#SentieonCommandLine: /lustre8/home/ykawai-tnproj-pg/packages/sentieon-genomics-201911/libexec/driver -t 8 -r /lustre8/home/ncbn-pg/data/resource/Homo_sapiens_assembly38.fasta -i HGDP/HGDP01102/HGDP01102.cram --algo InsertSizeMetricAlgo HGDP/HGDP01102/QCmetrics/HGDP01102.InsertSizeMetricAlgo.txt MEDIAN_INSERT_SIZE MEDIAN_ABSOLUTE_DEVIATION MIN_INSERT_SIZE MAX_INSERT_SIZE MEAN_INSERT_SIZE STANDARD_DEVIATION READ_PAIRS PAIR_ORIENTATION WIDTH_OF_10_PERCENT WIDTH_OF_20_PERCENT WIDTH_OF_30_PERCENT WIDTH_OF_40_PERCENT WIDTH_OF_50_PERCENT WIDTH_OF_60_PERCENT WIDTH_OF_70_PERCENT WIDTH_OF_80_PERCENT WIDTH_OF_90_PERCENT WIDTH_OF_99_PERCENT 425.000000 59.000000 2 247299336 435.836125 97.344951 332626206 FR 23 45 69 93 119 149 183 229 311 655 insert_size All_Reads.fr_count 2 443 3 453 4 491 5 522 6 528 7 545 8 483 9 508 10 513 11 550 12 750 13 750 14 933 15 1039 16 1023 17 929 18 1080 19 2050 20 2061 21 2180 22 2693 23 2858 24 4043 25 4824 26 5071 27 5425 28 5644 29 6121 30 6573 31 6874 32 7376 33 8045 34 8520 35 8871 36 9278 37 9323 38 9957 39 10405 40 10760 41 11284 42 11518 43 12276 44 12892 45 12993 46 13249 47 13194 48 14110 49 14324 50 14957 51 15362 52 15483 53 16290 54 17094 55 16958 56 17208 57 17350 58 18505 59 18939 60 19336 61 19450 62 19679 63 19776 64 20499 65 20129 66 20358 67 20128 68 20821 69 21512 70 21319 71 21351 72 21347 73 21612 74 22049 75 21317 76 21332 77 21060 78 21919 79 22647 80 22082 81 22250 82 22225 83 22536 84 23272 85 23103 86 23359 87 22912 88 23416 89 23783 90 23478 91 23151 92 22687 93 23087 94 23445 95 22971 96 22495 97 22354 98 22830 99 22695 100 22709 101 22105 102 22033 103 22303 104 22333 105 22470 106 21775 107 21540 108 21971 109 22232 110 22187 111 22147 112 21817 113 22148 114 22117 115 22286 116 21920 117 21837 118 21767 119 21926 120 21898 121 21451 122 21181 123 21014 124 21423 125 21061 126 20579 127 20171 128 20094 129 20198 130 20453 131 19997 132 19787 133 20097 134 20446 135 19969 136 19446 137 19272 138 19421 139 19165 140 19325 141 19452 142 19085 143 19325 144 19393 145 19309 146 19219 147 19076 148 19063 149 19126 150 19060 151 18724 152 18642 153 18755 154 18541 155 18166 156 18318 157 17713 158 17900 159 17769 160 17590 161 17266 162 17304 163 17139 164 17013 165 16862 166 16927 167 16682 168 16885 169 16683 170 16305 171 16512 172 16462 173 16111 174 16257 175 15998 176 15798 177 15801 178 15898 179 16322 180 15917 181 15678 182 15873 183 15772 184 15867 185 15658 186 15485 187 15329 188 15624 189 15556 190 15489 191 15100 192 15178 193 15194 194 15469 195 15233 196 15258 197 14859 198 15336 199 15400 200 15447 201 15433 202 15604 203 15662 204 15786 205 15779 206 15963 207 16068 208 16428 209 16302 210 16681 211 16969 212 17446 213 17610 214 17912 215 18105 216 18366 217 19325 218 19474 219 20047 220 20551 221 21116 222 21864 223 22527 224 23659 225 23982 226 24672 227 25507 228 26147 229 27092 230 28230 231 29204 232 29894 233 31331 234 32378 235 33962 236 34747 237 36490 238 37842 239 39627 240 41053 241 42421 242 43992 243 46149 244 47945 245 49852 246 51601 247 53963 248 56044 249 58817 250 61134 251 64076 252 66532 253 69549 254 72166 255 75242 256 79082 257 81420 258 84924 259 88945 260 92621 261 96657 262 101015 263 105192 264 109387 265 114146 266 118057 267 122954 268 128233 269 133974 270 139860 271 146144 272 151856 273 158117 274 165112 275 172745 276 180806 277 186707 278 193386 279 200534 280 207000 281 214778 282 222359 283 230205 284 239445 285 247694 286 255469 287 264979 288 275149 289 283913 290 293779 291 303595 292 315118 293 325546 294 336713 295 346104 296 357733 297 369895 298 381960 299 392611 300 407575 301 418930 302 432438 303 