#SentieonCommandLine: /lustre8/home/ykawai-tnproj-pg/packages/sentieon-genomics-201911/libexec/driver -t 8 -r /lustre8/home/ncbn-pg/data/resource/Homo_sapiens_assembly38.fasta -i HGDP/HGDP00963/HGDP00963.cram --algo InsertSizeMetricAlgo HGDP/HGDP00963/QCmetrics/HGDP00963.InsertSizeMetricAlgo.txt MEDIAN_INSERT_SIZE MEDIAN_ABSOLUTE_DEVIATION MIN_INSERT_SIZE MAX_INSERT_SIZE MEAN_INSERT_SIZE STANDARD_DEVIATION READ_PAIRS PAIR_ORIENTATION WIDTH_OF_10_PERCENT WIDTH_OF_20_PERCENT WIDTH_OF_30_PERCENT WIDTH_OF_40_PERCENT WIDTH_OF_50_PERCENT WIDTH_OF_60_PERCENT WIDTH_OF_70_PERCENT WIDTH_OF_80_PERCENT WIDTH_OF_90_PERCENT WIDTH_OF_99_PERCENT 459.000000 59.000000 2 245917077 465.218298 95.848317 338753548 FR 23 45 69 93 119 147 183 227 303 659 insert_size All_Reads.fr_count 2 267 3 302 4 315 5 331 6 283 7 339 8 347 9 320 10 319 11 336 12 365 13 374 14 366 15 390 16 332 17 380 18 379 19 399 20 435 21 426 22 408 23 424 24 451 25 503 26 499 27 523 28 553 29 711 30 1943 31 2014 32 2028 33 2191 34 2417 35 2861 36 3043 37 3139 38 3389 39 3561 40 3931 41 3990 42 4316 43 4519 44 4867 45 5091 46 5264 47 5313 48 5578 49 6504 50 6521 51 6832 52 8321 53 9973 54 11306 55 11862 56 12694 57 13090 58 14571 59 15935 60 17461 61 17444 62 17948 63 18835 64 19944 65 19567 66 19794 67 20090 68 20834 69 21427 70 21088 71 21228 72 21262 73 21380 74 21735 75 21741 76 21364 77 21483 78 21804 79 22434 80 21738 81 21554 82 21577 83 22173 84 22890 85 22723 86 22440 87 21937 88 22691 89 23304 90 23315 91 22857 92 22810 93 23476 94 24203 95 23427 96 22992 97 22882 98 23438 99 23551 100 23222 101 22704 102 22542 103 23838 104 23394 105 22656 106 22753 107 22384 108 23138 109 22877 110 22782 111 22229 112 22205 113 22793 114 23240 115 22901 116 23421 117 23022 118 23545 119 23598 120 23514 121 23140 122 22995 123 22959 124 23417 125 22999 126 22657 127 22288 128 22216 129 22425 130 22274 131 22105 132 21650 133 21870 134 21944 135 21426 136 21181 137 21238 138 21096 139 21161 140 20896 141 20402 142 20441 143 20247 144 20597 145 20565 146 20615 147 20202 148 20494 149 20634 150 20281 151 19974 152 19606 153 19937 154 19757 155 19184 156 19095 157 18815 158 18542 159 18525 160 17724 161 17772 162 17819 163 17742 164 17565 165 17175 166 17074 167 16496 168 16518 169 16480 170 16391 171 16029 172 15938 173 15925 174 15830 175 15660 176 15529 177 15755 178 15726 179 15622 180 15661 181 15423 182 15359 183 15297 184 15321 185 15155 186 14822 187 14547 188 14762 189 14794 190 14399 191 14162 192 14199 193 14041 194 14072 195 14012 196 14101 197 14101 198 13951 199 13738 200 13878 201 13701 202 13621 203 13692 204 13535 205 13481 206 13558 207 13930 208 13794 209 13747 210 13620 211 13774 212 14055 213 14234 214 14499 215 14607 216 14628 217 15129 218 15233 219 15355 220 15376 221 15432 222 15746 223 15930 224 15916 225 16439 226 16523 227 16828 228 16770 229 17459 230 17516 231 18252 232 18509 233 18829 234 19393 235 19760 236 19913 237 20628 238 21130 239 21795 240 22409 241 22804 242 23381 243 24226 244 24685 245 25400 246 26305 247 27119 248 27876 249 29018 250 29571 251 30761 252 32335 253 33229 254 34779 255 35791 256 36269 257 38310 258 39506 259 41073 260 42220 261 43984 262 45446 263 46948 264 48823 265 50518 266 52481 267 53940 268 56150 269 58655 270 60499 271 62525 272 64406 273 67756 274 70665 275 74197 276 77342 277 79435 278 82877 279 85722 280 87400 281 90871 282 93659 283 97988 284 101125 285 104439 286 107859 287 112248 288 115136 289 119870 290 124108 291 127806 292 132901 293 138013 294 142762 295 147019 296 152373 297 156948 298 162774 299 169289 300 174330 301 180741 302 186528 303 193050 304 199664 305 206061 306 212427 307 219332 308 225900 309 233199 310 240073 311 248193 312 256106 313 264061 314 272202 315 280050 316 288333 