#SentieonCommandLine: /lustre8/home/ykawai-tnproj-pg/packages/sentieon-genomics-201911/libexec/driver -t 8 -r /lustre8/home/ncbn-pg/data/resource/Homo_sapiens_assembly38.fasta -i HGDP/HGDP00892/HGDP00892.cram --algo InsertSizeMetricAlgo HGDP/HGDP00892/QCmetrics/HGDP00892.InsertSizeMetricAlgo.txt MEDIAN_INSERT_SIZE MEDIAN_ABSOLUTE_DEVIATION MIN_INSERT_SIZE MAX_INSERT_SIZE MEAN_INSERT_SIZE STANDARD_DEVIATION READ_PAIRS PAIR_ORIENTATION WIDTH_OF_10_PERCENT WIDTH_OF_20_PERCENT WIDTH_OF_30_PERCENT WIDTH_OF_40_PERCENT WIDTH_OF_50_PERCENT WIDTH_OF_60_PERCENT WIDTH_OF_70_PERCENT WIDTH_OF_80_PERCENT WIDTH_OF_90_PERCENT WIDTH_OF_99_PERCENT 422.000000 58.000000 2 242742516 430.477604 93.358842 365833046 FR 23 45 67 91 117 145 179 223 297 619 insert_size All_Reads.fr_count 2 375 3 406 4 439 5 401 6 417 7 473 8 470 9 472 10 439 11 429 12 468 13 474 14 478 15 447 16 454 17 545 18 596 19 1535 20 2371 21 2265 22 2307 23 2448 24 3389 25 4662 26 5315 27 5093 28 5475 29 6536 30 6931 31 7066 32 7388 33 8024 34 8913 35 9272 36 9477 37 9975 38 10244 39 10932 40 11066 41 11488 42 11711 43 12178 44 12590 45 12845 46 13001 47 13247 48 14125 49 14284 50 14227 51 14691 52 14840 53 15821 54 16475 55 16167 56 16792 57 16877 58 17767 59 18378 60 18817 61 19160 62 19239 63 19889 64 20238 65 20031 66 19907 67 19893 68 20805 69 21168 70 20985 71 21199 72 20873 73 21152 74 21661 75 21087 76 21015 77 21146 78 21704 79 22139 80 21684 81 21572 82 21624 83 22377 84 23112 85 23079 86 23086 87 22773 88 23921 89 23930 90 23758 91 23184 92 22971 93 23416 94 23741 95 23233 96 23117 97 22707 98 23180 99 23419 100 23196 101 22832 102 22537 103 22802 104 23338 105 22606 106 22757 107 22180 108 22543 109 22530 110 22554 111 22520 112 21999 113 22517 114 22869 115 22817 116 22868 117 22401 118 22366 119 22805 120 22637 121 22308 122 22177 123 22291 124 22294 125 22194 126 21472 127 21442 128 21384 129 21605 130 21129 131 21066 132 20957 133 20907 134 21043 135 20714 136 20563 137 20216 138 20309 139 20594 140 20479 141 20228 142 20115 143 20260 144 20766 145 20270 146 20268 147 20274 148 20175 149 20311 150 20322 151 20179 152 20365 153 20099 154 19983 155 19724 156 19484 157 19310 158 19249 159 19047 160 18939 161 18827 162 18901 163 18927 164 18940 165 18677 166 18716 167 18399 168 18473 169 18252 170 18196 171 18094 172 17877 173 18112 174 17700 175 18029 176 17360 177 17794 178 17773 179 18154 180 17870 181 17717 182 17871 183 17900 184 17891 185 17775 186 17889 187 17834 188 17994 189 18241 190 17782 191 17724 192 17899 193 18196 194 17778 195 17895 196 18296 197 18176 198 18276 199 18508 200 18544 201 18534 202 19105 203 19212 204 19136 205 19838 206 19961 207 20214 208 20419 209 20875 210 21370 211 21863 212 22109 213 22770 214 22988 215 23592 216 24127 217 25019 218 25804 219 26600 220 27505 221 28415 222 29507 223 30224 224 31291 225 32483 226 33597 227 35011 228 36175 229 37527 230 39213 231 40180 232 41528 233 43012 234 45043 235 46900 236 48334 237 50270 238 52190 239 55030 240 56543 241 59016 242 61151 243 64100 244 66007 245 68816 246 71865 247 74435 248 78096 249 81414 250 84988 251 88159 252 91994 253 95691 254 98659 255 103415 256 107228 257 111392 258 116655 259 121503 260 125793 261 131075 262 136919 263 141154 264 147588 265 153421 266 159360 267 166448 268 172763 269 179249 270 185008 271 192663 272 200531 273 209010 274 216095 275 224641 276 234635 277 242760 278 251001 279 258984 280 268098 281 275830 282 284968 283 295054 284 305541 285 316394 286 324028 287 334920 288 345659 289 357726 290 368174 291 381860 292 391630 293 403648 294 416550 295 429865 296 442163 297 454137 