#SentieonCommandLine: /lustre8/home/ykawai-tnproj-pg/packages/sentieon-genomics-201911/libexec/driver -t 8 -r /lustre8/home/ncbn-pg/data/resource/Homo_sapiens_assembly38.fasta -i HGDP/HGDP00965/HGDP00965.cram --algo InsertSizeMetricAlgo HGDP/HGDP00965/QCmetrics/HGDP00965.InsertSizeMetricAlgo.txt MEDIAN_INSERT_SIZE MEDIAN_ABSOLUTE_DEVIATION MIN_INSERT_SIZE MAX_INSERT_SIZE MEAN_INSERT_SIZE STANDARD_DEVIATION READ_PAIRS PAIR_ORIENTATION WIDTH_OF_10_PERCENT WIDTH_OF_20_PERCENT WIDTH_OF_30_PERCENT WIDTH_OF_40_PERCENT WIDTH_OF_50_PERCENT WIDTH_OF_60_PERCENT WIDTH_OF_70_PERCENT WIDTH_OF_80_PERCENT WIDTH_OF_90_PERCENT WIDTH_OF_99_PERCENT 461.000000 62.000000 2 243691768 468.814338 101.233365 313906047 FR 25 47 71 97 125 155 191 239 319 697 insert_size All_Reads.fr_count 2 376 3 439 4 451 5 381 6 433 7 450 8 485 9 446 10 462 11 461 12 462 13 485 14 485 15 493 16 493 17 473 18 500 19 479 20 532 21 522 22 528 23 519 24 613 25 607 26 643 27 648 28 761 29 1179 30 1997 31 2067 32 3154 33 3455 34 4106 35 4465 36 5900 37 6189 38 8018 39 8373 40 8708 41 9177 42 9481 43 9940 44 11441 45 12044 46 11782 47 13007 48 14109 49 14567 50 14667 51 15187 52 15384 53 16002 54 17180 55 16802 56 17035 57 17141 58 18343 59 18752 60 18625 61 18808 62 18804 63 19711 64 19957 65 20273 66 19888 67 19852 68 20660 69 21024 70 20919 71 20987 72 21720 73 21499 74 22423 75 21967 76 22085 77 22085 78 22459 79 23669 80 22779 81 22674 82 22555 83 23058 84 23762 85 23210 86 23150 87 22548 88 23225 89 23436 90 23111 91 22617 92 22225 93 22863 94 22905 95 22732 96 22397 97 22480 98 22493 99 22804 100 23161 101 22775 102 22684 103 23225 104 23432 105 23254 106 23465 107 23224 108 24190 109 24403 110 23718 111 23376 112 22932 113 23601 114 23950 115 23491 116 22969 117 22647 118 22742 119 23295 120 22748 121 22337 122 22296 123 22527 124 22506 125 21918 126 22043 127 21322 128 21842 129 21396 130 21862 131 21736 132 21185 133 21547 134 21686 135 21581 136 21562 137 21243 138 21829 139 21678 140 21512 141 21488 142 20765 143 21032 144 20963 145 20544 146 20626 147 20169 148 20007 149 19997 150 19692 151 19447 152 19422 153 19373 154 19647 155 19036 156 18691 157 18169 158 18451 159 18053 160 17816 161 17609 162 17298 163 17700 164 17349 165 17276 166 16879 167 17071 168 16748 169 16881 170 16783 171 16880 172 16702 173 16804 174 16514 175 16619 176 16218 177 15967 178 16046 179 15979 180 15394 181 15153 182 15151 183 15390 184 14909 185 14462 186 14628 187 14311 188 14433 189 14438 190 14351 191 14104 192 13849 193 13895 194 13801 195 13478 196 13568 197 13336 198 13430 199 12993 200 13290 201 13122 202 13089 203 13091 204 13200 205 13079 206 13177 207 13512 208 13509 209 13585 210 13561 211 13441 212 13420 213 13328 214 13459 215 13526 216 13356 217 13677 218 13774 219 13851 220 13888 221 14043 222 13786 223 13956 224 14304 225 14435 226 14565 227 14762 228 14786 229 15186 230 15574 231 15645 232 15879 233 16239 234 16764 235 17007 236 17400 237 17714 238 18094 239 18554 240 19111 241 19544 242 20041 243 20737 244 21191 245 21775 246 22372 247 23214 248 24085 249 25116 250 26032 251 26941 252 27887 253 28691 254 29779 255 30723 256 31609 257 32794 258 33578 259 35202 260 36587 261 37529 262 38839 263 40435 264 42034 265 43449 266 45230 267 46271 268 48306 269 50511 270 52610 271 54880 272 56275 273 59141 274 62192 275 64410 276 69351 277 71120 278 73542 279 75360 280 77732 281 80611 282 83125 283 86389 284 89376 285 93054 286 95732 287 98957 288 103306 289 106925 290 111072 291 115039 292 119192 293 122616 294 128247 295 131911 296 136816 297 142096 298 148239 299 152614 300 158024 301 164657 302 170051 303 176010 304 182763 305 188751 306 194831 307 200463 308 207483 309 213976 310 222124 311 228930 312 236817 313 243890 314 250737 315 258032 316 266860 317 274696 318 282595 319 291797 320 300161 321 308430 322 319283 323 327788 324 337724 325 347005 326 