#SentieonCommandLine: /lustre8/home/ykawai-tnproj-pg/packages/sentieon-genomics-201911/libexec/driver -t 8 -r /lustre8/home/ncbn-pg/data/resource/Homo_sapiens_assembly38.fasta -i HGDP/HGDP01101/HGDP01101.cram --algo InsertSizeMetricAlgo HGDP/HGDP01101/QCmetrics/HGDP01101.InsertSizeMetricAlgo.txt MEDIAN_INSERT_SIZE MEDIAN_ABSOLUTE_DEVIATION MIN_INSERT_SIZE MAX_INSERT_SIZE MEAN_INSERT_SIZE STANDARD_DEVIATION READ_PAIRS PAIR_ORIENTATION WIDTH_OF_10_PERCENT WIDTH_OF_20_PERCENT WIDTH_OF_30_PERCENT WIDTH_OF_40_PERCENT WIDTH_OF_50_PERCENT WIDTH_OF_60_PERCENT WIDTH_OF_70_PERCENT WIDTH_OF_80_PERCENT WIDTH_OF_90_PERCENT WIDTH_OF_99_PERCENT 433.000000 58.000000 2 246030775 442.188034 95.454195 358051597 FR 23 45 67 91 117 145 179 225 303 653 insert_size All_Reads.fr_count 2 590 3 647 4 654 5 670 6 701 7 672 8 645 9 701 10 694 11 700 12 665 13 701 14 715 15 739 16 678 17 718 18 713 19 733 20 809 21 864 22 807 23 1147 24 1285 25 1290 26 1349 27 1329 28 1477 29 1863 30 3251 31 3733 32 4405 33 5310 34 5653 35 6803 36 8218 37 9403 38 10257 39 10999 40 11520 41 11549 42 11937 43 12865 44 13633 45 13891 46 14145 47 14805 48 15884 49 16296 50 16508 51 17092 52 16920 53 18075 54 18215 55 18408 56 18775 57 18776 58 19438 59 20206 60 20282 61 20592 62 20762 63 21413 64 21776 65 21601 66 21693 67 21598 68 22474 69 23677 70 23622 71 23414 72 23849 73 24295 74 24977 75 24446 76 24844 77 24144 78 24816 79 25347 80 25182 81 24245 82 24511 83 24737 84 25497 85 25219 86 24797 87 24286 88 25000 89 25600 90 25356 91 24783 92 24764 93 24617 94 25071 95 25320 96 25375 97 25393 98 26095 99 26422 100 26635 101 26158 102 25919 103 26301 104 26255 105 25877 106 25699 107 25441 108 25688 109 25657 110 25536 111 24990 112 24935 113 25194 114 24971 115 24542 116 24908 117 24249 118 24446 119 24233 120 24161 121 23908 122 23580 123 23792 124 23844 125 23816 126 23897 127 23464 128 23844 129 24107 130 23859 131 23728 132 23398 133 23451 134 23511 135 23017 136 22864 137 22862 138 22659 139 22612 140 22405 141 22365 142 22297 143 22215 144 22134 145 21510 146 21576 147 21012 148 21052 149 21214 150 20702 151 21032 152 20508 153 20470 154 20182 155 19760 156 19608 157 19961 158 19973 159 20233 160 19730 161 19628 162 19587 163 19332 164 19059 165 18916 166 18610 167 18601 168 18500 169 18242 170 18139 171 17793 172 17580 173 17548 174 17443 175 17262 176 17179 177 17020 178 16792 179 16883 180 16286 181 16269 182 16172 183 15988 184 16105 185 15749 186 15632 187 15556 188 15478 189 15366 190 15307 191 15089 192 15159 193 15272 194 15435 195 15375 196 15237 197 14848 198 15038 199 15019 200 14822 201 14796 202 14771 203 14800 204 14431 205 14653 206 14581 207 14630 208 14397 209 14947 210 14806 211 14728 212 14654 213 14752 214 14957 215 15086 216 15035 217 15304 218 15507 219 15609 220 15891 221 15999 222 16264 223 16706 224 16779 225 17077 226 17605 227 17971 228 18397 229 18624 230 19315 231 19763 232 20664 233 21625 234 22436 235 23183 236 23652 237 24894 238 25874 239 26473 240 27440 241 28555 242 29859 243 30721 244 31857 245 32861 246 34496 247 36021 248 37202 249 38934 250 41179 251 42940 252 44369 253 46505 254 49212 255 51112 256 53737 257 56144 258 58684 259 61274 260 64645 261 67734 262 70165 263 73765 264 76902 265 81048 266 84986 267 88317 268 91968 269 96874 270 101798 271 106350 272 111324 273 116734 274 122133 275 127335 276 136473 277 140853 278 147024 279 152628 280 158939 281 165240 282 172921 283 179834 284 187466 285 194895 286 200844 287 209889 288 217502 289 226142 290 234455 291 243863 292 253098 293 263098 294 272463 295 283595 296 292537 297 301550 298 313894 299 325460 300 336991 301 349490 302 360882 303 372834 304 