#SentieonCommandLine: /lustre8/home/ykawai-tnproj-pg/packages/sentieon-genomics-201911/libexec/driver -t 8 -r /lustre8/home/ncbn-pg/data/resource/Homo_sapiens_assembly38.fasta -i HGDP/HGDP00898/HGDP00898.cram --algo InsertSizeMetricAlgo HGDP/HGDP00898/QCmetrics/HGDP00898.InsertSizeMetricAlgo.txt MEDIAN_INSERT_SIZE MEDIAN_ABSOLUTE_DEVIATION MIN_INSERT_SIZE MAX_INSERT_SIZE MEAN_INSERT_SIZE STANDARD_DEVIATION READ_PAIRS PAIR_ORIENTATION WIDTH_OF_10_PERCENT WIDTH_OF_20_PERCENT WIDTH_OF_30_PERCENT WIDTH_OF_40_PERCENT WIDTH_OF_50_PERCENT WIDTH_OF_60_PERCENT WIDTH_OF_70_PERCENT WIDTH_OF_80_PERCENT WIDTH_OF_90_PERCENT WIDTH_OF_99_PERCENT 426.000000 57.000000 2 245542387 435.175077 92.989802 399722392 FR 23 45 67 91 115 145 177 221 297 621 insert_size All_Reads.fr_count 2 448 3 461 4 482 5 471 6 485 7 532 8 523 9 490 10 542 11 523 12 527 13 584 14 570 15 553 16 563 17 523 18 578 19 549 20 909 21 930 22 1252 23 1569 24 1998 25 2128 26 3014 27 3013 28 3268 29 4181 30 5320 31 5845 32 6218 33 6828 34 7186 35 8009 36 8393 37 8767 38 9491 39 9813 40 10851 41 11586 42 11827 43 13068 44 13649 45 13953 46 13961 47 14351 48 15349 49 15624 50 15547 51 15874 52 16053 53 17033 54 17888 55 17533 56 17626 57 17656 58 18715 59 18885 60 19093 61 19357 62 19861 63 20761 64 21489 65 21703 66 21398 67 21127 68 22404 69 22904 70 22640 71 22349 72 22335 73 22840 74 23062 75 22773 76 22810 77 22746 78 23475 79 23940 80 23388 81 23069 82 22187 83 23181 84 23935 85 23627 86 22969 87 22535 88 23742 89 24419 90 24820 91 24014 92 23569 93 24262 94 25267 95 24695 96 24288 97 23875 98 24223 99 24624 100 24151 101 23725 102 23436 103 24419 104 24687 105 23715 106 23623 107 23425 108 23788 109 23815 110 23184 111 22797 112 22717 113 22941 114 23047 115 22467 116 22336 117 21610 118 22564 119 23163 120 22896 121 22641 122 22395 123 22369 124 22500 125 22397 126 21996 127 21539 128 21352 129 21717 130 21736 131 21304 132 21278 133 21273 134 21178 135 21196 136 20557 137 20293 138 20681 139 20396 140 20254 141 20086 142 19801 143 19754 144 20123 145 19453 146 19195 147 19131 148 19142 149 19177 150 19037 151 19124 152 18824 153 19070 154 19468 155 18804 156 18924 157 18402 158 18285 159 18259 160 18287 161 18090 162 17884 163 17962 164 17700 165 17467 166 17314 167 17009 168 16998 169 17232 170 16861 171 16602 172 16523 173 16540 174 16388 175 16344 176 16450 177 16096 178 15948 179 16148 180 15842 181 15553 182 15546 183 15596 184 15807 185 15532 186 15836 187 15834 188 15938 189 16282 190 16063 191 16097 192 16033 193 16219 194 16549 195 16139 196 16478 197 16205 198 16714 199 16553 200 16814 201 16923 202 16854 203 16978 204 17458 205 17511 206 17884 207 18270 208 18363 209 18567 210 18907 211 19137 212 19670 213 20001 214 20594 215 21075 216 21448 217 22135 218 22584 219 23719 220 24166 221 24675 222 25562 223 26649 224 27166 225 28354 226 29354 227 30716 228 32052 229 33232 230 34159 231 35759 232 37143 233 38413 234 40338 235 41993 236 43264 237 45098 238 46988 239 49116 240 50881 241 52617 242 55185 243 57224 244 59476 245 61921 246 64309 247 67486 248 70193 249 73493 250 76005 251 79340 252 83007 253 86186 254 89569 255 93123 256 97021 257 101173 258 105571 259 109737 260 114469 261 119248 262 123934 263 128171 264 134166 265 139783 266 144646 267 150873 268 156193 269 161992 270 169095 271 175837 272 183706 273 191134 274 198000 275 206461 276 216770 277 223857 278 231315 279 239318 280 247460 281 256457 282 265609 283 274228 284 284571 285 292880 286 302516 287 312742 288 323893 289 334546 290 346110 291 358716 292 369460 293 381468 294 393855 295 404751 296 418382 297 430323 