#SentieonCommandLine: /lustre8/home/ykawai-tnproj-pg/packages/sentieon-genomics-201911/libexec/driver -t 8 -r /lustre8/home/ncbn-pg/data/resource/Homo_sapiens_assembly38.fasta -i HGDP/HGDP01073/HGDP01073.cram --algo InsertSizeMetricAlgo HGDP/HGDP01073/QCmetrics/HGDP01073.InsertSizeMetricAlgo.txt MEDIAN_INSERT_SIZE MEDIAN_ABSOLUTE_DEVIATION MIN_INSERT_SIZE MAX_INSERT_SIZE MEAN_INSERT_SIZE STANDARD_DEVIATION READ_PAIRS PAIR_ORIENTATION WIDTH_OF_10_PERCENT WIDTH_OF_20_PERCENT WIDTH_OF_30_PERCENT WIDTH_OF_40_PERCENT WIDTH_OF_50_PERCENT WIDTH_OF_60_PERCENT WIDTH_OF_70_PERCENT WIDTH_OF_80_PERCENT WIDTH_OF_90_PERCENT WIDTH_OF_99_PERCENT 448.000000 60.000000 2 247299336 455.543031 95.450384 410897118 FR 23 47 71 95 121 149 183 227 303 631 insert_size All_Reads.fr_count 2 158 3 182 4 202 5 200 6 191 7 205 8 217 9 193 10 191 11 240 12 233 13 230 14 243 15 210 16 230 17 215 18 219 19 229 20 241 21 279 22 242 23 264 24 278 25 350 26 310 27 331 28 416 29 745 30 1274 31 1904 32 2360 33 3312 34 4176 35 4753 36 5232 37 5360 38 5706 39 6159 40 6804 41 7379 42 8190 43 8578 44 9438 45 9884 46 10078 47 10425 48 11184 49 11636 50 11805 51 12347 52 12494 53 13172 54 13915 55 13904 56 13998 57 14106 58 14522 59 15412 60 15114 61 15553 62 15745 63 16135 64 16372 65 16515 66 16374 67 16290 68 16733 69 17333 70 17597 71 17338 72 17529 73 17927 74 18694 75 18676 76 18828 77 18725 78 19513 79 19919 80 19467 81 19425 82 19131 83 19622 84 20186 85 20192 86 19900 87 19651 88 20045 89 20456 90 19906 91 19906 92 19537 93 20024 94 20138 95 19994 96 19590 97 19584 98 20257 99 20822 100 20495 101 20061 102 20485 103 21263 104 22185 105 21524 106 21501 107 21436 108 21784 109 22348 110 22054 111 21793 112 21705 113 21856 114 22283 115 21828 116 21719 117 21271 118 21598 119 22285 120 21643 121 22021 122 21264 123 22051 124 21712 125 21807 126 21509 127 21037 128 21290 129 21638 130 21914 131 22093 132 22146 133 22640 134 22973 135 22685 136 22681 137 22605 138 22940 139 23373 140 23306 141 23333 142 23296 143 23446 144 23675 145 23510 146 23115 147 23060 148 23094 149 23123 150 23360 151 23287 152 23588 153 23660 154 23589 155 23202 156 23590 157 22951 158 22971 159 23339 160 23517 161 23667 162 23479 163 24016 164 24227 165 23959 166 23683 167 24000 168 24471 169 24549 170 24525 171 24521 172 24414 173 24419 174 24168 175 24286 176 23787 177 23843 178 23991 179 24007 180 24116 181 23820 182 23761 183 23722 184 23428 185 23510 186 23367 187 23428 188 23491 189 23369 190 23773 191 23575 192 23146 193 23449 194 23270 195 23566 196 23484 197 23443 198 23485 199 23365 200 23298 201 23676 202 23720 203 23485 204 23920 205 24042 206 23941 207 24095 208 24383 209 24311 210 24331 211 24502 212 24666 213 24881 214 25011 215 24939 216 25292 217 25901 218 26072 219 26086 220 25800 221 26907 222 27133 223 27383 224 27857 225 28289 226 28898 227 29258 228 29640 229 29987 230 30748 231 31430 232 31905 233 32321 234 33408 235 33808 236 34724 237 35655 238 36250 239 37357 240 38606 241 39686 242 40713 243 42264 244 42950 245 44010 246 45217 247 47103 248 48228 249 49919 250 51461 251 52843 252 54283 253 56189 254 57512 255 59778 256 61311 257 63175 258 65644 259 68119 260 70306 261 72580 262 75144 263 77792 264 80118 265 83254 266 85676 267 88802 268 91565 269 95313 270 99079 271 101893 272 106088 273 110158 274 114420 275 118122 276 123570 277 127348 278 131691 279 135837 280 140675 281 145175 282 150991 283 156238 284 161189 285 168102 286 173025 287 179366 288 184063 289 191433 290 197953 291 205283 292 212989 293 219653 294 227686 295 234975 296 242989 297 250302 298 259396 299 268464 300 277154 301 286967 302 295191 303 306920 304 316105 305 326216 306 336706 307 345367 308 357568 309 369150 310 380264 311 392550 312 404926 313 418319 314 430478 315 443149 316 456142 317 