386366 305 399278 306 411877 307 424419 308 438656 309 452764 310 468499 311 480958 312 496164 313 512194 314 526001 315 543319 316 558113 317 572892 318 589347 319 605564 320 621140 321 638736 322 655400 323 673818 324 691284 325 707471 326 724291 327 743590 328 759259 329 776594 330 795458 331 811816 332 833365 333 853025 334 868740 335 887988 336 909332 337 925110 338 943768 339 960696 340 982525 341 998235 342 1021780 343 1039591 344 1060566 345 1076805 346 1095766 347 1112748 348 1129999 349 1148338 350 1165789 351 1183001 352 1202073 353 1218696 354 1235555 355 1254492 356 1270855 357 1287552 358 1303523 359 1319075 360 1335575 361 1350122 362 1367455 363 1381479 364 1396977 365 1413912 366 1427921 367 1440013 368 1455446 369 1467423 370 1479602 371 1489975 372 1505964 373 1515022 374 1528113 375 1539948 376 1551844 377 1562180 378 1573231 379 1581655 380 1591102 381 1600530 382 1607698 383 1618746 384 1627517 385 1635750 386 1643270 387 1648854 388 1657653 389 1660129 390 1668479 391 1674413 392 1677629 393 1686826 394 1691887 395 1695689 396 1701559 397 1704991 398 1708742 399 1711402 400 1716566 401 1714520 402 1716816 403 1720346 404 1720418 405 1722899 406 1724449 407 1726195 408 1728538 409 1725189 410 1728547 411 1723047 412 1720693 413 1721739 414 1719790 415 1716549 416 1715946 417 1714998 418 1714149 419 1707246 420 1703881 421 1701295 422 1693488 423 1690674 424 1686306 425 1682292 426 1677850 427 1674207 428 1671726 429 1663556 430 1655853 431 1650254 432 1644592 433 1639364 434 1634543 435 1626038 436 1620053 437 1615579 438 1607042 439 1600600 440 1591924 441 1585793 442 1577936 443 1568703 444 1563015 445 1556704 446 1549581 447 1539777 448 1530886 449 1528098 450 1517601 451 1506595 452 1497203 453 1490074 454 1479389 455 1470741 456 1461918 457 1457175 458 1447453 459 1437047 460 1425427 461 1418738 462 1410248 463 1400072 464 1390576 465 1379641 466 1371415 467 1364646 468 1354373 469 1347890 470 1332707 471 1325940 472 1316188 473 1308266 474 1296431 475 1286831 476 1278342 477 1268547 478 1258456 479 1250039 480 1239632 481 1228699 482 1220585 483 1211090 484 1202593 485 1190132 486 1182105 487 1171353 488 1163533 489 1153028 490 1144696 491 1135053 492 1125184 493 1113872 494 1107230 495 1095609 496 1085812 497 1077055 498 1068153 499 1059430 500 1050118 501 1041202 502 1031654 503 1023595 504 1013726 505 1005777 506 993207 507 986360 508 977118 509 967993 510 960705 511 949128 512 942045 513 933628 514 923115 515 917166 516 906025 517 896374 518 887438 519 879544 520 872813 521 863683 522 855177 523 846490 524 837998 525 831026 526 819823 527 812388 528 803660 529 793055 530 788667 531 780788 532 770711 533 762925 534 753513 535 746978 536 738484 537 730733 538 722002 539 712265 540 705869 541 698607 542 690087 543 682841 544 674697 545 667929 546 660494 547 652960 548 645892 549 638404 550 631427 551 624922 552 617190 553 611119 554 603793 555 597032 556 589816 557 583369 558 576014 559 569406 560 561499 561 556789 562 548451 563 541896 564 537185 565 529146 566 524789 567 517539 568 510523 569 504834 570 498430 571 492861 572 486342 573 481029 574 475320 575 469167 576 463197 577 456153 578 451112 579 446937 580 439795 581 435117 582 428796 583 424301 584 418055 585 412548 586 407954 587 403227 588 396624 589 391767 590 384943 591 382330 592 376697 593 372227 594 366434 595 360788 596 357856 597 352651 598 347657 599 341846 600 336711 601 332701 602 327901 603 323856 604 318902 605 314148 606 310411 607 305733 608 301125 609 297442 610 292735 611 288878 612 285338 613 281246 614 277507 615 273782 616 269592 617 265941 618 263075 619 258407 620 254129 621 250593 622 