445555 304 459908 305 472754 306 487051 307 498808 308 513337 309 529486 310 544209 311 559374 312 575243 313 590703 314 605386 315 622064 316 637940 317 652809 318 668071 319 685340 320 702814 321 717654 322 736323 323 754449 324 771003 325 787393 326 803864 327 821763 328 836360 329 854596 330 874079 331 890953 332 908507 333 926240 334 946872 335 964113 336 981256 337 996751 338 1014380 339 1028417 340 1047237 341 1063850 342 1083630 343 1100226 344 1116564 345 1132074 346 1149097 347 1164302 348 1179752 349 1195853 350 1211144 351 1224553 352 1239748 353 1257479 354 1270968 355 1285514 356 1299038 357 1311454 358 1324837 359 1336923 360 1348732 361 1362573 362 1374333 363 1385464 364 1398960 365 1409562 366 1419591 367 1431742 368 1441637 369 1451856 370 1459800 371 1468414 372 1477279 373 1485777 374 1494725 375 1504725 376 1510839 377 1517317 378 1524241 379 1528645 380 1535494 381 1540488 382 1542868 383 1551099 384 1551923 385 1558543 386 1561774 387 1563210 388 1571115 389 1570388 390 1572688 391 1574228 392 1578623 393 1576270 394 1580804 395 1581612 396 1582401 397 1584768 398 1582104 399 1583619 400 1583039 401 1582072 402 1582639 403 1579929 404 1580039 405 1577459 406 1575171 407 1573789 408 1568877 409 1566639 410 1561922 411 1560205 412 1554107 413 1553595 414 1545633 415 1543549 416 1540801 417 1535036 418 1529981 419 1525451 420 1521330 421 1517306 422 1506126 423 1503645 424 1497114 425 1490221 426 1486718 427 1480130 428 1475207 429 1469241 430 1461953 431 1454423 432 1444960 433 1440315 434 1431306 435 1425796 436 1418449 437 1411613 438 1403372 439 1397680 440 1388102 441 1385322 442 1376034 443 1366018 444 1357512 445 1346593 446 1343013 447 1335190 448 1330352 449 1320660 450 1310491 451 1304066 452 1294108 453 1284950 454 1278242 455 1270054 456 1259647 457 1254108 458 1246122 459 1237310 460 1226707 461 1219063 462 1210930 463 1202830 464 1195180 465 1186932 466 1176631 467 1167946 468 1161341 469 1152882 470 1146199 471 1134434 472 1125512 473 1120456 474 1109637 475 1100800 476 1094951 477 1084091 478 1077299 479 1069990 480 1060644 481 1053535 482 1045615 483 1036779 484 1026047 485 1018886 486 1010828 487 1002976 488 995275 489 986907 490 977680 491 970084 492 961922 493 954767 494 946710 495 938063 496 929557 497 921299 498 913936 499 907860 500 896934 501 891330 502 882392 503 876237 504 869646 505 858671 506 851835 507 844470 508 837084 509 829407 510 823381 511 814457 512 805690 513 799824 514 791259 515 785507 516 777383 517 767623 518 761953 519 755737 520 747965 521 742312 522 734942 523 726777 524 718482 525 712479 526 704923 527 697368 528 691233 529 682756 530 677234 531 672281 532 663585 533 657437 534 651226 535 642841 536 637818 537 628584 538 621682 539 615937 540 609960 541 601992 542 596753 543 589959 544 584134 545 576235 546 570833 547 566190 548 559353 549 553192 550 547267 551 542669 552 534415 553 528602 554 523698 555 516932 556 510638 557 506253 558 501024 559 494110 560 488637 561 483958 562 477783 563 472695 564 467061 565 462343 566 456156 567 450594 568 444828 569 440332 570 434119 571 429050 572 424864 573 420782 574 416101 575 409221 576 404481 577 399774 578 394134 579 389396 580 386145 581 380961 582 375430 583 370580 584 366508 585 360589 586 356685 587 352305 588 347363 589 342787 590 338200 591 334036 592 329662 593 325495 594 322039 595 317719 596 314099 597 309490 598 305100 599 301281 600 295744 601 291934 602 288779 603 283582 604 280593 605 275891 606 272489 607 268563 608 266078 609 261711 610 257183 611 254839 612 251442 613 247567 614 244099 615 240611 616 237776 617 234263 618 230480 619 228591 620 224693 621 221518 622 219272 623 