356893 327 367033 328 376681 329 387840 330 397620 331 409074 332 418308 333 429316 334 441667 335 453907 336 463904 337 476663 338 488360 339 497919 340 511291 341 523316 342 535777 343 548322 344 562636 345 574875 346 587244 347 597544 348 613332 349 626248 350 637757 351 651638 352 663583 353 679554 354 690422 355 707357 356 717684 357 733618 358 746741 359 758692 360 772518 361 784777 362 800625 363 813014 364 826716 365 842510 366 854755 367 866412 368 881724 369 895017 370 907669 371 922748 372 934282 373 948960 374 959807 375 974738 376 986691 377 997036 378 1012515 379 1021976 380 1034943 381 1046602 382 1057977 383 1072743 384 1083253 385 1096050 386 1105675 387 1119062 388 1127520 389 1139320 390 1151379 391 1160225 392 1168966 393 1181815 394 1193403 395 1205419 396 1212730 397 1220600 398 1229982 399 1242141 400 1248932 401 1261685 402 1265662 403 1273994 404 1285029 405 1290899 406 1299027 407 1305141 408 1314978 409 1322299 410 1327187 411 1334648 412 1335238 413 1344617 414 1347305 415 1354802 416 1358384 417 1363423 418 1369855 419 1372689 420 1374326 421 1379979 422 1383135 423 1386059 424 1387374 425 1390610 426 1397047 427 1400041 428 1401394 429 1402568 430 1404591 431 1404222 432 1404048 433 1407326 434 1405437 435 1408523 436 1408129 437 1408484 438 1408000 439 1408649 440 1409383 441 1406978 442 1406248 443 1406213 444 1403132 445 1402402 446 1399853 447 1399390 448 1395843 449 1395751 450 1393596 451 1391633 452 1389349 453 1383668 454 1381294 455 1375654 456 1374186 457 1370440 458 1367321 459 1361629 460 1361606 461 1359123 462 1354005 463 1346117 464 1341566 465 1337666 466 1329964 467 1327186 468 1323522 469 1319138 470 1313501 471 1308719 472 1301392 473 1299828 474 1290765 475 1285918 476 1278441 477 1274542 478 1267470 479 1261556 480 1255918 481 1249336 482 1245588 483 1238092 484 1231414 485 1223806 486 1216711 487 1210315 488 1205012 489 1196865 490 1189256 491 1184986 492 1178259 493 1170548 494 1164764 495 1157391 496 1150049 497 1143295 498 1136343 499 1127177 500 1120091 501 1112865 502 1104391 503 1097777 504 1093708 505 1084887 506 1078066 507 1069595 508 1063664 509 1054486 510 1048143 511 1040118 512 1034396 513 1025954 514 1017915 515 1010845 516 1005657 517 994590 518 989547 519 980692 520 975234 521 967549 522 959280 523 951723 524 944531 525 935621 526 928089 527 922373 528 913769 529 906295 530 897880 531 892370 532 885543 533 879198 534 868843 535 863451 536 854731 537 847314 538 838093 539 832422 540 823865 541 817167 542 810765 543 804477 544 795930 545 789520 546 783115 547 773884 548 767392 549 758368 550 753887 551 746549 552 739452 553 730777 554 726234 555 718021 556 712579 557 704970 558 699046 559 690346 560 681933 561 675480 562 668476 563 662375 564 656294 565 648689 566 643301 567 636639 568 629082 569 622592 570 617138 571 610577 572 601411 573 597478 574 589660 575 585549 576 577381 577 569697 578 562461 579 556214 580 551050 581 544501 582 538381 583 531864 584 527424 585 520857 586 515829 587 510556 588 503831 589 499146 590 492545 591 486255 592 479988 593 476820 594 470349 595 464599 596 459287 597 452427 598 447736 599 444119 600 437407 601 433173 602 427157 603 422166 604 416697 605 411739 606 407770 607 402785 608 398154 609 392970 610 386710 611 383764 612 378855 613 375061 614 369970 615 364843 616 361854 617 355531 618 351629 619 346400 620 342576 621 338347 622 332257 623 328604 624 326136 625 319717 626 315888 627 312032 628 308118 629 305332 630 300272 631 296983 632 293230 633 288556 634 285199 635 280945 636 276467 637 273014 638 269926 639 266196 640 263123 641 258857 642 255474 643 251817 644 248281 645 244910 646 241438 647 237917 648 235017 649 232464 650 228170 651 226267 652 222631 653 219176 654 216051 655 213489 656 210468 657 207448 658 204246 659 201962 660 198626 661 195763 662 193425 663 190937 664 187606 665 185227 666 