#SentieonCommandLine: /lustre8/home/ykawai-tnproj-pg/packages/sentieon-genomics-201911/libexec/driver -t 8 -r /lustre8/home/ncbn-pg/data/resource/Homo_sapiens_assembly38.fasta -i HGDP/HGDP00894/HGDP00894.cram --algo InsertSizeMetricAlgo HGDP/HGDP00894/QCmetrics/HGDP00894.InsertSizeMetricAlgo.txt MEDIAN_INSERT_SIZE MEDIAN_ABSOLUTE_DEVIATION MIN_INSERT_SIZE MAX_INSERT_SIZE MEAN_INSERT_SIZE STANDARD_DEVIATION READ_PAIRS PAIR_ORIENTATION WIDTH_OF_10_PERCENT WIDTH_OF_20_PERCENT WIDTH_OF_30_PERCENT WIDTH_OF_40_PERCENT WIDTH_OF_50_PERCENT WIDTH_OF_60_PERCENT WIDTH_OF_70_PERCENT WIDTH_OF_80_PERCENT WIDTH_OF_90_PERCENT WIDTH_OF_99_PERCENT 442.000000 59.000000 2 243945450 447.378850 94.235976 366857800 FR 23 45 69 93 119 147 181 225 297 643 insert_size All_Reads.fr_count 2 344 3 369 4 393 5 410 6 414 7 461 8 450 9 411 10 447 11 427 12 450 13 438 14 452 15 471 16 511 17 461 18 458 19 503 20 473 21 515 22 471 23 528 24 585 25 595 26 644 27 632 28 792 29 1590 30 2694 31 3508 32 4229 33 4260 34 4594 35 5844 36 6376 37 7080 38 9209 39 9371 40 10640 41 12623 42 12934 43 14349 44 14875 45 15090 46 15381 47 15725 48 16781 49 17687 50 17702 51 17937 52 17922 53 19148 54 20575 55 20094 56 20445 57 21053 58 21311 59 22083 60 22307 61 22406 62 22747 63 23414 64 23879 65 23455 66 23665 67 23571 68 24578 69 25254 70 24891 71 24784 72 24850 73 25617 74 26546 75 25818 76 25440 77 25306 78 26352 79 27560 80 27089 81 26770 82 26383 83 27430 84 27957 85 27308 86 27210 87 26654 88 27312 89 27396 90 27130 91 26495 92 26698 93 26856 94 27453 95 26946 96 26290 97 26070 98 26790 99 26664 100 26839 101 27049 102 26941 103 27833 104 27944 105 27648 106 27554 107 27321 108 28135 109 28347 110 28196 111 27124 112 27265 113 27044 114 27447 115 26996 116 26827 117 26244 118 26861 119 26718 120 26210 121 26338 122 25882 123 25959 124 25916 125 25828 126 25526 127 24938 128 25322 129 25439 130 25945 131 25359 132 25043 133 25693 134 25790 135 25729 136 25131 137 25397 138 25332 139 25258 140 25670 141 25192 142 25061 143 25113 144 24876 145 24714 146 24363 147 23905 148 23792 149 23796 150 23988 151 23833 152 23812 153 23718 154 23775 155 23271 156 23354 157 22748 158 22627 159 22632 160 22563 161 22317 162 22248 163 22574 164 22660 165 22496 166 22112 167 22390 168 22455 169 22064 170 22249 171 21696 172 21176 173 21785 174 21532 175 21209 176 21270 177 20842 178 21137 179 21340 180 20477 181 20579 182 20195 183 20317 184 19990 185 19944 186 19418 187 19548 188 19638 189 19527 190 19289 191 18923 192 18735 193 19039 194 18999 195 19047 196 18545 197 18655 198 18894 199 19041 200 19019 201 18816 202 19099 203 19192 204 18957 205 18997 206 18816 207 18800 208 18900 209 19200 210 18992 211 19040 212 19066 213 19189 214 19266 215 19404 216 19458 217 19659 218 19787 219 20260 220 20636 221 20809 222 20851 223 21233 224 21579 225 21764 226 22272 227 22633 228 23198 229 23768 230 24631 231 25018 232 25788 233 26589 234 27252 235 28057 236 28786 237 30230 238 30644 239 32519 240 33444 241 34596 242 35857 243 37236 244 38774 245 39526 246 41397 247 42638 248 44779 249 46185 250 48319 251 50086 252 51948 253 54048 254 56187 255 58661 256 60457 257 63154 258 66157 259 68495 260 71364 261 74204 262 77248 263 80650 264 83824 265 87218 266 90275 267 94472 268 98724 269 102100 270 106382 271 111443 272 114984 273 120379 274 125855 275 131061 276 137347 277 142839 278 147034 279 152094 280 157400 281 163315 282 170024 283 175021 284 182130 285 190069 286 194690 287 201914 288 207990 289 217118 290 224429 291 232365 292 240311 293 248392 294 255885 295 265464 296 271951 297 280849 298 291376 299 301032 300 311216 301 319693 302 331202 303 340435 304 351726 305 363695 306 373116 307 384013 308 