#SentieonCommandLine: /lustre8/home/ykawai-tnproj-pg/packages/sentieon-genomics-201911/libexec/driver -t 8 -r /lustre8/home/ncbn-pg/data/resource/Homo_sapiens_assembly38.fasta -i HGDP/HGDP00870/HGDP00870.cram --algo InsertSizeMetricAlgo HGDP/HGDP00870/QCmetrics/HGDP00870.InsertSizeMetricAlgo.txt MEDIAN_INSERT_SIZE MEDIAN_ABSOLUTE_DEVIATION MIN_INSERT_SIZE MAX_INSERT_SIZE MEAN_INSERT_SIZE STANDARD_DEVIATION READ_PAIRS PAIR_ORIENTATION WIDTH_OF_10_PERCENT WIDTH_OF_20_PERCENT WIDTH_OF_30_PERCENT WIDTH_OF_40_PERCENT WIDTH_OF_50_PERCENT WIDTH_OF_60_PERCENT WIDTH_OF_70_PERCENT WIDTH_OF_80_PERCENT WIDTH_OF_90_PERCENT WIDTH_OF_99_PERCENT 419.000000 60.000000 2 246616256 430.689983 96.004229 398496981 FR 23 47 71 95 121 149 183 227 305 635 insert_size All_Reads.fr_count 2 509 3 702 4 711 5 797 6 789 7 1066 8 1184 9 1180 10 1178 11 1184 12 1258 13 1536 14 1587 15 1755 16 1638 17 1574 18 1772 19 3328 20 3481 21 3242 22 3500 23 3996 24 4221 25 4571 26 4776 27 4919 28 5236 29 5676 30 5723 31 5904 32 6228 33 6683 34 7349 35 7603 36 7839 37 8195 38 8816 39 9065 40 9585 41 9603 42 9793 43 10469 44 10808 45 10984 46 11206 47 11410 48 12326 49 12521 50 13128 51 13549 52 13578 53 14818 54 15578 55 15182 56 15659 57 15826 58 16572 59 17140 60 17243 61 17013 62 17356 63 17905 64 18470 65 18160 66 18293 67 18051 68 18833 69 19958 70 19269 71 19101 72 19180 73 19320 74 19826 75 19195 76 19236 77 19311 78 20419 79 21413 80 21038 81 20903 82 20557 83 21337 84 22162 85 21108 86 21069 87 20709 88 21012 89 21524 90 21352 91 20206 92 20459 93 20845 94 21171 95 20706 96 19854 97 19779 98 20326 99 20571 100 20118 101 20035 102 19573 103 20180 104 20683 105 19533 106 19798 107 19737 108 20498 109 20941 110 20566 111 20133 112 20310 113 20323 114 20899 115 20160 116 19679 117 19085 118 19621 119 19413 120 19489 121 18857 122 18396 123 18600 124 18506 125 18335 126 17762 127 17471 128 17528 129 17724 130 17092 131 17060 132 16919 133 17082 134 17083 135 16844 136 16547 137 16257 138 16619 139 16617 140 16885 141 16617 142 16467 143 16562 144 16770 145 16513 146 16077 147 15815 148 15725 149 15921 150 15513 151 15239 152 15011 153 14944 154 15137 155 14275 156 14249 157 14112 158 14059 159 13858 160 13639 161 13614 162 13224 163 13347 164 13284 165 12817 166 12771 167 12683 168 12588 169 12440 170 12304 171 12355 172 12149 173 12132 174 11987 175 11938 176 12193 177 12091 178 12351 179 12181 180 11939 181 11744 182 11815 183 11716 184 11446 185 11531 186 11436 187 11248 188 11304 189 11486 190 11286 191 11161 192 11082 193 11269 194 11056 195 11058 196 11119 197 10826 198 11166 199 11243 200 11061 201 11060 202 11027 203 11370 204 11414 205 11448 206 11720 207 11655 208 11987 209 12236 210 12406 211 12488 212 12505 213 13128 214 13361 215 13607 216 14349 217 14678 218 15334 219 15943 220 16071 221 17001 222 17319 223 18173 224 18579 225 19385 226 20239 227 21008 228 22007 229 23140 230 24131 231 25424 232 26571 233 27933 234 29463 235 30648 236 32205 237 34061 238 36062 239 37708 240 40038 241 41833 242 44797 243 47072 244 49353 245 52157 246 55034 247 58104 248 60909 249 64633 250 68447 251 72617 252 76572 253 81088 254 85092 255 89444 256 94284 257 99370 258 105301 259 110551 260 116568 261 122797 262 129098 263 135905 264 142905 265 149983 266 157344 267 164953 268 174269 269 182552 270 191123 271 201455 272 210377 273 221104 274 231255 275 242513 276 256573 277 266500 278 277602 279 289113 280 300264 281 312325 282 324437 283 339412 284 351218 285 366464 286 379197 287 393055 288 407801 289 424084 290 439326 291 455242 292 471689 293 487885 294 507083 295 522921 296 539588 297 556929 298 576543 299 595562 300 613230 301 632562 302 655274 303 672747 304 691141 305 