#SentieonCommandLine: /lustre8/home/ykawai-tnproj-pg/packages/sentieon-genomics-201911/libexec/driver -t 8 -r /lustre8/home/ncbn-pg/data/resource/Homo_sapiens_assembly38.fasta -i HGDP/HGDP01207/HGDP01207.cram --algo InsertSizeMetricAlgo HGDP/HGDP01207/QCmetrics/HGDP01207.InsertSizeMetricAlgo.txt MEDIAN_INSERT_SIZE MEDIAN_ABSOLUTE_DEVIATION MIN_INSERT_SIZE MAX_INSERT_SIZE MEAN_INSERT_SIZE STANDARD_DEVIATION READ_PAIRS PAIR_ORIENTATION WIDTH_OF_10_PERCENT WIDTH_OF_20_PERCENT WIDTH_OF_30_PERCENT WIDTH_OF_40_PERCENT WIDTH_OF_50_PERCENT WIDTH_OF_60_PERCENT WIDTH_OF_70_PERCENT WIDTH_OF_80_PERCENT WIDTH_OF_90_PERCENT WIDTH_OF_99_PERCENT 452.000000 60.000000 2 246616298 461.411101 98.402398 301880348 FR 23 47 69 93 121 149 185 231 313 675 insert_size All_Reads.fr_count 2 396 3 357 4 403 5 421 6 414 7 462 8 451 9 433 10 426 11 466 12 432 13 489 14 442 15 481 16 464 17 476 18 469 19 503 20 486 21 539 22 499 23 514 24 489 25 537 26 562 27 642 28 664 29 784 30 1620 31 1791 32 1827 33 2219 34 2368 35 2883 36 3251 37 3872 38 4634 39 5183 40 5813 41 6449 42 6709 43 7146 44 8133 45 8329 46 8725 47 9124 48 9939 49 10884 50 10821 51 11435 52 11486 53 13519 54 14073 55 14050 56 14338 57 14341 58 14942 59 15698 60 15647 61 15918 62 16132 63 16595 64 17013 65 17031 66 17026 67 16719 68 17381 69 17947 70 17761 71 17732 72 18095 73 18315 74 18870 75 19060 76 18716 77 18766 78 19135 79 19522 80 19387 81 19420 82 19387 83 20161 84 20207 85 20091 86 19973 87 20058 88 20101 89 20451 90 20410 91 19974 92 19847 93 20071 94 20531 95 20059 96 19849 97 19607 98 20039 99 20314 100 19866 101 20435 102 20150 103 21569 104 20935 105 20700 106 20708 107 20682 108 21408 109 21284 110 21336 111 20920 112 21030 113 21078 114 21239 115 20906 116 20579 117 20400 118 20664 119 20621 120 20319 121 20139 122 19874 123 19761 124 20307 125 19740 126 19546 127 19575 128 19267 129 19045 130 19283 131 19371 132 18968 133 19336 134 19625 135 19206 136 18878 137 19072 138 19310 139 19175 140 19169 141 19005 142 18937 143 18716 144 18831 145 18280 146 18270 147 18134 148 18002 149 17845 150 17377 151 17626 152 17373 153 17017 154 17208 155 16717 156 16746 157 16343 158 16060 159 16070 160 15804 161 15647 162 15350 163 15432 164 15549 165 15375 166 15339 167 15375 168 15326 169 15017 170 14982 171 15087 172 14904 173 14885 174 14649 175 14662 176 14229 177 14113 178 14353 179 14071 180 13819 181 13833 182 13744 183 13435 184 13436 185 13443 186 13070 187 12752 188 13153 189 13029 190 12801 191 12665 192 12560 193 12374 194 12449 195 12212 196 12188 197 12012 198 12116 199 11923 200 11916 201 12010 202 11826 203 12224 204 12153 205 12185 206 12148 207 12412 208 12261 209 12307 210 12357 211 12253 212 12086 213 12363 214 12253 215 12516 216 12385 217 12395 218 12575 219 12692 220 12543 221 12786 222 12789 223 12822 224 13286 225 13289 226 13230 227 13684 228 13924 229 14116 230 14482 231 14556 232 14954 233 15477 234 15789 235 16048 236 16005 237 16720 238 17206 239 17799 240 17960 241 18456 242 18988 243 19863 244 20515 245 21307 246 21956 247 22859 248 23442 249 24438 250 25606 251 26460 252 27058 253 28248 254 28942 255 30084 256 31105 257 32162 258 33525 259 34947 260 36221 261 37475 262 38636 263 40532 264 41925 265 43326 266 45511 267 47116 268 48870 269 51308 270 53596 271 55770 272 57887 273 60167 274 62947 275 65742 276 69731 277 72367 278 74912 279 77204 280 79753 281 82907 282 85675 283 89544 284 92368 285 97048 286 99460 287 103602 288 106628 289 111093 290 115567 291 119842 292 124958 293 129419 294 135389 295 139599 296 144429 297 150251 298 155494 299 161938 300 167881 301 172981 302 179410 303 186440 304 192397 305 199729 306 206482 307 212205 308 219581 309 227935 310 235579 311 242433 312 251658 313 260406 314 269084 315 277144 316 285258 317 294918 