#SentieonCommandLine: /lustre8/home/ykawai-tnproj-pg/packages/sentieon-genomics-201911/libexec/driver -t 8 -r /lustre8/home/ncbn-pg/data/resource/Homo_sapiens_assembly38.fasta -i HGDP/HGDP00865/HGDP00865.cram --algo InsertSizeMetricAlgo HGDP/HGDP00865/QCmetrics/HGDP00865.InsertSizeMetricAlgo.txt MEDIAN_INSERT_SIZE MEDIAN_ABSOLUTE_DEVIATION MIN_INSERT_SIZE MAX_INSERT_SIZE MEAN_INSERT_SIZE STANDARD_DEVIATION READ_PAIRS PAIR_ORIENTATION WIDTH_OF_10_PERCENT WIDTH_OF_20_PERCENT WIDTH_OF_30_PERCENT WIDTH_OF_40_PERCENT WIDTH_OF_50_PERCENT WIDTH_OF_60_PERCENT WIDTH_OF_70_PERCENT WIDTH_OF_80_PERCENT WIDTH_OF_90_PERCENT WIDTH_OF_99_PERCENT 416.000000 61.000000 2 243251216 429.451201 98.128505 389358331 FR 25 47 71 97 123 153 187 231 313 643 insert_size All_Reads.fr_count 2 1271 3 1414 4 1390 5 1471 6 1359 7 1503 8 1393 9 1367 10 1468 11 1421 12 1393 13 1599 14 1558 15 1644 16 1772 17 1521 18 1896 19 3638 20 3646 21 3631 22 3817 23 4353 24 4658 25 4749 26 5076 27 5139 28 5467 29 5665 30 5962 31 6145 32 6451 33 6705 34 7283 35 7763 36 8097 37 8378 38 9032 39 9412 40 10212 41 10343 42 10890 43 11422 44 11713 45 12071 46 12145 47 12508 48 13069 49 13513 50 13585 51 14034 52 13968 53 14714 54 15102 55 15135 56 15476 57 15383 58 16188 59 16519 60 16794 61 16879 62 16782 63 17160 64 17590 65 17756 66 18218 67 18680 68 19320 69 20088 70 20023 71 19730 72 19719 73 19984 74 20401 75 19986 76 19933 77 20041 78 20277 79 20563 80 20219 81 19871 82 19655 83 20078 84 20541 85 20307 86 19959 87 19543 88 20042 89 20154 90 20316 91 19695 92 19275 93 19465 94 20025 95 19461 96 19862 97 19584 98 20365 99 21179 100 20602 101 20547 102 19827 103 20203 104 20651 105 19927 106 20237 107 19499 108 19716 109 20091 110 19852 111 19244 112 19160 113 18932 114 19126 115 18938 116 19148 117 18071 118 18374 119 18692 120 18506 121 17901 122 17530 123 17648 124 17670 125 17789 126 17272 127 16926 128 16758 129 17129 130 17223 131 17597 132 17205 133 17517 134 17478 135 17008 136 16944 137 16695 138 16710 139 16796 140 16449 141 16308 142 16209 143 16181 144 16202 145 15674 146 15640 147 15272 148 15227 149 15138 150 14955 151 15040 152 14927 153 14646 154 14637 155 14412 156 14177 157 13917 158 13852 159 14153 160 13650 161 13365 162 13310 163 13344 164 13277 165 12944 166 13168 167 12900 168 13227 169 13552 170 13302 171 13146 172 12876 173 12971 174 12894 175 12854 176 12527 177 12458 178 12689 179 12585 180 12151 181 12136 182 11913 183 11839 184 11969 185 11972 186 11906 187 11581 188 11763 189 11781 190 11550 191 11288 192 11566 193 11480 194 11533 195 11362 196 11549 197 11355 198 11451 199 11353 200 11521 201 11594 202 11420 203 11592 204 11666 205 11672 206 11954 207 11928 208 12294 209 12693 210 12895 211 13418 212 13558 213 13835 214 14130 215 14442 216 14510 217 15148 218 15592 219 15784 220 16184 221 16689 222 17264 223 18164 224 18944 225 19910 226 20509 227 21221 228 22692 229 23382 230 24956 231 26108 232 26971 233 28495 234 30042 235 31360 236 33399 237 35371 238 37385 239 39564 240 41587 241 43910 242 46776 243 49399 244 52352 245 55195 246 58264 247 61669 248 65482 249 69591 250 73649 251 78222 252 82357 253 87017 254 91665 255 97279 256 102327 257 108885 258 115067 259 121403 260 128849 261 136090 262 143522 263 151617 264 158338 265 167940 266 174046 267 184219 268 193804 269 202755 270 213276 271 223910 272 234491 273 245943 274 258108 275 269705 276 286535 277 297776 278 310207 279 321885 280 334734 281 346798 282 362261 283 376868 284 391297 285 406980 286 420395 287 436898 288 453059 289 469850 290 486135 291 503882 292 523295 293 539658 294 555772 295 573570 296 591867 297 611848 298 631801 299 649407 300 670986 301 691609 302 710838 303 732115 304 752729 305 772508 306 