713539 306 734013 307 751971 308 771405 309 795049 310 815833 311 834502 312 859464 313 880086 314 902941 315 924269 316 946442 317 965560 318 988592 319 1009975 320 1032260 321 1056445 322 1075584 323 1101687 324 1122136 325 1144600 326 1166097 327 1187718 328 1208928 329 1232901 330 1253463 331 1270250 332 1294768 333 1316277 334 1336515 335 1359196 336 1378614 337 1393332 338 1414354 339 1433181 340 1449215 341 1469274 342 1490574 343 1508761 344 1527976 345 1542191 346 1560263 347 1574189 348 1591434 349 1607487 350 1623596 351 1636298 352 1651440 353 1666366 354 1681053 355 1692767 356 1706945 357 1717139 358 1730824 359 1740187 360 1749833 361 1756004 362 1766518 363 1781333 364 1791695 365 1799720 366 1805284 367 1814139 368 1822882 369 1829910 370 1833460 371 1839898 372 1843464 373 1851760 374 1855680 375 1862859 376 1866157 377 1872530 378 1875711 379 1876018 380 1878182 381 1878946 382 1884221 383 1882618 384 1885122 385 1884881 386 1887164 387 1886709 388 1885306 389 1883500 390 1880779 391 1880430 392 1878582 393 1878585 394 1874859 395 1876603 396 1872703 397 1869836 398 1869612 399 1864689 400 1861828 401 1854750 402 1854243 403 1851204 404 1846626 405 1837430 406 1835668 407 1830981 408 1827157 409 1818949 410 1814875 411 1806800 412 1799710 413 1795344 414 1787412 415 1782935 416 1776000 417 1768558 418 1760709 419 1753343 420 1745808 421 1737711 422 1730560 423 1724163 424 1714512 425 1703388 426 1699568 427 1690426 428 1681851 429 1676031 430 1666056 431 1655846 432 1644186 433 1638696 434 1628419 435 1620598 436 1610891 437 1602644 438 1594040 439 1584116 440 1575982 441 1565665 442 1554601 443 1548574 444 1535872 445 1527971 446 1519076 447 1510244 448 1500294 449 1492012 450 1482424 451 1473673 452 1463211 453 1452464 454 1442853 455 1432674 456 1420251 457 1411834 458 1403402 459 1395867 460 1385236 461 1374642 462 1365296 463 1354706 464 1346288 465 1337056 466 1323823 467 1316083 468 1306479 469 1297672 470 1288642 471 1278286 472 1269335 473 1261271 474 1249147 475 1241777 476 1231221 477 1220363 478 1210800 479 1203281 480 1194745 481 1183321 482 1175112 483 1165718 484 1155612 485 1148054 486 1138600 487 1128526 488 1118005 489 1110403 490 1102147 491 1092228 492 1083225 493 1072749 494 1065425 495 1054675 496 1046035 497 1038342 498 1028020 499 1019855 500 1010902 501 1002476 502 994612 503 984256 504 976062 505 968864 506 958029 507 949940 508 941781 509 933845 510 925858 511 916569 512 909932 513 901272 514 893368 515 884936 516 875676 517 869096 518 858930 519 850994 520 841928 521 835357 522 824801 523 818898 524 811466 525 801390 526 793745 527 786161 528 779910 529 771405 530 765778 531 757576 532 749406 533 741447 534 733811 535 724819 536 719143 537 711900 538 703303 539 696572 540 688079 541 680368 542 674477 543 667669 544 660707 545 655528 546 647693 547 639832 548 633110 549 626928 550 619752 551 613717 552 607662 553 598372 554 593541 555 584766 556 580625 557 573616 558 564921 559 561847 560 553328 561 547878 562 541905 563 535978 564 527875 565 523790 566 517541 567 510970 568 504214 569 500199 570 494241 571 487962 572 482730 573 477563 574 470719 575 463297 576 458767 577 455236 578 449150 579 443081 580 437820 581 432807 582 426996 583 420993 584 415527 585 410873 586 405326 587 400459 588 394529 589 389963 590 384806 591 380335 592 374890 593 370461 594 367006 595 361244 596 356706 597 350625 598 345900 599 342003 600 338155 601 332595 602 327701 603 323657 604 319368 605 314544 606 311103 607 306745 608 303209 609 299076 610 294732 611 289251 612 285714 613 283395 614 278181 615 275197 616 270449 617 266403 618 262451 619 259228 620 254772 621 252518 622 249030 623 244498 624 240704 