468617 318 481634 319 496931 320 510110 321 524194 322 540759 323 556395 324 571020 325 584874 326 602156 327 617718 328 633157 329 648183 330 666421 331 684431 332 700211 333 719128 334 736433 335 754356 336 773717 337 787660 338 806829 339 824928 340 844301 341 865038 342 883238 343 904713 344 922813 345 940122 346 960176 347 979428 348 999482 349 1018689 350 1038560 351 1057708 352 1078308 353 1099298 354 1119988 355 1141223 356 1160151 357 1179579 358 1194799 359 1217646 360 1238667 361 1255630 362 1273938 363 1298139 364 1314353 365 1332675 366 1350254 367 1369617 368 1387856 369 1405769 370 1422225 371 1436983 372 1457994 373 1471968 374 1489019 375 1508753 376 1522256 377 1539353 378 1556274 379 1571213 380 1582686 381 1599193 382 1613445 383 1628186 384 1643066 385 1655003 386 1667569 387 1678437 388 1692139 389 1703809 390 1716518 391 1723472 392 1736752 393 1748051 394 1755235 395 1766191 396 1775536 397 1784869 398 1794859 399 1803325 400 1812818 401 1815296 402 1823284 403 1832693 404 1838317 405 1843924 406 1848043 407 1857094 408 1861094 409 1863508 410 1867907 411 1871578 412 1874514 413 1877682 414 1883869 415 1886248 416 1888384 417 1890444 418 1892432 419 1892864 420 1890732 421 1893323 422 1893601 423 1892819 424 1894967 425 1891683 426 1891595 427 1891775 428 1891778 429 1888219 430 1885540 431 1884083 432 1881625 433 1878210 434 1876297 435 1873089 436 1871303 437 1867570 438 1866404 439 1860594 440 1855529 441 1852540 442 1848008 443 1843146 444 1838147 445 1833592 446 1826767 447 1824401 448 1821095 449 1813824 450 1809494 451 1800207 452 1795075 453 1789176 454 1783441 455 1776134 456 1769550 457 1764218 458 1756268 459 1750401 460 1745184 461 1737573 462 1731257 463 1724182 464 1716174 465 1704263 466 1695427 467 1688432 468 1682562 469 1674953 470 1665735 471 1657323 472 1651595 473 1641944 474 1632715 475 1623778 476 1615876 477 1609611 478 1598874 479 1590848 480 1581414 481 1572838 482 1564220 483 1553753 484 1544240 485 1535797 486 1526117 487 1518521 488 1508113 489 1499786 490 1494035 491 1481804 492 1472143 493 1463622 494 1451955 495 1443235 496 1433619 497 1423483 498 1414375 499 1408504 500 1396705 501 1384445 502 1376163 503 1368326 504 1360677 505 1348614 506 1335122 507 1326010 508 1316672 509 1310116 510 1296288 511 1287007 512 1277916 513 1269192 514 1259440 515 1246258 516 1239163 517 1226445 518 1217923 519 1209200 520 1198160 521 1187511 522 1177408 523 1167760 524 1158439 525 1148614 526 1137668 527 1127414 528 1118099 529 1107012 530 1097234 531 1089362 532 1076981 533 1069586 534 1059058 535 1046497 536 1037307 537 1027111 538 1018288 539 1006718 540 1000101 541 989090 542 978418 543 970846 544 960392 545 951522 546 939871 547 928534 548 919146 549 909186 550 899132 551 890236 552 880860 553 871379 554 861353 555 852751 556 841595 557 832862 558 820457 559 813484 560 802628 561 794100 562 785272 563 775099 564 766337 565 758712 566 747214 567 738947 568 730522 569 720316 570 711893 571 703373 572 692731 573 685778 574 676932 575 668228 576 660120 577 650518 578 644170 579 634606 580 626586 581 617570 582 610332 583 601951 584 594043 585 587176 586 578667 587 571173 588 563750 589 555379 590 546822 591 540552 592 531674 593 525937 594 518127 595 510063 596 502761 597 497140 598 489355 599 481309 600 475665 601 467169 602 461946 603 454769 604 449770 605 442978 606 435216 607 428744 608 422264 609 416848 610 409508 611 403210 612 396998 613 391866 614 386234 615 381078 616 374330 617 369461 618 362909 619 356823 620 352121 621 345716 622 338825 623 334861 624 329774 625 325416 626 319501 627 313883 628 309392 629 304372 630 299698 631 294824 632 290882 633 284221 634 281251 635 276533 636 272433 637 267939 638 263362 639 259931 640 255625 641 250995 642 247404 643 244041 644 239385 