#SentieonCommandLine: /lustre8/home/ykawai-tnproj-pg/packages/sentieon-genomics-201911/libexec/driver -t 8 -r /lustre8/home/ncbn-pg/data/resource/Homo_sapiens_assembly38.fasta -i HGDP/HGDP01006/HGDP01006.cram --algo InsertSizeMetricAlgo HGDP/HGDP01006/QCmetrics/HGDP01006.InsertSizeMetricAlgo.txt MEDIAN_INSERT_SIZE MEDIAN_ABSOLUTE_DEVIATION MIN_INSERT_SIZE MAX_INSERT_SIZE MEAN_INSERT_SIZE STANDARD_DEVIATION READ_PAIRS PAIR_ORIENTATION WIDTH_OF_10_PERCENT WIDTH_OF_20_PERCENT WIDTH_OF_30_PERCENT WIDTH_OF_40_PERCENT WIDTH_OF_50_PERCENT WIDTH_OF_60_PERCENT WIDTH_OF_70_PERCENT WIDTH_OF_80_PERCENT WIDTH_OF_90_PERCENT WIDTH_OF_99_PERCENT 419.000000 61.000000 2 246804611 432.016616 97.389320 412201656 FR 25 47 71 95 123 151 185 231 311 641 insert_size All_Reads.fr_count 2 1106 3 1068 4 1064 5 1147 6 1249 7 1393 8 1446 9 1514 10 1547 11 1535 12 1529 13 1594 14 1527 15 1589 16 1683 17 1585 18 1785 19 3312 20 3615 21 3535 22 3656 23 4237 24 4468 25 4907 26 4953 27 5054 28 5218 29 5623 30 5905 31 6059 32 6413 33 6579 34 7350 35 7700 36 7894 37 8146 38 8591 39 9102 40 9354 41 9553 42 9809 43 10477 44 11186 45 11490 46 11781 47 12134 48 13179 49 13679 50 13302 51 13945 52 14128 53 14413 54 15422 55 14980 56 15266 57 15321 58 16207 59 16469 60 16710 61 16733 62 16944 63 17644 64 18124 65 17484 66 17985 67 17793 68 18184 69 18519 70 18452 71 18485 72 18340 73 19292 74 19955 75 19761 76 20115 77 19652 78 20181 79 20609 80 20146 81 19887 82 19715 83 19866 84 20571 85 20192 86 19926 87 19456 88 20113 89 20301 90 20372 91 19776 92 19462 93 19704 94 20092 95 19997 96 19773 97 19351 98 19558 99 19333 100 19484 101 19207 102 18921 103 19727 104 20282 105 20033 106 19798 107 19867 108 20134 109 20159 110 19864 111 19664 112 19472 113 19236 114 19634 115 19133 116 19142 117 18650 118 18660 119 18758 120 18669 121 18541 122 17857 123 17925 124 18100 125 18037 126 17428 127 16985 128 17515 129 17618 130 17605 131 17433 132 17100 133 17090 134 17329 135 17180 136 16817 137 17252 138 17452 139 17677 140 17120 141 17084 142 16979 143 17074 144 17093 145 16442 146 16655 147 16131 148 16155 149 16405 150 16089 151 16104 152 16120 153 15746 154 15949 155 15685 156 15430 157 15082 158 15153 159 15181 160 14890 161 15055 162 14743 163 14563 164 14917 165 14647 166 14282 167 14395 168 14676 169 14491 170 14549 171 14242 172 14295 173 14400 174 14790 175 14548 176 14586 177 14619 178 14498 179 14208 180 14163 181 14107 182 13989 183 13843 184 13838 185 13863 186 13867 187 13681 188 13803 189 14010 190 13673 191 13701 192 13651 193 13813 194 13584 195 13612 196 13738 197 13573 198 13638 199 13752 200 13703 201 13979 202 13583 203 13862 204 14220 205 14137 206 14329 207 14258 208 14887 209 14711 210 14955 211 15340 212 15534 213 15943 214 16464 215 16744 216 17304 217 17609 218 18335 219 18986 220 19121 221 19723 222 20066 223 20897 224 21413 225 22208 226 23084 227 23921 228 24666 229 26215 230 26864 231 28576 232 29666 233 31172 234 32443 235 33927 236 35834 237 37172 238 39305 239 41193 240 43178 241 44965 242 48046 243 50536 244 53082 245 55526 246 58605 247 61869 248 65279 249 68632 250 71944 251 76127 252 80210 253 84550 254 89450 255 93727 256 98378 257 104230 258 108731 259 114808 260 121046 261 127640 262 134338 263 140809 264 148893 265 155414 266 162693 267 171873 268 178855 269 188466 270 197059 271 206609 272 216145 273 226232 274 237609 275 248600 276 262760 277 272910 278 285420 279 296563 280 307764 281 320967 282 333515 283 345863 284 361920 285 373805 286 387550 287 402263 288 417688 289 433856 290 450455 291 467211 292 482366 293 500730 294 516332 295 534763 296 552395 297 569528 298 588083 299 609079 300 628529 301 648846 302 668051 303 688489 304 710368 305 729515 306 750396 307 770715 308 