#SentieonCommandLine: /lustre8/home/ykawai-tnproj-pg/packages/sentieon-genomics-201911/libexec/driver -t 8 -r /lustre8/home/ncbn-pg/data/resource/Homo_sapiens_assembly38.fasta -i HGDP/HGDP00974/HGDP00974.cram --algo InsertSizeMetricAlgo HGDP/HGDP00974/QCmetrics/HGDP00974.InsertSizeMetricAlgo.txt MEDIAN_INSERT_SIZE MEDIAN_ABSOLUTE_DEVIATION MIN_INSERT_SIZE MAX_INSERT_SIZE MEAN_INSERT_SIZE STANDARD_DEVIATION READ_PAIRS PAIR_ORIENTATION WIDTH_OF_10_PERCENT WIDTH_OF_20_PERCENT WIDTH_OF_30_PERCENT WIDTH_OF_40_PERCENT WIDTH_OF_50_PERCENT WIDTH_OF_60_PERCENT WIDTH_OF_70_PERCENT WIDTH_OF_80_PERCENT WIDTH_OF_90_PERCENT WIDTH_OF_99_PERCENT 423.000000 58.000000 2 247013658 433.462004 95.414960 348436023 FR 23 45 67 91 117 145 179 223 303 647 insert_size All_Reads.fr_count 2 343 3 381 4 369 5 367 6 405 7 426 8 372 9 382 10 377 11 373 12 392 13 395 14 588 15 616 16 627 17 644 18 689 19 1174 20 1173 21 1178 22 1324 23 1786 24 1958 25 2490 26 2990 27 3528 28 4197 29 4473 30 6102 31 6137 32 7047 33 7176 34 7594 35 8638 36 9200 37 9958 38 10389 39 11194 40 11713 41 12041 42 12247 43 13077 44 13615 45 13643 46 13919 47 14304 48 15237 49 15650 50 15736 51 16287 52 16243 53 17054 54 17805 55 17711 56 17794 57 18129 58 18601 59 19092 60 19717 61 20255 62 20314 63 20697 64 21625 65 21535 66 21949 67 21842 68 22403 69 22867 70 22519 71 22899 72 23187 73 23228 74 23794 75 23497 76 23134 77 23522 78 24013 79 24273 80 23779 81 23487 82 23084 83 23695 84 24524 85 24242 86 24172 87 24234 88 24632 89 25092 90 24669 91 24711 92 24995 93 24749 94 25123 95 24825 96 24797 97 24400 98 24965 99 25241 100 24482 101 24528 102 23952 103 24529 104 24325 105 24165 106 23983 107 23973 108 23955 109 24429 110 23800 111 23579 112 23547 113 23485 114 23672 115 23382 116 22912 117 23224 118 23538 119 23608 120 23325 121 23113 122 23031 123 23174 124 22878 125 22645 126 22425 127 22186 128 22273 129 21957 130 21831 131 21655 132 21417 133 21318 134 21203 135 21347 136 20982 137 20475 138 20706 139 20704 140 20354 141 20118 142 19960 143 19855 144 19884 145 19567 146 19361 147 19141 148 19232 149 19263 150 19193 151 19022 152 18997 153 19128 154 19114 155 18555 156 18141 157 17617 158 17852 159 17624 160 17430 161 17098 162 16915 163 17019 164 16607 165 16662 166 16471 167 16184 168 16148 169 16016 170 15901 171 15731 172 15321 173 15419 174 15209 175 14981 176 14968 177 14846 178 14829 179 14569 180 14452 181 14426 182 14559 183 14378 184 14435 185 14768 186 14518 187 14287 188 14394 189 14415 190 14508 191 14082 192 14088 193 14169 194 14015 195 14073 196 13973 197 13849 198 13726 199 13927 200 13540 201 13774 202 13659 203 14001 204 13831 205 13992 206 14163 207 13916 208 14201 209 14508 210 14434 211 14595 212 14983 213 14931 214 15225 215 15370 216 15583 217 15754 218 16159 219 16366 220 16759 221 17245 222 17547 223 18099 224 19065 225 19693 226 20267 227 21022 228 21473 229 22164 230 23291 231 23824 232 24785 233 25959 234 26730 235 27895 236 28483 237 29755 238 31265 239 32574 240 33780 241 35707 242 37044 243 38871 244 40825 245 42181 246 44570 247 46276 248 48608 249 51128 250 53784 251 55961 252 58979 253 61365 254 64618 255 67853 256 70948 257 74305 258 78311 259 82132 260 85411 261 89967 262 94311 263 98994 264 103388 265 108805 266 114189 267 119045 268 125823 269 129980 270 136476 271 143064 272 150452 273 157853 274 165263 275 172450 276 182380 277 189496 278 196376 279 204132 280 211793 281 219956 282 228577 283 238301 284 248097 285 258276 286 266182 287 276947 288 286878 289 297601 290 308233 291 320957 292 331813 293 344675 294 356431 295 368188 296 381035 297 394434 298 406900 299 422460 