625 237514 626 234369 627 230647 628 226960 629 224547 630 221101 631 217037 632 214373 633 211093 634 207868 635 204577 636 200255 637 198291 638 195740 639 192910 640 189600 641 186180 642 184358 643 180346 644 178115 645 175125 646 172129 647 170009 648 166879 649 164471 650 162435 651 159533 652 157474 653 154354 654 152715 655 149086 656 146994 657 145353 658 142309 659 139908 660 137406 661 136701 662 133906 663 131638 664 129645 665 127449 666 125246 667 123207 668 122586 669 119040 670 117371 671 114717 672 113377 673 111656 674 109819 675 107698 676 105745 677 104191 678 102535 679 100573 680 99253 681 97208 682 95722 683 94406 684 92316 685 90844 686 89117 687 87564 688 86540 689 84588 690 83174 691 81852 692 80420 693 79190 694 78049 695 75898 696 74451 697 73913 698 72639 699 71301 700 69129 701 68918 702 67453 703 66411 704 64834 705 64397 706 62753 707 61239 708 60310 709 59081 710 58316 711 56763 712 56673 713 55461 714 54439 715 53182 716 52038 717 51395 718 50070 719 49304 720 48757 721 47965 722 47033 723 45630 724 45144 725 44246 726 43524 727 42821 728 41976 729 40883 730 40346 731 39782 732 38976 733 38220 734 37867 735 36729 736 36006 737 35705 738 34675 739 34555 740 33951 741 33231 742 32680 743 32056 744 31343 745 30805 746 30480 747 29891 748 29088 749 28570 750 28035 751 27949 752 27080 753 26784 754 26105 755 25376 756 24884 757 24500 758 23981 759 23509 760 23052 761 22628 762 22199 763 21733 764 21062 765 20683 766 20535 767 20061 768 19708 769 19247 770 18741 771 18613 772 18383 773 18038 774 17400 775 17141 776 16767 777 16601 778 16113 779 15922 780 15664 781 15261 782 14900 783 14858 784 14585 785 14107 786 13934 787 13484 788 13062 789 13172 790 12745 791 12378 792 12199 793 12176 794 11791 795 11591 796 11425 797 11124 798 10809 799 10705 800 10583 801 10567 802 10163 803 9949 804 9858 805 9562 806 9399 807 9339 808 9240 809 8967 810 8871 811 8683 812 8630 813 8252 814 8058 815 8132 816 7926 817 8073 818 7578 819 7331 820 7039 821 7077 822 7005 823 6711 824 6937 825 6432 826 6539 827 6074 828 5855 829 5672 830 5794 831 5477 832 5485 833 5317 834 5318 835 5213 836 5240 837 5061 838 5012 839 5218 840 4672 841 4485 842 4391 843 4453 844 4413 845 4319 846 4106 847 3850 848 3874 849 3865 850 3578 851 3444 852 3322 853 3259 854 3233 855 3184 856 3074 857 3050 858 2906 859 2896 860 2867 861 2909 862 2695 863 2644 864 2592 865 2601 866 2476 867 2371 868 2354 869 2326 870 2326 871 2212 872 2217 873 2131 874 2078 875 2111 876 2058 877 2048 878 1951 879 1914 880 1884 881 1871 882 1913 883 1789 884 1866 885 1757 886 1625 887 1712 888 1673 889 1527 890 1578 891 1483 892 1444 893 1394 894 1347 895 1341 896 1327 897 1301 898 1214 899 1332 900 1234 901 1221 902 1262 903 1207 904 1138 905 1079 906 1108 907 1184 908 1057 909 1028 910 1032 911 1032 912 1005 913 1008 914 1033 915 913 916 939 917 952 918 845 919 955 920 884 921 834 922 851 923 839 924 850 925 785 926 762 927 793 928 761 929 765 930 721 931 816 932 712 933 718 934 721 935 740 936 680 937 715 938 695 939 697 940 609 941 637 942 574 943 594 944 579 945 590 946 561 947 542 948 519 949 576 950 569 951 516 952 536 953 525 954 535 955 520 956 503 957 503 958 477 959 484 960 475 961 419 962 463 963 450 964 423 965 442 966 417 967 392 968 422 969 391 970 383 971 400 972 423 973 408 974 389 975 365 976 368 977 365 978 351 979 351 980 331 981 358 982 310 983 337 984 347 985 353 986 312 987 306 988 292 989 318 990 280 991 313 992 312 993 304 994 285 995 298 996 288 997 300 998 267 999 282 1000 254 1001 270 1002 283 1003 251 1004 269 1005 235 1006 249 1007 218 1008 242 1009 263 1010 223 1011 255 1012 258 1013 226 1014 242 1015 198 1016 164 1017 199 1018 216 1019 218