792627 309 814648 310 834911 311 858719 312 881547 313 905161 314 926923 315 948175 316 970010 317 993062 318 1014308 319 1037062 320 1061990 321 1083887 322 1106912 323 1132337 324 1152430 325 1175234 326 1197896 327 1220717 328 1243302 329 1264785 330 1290219 331 1311622 332 1333053 333 1354685 334 1378244 335 1399787 336 1420867 337 1437958 338 1458192 339 1477686 340 1496363 341 1518246 342 1537430 343 1558092 344 1576581 345 1593762 346 1613707 347 1627937 348 1646777 349 1660667 350 1674469 351 1691331 352 1707410 353 1724591 354 1739408 355 1751134 356 1766259 357 1778015 358 1787462 359 1797474 360 1809102 361 1821263 362 1832192 363 1843268 364 1853074 365 1862973 366 1867991 367 1880953 368 1885995 369 1892120 370 1899955 371 1904417 372 1910150 373 1917457 374 1923114 375 1926906 376 1932028 377 1935155 378 1936551 379 1939563 380 1940380 381 1939394 382 1941552 383 1942790 384 1945641 385 1946328 386 1946073 387 1944210 388 1944766 389 1945352 390 1939149 391 1940546 392 1935782 393 1932243 394 1933501 395 1932876 396 1927963 397 1921780 398 1920004 399 1914285 400 1912254 401 1905290 402 1901595 403 1893635 404 1892856 405 1884212 406 1878101 407 1872625 408 1868874 409 1862618 410 1855572 411 1844523 412 1836697 413 1830376 414 1823199 415 1817160 416 1807492 417 1807526 418 1796343 419 1788174 420 1778199 421 1770341 422 1759526 423 1753849 424 1742683 425 1734690 426 1728545 427 1717921 428 1712277 429 1702504 430 1692854 431 1682051 432 1673682 433 1662356 434 1651954 435 1643352 436 1634770 437 1624724 438 1615336 439 1606532 440 1598065 441 1589168 442 1579330 443 1569438 444 1558862 445 1549946 446 1539332 447 1530907 448 1524769 449 1513054 450 1505585 451 1494579 452 1484378 453 1472470 454 1462468 455 1451871 456 1443678 457 1435340 458 1424317 459 1414402 460 1405096 461 1396382 462 1386260 463 1377459 464 1369469 465 1357159 466 1350158 467 1337655 468 1328179 469 1321352 470 1311359 471 1303969 472 1294081 473 1281196 474 1271753 475 1264425 476 1254563 477 1244715 478 1237871 479 1229132 480 1218270 481 1210603 482 1200710 483 1191050 484 1181446 485 1174102 486 1164208 487 1155021 488 1145237 489 1137095 490 1128028 491 1121339 492 1110511 493 1102050 494 1091799 495 1083586 496 1073588 497 1065975 498 1059968 499 1049338 500 1041478 501 1033751 502 1024906 503 1017371 504 1009099 505 998270 506 991512 507 981756 508 974992 509 966190 510 959891 511 950832 512 943138 513 934503 514 924978 515 918052 516 910537 517 901279 518 894713 519 887665 520 879095 521 870952 522 860729 523 853999 524 846645 525 837465 526 829419 527 823011 528 815470 529 808400 530 799934 531 794296 532 786534 533 777636 534 771079 535 764198 536 752920 537 745764 538 738906 539 733640 540 725093 541 719812 542 710844 543 704501 544 698245 545 691265 546 683723 547 674764 548 668626 549 662374 550 656335 551 650332 552 642760 553 636398 554 627228 555 621990 556 615514 557 607973 558 601531 559 597277 560 589283 561 583273 562 576254 563 568949 564 563661 565 558076 566 552623 567 546214 568 539592 569 532801 570 528339 571 521369 572 515455 573 510682 574 502377 575 496553 576 492792 577 487005 578 480534 579 474765 580 467902 581 463301 582 456817 583 452244 584 445291 585 440620 586 436089 587 428795 588 425233 589 418517 590 413726 591 409259 592 403561 593 399110 594 393664 595 388068 596 383535 597 378593 598 373072 599 369072 600 363834 601 359028 602 354174 603 348876 604 344897 605 341693 606 335352 607 332366 608 326625 609 322011 610 318247 611 313342 612 309131 613 305595 614 300721 615 297150 616 293142 617 289338 618 285989 619 281272 620 277732 621 273818 622 269561 623 266095 624 261793 625 257827 626 254900 627 251551 628 247927 629 243498 630 241867 631 