791814 307 811136 308 833637 309 854244 310 876981 311 896132 312 919774 313 940881 314 961826 315 983729 316 1002500 317 1025051 318 1045057 319 1064619 320 1086375 321 1106459 322 1132556 323 1153541 324 1171537 325 1194560 326 1213296 327 1233461 328 1253326 329 1271454 330 1290970 331 1310640 332 1329940 333 1352548 334 1371637 335 1386503 336 1407220 337 1423334 338 1439612 339 1454685 340 1471759 341 1488778 342 1506152 343 1522580 344 1538645 345 1551530 346 1566405 347 1579688 348 1593255 349 1603458 350 1616943 351 1630938 352 1643478 353 1654618 354 1668862 355 1681734 356 1690510 357 1696904 358 1707029 359 1713770 360 1723569 361 1729961 362 1739790 363 1749912 364 1755386 365 1762636 366 1770437 367 1773609 368 1778633 369 1785254 370 1787055 371 1790687 372 1792785 373 1801515 374 1804732 375 1806311 376 1808735 377 1809744 378 1812644 379 1812915 380 1815362 381 1810085 382 1811530 383 1815541 384 1811381 385 1815524 386 1814540 387 1814356 388 1809497 389 1807833 390 1803986 391 1801170 392 1797840 393 1796153 394 1794130 395 1792486 396 1788641 397 1785537 398 1782425 399 1776092 400 1772073 401 1769905 402 1763823 403 1756815 404 1753701 405 1749854 406 1744508 407 1740668 408 1732859 409 1725645 410 1719643 411 1709504 412 1704194 413 1696155 414 1689746 415 1683380 416 1677542 417 1669878 418 1663421 419 1656880 420 1647758 421 1638822 422 1630097 423 1621444 424 1615607 425 1605033 426 1600653 427 1590768 428 1585715 429 1574039 430 1567526 431 1558587 432 1549079 433 1540029 434 1533263 435 1522763 436 1514381 437 1507440 438 1498508 439 1489547 440 1481198 441 1471541 442 1460241 443 1450531 444 1443037 445 1435047 446 1427384 447 1418086 448 1411223 449 1402055 450 1390104 451 1383235 452 1370870 453 1363300 454 1350294 455 1345454 456 1333837 457 1327399 458 1318287 459 1308722 460 1300607 461 1292588 462 1281248 463 1274011 464 1265660 465 1254461 466 1245793 467 1235700 468 1228633 469 1219395 470 1212368 471 1202179 472 1193153 473 1183192 474 1175934 475 1166664 476 1157162 477 1148101 478 1141345 479 1131564 480 1123875 481 1114294 482 1107022 483 1097948 484 1089600 485 1079175 486 1071108 487 1066210 488 1056492 489 1047066 490 1037523 491 1033031 492 1020978 493 1012353 494 1006353 495 995891 496 987579 497 981733 498 974181 499 964801 500 956654 501 949035 502 942052 503 933284 504 926220 505 917300 506 909297 507 900342 508 893997 509 886174 510 879493 511 872986 512 864993 513 855558 514 849552 515 841976 516 833593 517 824780 518 818774 519 810499 520 804137 521 794130 522 789021 523 783626 524 776328 525 769223 526 759868 527 752579 528 745715 529 740350 530 731395 531 724249 532 718649 533 710563 534 703981 535 697853 536 690213 537 683507 538 675185 539 670186 540 663282 541 654737 542 649823 543 644412 544 636728 545 632050 546 623166 547 617972 548 609466 549 605421 550 600895 551 593834 552 588003 553 579940 554 575127 555 568751 556 563620 557 556887 558 551377 559 544850 560 539280 561 533583 562 526675 563 521561 564 516093 565 509180 566 505333 567 500330 568 493073 569 488144 570 483248 571 479059 572 471610 573 468049 574 461028 575 455826 576 451092 577 445457 578 442181 579 435048 580 431618 581 424242 582 420238 583 415147 584 409970 585 406212 586 401157 587 396735 588 391216 589 386732 590 381303 591 375998 592 372271 593 367731 594 362932 595 358829 596 354135 597 349400 598 344903 599 339548 600 336718 601 331662 602 326510 603 322664 604 318120 605 314308 606 312081 607 306661 608 303065 609 298254 610 294780 611 290094 612 287486 613 283384 614 279663 615 276688 616 273124 617 268983 618 264623 619 260724 620 257920 621 254920 622 250762 623 247635 624 243664 625 240594 626 237022 627 234234 628 231026 