298 467566 299 481829 300 495716 301 510090 302 524088 303 537627 304 554057 305 567533 306 581766 307 597500 308 613361 309 629621 310 645415 311 662745 312 679304 313 695461 314 712807 315 728747 316 745669 317 761129 318 777184 319 795136 320 813325 321 830776 322 847967 323 867267 324 885355 325 905115 326 922786 327 939673 328 959412 329 977240 330 993267 331 1014330 332 1033869 333 1051167 334 1072456 335 1088356 336 1105044 337 1125079 338 1143014 339 1160671 340 1177926 341 1196150 342 1211824 343 1233435 344 1252136 345 1267984 346 1285543 347 1301159 348 1317016 349 1333973 350 1349426 351 1367768 352 1384131 353 1401220 354 1415377 355 1433906 356 1447946 357 1460133 358 1474361 359 1489596 360 1502224 361 1514642 362 1531765 363 1545023 364 1556633 365 1571399 366 1579484 367 1593299 368 1605789 369 1614338 370 1622833 371 1634550 372 1644088 373 1655321 374 1664127 375 1673892 376 1681896 377 1689418 378 1696378 379 1703899 380 1710561 381 1717092 382 1720990 383 1728931 384 1735404 385 1740984 386 1744117 387 1749184 388 1751515 389 1755634 390 1758267 391 1757997 392 1762891 393 1763778 394 1765856 395 1768656 396 1769671 397 1769552 398 1772926 399 1770216 400 1769554 401 1767842 402 1770332 403 1768755 404 1764363 405 1764113 406 1762686 407 1762528 408 1756094 409 1753569 410 1749511 411 1745603 412 1741214 413 1738666 414 1735538 415 1731648 416 1723354 417 1720694 418 1717668 419 1708480 420 1703447 421 1695757 422 1688454 423 1684638 424 1677443 425 1670520 426 1663327 427 1656397 428 1649227 429 1644885 430 1636620 431 1625586 432 1618013 433 1611854 434 1602548 435 1595720 436 1587010 437 1577806 438 1572499 439 1563593 440 1554552 441 1546532 442 1535867 443 1526833 444 1518910 445 1509149 446 1501061 447 1492274 448 1483524 449 1473012 450 1466157 451 1454315 452 1447218 453 1434289 454 1427705 455 1413180 456 1407196 457 1398154 458 1387995 459 1378099 460 1368551 461 1360052 462 1348748 463 1341272 464 1330141 465 1322090 466 1309979 467 1299945 468 1292223 469 1282460 470 1271570 471 1261012 472 1251586 473 1243092 474 1233921 475 1222456 476 1214766 477 1202139 478 1194620 479 1186814 480 1175312 481 1166673 482 1155861 483 1144745 484 1136017 485 1127250 486 1117277 487 1106638 488 1097543 489 1088069 490 1080448 491 1071006 492 1060874 493 1050724 494 1043217 495 1033933 496 1024758 497 1015342 498 1005241 499 995740 500 985834 501 979346 502 968753 503 961314 504 951194 505 943141 506 932485 507 924591 508 916963 509 907469 510 899028 511 890101 512 881539 513 872416 514 866249 515 856474 516 848583 517 836948 518 829103 519 821158 520 813270 521 803213 522 796157 523 789465 524 779213 525 770014 526 761156 527 752940 528 745599 529 736284 530 729200 531 720645 532 712304 533 707111 534 699177 535 691254 536 683512 537 674309 538 668204 539 661092 540 651101 541 644274 542 637632 543 629835 544 622119 545 615177 546 609097 547 600548 548 593649 549 585212 550 581111 551 573750 552 566817 553 558327 554 553385 555 545730 556 537728 557 532822 558 524407 559 517269 560 511790 561 504633 562 499086 563 493223 564 486136 565 480816 566 473671 567 466707 568 462317 569 454992 570 449605 571 442919 572 435476 573 431817 574 424662 575 419372 576 414570 577 407035 578 401401 579 395707 580 391264 581 384351 582 379996 583 374353 584 367930 585 362601 586 356412 587 351454 588 345245 589 340865 590 336228 591 331024 592 326142 593 322697 594 316796 595 311689 596 307814 597 302748 598 298429 599 293399 600 288124 601 284646 602 280045 603 275271 604 271822 605 267978 606 262738 607 258469 608 253750 609 251420 610 245629 611 242673 