181808 667 179335 668 177073 669 174460 670 172367 671 170041 672 167844 673 165711 674 162305 675 159463 676 157195 677 154971 678 152842 679 150352 680 148679 681 146393 682 143885 683 141410 684 139839 685 138111 686 135106 687 133049 688 131200 689 129716 690 127738 691 126261 692 123592 693 122696 694 119590 695 117497 696 115589 697 113270 698 111690 699 110519 700 108523 701 107268 702 105062 703 103447 704 101344 705 100184 706 98192 707 96933 708 95779 709 94363 710 92734 711 90944 712 90198 713 88445 714 86691 715 84827 716 84355 717 82724 718 81487 719 79989 720 78463 721 77000 722 75469 723 74987 724 73806 725 72639 726 71070 727 70108 728 68533 729 67633 730 66474 731 65066 732 64499 733 63517 734 62644 735 61562 736 60485 737 58805 738 57834 739 56960 740 56033 741 55666 742 54302 743 53466 744 52578 745 52029 746 50784 747 50235 748 49154 749 48763 750 47855 751 46535 752 46124 753 45257 754 44227 755 43631 756 42798 757 42217 758 41335 759 40684 760 39665 761 39326 762 38922 763 37643 764 37485 765 36434 766 36109 767 35087 768 34914 769 33991 770 33542 771 32773 772 32253 773 31707 774 31333 775 30286 776 29777 777 29309 778 28667 779 28420 780 27814 781 27388 782 26894 783 26260 784 25841 785 25486 786 24526 787 24520 788 24217 789 23375 790 22871 791 22460 792 22260 793 21726 794 21363 795 20985 796 20605 797 20316 798 19779 799 19488 800 18778 801 18712 802 18044 803 18040 804 17510 805 17200 806 16816 807 16774 808 16543 809 16046 810 15349 811 15373 812 15244 813 14865 814 14236 815 14008 816 13804 817 13629 818 13398 819 13198 820 12770 821 12525 822 12314 823 12113 824 11918 825 11811 826 11571 827 11106 828 10878 829 11051 830 10662 831 10428 832 10389 833 10058 834 9749 835 9558 836 9509 837 9395 838 9092 839 9037 840 8741 841 8613 842 8378 843 8145 844 8142 845 7806 846 7950 847 7686 848 7813 849 7537 850 7284 851 7277 852 6925 853 6833 854 6749 855 6492 856 6424 857 6291 858 6173 859 6322 860 5994 861 5880 862 5681 863 5775 864 5691 865 5534 866 5378 867 5411 868 5378 869 5252 870 4975 871 4761 872 4717 873 4683 874 4392 875 4412 876 4139 877 4105 878 4069 879 4146 880 3928 881 3817 882 3832 883 3796 884 3818 885 3727 886 3414 887 3323 888 3272 889 3432 890 3037 891 3022 892 2996 893 3048 894 2930 895 2878 896 2955 897 2663 898 2842 899 2679 900 2301 901 2228 902 2115 903 2181 904 1937 905 1932 906 1909 907 1899 908 1811 909 1794 910 1764 911 1753 912 1748 913 1618 914 1612 915 1510 916 1544 917 1575 918 1505 919 1494 920 1483 921 1428 922 1365 923 1325 924 1365 925 1313 926 1280 927 1269 928 1216 929 1155 930 1227 931 1134 932 1132 933 1105 934 1105 935 1117 936 1045 937 1009 938 998 939 979 940 954 941 931 942 938 943 910 944 883 945 911 946 866 947 864 948 836 949 816 950 851 951 874 952 797 953 748 954 773 955 745 956 729 957 714 958 760 959 701 960 654 961 666 962 625 963 626 964 605 965 643 966 629 967 613 968 594 969 571 970 553 971 558 972 551 973 564 974 545 975 508 976 510 977 496 978 487 979 450 980 474 981 424 982 485 983 426 984 453 985 421 986 409 987 435 988 426 989 372 990 416 991 388 992 398 993 381 994 357 995 354 996 320 997 374 998 336 999 341 1000 333 1001 323 1002 283 1003 314 1004 330 1005 301 1006 293 1007 274 1008 238 1009 317 1010 273 1011 266 1012 255 1013 269 1014 278 1015 245 1016 237 1017 258 1018 218 1019 236 1020 220 1021 201 1022 222 1023 223 1024 236 1025 215 1026 243 1027 218 1028 200 1029 205 1030 211 1031 204 1032 194 1033 202 1034 181 1035 177 1036 179 1037 171 1038 180 1039 192 1040 178 1041 166 1042 184 1043 168 1044 169 1045 176 1046 184 1047 148 1048 150 1049 164 1050 150 1051 155 1052 174 1053 142 1054 155 1055 153 1056 126 1057 150 1058 154 1059 132 1060 139 1061 147 1062 113 1063 123 1064 128 1065 115 1066 130 1067 121 1068 101 1069 114 1070 105 1071 97 1072 92 1073 122 1074 106 1075 99 1076 102 1077 90 1078 98 1079 113 1080 103 1081 96