645 234425 646 231260 647 228357 648 224687 649 220236 650 215928 651 211850 652 210414 653 206569 654 202620 655 199795 656 196161 657 192918 658 190103 659 186255 660 183534 661 180295 662 177213 663 173961 664 170941 665 168075 666 165304 667 162356 668 159986 669 157206 670 154252 671 150850 672 148709 673 145987 674 143719 675 141990 676 138852 677 136783 678 134024 679 131719 680 129260 681 127577 682 124746 683 122963 684 121488 685 118917 686 116351 687 114552 688 112243 689 111106 690 108839 691 105901 692 104840 693 102710 694 100881 695 98840 696 97615 697 96461 698 94416 699 92879 700 90670 701 89221 702 87478 703 85856 704 84408 705 82422 706 81425 707 79791 708 79005 709 77375 710 75576 711 74626 712 72687 713 71490 714 70158 715 69052 716 67366 717 66181 718 64385 719 64546 720 62842 721 61768 722 59995 723 59448 724 58378 725 57266 726 56105 727 54758 728 54292 729 53066 730 52183 731 51011 732 50225 733 49606 734 48795 735 47367 736 46854 737 45897 738 45318 739 44404 740 43211 741 42561 742 42029 743 40927 744 40829 745 39662 746 38941 747 38274 748 37322 749 36358 750 35819 751 35457 752 34541 753 34119 754 33439 755 32675 756 32084 757 31654 758 30712 759 30134 760 29957 761 29182 762 28311 763 27783 764 27761 765 27151 766 26579 767 26111 768 25427 769 25067 770 25002 771 24073 772 23732 773 23352 774 22694 775 22400 776 21877 777 21415 778 21150 779 20819 780 20361 781 19659 782 19241 783 18969 784 18524 785 18239 786 18111 787 17580 788 17133 789 16764 790 16486 791 16007 792 15772 793 15328 794 15096 795 14802 796 14549 797 14331 798 14098 799 13729 800 13668 801 13304 802 13233 803 12917 804 12638 805 12453 806 12142 807 11944 808 11696 809 11673 810 11194 811 11072 812 10924 813 10556 814 10399 815 10367 816 10010 817 9818 818 9587 819 9674 820 9333 821 9169 822 8889 823 8656 824 8481 825 8523 826 8438 827 8359 828 8044 829 7738 830 7543 831 7576 832 7387 833 7285 834 7401 835 7002 836 7094 837 6796 838 6800 839 6527 840 6441 841 6236 842 6278 843 6095 844 6108 845 5997 846 5847 847 5845 848 5613 849 5493 850 5521 851 5668 852 5212 853 5165 854 5038 855 4889 856 4853 857 4675 858 4806 859 4515 860 4586 861 4281 862 4247 863 3899 864 4088 865 3974 866 3782 867 3816 868 3767 869 3694 870 3797 871 3669 872 3720 873 3362 874 3238 875 3148 876 2923 877 2863 878 2929 879 2786 880 2947 881 2687 882 2372 883 2364 884 2432 885 2455 886 2140 887 2129 888 2127 889 1985 890 1992 891 2015 892 2047 893 1914 894 1937 895 1825 896 1789 897 1829 898 1739 899 1768 900 1661 901 1731 902 1599 903 1602 904 1551 905 1556 906 1534 907 1506 908 1532 909 1466 910 1462 911 1406 912 1420 913 1346 914 1362 915 1308 916 1288 917 1322 918 1230 919 1195 920 1186 921 1180 922 1179 923 1145 924 1153 925 1121 926 1175 927 1082 928 1004 929 1039 930 1049 931 1022 932 983 933 1026 934 940 935 960 936 986 937 977 938 933 939 931 940 892 941 915 942 809 943 873 944 910 945 754 946 803 947 843 948 789 949 799 950 788 951 768 952 705 953 750 954 688 955 703 956 693 957 704 958 717 959 685 960 706 961 665 962 674 963 637 964 642 965 637 966 628 967 568 968 631 969 582 970 592 971 557 972 605 973 585 974 533 975 577 976 502 977 535 978 505 979 523 980 577 981 541 982 465 983 480 984 506 985 479 986 488 987 473 988 438 989 429 990 423 991 432 992 444 993 424 994 399 995 388 996 401 997 443 998 400 999 438 1000 373 1001 399 1002 421 1003 364 1004 390 1005 354 1006 336 1007 377 1008 345 1009 353 1010 350 1011 375 1012 317 1013 321 1014 334 1015 348 1016 294 1017 326 1018 322 1019 327 1020 274 1021 324 1022 279 1023 289 1024 277 1025 269 1026 303 1027 267 1028 286 1029 271 1030 263 1031 254 1032 277 1033 250 1034 268 1035 219 1036 247 1037 257 1038 272 1039 273 1040 239 1041 246 1042 228 1043 225 1044 230 1045 241 1046 256 1047 210 1048 217