300 435077 301 448908 302 464035 303 479104 304 493913 305 508840 306 523698 307 539631 308 554532 309 570133 310 588408 311 603682 312 621673 313 637383 314 656917 315 672754 316 689132 317 707400 318 727342 319 743924 320 762115 321 779952 322 797183 323 815724 324 834478 325 852712 326 874039 327 890680 328 907550 329 927681 330 948245 331 964864 332 984391 333 1008402 334 1024416 335 1045585 336 1060827 337 1077694 338 1097989 339 1116071 340 1133992 341 1150922 342 1170883 343 1189348 344 1206813 345 1222745 346 1237831 347 1255988 348 1274024 349 1287984 350 1304858 351 1320708 352 1336600 353 1353604 354 1369832 355 1384637 356 1398733 357 1413140 358 1426005 359 1439694 360 1453184 361 1468154 362 1477947 363 1488799 364 1503390 365 1515809 366 1528453 367 1536084 368 1547105 369 1557664 370 1563648 371 1576756 372 1584127 373 1592202 374 1604906 375 1611509 376 1620860 377 1628786 378 1633399 379 1641012 380 1647199 381 1652481 382 1655767 383 1663258 384 1666356 385 1673558 386 1677177 387 1682087 388 1684945 389 1688176 390 1688445 391 1689778 392 1692094 393 1693122 394 1693376 395 1698666 396 1701476 397 1699509 398 1699576 399 1701579 400 1700129 401 1696477 402 1695952 403 1694944 404 1692693 405 1693752 406 1690957 407 1687337 408 1687345 409 1682180 410 1678525 411 1674040 412 1670628 413 1665046 414 1661104 415 1654730 416 1650207 417 1647152 418 1642638 419 1635580 420 1631281 421 1622971 422 1616365 423 1611847 424 1602944 425 1599236 426 1591870 427 1582688 428 1577122 429 1570215 430 1562386 431 1554427 432 1545536 433 1538393 434 1532699 435 1521896 436 1514185 437 1507028 438 1498495 439 1492105 440 1481079 441 1470714 442 1461634 443 1454523 444 1442158 445 1435411 446 1425656 447 1416770 448 1408978 449 1399584 450 1391143 451 1381059 452 1370487 453 1362420 454 1353034 455 1343311 456 1333940 457 1323756 458 1313405 459 1305747 460 1296856 461 1285648 462 1275135 463 1267510 464 1255538 465 1247047 466 1237165 467 1226740 468 1218522 469 1208342 470 1200241 471 1189128 472 1178168 473 1167559 474 1161786 475 1151261 476 1140803 477 1131333 478 1120505 479 1113515 480 1102902 481 1094661 482 1086257 483 1075824 484 1063388 485 1055972 486 1047020 487 1036883 488 1027719 489 1018467 490 1009476 491 999919 492 993080 493 983471 494 972620 495 964217 496 955896 497 946544 498 938593 499 930674 500 920219 501 910857 502 902670 503 896111 504 888098 505 878033 506 869227 507 860558 508 852200 509 845027 510 835018 511 827547 512 818660 513 812262 514 802683 515 795633 516 788558 517 780189 518 771348 519 763615 520 755698 521 746696 522 738382 523 732510 524 724797 525 716879 526 708542 527 700778 528 691697 529 685400 530 678767 531 670839 532 664039 533 656346 534 649426 535 642074 536 636146 537 628042 538 620695 539 615382 540 607541 541 601310 542 595552 543 588778 544 580930 545 575491 546 567485 547 560375 548 555476 549 548893 550 542244 551 537718 552 531126 553 524932 554 518383 555 512903 556 506177 557 499986 558 495334 559 490234 560 483235 561 475975 562 472121 563 467488 564 461284 565 455798 566 450367 567 445257 568 439514 569 434138 570 427434 571 424110 572 417056 573 412618 574 407731 575 404398 576 398051 577 393280 578 387403 579 383878 580 378340 581 373542 582 368210 583 364210 584 359627 585 355263 586 350294 587 345712 588 339842 589 337334 590 330708 591 328380 592 322885 593 317899 594 315191 595 311215 596 306079 597 302686 598 299053 599 295338 600 291004 601 286618 602 282453 603 279667 604 275862 605 271229 606 267942 607 265297 608 260536 609 257947 610 254602 611 250452 612 247354 613 243873 614 240168 615 236090 