298 443748 299 458382 300 472275 301 486343 302 500931 303 514274 304 531570 305 545584 306 559756 307 575346 308 593639 309 606916 310 625026 311 642902 312 658293 313 677965 314 692754 315 709937 316 728670 317 747146 318 764367 319 781763 320 801693 321 819068 322 838645 323 858810 324 879552 325 898855 326 916983 327 936132 328 953700 329 974467 330 994274 331 1013349 332 1036002 333 1055993 334 1075545 335 1097512 336 1118501 337 1136750 338 1159717 339 1178589 340 1194227 341 1218596 342 1237523 343 1259403 344 1278486 345 1300133 346 1318685 347 1340005 348 1358351 349 1374551 350 1393218 351 1412453 352 1433496 353 1450267 354 1471279 355 1488155 356 1506718 357 1521812 358 1540817 359 1554718 360 1571686 361 1585905 362 1603756 363 1619091 364 1636087 365 1651384 366 1665426 367 1680053 368 1693366 369 1707821 370 1720021 371 1731328 372 1747241 373 1757844 374 1769871 375 1784720 376 1795610 377 1802807 378 1813533 379 1826242 380 1834234 381 1842255 382 1852322 383 1858680 384 1868614 385 1874822 386 1883133 387 1889183 388 1897946 389 1903063 390 1905062 391 1910350 392 1911746 393 1920046 394 1924539 395 1928916 396 1933185 397 1933805 398 1936288 399 1936800 400 1941451 401 1941997 402 1939357 403 1938880 404 1943828 405 1940724 406 1940658 407 1940974 408 1941008 409 1939605 410 1936104 411 1932844 412 1926770 413 1924325 414 1922139 415 1918972 416 1916559 417 1915047 418 1908166 419 1902822 420 1897394 421 1890247 422 1886786 423 1882178 424 1872506 425 1870478 426 1862113 427 1853431 428 1849554 429 1842356 430 1833262 431 1825798 432 1817615 433 1812988 434 1803078 435 1795755 436 1787011 437 1779460 438 1768692 439 1760765 440 1755345 441 1741502 442 1735143 443 1724295 444 1716519 445 1706233 446 1695815 447 1687006 448 1679222 449 1669419 450 1658683 451 1649305 452 1639573 453 1625900 454 1616695 455 1604434 456 1596277 457 1587369 458 1577906 459 1564810 460 1555399 461 1546048 462 1534194 463 1522611 464 1509562 465 1499714 466 1490252 467 1478663 468 1468309 469 1457801 470 1446242 471 1435155 472 1425008 473 1411898 474 1401953 475 1391895 476 1379891 477 1368894 478 1357811 479 1350667 480 1337695 481 1327473 482 1318268 483 1304471 484 1292809 485 1280553 486 1273339 487 1260327 488 1247462 489 1239686 490 1229079 491 1218493 492 1208629 493 1196325 494 1186697 495 1175632 496 1165258 497 1153263 498 1144041 499 1134984 500 1122131 501 1112814 502 1103479 503 1093177 504 1082559 505 1071916 506 1062719 507 1052574 508 1042575 509 1031174 510 1021707 511 1013207 512 1002072 513 992792 514 982614 515 973338 516 962595 517 952967 518 943266 519 934281 520 923214 521 916434 522 906120 523 893983 524 886851 525 876949 526 867812 527 859301 528 848024 529 839406 530 829081 531 820869 532 811522 533 801888 534 795358 535 785192 536 776615 537 767535 538 759680 539 750396 540 744268 541 734980 542 727621 543 717947 544 708679 545 700899 546 690296 547 683089 548 675185 549 669030 550 660688 551 653355 552 645341 553 636507 554 628695 555 622194 556 613971 557 608172 558 597195 559 591420 560 584892 561 576835 562 569755 563 562019 564 555940 565 549030 566 540674 567 534673 568 528853 569 521156 570 514018 571 507404 572 499356 573 493433 574 488909 575 480973 576 474762 577 467631 578 461736 579 454347 580 450193 581 442646 582 436149 583 430627 584 424502 585 417638 586 413386 587 406207 588 400877 589 394730 590 389354 591 384071 592 377741 593 371689 594 367540 595 361519 596 356536 597 351085 598 345919 599 339157 600 335584 601 330517 602 325741 603 321520 604 316375 605 311057 606 306394 607 301788 608 298145 609 