#SentieonCommandLine: /lustre8/home/ykawai-tnproj-pg/packages/sentieon-genomics-201911/libexec/driver -t 8 -r /lustre8/home/ncbn-pg/data/resource/Homo_sapiens_assembly38.fasta -i HGDP/HGDP01219/HGDP01219.cram --algo InsertSizeMetricAlgo HGDP/HGDP01219/QCmetrics/HGDP01219.InsertSizeMetricAlgo.txt MEDIAN_INSERT_SIZE MEDIAN_ABSOLUTE_DEVIATION MIN_INSERT_SIZE MAX_INSERT_SIZE MEAN_INSERT_SIZE STANDARD_DEVIATION READ_PAIRS PAIR_ORIENTATION WIDTH_OF_10_PERCENT WIDTH_OF_20_PERCENT WIDTH_OF_30_PERCENT WIDTH_OF_40_PERCENT WIDTH_OF_50_PERCENT WIDTH_OF_60_PERCENT WIDTH_OF_70_PERCENT WIDTH_OF_80_PERCENT WIDTH_OF_90_PERCENT WIDTH_OF_99_PERCENT 459.000000 62.000000 2 245037602 467.890987 102.133451 329125200 FR 25 49 73 99 125 157 193 239 323 695 insert_size All_Reads.fr_count 2 341 3 370 4 353 5 387 6 370 7 443 8 381 9 384 10 428 11 393 12 425 13 395 14 380 15 516 16 498 17 453 18 506 19 638 20 611 21 666 22 813 23 930 24 993 25 1352 26 1408 27 2157 28 2387 29 2777 30 3393 31 3615 32 4117 33 4264 34 4552 35 5470 36 6212 37 6487 38 6991 39 7616 40 8711 41 9694 42 10165 43 10618 44 11332 45 11761 46 12135 47 12504 48 13593 49 13729 50 13956 51 14676 52 14502 53 15524 54 16264 55 15946 56 16142 57 16215 58 17268 59 17638 60 17752 61 17839 62 18147 63 18661 64 19302 65 19256 66 19786 67 20083 68 20160 69 20908 70 20858 71 20955 72 20837 73 21825 74 22299 75 21805 76 22133 77 21890 78 22413 79 22869 80 22411 81 22125 82 21649 83 22461 84 23222 85 22875 86 22340 87 21988 88 22463 89 22926 90 22854 91 22467 92 22121 93 22774 94 23435 95 23456 96 23140 97 22730 98 23372 99 23509 100 23514 101 23563 102 23232 103 23933 104 24823 105 24086 106 24003 107 23705 108 24156 109 24520 110 24036 111 23561 112 24027 113 23463 114 24091 115 23494 116 23449 117 22890 118 23087 119 23289 120 23280 121 23117 122 23298 123 22704 124 22508 125 23072 126 22589 127 22666 128 23013 129 23168 130 23083 131 23226 132 22885 133 23258 134 23664 135 22911 136 22898 137 23050 138 23118 139 23184 140 22996 141 22955 142 23085 143 23151 144 22999 145 22807 146 22777 147 22687 148 22146 149 22411 150 22557 151 22254 152 21964 153 21923 154 22419 155 21751 156 21790 157 21657 158 21582 159 21327 160 21721 161 22073 162 21543 163 21683 164 21941 165 21747 166 21921 167 22049 168 21940 169 21718 170 21908 171 21801 172 21804 173 21321 174 21369 175 21134 176 20901 177 20960 178 21076 179 20879 180 20927 181 20763 182 20503 183 20659 184 20322 185 20062 186 20173 187 19781 188 19710 189 19657 190 19729 191 19549 192 19427 193 19118 194 19368 195 19233 196 18780 197 18936 198 19118 199 19127 200 18983 201 18890 202 18872 203 18992 204 19031 205 18947 206 18898 207 18718 208 18841 209 18745 210 18749 211 18844 212 18851 213 18664 214 18610 215 18795 216 18711 217 18753 218 18822 219 18992 220 18840 221 19010 222 19260 223 19388 224 19435 225 19301 226 19383 227 19704 228 19672 229 20203 230 20376 231 20540 232 21130 233 21054 234 21694 235 21842 236 21705 237 22268 238 22902 239 23518 240 23946 241 24628 242 25070 243 25927 244 26361 245 27170 246 27565 247 27943 248 28590 249 29781 250 30306 251 31234 252 32607 253 33030 254 34123 255 35238 256 35872 257 36850 258 38157 259 39191 260 40605 261 41840 262 43136 263 44718 264 45981 265 47404 266 49449 267 50386 268 52389 269 53991 270 56416 271 58624 272 60868 273 63065 274 65680 275 68312 276 71959 277 74324 278 77088 279 79386 280 81217 281 84463 282 87542 283 90564 284 93542 285 97623 286 99542 287 103812 288 107090 289 111874 290 115818 291 120094 292 125408 293 130260 294 134615 295 138855 296 143703 297 148091 298 153260 299 158467 300 163981 301 171146 302 176418 303 183862 304 189937 305 196413 306 202148 307 210045 308 216667 309 222957 310 232059 311 239665 312 248741 313 256069 314 265293 315 272797 