395834 309 407475 310 418992 311 431298 312 443179 313 456244 314 469485 315 481994 316 493589 317 506292 318 520220 319 533798 320 547371 321 562526 322 577688 323 591644 324 607157 325 621102 326 634972 327 649164 328 664178 329 679066 330 695562 331 710495 332 727653 333 744359 334 760878 335 773530 336 792015 337 805351 338 824566 339 837846 340 855402 341 870915 342 890535 343 906141 344 925056 345 938723 346 956391 347 972626 348 987940 349 1008459 350 1025186 351 1041400 352 1056674 353 1074117 354 1088115 355 1106637 356 1122176 357 1138931 358 1153726 359 1168412 360 1182419 361 1199378 362 1213539 363 1229564 364 1245350 365 1261184 366 1273780 367 1289887 368 1301938 369 1316420 370 1327882 371 1341722 372 1355951 373 1370443 374 1384681 375 1397351 376 1409258 377 1424737 378 1435056 379 1447258 380 1457908 381 1471419 382 1479989 383 1488995 384 1502268 385 1513785 386 1523185 387 1533975 388 1541916 389 1551077 390 1560860 391 1567364 392 1576667 393 1585140 394 1594015 395 1601701 396 1610054 397 1617317 398 1625135 399 1631245 400 1635980 401 1641890 402 1649689 403 1654223 404 1658999 405 1665491 406 1670962 407 1678259 408 1679080 409 1682073 410 1687037 411 1689471 412 1690763 413 1694283 414 1698220 415 1699572 416 1703655 417 1705084 418 1705819 419 1708492 420 1707850 421 1708976 422 1706844 423 1707620 424 1709543 425 1708840 426 1708735 427 1708439 428 1708487 429 1708383 430 1702206 431 1702491 432 1700680 433 1697037 434 1696048 435 1694251 436 1690035 437 1687921 438 1688227 439 1683489 440 1679764 441 1671424 442 1670512 443 1666668 444 1662199 445 1660543 446 1655343 447 1652407 448 1647087 449 1641091 450 1634833 451 1628272 452 1622348 453 1616280 454 1611944 455 1600849 456 1595557 457 1591330 458 1586652 459 1581714 460 1572976 461 1564781 462 1560259 463 1547627 464 1544650 465 1534945 466 1526849 467 1521057 468 1512939 469 1507030 470 1498174 471 1490313 472 1479953 473 1472897 474 1461448 475 1453368 476 1445298 477 1435181 478 1424849 479 1417760 480 1410592 481 1402196 482 1391873 483 1382720 484 1373244 485 1364633 486 1353801 487 1344176 488 1335751 489 1326433 490 1318197 491 1307202 492 1297358 493 1287553 494 1276228 495 1267082 496 1257200 497 1248249 498 1238293 499 1232059 500 1219794 501 1210168 502 1200247 503 1190544 504 1179456 505 1170197 506 1159755 507 1148997 508 1138638 509 1131053 510 1120323 511 1108236 512 1100376 513 1090468 514 1080147 515 1070151 516 1060574 517 1049225 518 1038922 519 1029238 520 1022346 521 1011091 522 1001164 523 991051 524 981778 525 971812 526 961134 527 951664 528 941149 529 932459 530 922152 531 914436 532 903950 533 893807 534 885328 535 874555 536 865173 537 854817 538 846304 539 836603 540 829422 541 818180 542 808111 543 800449 544 790137 545 780487 546 770769 547 762696 548 752882 549 742896 550 735574 551 727159 552 716502 553 707810 554 700271 555 691118 556 682339 557 674954 558 664834 559 658600 560 647907 561 641994 562 633302 563 625982 564 616046 565 609707 566 600369 567 593442 568 585509 569 578746 570 569964 571 561805 572 555336 573 547987 574 539836 575 532331 576 525772 577 517803 578 510881 579 504116 580 497225 581 490768 582 483710 583 476594 584 470095 585 462304 586 454953 587 449772 588 442503 589 436065 590 428478 591 423332 592 417146 593 411291 594 405686 595 398296 596 394345 597 386943 598 381467 599 376363 600 369461 601 363710 602 359332 603 353668 604 348275 605 341934 606 335830 607 330457 608 326512 609 321562 610 314080 611 310125 612 304691 613 300844 614 295723 615 289601 616 287252 617 282946 618 276479 619 272447 620 268598 621 264103 622 259169 623 255140 624 251954 625 246736 626 242283 627 239035 628 234511 629 