#SentieonCommandLine: /lustre8/home/ykawai-tnproj-pg/packages/sentieon-genomics-201911/libexec/driver -t 8 -r /lustre8/home/ncbn-pg/data/resource/Homo_sapiens_assembly38.fasta -i HGDP/HGDP00869/HGDP00869.cram --algo InsertSizeMetricAlgo HGDP/HGDP00869/QCmetrics/HGDP00869.InsertSizeMetricAlgo.txt MEDIAN_INSERT_SIZE MEDIAN_ABSOLUTE_DEVIATION MIN_INSERT_SIZE MAX_INSERT_SIZE MEAN_INSERT_SIZE STANDARD_DEVIATION READ_PAIRS PAIR_ORIENTATION WIDTH_OF_10_PERCENT WIDTH_OF_20_PERCENT WIDTH_OF_30_PERCENT WIDTH_OF_40_PERCENT WIDTH_OF_50_PERCENT WIDTH_OF_60_PERCENT WIDTH_OF_70_PERCENT WIDTH_OF_80_PERCENT WIDTH_OF_90_PERCENT WIDTH_OF_99_PERCENT 430.000000 62.000000 2 246986438 442.149365 100.884515 388741160 FR 25 49 73 99 125 155 191 239 323 665 insert_size All_Reads.fr_count 2 1156 3 1133 4 1464 5 1482 6 1532 7 1587 8 1574 9 1629 10 1764 11 1714 12 1713 13 1937 14 1896 15 1827 16 1988 17 1859 18 2084 19 3636 20 3962 21 3915 22 4065 23 4572 24 4806 25 5128 26 5121 27 5376 28 5431 29 5805 30 6005 31 6314 32 6498 33 6954 34 7445 35 7859 36 8265 37 8485 38 9069 39 9507 40 10160 41 10189 42 10473 43 11287 44 11653 45 11734 46 12053 47 12311 48 13609 49 13694 50 13695 51 14228 52 14229 53 14832 54 15684 55 15363 56 15617 57 15646 58 16312 59 16941 60 17011 61 16977 62 17079 63 17674 64 17988 65 18074 66 18462 67 18596 68 19119 69 19922 70 19824 71 19592 72 19884 73 20159 74 20877 75 20268 76 20830 77 20589 78 20945 79 21572 80 21204 81 20812 82 20454 83 21258 84 21791 85 21236 86 20993 87 20510 88 21187 89 21599 90 21015 91 20624 92 20396 93 20621 94 21285 95 20551 96 20404 97 20401 98 21089 99 21206 100 21118 101 21180 102 21009 103 21501 104 21833 105 21392 106 21339 107 21343 108 21798 109 21649 110 21587 111 21233 112 21123 113 21152 114 21527 115 20826 116 20611 117 19961 118 20651 119 20534 120 20209 121 20117 122 20059 123 20077 124 19990 125 19734 126 19318 127 19156 128 18972 129 19267 130 19118 131 18811 132 18778 133 18754 134 19335 135 18729 136 18895 137 18910 138 18869 139 19236 140 19296 141 18934 142 18825 143 18815 144 19032 145 18667 146 18487 147 18354 148 18199 149 18466 150 18280 151 17750 152 17960 153 17827 154 17692 155 17760 156 17109 157 17074 158 16903 159 16704 160 16746 161 16772 162 16496 163 16623 164 16636 165 16212 166 16288 167 16265 168 16120 169 15923 170 16057 171 16251 172 16166 173 16336 174 16096 175 16227 176 15995 177 15993 178 16441 179 16005 180 16250 181 15742 182 15731 183 15672 184 15729 185 15646 186 15603 187 15420 188 15727 189 15787 190 15509 191 15500 192 15307 193 15562 194 15594 195 15619 196 15505 197 15573 198 15588 199 15659 200 15885 201 15750 202 15829 203 15978 204 16128 205 16126 206 16464 207 16486 208 16906 209 17033 210 17343 211 17554 212 17507 213 17767 214 18676 215 19136 216 19397 217 19882 218 20286 219 21122 220 21743 221 22131 222 23014 223 23321 224 24492 225 24735 226 25658 227 26772 228 27303 229 28430 230 29029 231 30616 232 31513 233 32707 234 34144 235 35377 236 36260 237 38227 238 39597 239 41457 240 43289 241 44829 242 46416 243 48642 244 50718 245 52756 246 54897 247 57619 248 60146 249 62788 250 65728 251 68516 252 72004 253 74912 254 77785 255 81258 256 84854 257 88517 258 92739 259 96901 260 101342 261 105304 262 109782 263 115179 264 119486 265 126103 266 130859 267 136351 268 142374 269 149179 270 155330 271 162900 272 168575 273 176760 274 183654 275 192477 276 202850 277 210184 278 217732 279 225117 280 232403 281 241829 282 250918 283 260456 284 271067 285 281018 286 290207 287 300794 288 311081 289 322740 290 333508 291 345575 292 358248 293 370632 294 383043 295 396600 296 408169 297 421769 298 436509 299 449808 300 463692 301 480734 302 493675 303 510546 304 526727 305 542647 306 557154 307 572493 308 589368 309 606560 310 623415 311 641932 312 658687 313 677087 314 693098 315 