#SentieonCommandLine: /lustre8/home/ykawai-tnproj-pg/packages/sentieon-genomics-201911/libexec/driver -t 8 -r /lustre8/home/ncbn-pg/data/resource/Homo_sapiens_assembly38.fasta -i HGDP/HGDP01182/HGDP01182.cram --algo InsertSizeMetricAlgo HGDP/HGDP01182/QCmetrics/HGDP01182.InsertSizeMetricAlgo.txt MEDIAN_INSERT_SIZE MEDIAN_ABSOLUTE_DEVIATION MIN_INSERT_SIZE MAX_INSERT_SIZE MEAN_INSERT_SIZE STANDARD_DEVIATION READ_PAIRS PAIR_ORIENTATION WIDTH_OF_10_PERCENT WIDTH_OF_20_PERCENT WIDTH_OF_30_PERCENT WIDTH_OF_40_PERCENT WIDTH_OF_50_PERCENT WIDTH_OF_60_PERCENT WIDTH_OF_70_PERCENT WIDTH_OF_80_PERCENT WIDTH_OF_90_PERCENT WIDTH_OF_99_PERCENT 402.000000 56.000000 2 245552304 413.602709 95.964516 347525823 FR 23 43 65 89 113 141 175 223 315 633 insert_size All_Reads.fr_count 2 736 3 757 4 798 5 826 6 723 7 837 8 784 9 770 10 1038 11 1049 12 1059 13 1199 14 1056 15 1335 16 1456 17 1523 18 1736 19 3564 20 3651 21 3645 22 3800 23 4134 24 5289 25 5442 26 5781 27 5858 28 6187 29 6310 30 6901 31 7227 32 7987 33 8322 34 8764 35 9875 36 10087 37 10536 38 11213 39 11689 40 12076 41 12472 42 12772 43 13257 44 13986 45 14330 46 14692 47 15019 48 16119 49 16405 50 16682 51 17507 52 17422 53 18098 54 19094 55 19227 56 19164 57 19152 58 20286 59 20816 60 20623 61 20931 62 21321 63 22595 64 23304 65 23175 66 23321 67 23590 68 23890 69 25174 70 25088 71 24940 72 24696 73 25106 74 25913 75 25243 76 25726 77 25376 78 26238 79 26627 80 26277 81 26225 82 25794 83 26541 84 27034 85 26885 86 26450 87 26233 88 26622 89 27159 90 27150 91 27444 92 27648 93 28002 94 28267 95 27588 96 27570 97 27497 98 28046 99 28755 100 29169 101 29167 102 28849 103 29414 104 29274 105 28970 106 28572 107 28248 108 29047 109 30050 110 30188 111 30300 112 29832 113 30329 114 30279 115 29725 116 29166 117 29151 118 29696 119 30570 120 30778 121 31377 122 32121 123 31918 124 31688 125 31348 126 30850 127 30410 128 31274 129 31984 130 32839 131 33562 132 34420 133 35372 134 36453 135 34947 136 33908 137 33876 138 34290 139 35751 140 36804 141 37777 142 38204 143 38755 144 38909 145 39116 146 38682 147 37859 148 37993 149 38456 150 39633 151 40321 152 41308 153 41683 154 41500 155 41562 156 41176 157 41044 158 41534 159 42162 160 43285 161 43939 162 44358 163 44614 164 44877 165 44854 166 44190 167 45201 168 44659 169 44943 170 45035 171 45262 172 45492 173 45571 174 45442 175 45243 176 44592 177 44905 178 44829 179 45022 180 45088 181 44402 182 44893 183 44501 184 44186 185 43911 186 43891 187 44183 188 43955 189 44106 190 44273 191 43801 192 43703 193 43833 194 43654 195 43633 196 44023 197 43871 198 44798 199 44295 200 44790 201 44581 202 44807 203 45351 204 45431 205 45841 206 46657 207 46609 208 47367 209 47464 210 48736 211 48739 212 48822 213 49094 214 49814 215 50444 216 50915 217 51791 218 52950 219 53567 220 54167 221 55345 222 56030 223 57522 224 58431 225 59445 226 60319 227 61443 228 62700 229 64261 230 65743 231 68009 232 69409 233 70955 234 72664 235 74834 236 75954 237 77705 238 80472 239 82238 240 85483 241 88666 242 91179 243 93949 244 95934 245 99262 246 101519 247 104317 248 107767 249 112703 250 116900 251 120869 252 125138 253 129400 254 133188 255 136824 256 140908 257 146274 258 151122 259 156963 260 163217 261 169661 262 175555 263 183348 264 188251 265 194137 266 199875 267 207557 268 214344 269 223351 270 230913 271 240568 272 250969 273 260193 274 270201 275 279082 276 290719 277 299725 278 307942 279 319420 280 330188 281 344416 282 356736 283 370313 284 381756 285 394424 286 