#SentieonCommandLine: /lustre8/home/ykawai-tnproj-pg/packages/sentieon-genomics-201911/libexec/driver -t 8 -r /lustre8/home/ncbn-pg/data/resource/Homo_sapiens_assembly38.fasta -i HGDP/HGDP01010/HGDP01010.cram --algo InsertSizeMetricAlgo HGDP/HGDP01010/QCmetrics/HGDP01010.InsertSizeMetricAlgo.txt MEDIAN_INSERT_SIZE MEDIAN_ABSOLUTE_DEVIATION MIN_INSERT_SIZE MAX_INSERT_SIZE MEAN_INSERT_SIZE STANDARD_DEVIATION READ_PAIRS PAIR_ORIENTATION WIDTH_OF_10_PERCENT WIDTH_OF_20_PERCENT WIDTH_OF_30_PERCENT WIDTH_OF_40_PERCENT WIDTH_OF_50_PERCENT WIDTH_OF_60_PERCENT WIDTH_OF_70_PERCENT WIDTH_OF_80_PERCENT WIDTH_OF_90_PERCENT WIDTH_OF_99_PERCENT 421.000000 62.000000 2 246308405 433.540987 99.282551 396808461 FR 25 49 73 99 125 155 189 235 317 647 insert_size All_Reads.fr_count 2 1272 3 1400 4 1330 5 1511 6 1366 7 1462 8 1521 9 1543 10 1578 11 1589 12 1503 13 1706 14 1689 15 1653 16 1821 17 1750 18 1990 19 3444 20 3537 21 3454 22 3695 23 4134 24 4280 25 4444 26 4821 27 4814 28 4911 29 5388 30 5391 31 5704 32 5858 33 6270 34 6896 35 7171 36 7325 37 7802 38 8435 39 8670 40 9071 41 9202 42 9647 43 10194 44 10751 45 10765 46 10871 47 11113 48 12020 49 12292 50 12201 51 12436 52 12684 53 13293 54 13830 55 13979 56 13773 57 14163 58 14861 59 15391 60 15312 61 15585 62 15756 63 16307 64 17017 65 16793 66 17291 67 17078 68 17757 69 18393 70 18461 71 18551 72 18367 73 18860 74 19220 75 18945 76 18740 77 18679 78 19092 79 19461 80 19135 81 18632 82 18456 83 18916 84 19549 85 19217 86 18715 87 18782 88 18898 89 19575 90 19510 91 18971 92 18723 93 19140 94 19836 95 19582 96 19176 97 18801 98 19276 99 19716 100 19453 101 19302 102 18967 103 19490 104 19899 105 19686 106 19438 107 19103 108 19251 109 19690 110 19074 111 18519 112 18448 113 18601 114 19156 115 18275 116 18138 117 17599 118 17938 119 18216 120 17849 121 17592 122 17105 123 17469 124 17621 125 17541 126 16996 127 16830 128 16799 129 16877 130 17109 131 16708 132 16883 133 16777 134 16822 135 16984 136 16640 137 16355 138 16393 139 16387 140 16262 141 16057 142 15918 143 15822 144 15831 145 15640 146 15328 147 15223 148 14987 149 15086 150 14743 151 14811 152 14424 153 14718 154 14615 155 14043 156 13851 157 13835 158 13769 159 13525 160 13334 161 13247 162 13156 163 12909 164 12968 165 12799 166 12822 167 12867 168 13201 169 13129 170 13116 171 12907 172 12899 173 12844 174 13114 175 12628 176 12449 177 12618 178 12735 179 12451 180 12252 181 12357 182 12225 183 12405 184 12345 185 12011 186 12024 187 11856 188 12386 189 12227 190 12146 191 12101 192 12290 193 12403 194 12473 195 12432 196 12452 197 12469 198 12818 199 13008 200 12934 201 13316 202 13302 203 13580 204 13828 205 14041 206 14318 207 14640 208 14852 209 15404 210 15918 211 16698 212 17437 213 17722 214 18024 215 18657 216 19326 217 19913 218 20894 219 21488 220 21929 221 22899 222 23785 223 24930 224 26055 225 26954 226 27891 227 29431 228 30478 229 32122 230 33404 231 34833 232 36719 233 38339 234 40340 235 41979 236 44539 237 46259 238 48726 239 50634 240 53387 241 56434 242 59420 243 61539 244 64501 245 68268 246 71481 247 75011 248 78562 249 82931 250 86552 251 90713 252 95134 253 99589 254 104369 255 108920 256 113776 257 120187 258 126341 259 131984 260 138412 261 145039 262 151591 263 159414 264 165803 265 173281 266 181203 267 189271 268 196617 269 205837 270 214278 271 223858 272 234449 273 243678 274 254786 275 265063 276 277762 277 287792 278 299254 279 310013 280 321550 281 335246 282 347311 283 359567 284 372146 285 385880 286 398525 287 413457 288 428445 289 442850 290 457855 291 472764 292 489127 293 506401 294 522351 295 539123 296 552728 297 570960 298 587601 299 606851 300 624487 301 642062 302 658973 303 681424 304 699100 305 717273 306 736696 307 755797 308 775538 309 793064 310 814860 311 834473 