711793 316 730958 317 749023 318 766552 319 783891 320 802545 321 821872 322 840348 323 864569 324 882160 325 901677 326 919213 327 937646 328 957316 329 976600 330 997044 331 1017222 332 1038106 333 1056975 334 1076468 335 1097318 336 1118280 337 1135084 338 1153554 339 1175627 340 1192613 341 1211680 342 1231839 343 1250361 344 1269714 345 1285854 346 1306041 347 1322021 348 1337156 349 1356133 350 1370960 351 1389823 352 1403893 353 1421981 354 1437090 355 1452478 356 1468788 357 1484697 358 1498955 359 1512034 360 1523106 361 1537932 362 1550781 363 1564644 364 1579133 365 1590280 366 1604574 367 1615985 368 1624135 369 1633378 370 1643069 371 1654653 372 1661432 373 1670498 374 1681023 375 1690545 376 1697249 377 1704185 378 1713282 379 1719022 380 1721092 381 1729198 382 1731357 383 1738274 384 1745474 385 1747699 386 1753282 387 1756620 388 1760045 389 1760552 390 1763670 391 1765884 392 1767230 393 1771199 394 1770444 395 1771124 396 1774550 397 1772694 398 1776186 399 1773302 400 1772762 401 1768323 402 1769916 403 1769361 404 1765377 405 1767025 406 1765008 407 1762337 408 1757492 409 1756032 410 1751641 411 1750335 412 1742504 413 1740399 414 1738242 415 1729675 416 1726689 417 1724888 418 1718330 419 1712045 420 1706217 421 1699216 422 1692889 423 1690435 424 1681406 425 1677697 426 1669698 427 1666465 428 1659286 429 1652141 430 1644237 431 1636543 432 1629270 433 1620971 434 1616922 435 1606270 436 1601079 437 1593334 438 1588487 439 1579205 440 1569905 441 1561619 442 1553308 443 1546026 444 1536368 445 1528850 446 1521115 447 1513360 448 1507960 449 1497650 450 1492218 451 1481671 452 1469805 453 1462265 454 1454494 455 1448398 456 1438916 457 1430731 458 1421462 459 1414521 460 1406251 461 1397033 462 1387670 463 1378863 464 1371011 465 1360736 466 1352590 467 1345000 468 1336105 469 1328194 470 1320667 471 1311742 472 1300964 473 1291497 474 1283569 475 1274346 476 1267213 477 1256516 478 1247637 479 1240138 480 1232232 481 1224631 482 1213685 483 1206980 484 1196445 485 1188259 486 1181690 487 1172042 488 1163679 489 1155394 490 1147179 491 1138894 492 1129721 493 1122221 494 1116013 495 1103521 496 1095990 497 1086250 498 1080843 499 1071626 500 1064231 501 1054255 502 1047601 503 1038608 504 1031800 505 1023906 506 1015096 507 1007655 508 1000396 509 991180 510 982855 511 978196 512 968218 513 959664 514 953093 515 944189 516 937012 517 928478 518 921422 519 914945 520 907974 521 898093 522 891555 523 884293 524 875659 525 868868 526 861301 527 853161 528 845792 529 837193 530 832179 531 824213 532 816907 533 809706 534 801681 535 795599 536 787324 537 778727 538 772337 539 762461 540 757278 541 750660 542 745015 543 738604 544 729508 545 723625 546 713635 547 708747 548 701307 549 693769 550 687593 551 680922 552 674097 553 669141 554 663956 555 653467 556 647066 557 640815 558 635749 559 627857 560 621003 561 616040 562 609819 563 602895 564 596170 565 590672 566 584864 567 578882 568 571603 569 565794 570 560733 571 554518 572 548542 573 542714 574 535475 575 529348 576 524803 577 518747 578 512992 579 508326 580 501285 581 495820 582 491334 583 484615 584 479972 585 473695 586 468966 587 464138 588 457993 589 452919 590 447399 591 442145 592 436804 593 433061 594 427436 595 423243 596 416534 597 412587 598 406901 599 403948 600 397534 601 391927 602 386985 603 382791 604 377930 605 373285 606 369696 607 364261 608 359182 609 356547 610 351312 611 345958 612 341128 613 336691 614 332714 615 328203 616 324998 617 321304 618 316911 619 312446 620 307954 621 304112 622 300464 623 296137 624 293001 625 288433 626 284731 627 280604 628 277828 629 273329 630 269128 631 266428 632 263306 633 260296 634 256165 635 252321 636 249637 637 245687 638 242582 639 238941 640 236614 641 233097 642 229643 643 226930 644 223348 645 220651 646 217563 