237183 632 233305 633 229979 634 227575 635 222613 636 220380 637 216480 638 214561 639 211783 640 207712 641 205059 642 201981 643 198193 644 196203 645 192490 646 189365 647 187060 648 184614 649 181729 650 178799 651 175095 652 173203 653 170243 654 168242 655 165571 656 162826 657 161066 658 158627 659 155395 660 153357 661 150462 662 148489 663 146024 664 144121 665 141174 666 139388 667 137577 668 134783 669 133449 670 131096 671 128610 672 126885 673 124827 674 123412 675 121537 676 118859 677 116532 678 114938 679 112802 680 111181 681 108888 682 106869 683 105883 684 104596 685 102728 686 101420 687 99405 688 97702 689 95728 690 95028 691 92777 692 90587 693 89506 694 88423 695 86907 696 84918 697 83802 698 82491 699 81199 700 79678 701 78530 702 77083 703 75906 704 74656 705 73329 706 71645 707 70554 708 69180 709 68336 710 66893 711 66020 712 64114 713 63691 714 62342 715 61477 716 60552 717 59024 718 58063 719 57318 720 56231 721 55040 722 54278 723 52880 724 52343 725 50837 726 50331 727 50018 728 48702 729 47413 730 46917 731 45589 732 45380 733 44264 734 43968 735 42867 736 42268 737 41431 738 40839 739 39807 740 39562 741 38279 742 37656 743 37421 744 36680 745 35833 746 35126 747 34781 748 34235 749 33201 750 32965 751 32260 752 31499 753 31132 754 30593 755 29657 756 29527 757 28439 758 28301 759 27619 760 26861 761 26489 762 25640 763 25169 764 24997 765 24613 766 24010 767 23500 768 22844 769 22444 770 22236 771 21433 772 21483 773 20692 774 20425 775 19945 776 19348 777 19248 778 18640 779 18685 780 18096 781 17787 782 17568 783 17201 784 16843 785 16349 786 16263 787 15871 788 15581 789 15344 790 14995 791 14650 792 14525 793 14115 794 13856 795 13551 796 13511 797 12965 798 12665 799 12579 800 12050 801 11983 802 11698 803 11594 804 11458 805 11114 806 10763 807 10763 808 10559 809 10230 810 10122 811 9869 812 9945 813 9780 814 9323 815 9023 816 9153 817 8746 818 8750 819 8544 820 8325 821 8462 822 8056 823 7889 824 7638 825 7550 826 7761 827 7196 828 6981 829 7083 830 6801 831 6822 832 6728 833 6216 834 6062 835 5815 836 5767 837 5525 838 5515 839 5431 840 5327 841 5274 842 5103 843 5117 844 4914 845 4926 846 4769 847 5015 848 4513 849 4397 850 4222 851 4275 852 4352 853 4110 854 4501 855 3875 856 3926 857 3625 858 3326 859 3343 860 3302 861 3190 862 3123 863 2955 864 3059 865 3004 866 2998 867 2838 868 2938 869 2823 870 2677 871 2584 872 2521 873 2625 874 2409 875 2307 876 2314 877 2286 878 2269 879 2196 880 2155 881 2081 882 2060 883 1954 884 1993 885 1972 886 1910 887 1848 888 1873 889 1825 890 1690 891 1700 892 1735 893 1632 894 1649 895 1564 896 1589 897 1563 898 1483 899 1505 900 1504 901 1318 902 1354 903 1330 904 1243 905 1211 906 1260 907 1288 908 1170 909 1176 910 1137 911 1164 912 1098 913 1110 914 1057 915 1014 916 1047 917 1002 918 969 919 965 920 897 921 930 922 905 923 951 924 879 925 871 926 881 927 836 928 825 929 829 930 807 931 800 932 810 933 798 934 714 935 760 936 749 937 704 938 713 939 751 940 726 941 677 942 635 943 682 944 647 945 653 946 624 947 579 948 595 949 610 950 578 951 570 952 596 953 552 954 557 955 468 956 533 957 525 958 523 959 527 960 529 961 502 962 493 963 500 964 479 965 486 966 485 967 455 968 410 969 447 970 430 971 396 972 419 973 398 974 369 975 424 976 387 977 364 978 363 979 344 980 386 981 370 982 346 983 360 984 341 985 332 986 354 987 314 988 298 989 298 990 322 991 324 992 312 993 326 994 313 995 275 996 274 997 294 998 262 999 280 1000 294 1001 230 1002 264 1003 269 1004 232 1005 250 1006 263 1007 266 1008 255 1009 248 1010 203 1011 250 1012 225 1013 233 1014 230 1015 223 1016 219 1017 223 1018 210 1019 248 1020 212 1021 205 1022 209 1023 198 1024 220 1025 200 1026 187 1027 189 1028 183 1029 187