312 855746 313 875976 314 895826 315 914764 316 933454 317 953915 318 974508 319 995051 320 1016665 321 1034998 322 1059522 323 1079008 324 1097216 325 1117424 326 1137428 327 1157570 328 1176567 329 1195303 330 1217077 331 1236665 332 1256171 333 1278681 334 1294709 335 1312955 336 1332570 337 1348618 338 1363267 339 1382536 340 1401137 341 1417021 342 1433681 343 1450827 344 1466413 345 1485872 346 1498698 347 1510539 348 1526319 349 1543545 350 1555290 351 1569738 352 1581641 353 1597540 354 1612417 355 1619697 356 1633271 357 1646276 358 1655330 359 1665127 360 1676969 361 1687102 362 1695972 363 1704583 364 1716086 365 1724592 366 1730480 367 1740155 368 1747278 369 1749849 370 1755129 371 1762758 372 1766916 373 1776815 374 1782516 375 1786402 376 1789494 377 1794181 378 1798980 379 1798500 380 1803972 381 1804655 382 1807337 383 1808517 384 1811705 385 1815244 386 1816196 387 1814493 388 1816132 389 1812030 390 1811916 391 1809667 392 1807388 393 1810193 394 1808839 395 1805856 396 1803640 397 1804960 398 1800860 399 1799781 400 1794840 401 1791255 402 1786543 403 1785945 404 1780747 405 1778897 406 1774665 407 1766924 408 1767332 409 1758301 410 1754171 411 1746440 412 1741335 413 1737252 414 1733492 415 1725755 416 1721152 417 1714865 418 1710569 419 1698955 420 1698700 421 1686294 422 1678400 423 1673986 424 1667638 425 1660848 426 1651856 427 1644714 428 1637222 429 1629870 430 1622173 431 1612017 432 1605078 433 1598449 434 1590926 435 1580826 436 1574616 437 1564214 438 1557901 439 1550574 440 1540405 441 1530201 442 1524913 443 1513144 444 1505306 445 1498258 446 1487372 447 1481625 448 1472776 449 1464336 450 1453976 451 1445645 452 1435304 453 1424375 454 1417748 455 1409708 456 1401029 457 1392415 458 1382598 459 1374289 460 1365257 461 1354574 462 1346350 463 1335813 464 1331054 465 1318740 466 1309067 467 1302304 468 1293070 469 1282152 470 1275715 471 1266938 472 1258075 473 1245480 474 1236626 475 1230575 476 1220860 477 1211041 478 1202807 479 1194036 480 1187070 481 1176917 482 1168913 483 1158724 484 1149159 485 1142860 486 1130192 487 1122070 488 1114728 489 1105592 490 1098816 491 1090438 492 1081216 493 1072929 494 1062616 495 1055441 496 1045185 497 1036443 498 1031667 499 1021189 500 1015977 501 1004718 502 998120 503 990622 504 981139 505 973567 506 962603 507 956348 508 946980 509 938482 510 933815 511 925184 512 917394 513 909343 514 901337 515 893492 516 885876 517 877471 518 869293 519 860936 520 853657 521 846030 522 837270 523 831202 524 824723 525 814250 526 810198 527 799298 528 792463 529 786036 530 779440 531 771760 532 766360 533 757522 534 749965 535 744195 536 736325 537 729755 538 719957 539 714521 540 707052 541 700642 542 694461 543 686360 544 678914 545 674545 546 666901 547 659705 548 653102 549 646726 550 639939 551 633406 552 627295 553 621158 554 615099 555 609465 556 600188 557 594975 558 589175 559 582446 560 576079 561 570476 562 565508 563 559229 564 550953 565 547036 566 540169 567 534275 568 527670 569 523781 570 518359 571 512514 572 507111 573 501348 574 495355 575 489758 576 484661 577 477147 578 475439 579 467378 580 463664 581 457416 582 452847 583 447132 584 441854 585 436793 586 431254 587 425938 588 420263 589 415069 590 411017 591 405898 592 400802 593 396947 594 391395 595 386655 596 382442 597 376589 598 373306 599 368417 600 364096 601 360304 602 354460 603 350240 604 346674 605 340553 606 337096 607 332181 608 328121 609 323248 610 320083 611 315325 612 312652 613 307531 614 304157 615 300718 616 296877 617 291503 618 289592 619 284389 620 280898 621 276970 622 272923 623 270042 624 267094 625 263067 626 258054 627 255436 628 251668 629 248701 630 245348 631 242153 632 238625 633 235094 634 232433 635 229195 636 226656 637 221956 638 218594 