318 302941 319 311840 320 322529 321 332149 322 341786 323 352884 324 363420 325 374301 326 384876 327 395728 328 406861 329 418125 330 428210 331 441443 332 453062 333 465514 334 478178 335 490452 336 502902 337 516424 338 528631 339 541166 340 554483 341 567235 342 582816 343 594404 344 608673 345 623923 346 636597 347 650048 348 664109 349 678676 350 692175 351 707904 352 724756 353 735044 354 754104 355 766080 356 782139 357 795752 358 810812 359 823637 360 840610 361 855176 362 868510 363 886099 364 899845 365 913764 366 929200 367 941397 368 955322 369 969796 370 984034 371 995648 372 1010967 373 1023822 374 1037539 375 1052882 376 1064779 377 1078926 378 1090743 379 1103073 380 1113819 381 1127358 382 1139164 383 1150636 384 1164060 385 1176716 386 1188346 387 1198052 388 1208555 389 1218289 390 1229064 391 1239394 392 1247100 393 1260712 394 1268520 395 1276472 396 1285733 397 1296287 398 1304526 399 1312214 400 1318673 401 1329312 402 1332826 403 1341227 404 1348013 405 1354008 406 1360896 407 1367171 408 1370832 409 1377743 410 1380327 411 1386371 412 1389582 413 1392670 414 1395692 415 1402493 416 1401507 417 1408158 418 1409774 419 1409721 420 1415706 421 1414827 422 1415069 423 1416002 424 1417925 425 1418683 426 1419678 427 1419046 428 1419215 429 1420427 430 1417846 431 1416733 432 1414654 433 1411859 434 1411244 435 1409548 436 1408713 437 1406331 438 1405854 439 1402628 440 1399325 441 1394983 442 1391897 443 1387123 444 1386115 445 1381218 446 1376238 447 1373828 448 1370411 449 1368487 450 1361994 451 1356637 452 1351107 453 1344965 454 1340296 455 1334045 456 1329374 457 1324763 458 1317229 459 1312489 460 1309033 461 1302725 462 1296976 463 1288277 464 1283596 465 1277515 466 1270783 467 1263254 468 1257624 469 1249370 470 1244715 471 1236737 472 1230028 473 1224631 474 1214884 475 1209652 476 1203768 477 1194775 478 1188249 479 1180364 480 1173948 481 1166412 482 1157956 483 1152170 484 1141802 485 1135216 486 1127019 487 1120013 488 1112876 489 1104563 490 1097665 491 1092457 492 1084569 493 1076448 494 1068604 495 1061411 496 1052715 497 1044817 498 1034978 499 1030049 500 1022947 501 1015141 502 1007663 503 1000919 504 991479 505 984170 506 978227 507 969661 508 961287 509 954883 510 946122 511 939307 512 929622 513 923662 514 915522 515 908239 516 900408 517 892676 518 886611 519 877448 520 870855 521 861526 522 857435 523 848518 524 841268 525 833343 526 826424 527 818873 528 810944 529 804128 530 796135 531 789865 532 782040 533 776494 534 770925 535 760217 536 755193 537 745001 538 741228 539 733828 540 724183 541 719808 542 710336 543 704874 544 697778 545 693167 546 683125 547 676546 548 671158 549 663420 550 657678 551 653046 552 644764 553 639335 554 629873 555 623939 556 616921 557 609907 558 605539 559 599144 560 591763 561 585583 562 580213 563 574482 564 567768 565 561247 566 556039 567 548387 568 542202 569 537111 570 530555 571 524538 572 520534 573 514524 574 509257 575 501327 576 496334 577 491511 578 486545 579 480108 580 474566 581 469399 582 463199 583 458787 584 454025 585 449686 586 443431 587 438153 588 432171 589 427408 590 421180 591 416234 592 412127 593 406296 594 402749 595 397986 596 393108 597 389252 598 383889 599 379200 600 373587 601 368469 602 364193 603 361005 604 355877 605 352018 606 347471 607 342204 608 337269 609 333055 610 329790 611 325833 612 321343 613 317983 614 313294 615 309911 616 304419 617 301090 618 297910 619 292669 620 289499 621 285229 622 281471 623 277452 624 272607 625 270529 626 266129 627 263261 628 259847 629 254634 630 252823 631 248396 632 245828 633 241344 634 238403 635 235730 636 232290 637 228267 638 225246 639 223127 640 219333 641 216680 642 213946 643 210448 644 208359 645 204420 646 201962 647 199482 648 195784 649 