317 297878 318 305076 319 314530 320 323604 321 333323 322 342057 323 353048 324 362723 325 372336 326 382485 327 393501 328 404135 329 414199 330 424954 331 436643 332 447156 333 459861 334 471347 335 482629 336 494427 337 506278 338 517816 339 532035 340 542754 341 556060 342 568390 343 581773 344 595545 345 609799 346 620628 347 634552 348 648388 349 662364 350 675275 351 689864 352 704146 353 717538 354 733027 355 746367 356 760624 357 775995 358 790019 359 803468 360 816649 361 834398 362 850396 363 863834 364 879363 365 896310 366 909447 367 924588 368 938957 369 953904 370 967980 371 981525 372 997026 373 1011358 374 1027684 375 1040516 376 1054791 377 1070516 378 1084147 379 1099163 380 1111681 381 1125211 382 1138804 383 1153340 384 1169007 385 1183549 386 1195332 387 1207743 388 1222191 389 1235177 390 1246459 391 1259926 392 1272127 393 1284143 394 1297324 395 1308402 396 1322464 397 1333791 398 1346295 399 1357719 400 1368704 401 1379137 402 1389311 403 1401032 404 1411320 405 1419822 406 1431019 407 1439890 408 1451119 409 1460540 410 1466628 411 1475695 412 1481794 413 1491482 414 1498103 415 1504384 416 1511355 417 1520234 418 1528022 419 1534122 420 1537232 421 1541094 422 1543087 423 1550824 424 1557249 425 1560117 426 1568692 427 1569190 428 1575034 429 1578037 430 1579635 431 1580578 432 1583501 433 1583877 434 1588503 435 1589411 436 1590796 437 1591978 438 1595132 439 1593301 440 1593874 441 1593055 442 1592025 443 1592021 444 1593849 445 1589797 446 1588646 447 1589226 448 1586868 449 1584777 450 1583349 451 1580414 452 1576212 453 1573444 454 1568831 455 1566410 456 1560252 457 1559193 458 1557388 459 1551296 460 1547826 461 1542268 462 1535645 463 1533876 464 1526368 465 1522918 466 1516130 467 1509252 468 1506054 469 1498501 470 1493870 471 1485782 472 1478895 473 1472745 474 1465116 475 1459117 476 1451228 477 1446542 478 1439339 479 1433589 480 1425452 481 1415429 482 1413306 483 1402975 484 1391591 485 1386665 486 1378341 487 1369052 488 1364049 489 1353311 490 1345057 491 1334669 492 1328585 493 1318430 494 1310777 495 1299967 496 1293691 497 1282581 498 1274117 499 1267126 500 1259143 501 1249781 502 1241453 503 1230724 504 1221173 505 1213129 506 1203272 507 1193436 508 1186545 509 1177564 510 1166418 511 1156789 512 1149099 513 1139457 514 1131672 515 1121956 516 1111775 517 1100928 518 1091338 519 1083271 520 1075371 521 1064432 522 1056146 523 1046892 524 1036954 525 1028585 526 1017668 527 1010258 528 999204 529 990647 530 983477 531 969992 532 961994 533 954289 534 946552 535 935352 536 927067 537 919770 538 907873 539 900473 540 890179 541 884259 542 873376 543 864911 544 858236 545 847790 546 839727 547 830040 548 821573 549 811734 550 804520 551 796473 552 787634 553 779325 554 770301 555 763588 556 754478 557 743573 558 735467 559 728402 560 717801 561 709801 562 703169 563 694989 564 687760 565 681831 566 672531 567 663524 568 657065 569 648322 570 641274 571 633643 572 627311 573 618622 574 612650 575 603846 576 596926 577 589154 578 583589 579 576370 580 568894 581 561338 582 555820 583 547971 584 541979 585 534065 586 527495 587 520220 588 514898 589 508491 590 502808 591 495285 592 489901 593 483083 594 477333 595 470692 596 464804 597 457979 598 452447 599 447093 600 442527 601 435216 602 428586 603 423855 604 417265 605 411817 606 405566 607 401237 608 395919 609 390112 610 384180 611 379714 612 374820 613 370008 614 363323 615 359563 616 354085 617 350226 618 343760 619 338620 620 332479 621 328870 622 323503 623 319318 624 313976 625 310107 626 305332 627 301185 628 295734 629 291724 630 287835 631 283124 632 279347 633 274548 634 271356 635 266710 636 264341 637 259956 638 255493 639 250453 640 247220 641 243916 642 240747 643 235849 644 231606 645 