292735 610 287867 611 284152 612 279755 613 275257 614 271373 615 266174 616 262548 617 258463 618 255367 619 250661 620 245654 621 241883 622 237789 623 235477 624 231094 625 228817 626 223509 627 220084 628 216952 629 212951 630 209542 631 205788 632 202704 633 199991 634 195642 635 192853 636 189353 637 186923 638 183705 639 180339 640 177546 641 173749 642 171466 643 168394 644 165373 645 163120 646 160469 647 157654 648 155002 649 151696 650 150186 651 146970 652 144701 653 141603 654 139976 655 137209 656 134293 657 132864 658 130560 659 127294 660 125901 661 123264 662 121024 663 119741 664 116974 665 115494 666 113273 667 111093 668 108870 669 107547 670 104808 671 103344 672 101775 673 98745 674 97240 675 95960 676 94184 677 92603 678 90999 679 89165 680 86774 681 85840 682 83922 683 82715 684 80681 685 79484 686 78607 687 76124 688 75372 689 73857 690 72410 691 71597 692 69662 693 68825 694 67530 695 66149 696 64428 697 63355 698 62039 699 61208 700 59682 701 58087 702 57317 703 56420 704 55407 705 54805 706 53333 707 52366 708 51248 709 49669 710 49856 711 48119 712 47429 713 46428 714 45363 715 44436 716 43687 717 42638 718 42076 719 41383 720 40339 721 39773 722 38833 723 37883 724 37192 725 36719 726 36072 727 35481 728 34511 729 33904 730 32910 731 32521 732 32198 733 31446 734 31230 735 30235 736 29629 737 28810 738 28553 739 28216 740 27150 741 26627 742 26439 743 25760 744 25555 745 24729 746 24432 747 23904 748 23053 749 22767 750 22418 751 21680 752 21392 753 21077 754 20721 755 20158 756 19744 757 19297 758 19067 759 18440 760 18343 761 17799 762 17671 763 17179 764 16993 765 16366 766 16105 767 15431 768 15406 769 15048 770 14426 771 14160 772 13825 773 13705 774 13241 775 12975 776 12598 777 12538 778 12256 779 11785 780 11803 781 11521 782 11194 783 11014 784 10648 785 10473 786 10511 787 10212 788 9983 789 9725 790 9721 791 9497 792 9155 793 9126 794 8791 795 8621 796 8446 797 8353 798 8150 799 7912 800 7859 801 7408 802 7474 803 7439 804 7185 805 6960 806 6969 807 6420 808 6328 809 6672 810 6189 811 6171 812 6050 813 5806 814 5822 815 5639 816 5609 817 5491 818 5346 819 5289 820 4961 821 5172 822 4885 823 4655 824 4516 825 4391 826 4344 827 4314 828 4037 829 3679 830 3877 831 3312 832 3260 833 3164 834 3231 835 3061 836 2963 837 2954 838 2886 839 2778 840 2685 841 2610 842 2556 843 2499 844 2495 845 2414 846 2374 847 2366 848 2345 849 2255 850 2120 851 2182 852 2143 853 2152 854 2206 855 1976 856 1909 857 1804 858 1779 859 1952 860 1651 861 1514 862 1497 863 1474 864 1476 865 1377 866 1432 867 1302 868 1347 869 1248 870 1231 871 1284 872 1273 873 1225 874 1160 875 1158 876 1146 877 1098 878 1063 879 1017 880 989 881 998 882 965 883 993 884 939 885 923 886 868 887 874 888 854 889 864 890 872 891 820 892 846 893 780 894 803 895 761 896 726 897 759 898 720 899 661 900 714 901 696 902 628 903 641 904 657 905 635 906 650 907 613 908 603 909 588 910 562 911 523 912 535 913 568 914 522 915 503 916 506 917 505 918 502 919 470 920 480 921 467 922 464 923 461 924 438 925 442 926 428 927 409 928 410 929 429 930 389 931 403 932 379 933 401 934 343 935 375 936 361 937 394 938 378 939 342 940 349 941 341 942 339 943 337 944 318 945 290 946 333 947 294 948 323 949 284 950 285 951 294 952 281 953 301 954 281 955 258 956 287 957 256 958 301 959 263 960 260 961 249 962 261 963 265 964 222 965 251 966 215 967 228 968 204 969 216 970 211 971 210 972 207 973 203 974 211 975 193 976 169 977 208 978 213 979 200 980 182 981 194 982 200 983 185 984 202 985 190 986 169 987 183 988 158 989 173 990 157 991 173 992 158 993 144 994 153 995 154 996 152