647 214765 648 211475 649 208486 650 205997 651 202053 652 199354 653 197412 654 194442 655 191184 656 188557 657 186725 658 183961 659 181262 660 178459 661 175271 662 173923 663 170493 664 168182 665 165393 666 163258 667 160889 668 158713 669 155800 670 154378 671 151923 672 149689 673 147831 674 144790 675 143222 676 139968 677 138606 678 136782 679 135210 680 131873 681 130503 682 128385 683 126706 684 124639 685 123159 686 121267 687 119256 688 117219 689 115651 690 114111 691 112211 692 110120 693 108949 694 106871 695 104931 696 103193 697 101319 698 99872 699 98584 700 97513 701 95242 702 93512 703 92139 704 91192 705 89335 706 88126 707 87061 708 85202 709 84059 710 81976 711 81414 712 79889 713 78932 714 77532 715 75955 716 74510 717 74270 718 71926 719 71033 720 70171 721 68873 722 68073 723 66823 724 66157 725 64481 726 63553 727 62569 728 61681 729 60524 730 59417 731 58501 732 58029 733 56869 734 55614 735 54359 736 53861 737 53028 738 51674 739 51697 740 50425 741 49433 742 48791 743 48178 744 47056 745 46201 746 45327 747 44831 748 43900 749 43445 750 42700 751 42164 752 41128 753 40330 754 39627 755 38695 756 38685 757 37645 758 36810 759 36542 760 35679 761 35246 762 34102 763 34196 764 33234 765 32276 766 32325 767 31515 768 31300 769 30364 770 29711 771 29339 772 28759 773 28148 774 27791 775 27312 776 27222 777 26251 778 25643 779 25067 780 24498 781 24278 782 23947 783 23285 784 23038 785 22625 786 22107 787 21473 788 21423 789 20891 790 20813 791 20130 792 19888 793 19387 794 19138 795 18846 796 18335 797 18043 798 17944 799 17823 800 17277 801 16778 802 16653 803 16149 804 15909 805 15664 806 15415 807 15335 808 14950 809 14675 810 14399 811 14070 812 13597 813 13470 814 13183 815 13090 816 12699 817 12714 818 12425 819 12191 820 12215 821 11785 822 11516 823 11347 824 11141 825 11104 826 10624 827 10782 828 10352 829 10157 830 10093 831 9808 832 9615 833 9419 834 9409 835 9249 836 9136 837 8943 838 8759 839 8685 840 8370 841 8287 842 8219 843 7941 844 7738 845 7790 846 7684 847 7642 848 7561 849 7382 850 7675 851 6839 852 6860 853 6614 854 6328 855 6189 856 6104 857 6007 858 5904 859 6289 860 5694 861 5653 862 5241 863 5261 864 5417 865 5049 866 4768 867 4883 868 4784 869 5060 870 4770 871 4550 872 4152 873 4132 874 3872 875 3835 876 3709 877 3673 878 3634 879 3500 880 3588 881 3330 882 3359 883 3267 884 3137 885 3163 886 3164 887 3008 888 3124 889 3172 890 2837 891 2578 892 2627 893 2601 894 2498 895 2610 896 2487 897 2435 898 2605 899 2328 900 2232 901 2123 902 2118 903 2031 904 2002 905 2089 906 1989 907 2008 908 1980 909 1919 910 1807 911 1868 912 1770 913 1767 914 1729 915 1638 916 1705 917 1621 918 1601 919 1535 920 1598 921 1549 922 1501 923 1479 924 1479 925 1377 926 1383 927 1406 928 1367 929 1348 930 1326 931 1315 932 1349 933 1238 934 1167 935 1205 936 1195 937 1240 938 1120 939 1175 940 1193 941 1129 942 1129 943 1089 944 1130 945 1057 946 1023 947 1021 948 985 949 973 950 934 951 940 952 966 953 892 954 875 955 904 956 869 957 838 958 894 959 828 960 878 961 797 962 819 963 789 964 770 965 729 966 706 967 730 968 716 969 732 970 697 971 703 972 704 973 729 974 664 975 628 976 629 977 620 978 663 979 644 980 577 981 553 982 544 983 581 984 591 985 612 986 553 987 540 988 507 989 528 990 476 991 508 992 503 993 502 994 475 995 473 996 484 997 466 998 431 999 436 1000 499 1001 495 1002 418 1003 412 1004 401 1005 421 1006 414 1007 431 1008 411 1009 420 1010 412 1011 385 1012 377 1013 396 1014 370 1015 370 1016 354 1017 356 1018 358 1019 400 1020 347 1021 327 1022 316 1023 301 1024 330 1025 286 1026 318 1027 298 1028 321 1029 296 1030 312 1031 299 1032 308 1033 261 1034 274 1035 273 1036 276 1037 265 1038 270 1039 284 1040 272 1041 251 1042 293 1043 250 1044 269 1045 255 1046 226 1047 240 1048 227 1049 241 1050 225