629 227397 630 224501 631 221232 632 218813 633 214919 634 211639 635 208974 636 205529 637 203023 638 200690 639 197419 640 193999 641 191617 642 188904 643 185754 644 183202 645 180089 646 177974 647 174525 648 172558 649 170042 650 167220 651 164594 652 162286 653 159359 654 157810 655 155372 656 152797 657 150248 658 148415 659 145336 660 144087 661 141796 662 139453 663 137137 664 135190 665 133517 666 130655 667 128894 668 127544 669 124374 670 122911 671 120945 672 119010 673 117469 674 115043 675 114391 676 112227 677 109871 678 108428 679 107165 680 104983 681 103239 682 101037 683 99478 684 98124 685 95689 686 94946 687 93330 688 91636 689 90070 690 88573 691 87368 692 86363 693 84480 694 82974 695 81709 696 80284 697 78158 698 77437 699 75971 700 75169 701 73348 702 72404 703 70862 704 69476 705 68811 706 67270 707 66249 708 65534 709 63852 710 62884 711 61791 712 60613 713 60082 714 58783 715 57958 716 56823 717 55725 718 55042 719 53391 720 52860 721 52106 722 51245 723 49963 724 49302 725 48217 726 47466 727 46234 728 45625 729 44874 730 44500 731 43393 732 42609 733 42125 734 40920 735 40246 736 39611 737 39112 738 38395 739 37852 740 37025 741 36160 742 35300 743 35391 744 34274 745 34118 746 33400 747 32876 748 31997 749 31099 750 30986 751 30464 752 29654 753 29260 754 28557 755 27785 756 27464 757 26986 758 26509 759 25702 760 25434 761 24918 762 24519 763 23887 764 23798 765 23278 766 22758 767 22095 768 21611 769 21271 770 21074 771 20647 772 19961 773 19881 774 19364 775 19215 776 18851 777 18476 778 18028 779 17526 780 17402 781 17041 782 16670 783 16197 784 16111 785 15591 786 15271 787 14912 788 14795 789 14439 790 14201 791 13936 792 13597 793 12968 794 13201 795 12909 796 12563 797 12589 798 12283 799 11883 800 11638 801 11367 802 11264 803 10987 804 10872 805 10601 806 10432 807 10134 808 9944 809 9643 810 9527 811 9299 812 9148 813 9116 814 8944 815 8686 816 8623 817 8475 818 8308 819 8149 820 7899 821 7879 822 7700 823 7490 824 7307 825 7040 826 7056 827 7001 828 6791 829 6752 830 6662 831 6318 832 6234 833 6100 834 5989 835 5951 836 6013 837 6043 838 5747 839 5271 840 5394 841 5472 842 5036 843 4710 844 4994 845 4535 846 4578 847 4535 848 4404 849 4207 850 4294 851 4012 852 4058 853 3958 854 3500 855 3451 856 3308 857 3266 858 3262 859 3187 860 3133 861 3073 862 3040 863 3075 864 2774 865 2697 866 2631 867 2622 868 2463 869 2520 870 2410 871 2357 872 2319 873 2219 874 2279 875 2120 876 2049 877 2033 878 1922 879 1935 880 1841 881 1838 882 1745 883 1743 884 1684 885 1647 886 1715 887 1630 888 1608 889 1583 890 1533 891 1508 892 1418 893 1452 894 1457 895 1336 896 1391 897 1265 898 1320 899 1282 900 1224 901 1263 902 1236 903 1142 904 1159 905 1144 906 1105 907 1075 908 1060 909 1071 910 1045 911 1010 912 975 913 967 914 925 915 920 916 931 917 940 918 879 919 881 920 852 921 852 922 867 923 842 924 815 925 780 926 762 927 819 928 733 929 778 930 733 931 749 932 667 933 699 934 683 935 628 936 650 937 652 938 613 939 653 940 595 941 607 942 542 943 592 944 581 945 541 946 550 947 564 948 524 949 494 950 523 951 473 952 496 953 456 954 478 955 469 956 427 957 468 958 455 959 417 960 419 961 413 962 390 963 384 964 413 965 382 966 409 967 385 968 370 969 336 970 341 971 359 972 345 973 352 974 334 975 317 976 347 977 309 978 323 979 329 980 291 981 323 982 284 983 316 984 288 985 297 986 296 987 257 988 280 989 281 990 276 991 254 992 229 993 234 994 246 995 246 996 252 997 221 998 222 999 241 1000 214 1001 243 1002 214 1003 222 1004 187 1005 194 1006 218 1007 192 1008 175 1009 215 1010 175 1011 186 1012 191 1013 160 1014 177 1015 181 1016 191 1017 176 1018 189 1019 181 1020 146 1021 173 1022 176 1023 175 1024 162 1025 155 1026 131