639 215872 640 212782 641 210140 642 207501 643 203876 644 200999 645 198493 646 195285 647 192601 648 189810 649 187053 650 183794 651 181617 652 179104 653 175483 654 174330 655 171536 656 168153 657 166136 658 163757 659 161312 660 158779 661 155930 662 153890 663 151451 664 149752 665 148069 666 144927 667 142974 668 140187 669 138583 670 135676 671 134683 672 131898 673 129665 674 127862 675 126552 676 124538 677 122040 678 120599 679 118819 680 116227 681 114348 682 113120 683 110874 684 109684 685 107436 686 106036 687 104780 688 102895 689 100755 690 99030 691 97889 692 95915 693 94678 694 93260 695 91816 696 89958 697 88358 698 87246 699 84931 700 83832 701 82910 702 80942 703 79713 704 78538 705 76804 706 75824 707 73620 708 73127 709 71849 710 70760 711 69533 712 68646 713 67550 714 66255 715 65005 716 63641 717 62776 718 61274 719 60754 720 59387 721 58494 722 57281 723 56450 724 55956 725 54506 726 53798 727 52897 728 52138 729 51109 730 49924 731 49429 732 48157 733 47783 734 46828 735 45899 736 44900 737 44284 738 43741 739 42599 740 42216 741 41126 742 40811 743 39736 744 38781 745 38430 746 38151 747 36907 748 36180 749 35689 750 34834 751 34651 752 33922 753 33270 754 32529 755 32260 756 31555 757 31081 758 30440 759 30089 760 28881 761 28860 762 28127 763 27581 764 26908 765 26436 766 25892 767 25300 768 24967 769 24511 770 24103 771 23550 772 23307 773 23103 774 22477 775 21874 776 21474 777 21017 778 20597 779 20378 780 19829 781 19353 782 19126 783 18955 784 18499 785 18217 786 17930 787 17730 788 17100 789 16713 790 16476 791 16305 792 15902 793 15576 794 15276 795 14871 796 14758 797 14580 798 14306 799 13808 800 13749 801 13354 802 13041 803 12690 804 12774 805 12426 806 12197 807 11759 808 11684 809 11573 810 11172 811 11032 812 10780 813 10679 814 10579 815 10208 816 10259 817 9926 818 9894 819 9873 820 9316 821 8989 822 8877 823 9296 824 8556 825 8329 826 8181 827 8008 828 7969 829 7920 830 7842 831 7588 832 7435 833 7172 834 7499 835 6908 836 6561 837 6400 838 6504 839 6237 840 5995 841 6031 842 5944 843 5729 844 5784 845 5628 846 5441 847 5411 848 5237 849 5208 850 5153 851 5037 852 4891 853 4737 854 4811 855 4784 856 4459 857 4442 858 4316 859 4534 860 4007 861 4036 862 3976 863 3956 864 3760 865 3765 866 3599 867 3382 868 3523 869 3345 870 3213 871 3233 872 3081 873 3094 874 3222 875 2843 876 2795 877 2720 878 2718 879 2589 880 2608 881 2565 882 2467 883 2485 884 2443 885 2513 886 2424 887 2356 888 2400 889 2283 890 2167 891 2152 892 2113 893 1980 894 2202 895 1916 896 1766 897 1848 898 1792 899 1829 900 1706 901 1724 902 1652 903 1661 904 1656 905 1521 906 1416 907 1461 908 1432 909 1398 910 1456 911 1315 912 1352 913 1291 914 1323 915 1204 916 1250 917 1248 918 1187 919 1182 920 1175 921 1159 922 1083 923 1070 924 1024 925 1112 926 998 927 985 928 965 929 983 930 971 931 976 932 906 933 877 934 895 935 904 936 926 937 851 938 843 939 807 940 828 941 839 942 789 943 762 944 773 945 756 946 809 947 794 948 724 949 718 950 685 951 699 952 704 953 650 954 644 955 607 956 613 957 578 958 643 959 593 960 580 961 546 962 562 963 594 964 574 965 559 966 512 967 532 968 511 969 500 970 468 971 484 972 510 973 477 974 525 975 492 976 478 977 444 978 462 979 414 980 459 981 399 982 393 983 403 984 401 985 386 986 414 987 404 988 357 989 392 990 337 991 383 992 358 993 335 994 337 995 356 996 308 997 338 998 374 999 360 1000 354 1001 298 1002 321 1003 301 1004 325 1005 310 1006 310 1007 313 1008 323 1009 287 1010 283 1011 305 1012 279 1013 285 1014 281 1015 265 1016 262 1017 267 1018 271 1019 258 1020 231 1021 213 1022 269 1023 214 1024 219 1025 215 1026 233 1027 237 1028 237 1029 212 1030 212 1031 233 1032 205 1033 228 1034 213 1035 177 1036 167 1037 209 1038 180 1039 191 1040 180 1041 193