193692 650 191205 651 188025 652 185040 653 183083 654 180120 655 176544 656 174965 657 172465 658 169677 659 167851 660 165555 661 162658 662 160176 663 158477 664 155230 665 152716 666 150739 667 148893 668 146668 669 144614 670 142780 671 140126 672 137453 673 136050 674 133900 675 131734 676 130290 677 127873 678 126184 679 124114 680 122649 681 120234 682 118454 683 116448 684 114104 685 112255 686 111554 687 109278 688 107782 689 105734 690 104198 691 103113 692 101224 693 99213 694 97867 695 96133 696 94871 697 93095 698 91928 699 90711 700 88992 701 87159 702 86491 703 84757 704 83844 705 81726 706 80774 707 79344 708 77992 709 76495 710 75343 711 74059 712 72948 713 71850 714 70826 715 69588 716 68132 717 66887 718 66128 719 65671 720 63902 721 62841 722 61901 723 61302 724 59960 725 58314 726 58013 727 56903 728 56005 729 54600 730 53764 731 52704 732 52067 733 51496 734 50606 735 49902 736 49237 737 48139 738 47678 739 46863 740 46052 741 44942 742 44119 743 43671 744 42649 745 41971 746 41565 747 40428 748 39971 749 39316 750 38603 751 37444 752 37308 753 36524 754 35592 755 35380 756 34590 757 34202 758 33407 759 32918 760 32355 761 31728 762 30725 763 30374 764 29623 765 29632 766 29030 767 28342 768 27995 769 27313 770 27020 771 26682 772 25877 773 25494 774 25078 775 24883 776 24245 777 23750 778 23184 779 22959 780 22570 781 21893 782 21527 783 20850 784 20954 785 20416 786 19828 787 19519 788 19156 789 18566 790 18160 791 17966 792 17497 793 17150 794 17081 795 16807 796 16278 797 15935 798 15764 799 15321 800 15270 801 14913 802 14561 803 14265 804 13874 805 13898 806 13292 807 13287 808 13042 809 12817 810 12491 811 12323 812 12097 813 11758 814 11616 815 11305 816 11028 817 10793 818 10658 819 10419 820 10277 821 10045 822 9982 823 9655 824 9550 825 9541 826 9194 827 9074 828 9079 829 8911 830 8533 831 8435 832 8053 833 8017 834 7956 835 7780 836 7791 837 7406 838 7174 839 7184 840 6851 841 6702 842 6500 843 6580 844 6466 845 6220 846 6143 847 5873 848 6029 849 5789 850 5708 851 5729 852 5628 853 5348 854 5398 855 5236 856 5065 857 4957 858 4897 859 4837 860 4455 861 4410 862 4503 863 4654 864 4143 865 4046 866 3833 867 3896 868 3628 869 3690 870 3497 871 3546 872 3182 873 3077 874 3109 875 3086 876 2935 877 2984 878 2962 879 2876 880 2798 881 2900 882 2815 883 2655 884 2614 885 2450 886 2349 887 2209 888 2290 889 2185 890 2202 891 2036 892 1992 893 1993 894 1930 895 1903 896 1903 897 1876 898 1869 899 1783 900 1753 901 1725 902 1719 903 1694 904 1697 905 1558 906 1611 907 1580 908 1480 909 1490 910 1398 911 1423 912 1372 913 1319 914 1333 915 1410 916 1319 917 1256 918 1235 919 1250 920 1219 921 1210 922 1170 923 1172 924 1157 925 1074 926 1060 927 1089 928 1036 929 1006 930 992 931 991 932 963 933 955 934 969 935 895 936 819 937 863 938 848 939 900 940 791 941 794 942 799 943 774 944 727 945 773 946 690 947 738 948 752 949 672 950 695 951 718 952 679 953 638 954 669 955 640 956 632 957 599 958 619 959 556 960 575 961 581 962 558 963 569 964 494 965 511 966 524 967 501 968 515 969 497 970 513 971 450 972 444 973 482 974 458 975 454 976 452 977 451 978 428 979 415 980 429 981 436 982 399 983 397 984 375 985 376 986 361 987 394 988 374 989 366 990 355 991 345 992 344 993 347 994 325 995 323 996 292 997 300 998 303 999 283 1000 310 1001 307 1002 289 1003 292 1004 309 1005 278 1006 285 1007 276 1008 277 1009 253 1010 289 1011 241 1012 261 1013 233 1014 226 1015 225 1016 223 1017 235 1018 227 1019 251 1020 220 1021 208 1022 186 1023 229 1024 216 1025 190 1026 194 1027 175 1028 204 1029 188 1030 199 1031 181 1032 174 1033 195 1034 178 1035 195 1036 181 1037 166 1038 200 1039 166 1040 162 1041 132 1042 188 1043 149 1044 144 1045 162 1046 158 1047 136 1048 146 1049 150 1050 156 1051 150 1052 121