228830 646 224709 647 221629 648 217779 649 215023 650 211593 651 208337 652 204695 653 201818 654 198736 655 195964 656 191827 657 189235 658 185962 659 183568 660 180252 661 176983 662 174296 663 171713 664 168476 665 166152 666 163607 667 160121 668 157553 669 153944 670 152483 671 149704 672 147798 673 145085 674 143405 675 140706 676 137238 677 135798 678 133476 679 130904 680 128636 681 126808 682 124519 683 122914 684 119391 685 118108 686 116297 687 114041 688 111868 689 110358 690 108458 691 105869 692 104174 693 102408 694 100312 695 98644 696 97540 697 95589 698 93897 699 92665 700 90690 701 88705 702 87636 703 85344 704 84124 705 83254 706 81149 707 79387 708 77903 709 76839 710 75281 711 73761 712 72323 713 70825 714 70162 715 68609 716 67585 717 66136 718 64960 719 64249 720 62557 721 61301 722 60186 723 59088 724 57921 725 57362 726 56590 727 55282 728 54418 729 52857 730 52333 731 50882 732 50388 733 49511 734 48732 735 47593 736 46698 737 46180 738 45244 739 44248 740 43840 741 42247 742 41676 743 40999 744 40616 745 39441 746 38785 747 38003 748 37150 749 36568 750 36076 751 35045 752 34405 753 33985 754 33000 755 32586 756 32049 757 31546 758 30847 759 30199 760 29775 761 28706 762 28694 763 28238 764 27807 765 27166 766 26424 767 26254 768 25405 769 25375 770 24218 771 24159 772 23636 773 23413 774 22716 775 22075 776 21803 777 21243 778 20909 779 20493 780 20227 781 19759 782 19253 783 19145 784 18681 785 18372 786 17860 787 17756 788 17192 789 16876 790 16368 791 16296 792 15569 793 15568 794 15453 795 14981 796 14753 797 14080 798 13993 799 13557 800 13391 801 12940 802 12725 803 12324 804 12024 805 11829 806 11666 807 11289 808 11248 809 11095 810 10548 811 10518 812 10369 813 10070 814 9959 815 9939 816 9499 817 9581 818 9178 819 8815 820 8778 821 8656 822 8669 823 8244 824 8143 825 8260 826 7613 827 7629 828 7548 829 7359 830 7187 831 7049 832 6751 833 6735 834 6557 835 6625 836 6417 837 6284 838 6223 839 6113 840 6036 841 5814 842 5787 843 5731 844 5510 845 5501 846 5442 847 5203 848 5196 849 5539 850 5162 851 4702 852 4686 853 4781 854 4368 855 4119 856 4226 857 4338 858 4058 859 3734 860 3460 861 3425 862 3457 863 3149 864 3057 865 2963 866 2966 867 2900 868 2755 869 2799 870 2871 871 2599 872 2486 873 2459 874 2642 875 2378 876 2279 877 2221 878 2188 879 2098 880 2094 881 2054 882 1920 883 1923 884 1911 885 1838 886 1692 887 1782 888 1704 889 1626 890 1602 891 1580 892 1515 893 1529 894 1473 895 1457 896 1408 897 1410 898 1332 899 1298 900 1229 901 1247 902 1203 903 1232 904 1148 905 1175 906 1193 907 1112 908 1081 909 1083 910 1019 911 988 912 995 913 993 914 1008 915 908 916 885 917 916 918 843 919 907 920 868 921 860 922 843 923 821 924 835 925 768 926 745 927 754 928 719 929 723 930 752 931 742 932 658 933 666 934 688 935 621 936 613 937 627 938 602 939 650 940 582 941 552 942 561 943 530 944 513 945 519 946 587 947 530 948 509 949 491 950 505 951 474 952 477 953 439 954 430 955 506 956 454 957 404 958 422 959 398 960 438 961 385 962 380 963 354 964 338 965 376 966 360 967 352 968 329 969 353 970 324 971 345 972 326 973 334 974 316 975 318 976 322 977 306 978 308 979 284 980 271 981 279 982 284 983 302 984 231 985 237 986 239 987 274 988 230 989 259 990 223 991 257 992 251 993 236 994 251 995 232 996 218 997 201 998 209 999 217 1000 233 1001 218 1002 207 1003 203 1004 215 1005 189 1006 212 1007 188 1008 200 1009 162 1010 166 1011 161 1012 178 1013 177 1014 196 1015 155 1016 142 1017 163 1018 176 1019 139 1020 177 1021 145 1022 155 1023 160 1024 159 1025 145 1026 150 1027 153 1028 144 1029 141 1030 126 1031 131 1032 129 1033 127 1034 139 1035 122 1036 132 1037 125 1038 134 1039 125 1040 133 1041 113 1042 104 1043 114 1044 121 1045 127 1046 100 1047 123 1048 116 1049 119