231433 630 226507 631 224034 632 220137 633 215698 634 212539 635 208182 636 204330 637 201179 638 198043 639 194378 640 191543 641 188539 642 184430 643 181694 644 178613 645 174900 646 172976 647 168955 648 165938 649 163197 650 160152 651 158537 652 154826 653 151216 654 149106 655 146620 656 143208 657 141632 658 138144 659 136059 660 133425 661 131001 662 129407 663 126818 664 124336 665 122558 666 119633 667 117631 668 114886 669 113364 670 110907 671 109032 672 107444 673 105079 674 103304 675 101350 676 99507 677 98160 678 95856 679 94473 680 92257 681 90193 682 88501 683 87747 684 85561 685 83707 686 82614 687 80964 688 78625 689 77506 690 76096 691 74684 692 72724 693 72280 694 70117 695 69139 696 67579 697 65851 698 65017 699 63287 700 62138 701 61667 702 60062 703 58653 704 57658 705 56120 706 55968 707 54566 708 52717 709 52530 710 51705 711 49837 712 49156 713 48317 714 47600 715 46444 716 45528 717 44689 718 43477 719 43037 720 42148 721 41248 722 40136 723 39341 724 38492 725 37903 726 37265 727 36762 728 35635 729 34971 730 34269 731 33547 732 32852 733 32313 734 31776 735 31215 736 30211 737 29821 738 29290 739 28840 740 28053 741 27292 742 26969 743 26487 744 26007 745 25279 746 24934 747 24661 748 23766 749 23553 750 22891 751 22628 752 22014 753 21534 754 21110 755 20783 756 20565 757 19996 758 19447 759 19088 760 18568 761 18116 762 17718 763 17255 764 17309 765 16619 766 16700 767 15804 768 15557 769 15474 770 15218 771 14894 772 14605 773 14144 774 13834 775 13562 776 13227 777 12894 778 12780 779 12555 780 11935 781 11746 782 11410 783 11325 784 10931 785 10911 786 10593 787 10278 788 10096 789 9750 790 9650 791 9434 792 9170 793 8931 794 8807 795 8579 796 8362 797 8141 798 8059 799 7934 800 7694 801 7663 802 7409 803 7274 804 7170 805 6930 806 6889 807 6731 808 6573 809 6421 810 6275 811 6122 812 6103 813 5876 814 5794 815 5845 816 5637 817 5506 818 5398 819 5295 820 5100 821 5035 822 5016 823 5038 824 4756 825 4619 826 4538 827 4410 828 4447 829 4421 830 4137 831 4210 832 3948 833 3995 834 3917 835 3759 836 3492 837 3492 838 3393 839 3231 840 3305 841 3187 842 3246 843 2943 844 2983 845 3075 846 2797 847 2773 848 2601 849 2728 850 2375 851 2214 852 2146 853 2588 854 2097 855 1957 856 1825 857 2053 858 1725 859 1603 860 1659 861 1596 862 1542 863 1797 864 1475 865 1386 866 1313 867 1302 868 1280 869 1283 870 1191 871 1186 872 1195 873 1215 874 1109 875 1093 876 1110 877 1035 878 1045 879 1003 880 1004 881 941 882 932 883 931 884 929 885 896 886 868 887 809 888 790 889 825 890 779 891 804 892 764 893 775 894 750 895 725 896 710 897 678 898 677 899 676 900 639 901 675 902 663 903 523 904 593 905 610 906 636 907 541 908 551 909 558 910 584 911 549 912 524 913 488 914 490 915 437 916 486 917 475 918 473 919 463 920 425 921 447 922 459 923 414 924 430 925 395 926 419 927 372 928 387 929 415 930 380 931 368 932 356 933 358 934 325 935 303 936 360 937 338 938 338 939 321 940 318 941 329 942 325 943 279 944 301 945 300 946 312 947 294 948 283 949 300 950 278 951 270 952 288 953 258 954 241 955 243 956 250 957 241 958 214 959 237 960 260 961 226 962 207 963 245 964 229 965 212 966 216 967 218 968 202 969 192 970 177 971 201 972 189 973 176 974 207 975 182 976 206 977 196 978 176 979 196 980 179 981 170 982 156 983 172 984 171 985 148 986 164 987 141 988 158 989 152 990 157 991 160 992 153 993 158 994 144 995 135 996 145 997 146 998 140 999 150 1000 136 1001 143 1002 127 1003 135 1004 110 1005 107 1006 118 1007 133 1008 102 1009 130 1010 122 1011 93 1012 106 1013 101 1014 106 1015 108 1016 100 1017 107 1018 99 1019 123 1020 106 1021 100 1022 115 1023 116 1024 98 1025 87 1026 93 1027 91 1028 90 1029 90 1030 101 1031 90 1032 98