612 238160 613 234223 614 231897 615 227731 616 223901 617 220081 618 216722 619 212761 620 209989 621 206417 622 201876 623 199560 624 194866 625 192921 626 189446 627 186510 628 182516 629 180243 630 176368 631 174144 632 170789 633 167471 634 164819 635 161671 636 159808 637 157097 638 153765 639 150884 640 148698 641 146332 642 144172 643 141171 644 137989 645 136371 646 133347 647 131938 648 129609 649 127456 650 125071 651 122618 652 120211 653 118374 654 116538 655 114713 656 111572 657 110175 658 108250 659 105919 660 104912 661 102539 662 100602 663 98959 664 97364 665 95371 666 93583 667 92301 668 90291 669 88458 670 86999 671 85363 672 83348 673 81829 674 80867 675 78933 676 77440 677 76179 678 74855 679 73377 680 71805 681 70519 682 69460 683 68342 684 66606 685 65362 686 64591 687 62726 688 62078 689 60579 690 59308 691 58663 692 57600 693 56401 694 54978 695 54400 696 53068 697 52591 698 50964 699 50011 700 49239 701 47891 702 47464 703 46393 704 45221 705 44336 706 43605 707 42827 708 42147 709 41033 710 40146 711 39589 712 38943 713 37905 714 37572 715 36701 716 35819 717 35104 718 34193 719 33547 720 33276 721 32598 722 32048 723 31529 724 30739 725 30180 726 29678 727 28796 728 28745 729 28003 730 27123 731 26992 732 26409 733 26059 734 25428 735 24622 736 24256 737 23664 738 23271 739 23120 740 22494 741 21919 742 21471 743 21253 744 20683 745 20229 746 19919 747 19411 748 19022 749 18615 750 18423 751 17924 752 17930 753 17551 754 17353 755 16645 756 16402 757 16163 758 15717 759 15339 760 15065 761 14495 762 14288 763 14036 764 13606 765 13469 766 12925 767 12823 768 12602 769 12312 770 11871 771 11687 772 11695 773 11212 774 11165 775 10683 776 10586 777 10524 778 10087 779 9943 780 9891 781 9568 782 9470 783 9036 784 8930 785 8745 786 8777 787 8438 788 8317 789 8258 790 7866 791 7732 792 7830 793 7572 794 7266 795 7212 796 7029 797 7033 798 6847 799 6547 800 6642 801 6512 802 6287 803 6136 804 6150 805 6367 806 5760 807 5719 808 5683 809 5624 810 5245 811 5008 812 5089 813 4943 814 5007 815 5053 816 4782 817 4585 818 4212 819 4288 820 4035 821 4274 822 3768 823 3700 824 3711 825 3294 826 3163 827 3211 828 3241 829 3054 830 2930 831 2939 832 2819 833 2605 834 2563 835 2538 836 2406 837 2369 838 2316 839 2320 840 2310 841 2239 842 2227 843 2163 844 2084 845 2006 846 2027 847 1953 848 1927 849 1935 850 1903 851 2009 852 1731 853 1762 854 1633 855 1547 856 1636 857 1543 858 1479 859 1536 860 1472 861 1407 862 1446 863 1355 864 1345 865 1357 866 1325 867 1325 868 1233 869 1268 870 1208 871 1182 872 1177 873 1197 874 1062 875 1073 876 1083 877 1022 878 983 879 980 880 968 881 971 882 945 883 956 884 915 885 846 886 860 887 878 888 823 889 812 890 810 891 792 892 808 893 812 894 732 895 718 896 731 897 704 898 673 899 671 900 679 901 616 902 690 903 660 904 650 905 616 906 608 907 619 908 583 909 574 910 555 911 543 912 530 913 555 914 516 915 552 916 494 917 506 918 516 919 486 920 477 921 464 922 468 923 498 924 432 925 476 926 418 927 444 928 445 929 442 930 423 931 416 932 389 933 389 934 369 935 376 936 397 937 379 938 373 939 338 940 363 941 334 942 329 943 348 944 308 945 316 946 328 947 329 948 299 949 311 950 307 951 306 952 328 953 339 954 279 955 289 956 277 957 290 958 280 959 255 960 265 961 240 962 275 963 256 964 246 965 246 966 244 967 230 968 246 969 247 970 238 971 237 972 249 973 207 974 253 975 219 976 225 977 231 978 217 979 191 980 207 981 185 982 198 983 173 984 205 985 197 986 197 987 190 988 182 989 198 990 181 991 173 992 174 993 152 994 191 995 204 996 184 997 177 998 167 999 163 1000 162 1001 146 1002 178