557 963 557 964 542 965 491 966 499 967 555 968 481 969 519 970 445 971 416 972 486 973 437 974 446 975 482 976 415 977 418 978 385 979 427 980 385 981 419 982 409 983 396 984 357 985 417 986 384 987 366 988 370 989 357 990 322 991 334 992 299 993 334 994 317 995 340 996 307 997 280 998 299 999 292 1000 279 1001 270 1002 268 1003 274 1004 286 1005 253 1006 237 1007 259 1008 258 1009 252 1010 250 1011 236 1012 251 1013 247 1014 243 1015 205 1016 211 1017 237 1018 226 1019 238 1020 224 1021 205 1022 223 1023 220 1024 196 1025 195 1026 212 1027 193 1028 178 1029 161 1030 187 1031 202 1032 177 1033 178 1034 183 1035 193 1036 181 1037 167 1038 157 1039 152 1040 161 1041 157 1042 182 1043 147 1044 160 1045 178 1046 148 1047 151 1048 149 1049 136 1050 139 1051 136 1052 137 1053 141 1054 128 1055 132 1056 125 1057 130 1058 128