406426 287 419206 288 431107 289 446666 290 463109 291 479625 292 496857 293 514229 294 529174 295 545894 296 559663 297 575278 298 593346 299 612480 300 630864 301 654279 302 676610 303 697108 304 718031 305 737489 306 754316 307 772826 308 793648 309 815456 310 840079 311 864068 312 886692 313 911526 314 935476 315 953891 316 976069 317 1000181 318 1018437 319 1042642 320 1065339 321 1088055 322 1112298 323 1136787 324 1164456 325 1183583 326 1206515 327 1223790 328 1248853 329 1269468 330 1290988 331 1311800 332 1334983 333 1356133 334 1378304 335 1399674 336 1417620 337 1436075 338 1456890 339 1475319 340 1492954 341 1513013 342 1530817 343 1548149 344 1565246 345 1582669 346 1598232 347 1611949 348 1624767 349 1640248 350 1653517 351 1667160 352 1680712 353 1691367 354 1702879 355 1717351 356 1726264 357 1735457 358 1741986 359 1751492 360 1757996 361 1764810 362 1772738 363 1780907 364 1785834 365 1790723 366 1794660 367 1796864 368 1800128 369 1802848 370 1802463 371 1803114 372 1804467 373 1805903 374 1807117 375 1805183 376 1802244 377 1798979 378 1797210 379 1797437 380 1794314 381 1790222 382 1783784 383 1780237 384 1772751 385 1770279 386 1765004 387 1757060 388 1750148 389 1745539 390 1738924 391 1731269 392 1723684 393 1715114 394 1707782 395 1702260 396 1692591 397 1684081 398 1674923 399 1665395 400 1657271 401 1645690 402 1637572 403 1629210 404 1621481 405 1611091 406 1601335 407 1589432 408 1578292 409 1569992 410 1557852 411 1547782 412 1536683 413 1524116 414 1516958 415 1503205 416 1494674 417 1484570 418 1475028 419 1464466 420 1452699 421 1442845 422 1430396 423 1419550 424 1408837 425 1400483 426 1389825 427 1379194 428 1367607 429 1359469 430 1348060 431 1337170 432 1325773 433 1315953 434 1306625 435 1296627 436 1285926 437 1274431 438 1267142 439 1256779 440 1249167 441 1236852 442 1227022 443 1217164 444 1208490 445 1199589 446 1189109 447 1177536 448 1171588 449 1161223 450 1151477 451 1140841 452 1133468 453 1125298 454 1117044 455 1107504 456 1096772 457 1088813 458 1082318 459 1070484 460 1062917 461 1053479 462 1046456 463 1039801 464 1028127 465 1021383 466 1012658 467 1003715 468 994928 469 988094 470 980953 471 971918 472 963127 473 957903 474 947449 475 941778 476 933466 477 924270 478 916446 479 908680 480 901412 481 893181 482 886539 483 879219 484 870494 485 863786 486 855823 487 849556 488 841990 489 833845 490 825688 491 818860 492 812291 493 805738 494 797468 495 791359 496 784643 497 774469 498 769026 499 763208 500 754677 501 747124 502 740754 503 733179 504 727654 505 720347 506 711937 507 706493 508 699434 509 692581 510 685014 511 679439 512 672714 513 665824 514 660294 515 652356 516 645466 517 640689 518 633321 519 627058 520 620024 521 612450 522 607780 523 600669 524 594895 525 587498 526 582349 527 575409 528 569476 529 563144 530 558811 531 550755 532 543905 533 539110 534 534957 535 527141 536 520534 537 516093 538 510548 539 504093 540 497326 541 493138 542 486293 543 480126 544 475367 545 470007 546 464623 547 458265 548 452628 549 447357 550 441545 551 436059 552 431527 553 426391 554 418643 555 414468 556 408581 557 403349 558 399184 559 394445 560 388573 561 383843 562 379676 563 373625 564 368603 565 363280 566 358964 567 354336 568 348986 569 343948 570 339980 571 335732 572 330772 573 326171 574 321920 575 316719 576 312416 577 307969 578 304147 579 299686 580 294940 581 291756 582 286928 583 283002 584 278899 585 275180 586 271562 587 266927 588 264137 589 259070 590 255955 591 