215408 624 213008 625 209548 626 207304 627 203582 628 200167 629 198515 630 194400 631 191749 632 189401 633 186723 634 183702 635 181088 636 178306 637 175758 638 172704 639 171244 640 167770 641 165223 642 162645 643 161117 644 158692 645 155512 646 153871 647 151643 648 149459 649 145764 650 144720 651 142563 652 139470 653 138195 654 135204 655 132998 656 131754 657 128814 658 127100 659 126097 660 123303 661 121468 662 119931 663 117812 664 115647 665 114806 666 112388 667 110989 668 109018 669 106776 670 105063 671 104035 672 102194 673 100788 674 98953 675 97220 676 95534 677 94044 678 92631 679 91294 680 89543 681 88450 682 86152 683 85181 684 83675 685 82160 686 81418 687 80191 688 78390 689 78000 690 76332 691 74856 692 73430 693 72093 694 71168 695 69619 696 68369 697 67414 698 66159 699 64975 700 64483 701 62767 702 61435 703 60726 704 59786 705 58613 706 57653 707 56638 708 56183 709 54697 710 54151 711 52940 712 51938 713 51051 714 50286 715 49047 716 48548 717 47586 718 46845 719 46108 720 45431 721 44228 722 43666 723 43380 724 42890 725 41669 726 40635 727 40132 728 39560 729 38381 730 37860 731 37274 732 36668 733 35787 734 35279 735 34626 736 33597 737 33463 738 33174 739 32230 740 32118 741 31238 742 30593 743 30049 744 29532 745 29308 746 28511 747 28049 748 27758 749 27322 750 26841 751 26101 752 25890 753 25243 754 24596 755 24587 756 24189 757 23546 758 23035 759 22288 760 21818 761 21593 762 21094 763 20489 764 20177 765 19830 766 19320 767 19254 768 18669 769 18322 770 18153 771 17425 772 17411 773 17056 774 16749 775 16303 776 15918 777 16040 778 15417 779 15081 780 15020 781 14692 782 14194 783 14163 784 13648 785 13389 786 13172 787 13123 788 12650 789 12460 790 12330 791 12128 792 11862 793 11389 794 11361 795 10846 796 11052 797 10738 798 10552 799 10355 800 10114 801 9981 802 9752 803 9538 804 9444 805 9147 806 9052 807 9188 808 8645 809 8539 810 8331 811 8220 812 8223 813 7915 814 7693 815 7706 816 7311 817 7351 818 6980 819 6952 820 6756 821 6865 822 6609 823 6149 824 6109 825 6017 826 5651 827 5575 828 5619 829 5441 830 5457 831 5324 832 5206 833 5304 834 5077 835 4861 836 4731 837 4825 838 4548 839 4414 840 4674 841 4479 842 4174 843 4249 844 4341 845 3926 846 4092 847 3612 848 3492 849 3278 850 3269 851 3603 852 3296 853 2959 854 2848 855 2765 856 2780 857 2735 858 2680 859 2660 860 2614 861 2518 862 2462 863 2431 864 2348 865 2331 866 2277 867 2177 868 2329 869 2205 870 2071 871 2083 872 2054 873 1935 874 1896 875 1960 876 1876 877 1793 878 1808 879 1734 880 1674 881 1661 882 1669 883 1704 884 1596 885 1527 886 1543 887 1532 888 1515 889 1458 890 1471 891 1460 892 1312 893 1310 894 1299 895 1333 896 1256 897 1254 898 1237 899 1172 900 1189 901 1129 902 1155 903 1115 904 1084 905 1032 906 999 907 1053 908 990 909 997 910 1003 911 932 912 949 913 908 914 899 915 870 916 890 917 869 918 868 919 803 920 833 921 795 922 721 923 771 924 728 925 738 926 715 927 729 928 731 929 682 930 661 931 669 932 675 933 678 934 674 935 621 936 597 937 616 938 600 939 579 940 512 941 558 942 586 943 563 944 529 945 499 946 565 947 487 948 460 949 493 950 446 951 492 952 489 953 470 954 465 955 423 956 440 957 426 958 438 959 385 960 422 961 393 962 433 963 394 964 368 965 368 966 339 967 393 968 338 969 342 970 362 971 344 972 363 973 321 974 339 975 322 976 327 977 314 978 326 979 290 980 289 981 301 982 289 983 275 984 284 985 280 986 259 987 263 988 253 989 283 990 247 991 246 992 234 993 248 994 244 995 237 996 234 997 229 998 232 999 230 1000 202 1001 208 1002 237 1003 213 1004 238 1005 211 1006 204 1007 200 1008 177 1009 206 1010 216 1011 190 1012 178 1013 188 1014 202 1015 167