616 233021 617 230279 618 226633 619 223973 620 220191 621 217891 622 214629 623 211282 624 208016 625 205381 626 202039 627 198959 628 196806 629 192707 630 191160 631 188089 632 184530 633 182713 634 180057 635 176896 636 175349 637 171428 638 169372 639 166893 640 164665 641 160489 642 158867 643 157159 644 154747 645 151687 646 149592 647 148414 648 146249 649 143246 650 141158 651 138423 652 136684 653 134563 654 131913 655 130702 656 128316 657 126389 658 124607 659 123093 660 121242 661 118787 662 116091 663 115116 664 112877 665 111204 666 109732 667 108041 668 105826 669 103996 670 102602 671 101311 672 98910 673 98377 674 95952 675 94466 676 92900 677 91230 678 89598 679 88347 680 87250 681 85092 682 84120 683 83303 684 81447 685 80252 686 78416 687 76807 688 76094 689 74723 690 73114 691 72568 692 71057 693 69942 694 68042 695 67184 696 65990 697 65340 698 63569 699 62702 700 61929 701 60581 702 59344 703 58994 704 57601 705 56655 706 55806 707 54829 708 54231 709 52563 710 51470 711 51036 712 49767 713 49045 714 48268 715 47626 716 46214 717 45474 718 45048 719 44210 720 43365 721 42778 722 41689 723 41433 724 40392 725 39665 726 38851 727 38446 728 37688 729 36953 730 36586 731 35833 732 35170 733 34390 734 33711 735 33361 736 32634 737 31685 738 31618 739 30939 740 30201 741 29900 742 29284 743 29022 744 28303 745 27837 746 27147 747 26779 748 26035 749 25418 750 25087 751 24816 752 24228 753 24122 754 23139 755 22964 756 22716 757 22290 758 21728 759 21458 760 20765 761 20240 762 20018 763 19574 764 19195 765 18944 766 18488 767 17964 768 17919 769 17317 770 16808 771 16492 772 16007 773 16140 774 15624 775 15239 776 15170 777 14729 778 14351 779 14033 780 13979 781 13615 782 13547 783 13111 784 12900 785 12646 786 12544 787 12228 788 12191 789 11793 790 11579 791 11203 792 11328 793 10734 794 10338 795 10216 796 10030 797 9856 798 9858 799 9659 800 9456 801 9423 802 9004 803 8792 804 9297 805 8309 806 8063 807 7830 808 8013 809 7761 810 7661 811 7537 812 7302 813 7389 814 7058 815 7148 816 6477 817 6368 818 6598 819 6262 820 6462 821 5839 822 5563 823 5905 824 5693 825 5202 826 4921 827 5009 828 4701 829 4970 830 4379 831 4232 832 4103 833 4198 834 4010 835 3870 836 3845 837 3670 838 3670 839 3558 840 3477 841 3479 842 3471 843 3343 844 3222 845 3159 846 3206 847 3002 848 2890 849 2829 850 2730 851 2776 852 2685 853 2610 854 2556 855 2452 856 2344 857 2355 858 2307 859 2207 860 2329 861 2253 862 2165 863 2133 864 2032 865 2002 866 1973 867 1942 868 1893 869 1826 870 1827 871 1782 872 1767 873 1705 874 1662 875 1662 876 1619 877 1605 878 1494 879 1545 880 1474 881 1433 882 1394 883 1395 884 1421 885 1323 886 1234 887 1291 888 1262 889 1217 890 1242 891 1196 892 1210 893 1118 894 1078 895 1089 896 1046 897 1012 898 1075 899 1008 900 976 901 948 902 921 903 945 904 895 905 839 906 884 907 816 908 822 909 784 910 807 911 782 912 789 913 730 914 773 915 749 916 725 917 696 918 691 919 601 920 649 921 659 922 629 923 602 924 630 925 620 926 573 927 567 928 594 929 595 930 532 931 489 932 545 933 551 934 511 935 517 936 481 937 512 938 470 939 501 940 477 941 469 942 441 943 482 944 447 945 431 946 392 947 416 948 384 949 400 950 391 951 331 952 398 953 376 954 339 955 381 956 350 957 335 958 357 959 355 960 315 961 312 962 307 963 309 964 284 965 332 966 323 967 255 968 275 969 286 970 259 971 259 972 264 973 265 974 229 975 232 976 263 977 259 978 245 979 235 980 235 981 246 982 238 983 234 984 211 985 204 986 209 987 210 988 222 989 192 990 196 991 203 992 210 993 180 994 190 995 156 996 186 997 177 998 183 999 175 1000 164 1001 168 1002 172 1003 156