252043 592 247808 593 244490 594 241293 595 237760 596 233632 597 230882 598 226630 599 224616 600 220293 601 217309 602 213460 603 210948 604 207701 605 204360 606 201465 607 199048 608 195154 609 192390 610 189835 611 186797 612 183291 613 180836 614 178360 615 175911 616 173965 617 169906 618 167556 619 165027 620 161996 621 159798 622 158037 623 155067 624 152279 625 150797 626 147370 627 145808 628 143337 629 141034 630 139030 631 137064 632 134963 633 132948 634 130168 635 128781 636 127075 637 125092 638 123046 639 120753 640 118366 641 116891 642 115832 643 113229 644 111914 645 110458 646 107550 647 106362 648 105097 649 103602 650 101004 651 100189 652 98189 653 97214 654 95586 655 93728 656 92191 657 90439 658 89145 659 87827 660 86464 661 84969 662 83496 663 82364 664 80720 665 79653 666 78354 667 76958 668 75765 669 74813 670 73331 671 72003 672 70568 673 70057 674 68319 675 67209 676 66054 677 65305 678 64106 679 63517 680 62257 681 60783 682 59644 683 59024 684 58143 685 56735 686 56310 687 55029 688 54119 689 53231 690 52808 691 51441 692 50259 693 49660 694 48379 695 47758 696 46955 697 46060 698 45684 699 44199 700 43549 701 42640 702 42315 703 41825 704 40839 705 40003 706 39514 707 38739 708 37987 709 37498 710 36686 711 35916 712 35458 713 34428 714 34163 715 33459 716 32970 717 31898 718 31581 719 31248 720 30164 721 29692 722 29449 723 28973 724 28439 725 27767 726 27185 727 26970 728 26020 729 26028 730 25438 731 24788 732 24434 733 23983 734 23467 735 23111 736 22278 737 22266 738 22141 739 21483 740 20822 741 20805 742 20378 743 19775 744 19584 745 19049 746 18592 747 18200 748 17912 749 17761 750 17232 751 16988 752 16735 753 16248 754 15920 755 15446 756 15086 757 14759 758 14518 759 14187 760 13875 761 13972 762 13436 763 13344 764 13113 765 13047 766 12208 767 11980 768 11940 769 11461 770 11127 771 10981 772 10946 773 10631 774 10386 775 10244 776 10157 777 9620 778 9809 779 10051 780 9085 781 9006 782 8933 783 8704 784 8550 785 8240 786 8306 787 7804 788 7495 789 7325 790 7019 791 7063 792 6942 793 6675 794 6670 795 6581 796 6394 797 6394 798 6602 799 5952 800 5775 801 5701 802 6021 803 5333 804 5094 805 4996 806 5001 807 5221 808 4878 809 4588 810 4559 811 4471 812 4336 813 4237 814 4245 815 3886 816 3892 817 3838 818 3780 819 3666 820 3502 821 3428 822 3432 823 3330 824 3347 825 3154 826 3198 827 2976 828 2954 829 2895 830 2936 831 2881 832 2839 833 2707 834 2769 835 2584 836 2393 837 2383 838 2415 839 2430 840 2272 841 2182 842 2319 843 2161 844 2071 845 1924 846 1961 847 2052 848 1887 849 1879 850 1879 851 1765 852 1811 853 1745 854 1736 855 1579 856 1652 857 1623 858 1626 859 1578 860 1495 861 1482 862 1475 863 1403 864 1389 865 1410 866 1374 867 1251 868 1246 869 1261 870 1253 871 1231 872 1206 873 1086 874 1130 875 1081 876 1065 877 1060 878 1072 879 1023 880 1000 881 950 882 970 883 996 884 916 885 932 886 868 887 859 888 869 889 869 890 856 891 792 892 812 893 692 894 751 895 780 896 729 897 679 898 707 899 699 900 674 901 693 902 676 903 624 904 638 905 654 906 599 907 612 908 578 909 574 910 558 911 586 912 512 913 523 914 508 915 475 916 498 917 501 918 451 919 471 920 493 921 486 922 467 923 429 924 461 925 452 926 438 927 453 928 365 929 398 930 386 931 355 932 382 933 351 934 371 935 360 936 349 937 385 938 361 939 359 940 315 941 291 942 341 943 321 944 315 945 299 946 343 947 277 948 304 949 291 950 250 951 268 952 258 953 270 954 247 955 257 956 274 957 232 958 252 959 240 960 255 961 227 962 232