247935 623 243141 624 240126 625 236782 626 233390 627 230125 628 226330 629 223406 630 218820 631 216762 632 213074 633 209531 634 206124 635 203583 636 200646 637 198255 638 195345 639 192329 640 188266 641 185914 642 183231 643 180420 644 177236 645 174474 646 171180 647 168792 648 166239 649 162937 650 161179 651 158731 652 155484 653 152790 654 151433 655 148258 656 146215 657 143642 658 141375 659 139074 660 137195 661 134573 662 132463 663 130474 664 128401 665 126680 666 124214 667 122843 668 120397 669 117895 670 116456 671 114566 672 112637 673 110517 674 108817 675 107360 676 105069 677 103039 678 102215 679 100344 680 98531 681 96231 682 95685 683 93338 684 91492 685 90259 686 88896 687 87143 688 85945 689 84418 690 83125 691 81154 692 79572 693 78256 694 77107 695 75653 696 74481 697 73083 698 71819 699 70974 700 69325 701 68154 702 67080 703 65742 704 64929 705 62916 706 62328 707 61416 708 60112 709 59154 710 57825 711 56770 712 55917 713 54930 714 54445 715 52829 716 51965 717 50959 718 49815 719 48477 720 48342 721 47418 722 46482 723 45719 724 45131 725 43742 726 42993 727 42718 728 41589 729 40357 730 39896 731 39576 732 38744 733 38167 734 37231 735 36782 736 36332 737 35521 738 35158 739 34354 740 33520 741 33063 742 32465 743 32223 744 31369 745 31013 746 30482 747 29671 748 29234 749 28505 750 28040 751 27723 752 27285 753 26550 754 26066 755 25618 756 24780 757 24603 758 24020 759 23268 760 23161 761 22722 762 22216 763 21930 764 21598 765 21090 766 20632 767 20197 768 19790 769 19446 770 19015 771 18714 772 18515 773 18203 774 17706 775 17311 776 16620 777 16374 778 16234 779 15851 780 15342 781 15162 782 14712 783 14580 784 14316 785 14109 786 13802 787 13439 788 13024 789 12824 790 12679 791 12432 792 12083 793 11971 794 11563 795 11628 796 11352 797 11218 798 11074 799 10555 800 10283 801 10078 802 9840 803 9885 804 9573 805 9417 806 9140 807 9002 808 8684 809 8825 810 8576 811 8375 812 8298 813 8111 814 8272 815 7803 816 7605 817 7384 818 7415 819 6956 820 6868 821 6854 822 6739 823 6743 824 6591 825 6506 826 6340 827 6704 828 5824 829 5574 830 5504 831 5363 832 5278 833 5374 834 4889 835 4831 836 4856 837 4746 838 4599 839 4271 840 4365 841 4322 842 4253 843 3820 844 3599 845 3445 846 3490 847 3494 848 3265 849 3164 850 3046 851 3111 852 2948 853 2924 854 2885 855 2784 856 2680 857 2668 858 2639 859 2651 860 2438 861 2506 862 2310 863 2362 864 2335 865 2301 866 2198 867 2262 868 2138 869 2090 870 2032 871 2011 872 1887 873 1925 874 1931 875 1836 876 1861 877 1800 878 1810 879 1696 880 1722 881 1635 882 1646 883 1626 884 1512 885 1484 886 1450 887 1516 888 1436 889 1429 890 1329 891 1342 892 1399 893 1288 894 1260 895 1249 896 1217 897 1202 898 1170 899 1115 900 1121 901 1097 902 1089 903 1042 904 1029 905 1053 906 1006 907 995 908 990 909 924 910 913 911 918 912 898 913 929 914 843 915 774 916 854 917 762 918 804 919 805 920 746 921 767 922 711 923 718 924 687 925 721 926 709 927 695 928 712 929 650 930 620 931 660 932 588 933 651 934 613 935 640 936 557 937 579 938 564 939 529 940 515 941 508 942 524 943 481 944 493 945 463 946 473 947 493 948 457 949 467 950 454 951 443 952 469 953 445 954 440 955 438 956 386 957 412 958 391 959 389 960 389 961 421 962 369 963 361 964 364 965 319 966 369 967 358 968 335 969 332 970 282 971 279 972 282 973 323 974 305 975 294 976 295 977 294 978 303 979 267 980 276 981 261 982 233 983 256 984 244 985 273 986 222 987 215 988 218 989 262 990 223 991 226 992 232 993 251 994 212 995 221 996 220 997 212 998 223 999 205 1000 196 1001 200 1002 218 1003 212 1004 175 1005 206 1006 175 1007 211 1008 180 1009 186 1010 184 1011 189 1012 164 1013 179