316 282494 317 290815 318 299620 319 308288 320 318298 321 328336 322 339297 323 349641 324 359793 325 370331 326 381018 327 392830 328 402254 329 414974 330 425594 331 438397 332 450597 333 463125 334 475490 335 487764 336 500865 337 513363 338 528099 339 538848 340 553148 341 566662 342 580253 343 594563 344 609692 345 622869 346 637422 347 651155 348 665044 349 678480 350 694495 351 707546 352 724238 353 738822 354 755279 355 770271 356 784830 357 800098 358 812393 359 828650 360 843392 361 857747 362 872623 363 887179 364 904156 365 919688 366 931591 367 947026 368 958270 369 975353 370 988220 371 1002082 372 1017618 373 1032619 374 1044076 375 1059004 376 1071395 377 1084748 378 1096921 379 1110876 380 1123713 381 1135545 382 1147790 383 1160545 384 1173096 385 1184681 386 1195199 387 1209267 388 1218227 389 1229109 390 1238230 391 1249117 392 1257515 393 1270435 394 1278938 395 1289693 396 1296118 397 1306775 398 1316855 399 1324692 400 1334757 401 1339488 402 1349981 403 1355934 404 1364640 405 1374307 406 1377904 407 1385415 408 1390988 409 1397256 410 1401257 411 1406154 412 1410428 413 1415833 414 1421431 415 1423224 416 1427568 417 1433763 418 1436062 419 1440294 420 1439787 421 1445049 422 1446739 423 1448427 424 1451370 425 1453617 426 1454103 427 1455685 428 1459690 429 1457015 430 1457870 431 1458551 432 1456557 433 1457148 434 1458832 435 1457353 436 1457790 437 1457108 438 1455175 439 1455747 440 1454608 441 1449764 442 1450464 443 1447901 444 1446667 445 1443323 446 1444069 447 1437998 448 1437766 449 1436069 450 1432909 451 1428382 452 1423928 453 1419096 454 1415923 455 1413929 456 1409055 457 1408953 458 1400870 459 1399174 460 1394178 461 1389987 462 1386119 463 1381223 464 1373490 465 1368444 466 1365021 467 1361466 468 1355540 469 1349611 470 1344624 471 1339909 472 1335087 473 1327954 474 1322982 475 1315591 476 1309071 477 1304491 478 1297695 479 1291398 480 1288654 481 1280826 482 1275368 483 1265794 484 1261489 485 1253346 486 1247669 487 1242733 488 1235193 489 1227182 490 1222073 491 1213498 492 1207989 493 1203184 494 1193965 495 1188186 496 1180415 497 1172773 498 1166399 499 1159402 500 1154114 501 1146516 502 1140255 503 1131626 504 1126206 505 1118007 506 1109576 507 1102071 508 1095832 509 1090105 510 1080608 511 1075645 512 1065160 513 1060894 514 1051933 515 1043378 516 1035846 517 1029366 518 1022420 519 1013135 520 1008571 521 1000347 522 992386 523 987204 524 978654 525 972889 526 961732 527 955781 528 946260 529 940837 530 934242 531 926812 532 920349 533 911263 534 903899 535 897591 536 888159 537 879643 538 873718 539 865412 540 857690 541 851979 542 845858 543 837228 544 830364 545 822577 546 814745 547 807073 548 801304 549 792982 550 785430 551 778779 552 770798 553 765019 554 756018 555 746978 556 742623 557 734697 558 727132 559 719477 560 712523 561 704546 562 700064 563 690987 564 686526 565 679197 566 673196 567 664214 568 658122 569 650077 570 643244 571 635558 572 628797 573 624455 574 616234 575 609989 576 604722 577 598076 578 590720 579 583066 580 578438 581 571961 582 565469 583 559969 584 551883 585 544890 586 541972 587 532527 588 527244 589 520397 590 515311 591 508382 592 504057 593 496939 594 492599 595 484929 596 479291 597 473959 598 468205 599 462938 600 457896 601 452393 602 446222 603 441357 604 436092 605 431050 606 426043 607 420740 608 413743 609 409342 610 404257 611 399409 612 392884 613 390476 614 385475 615 380855 616 376084 617 371701 618 364546 619 360517 620 355944 621 351454 622 346997 623 341488 624 337670 625 333538 626 328659 627 325771 628 320393 629 316745 630 310587 631 307711 632 303131 633 299999 634 295826 635 292660 636 287609 637 283439 638 279911 639 276774 640 272979 641 268175 642 265211 643 262169 644 258677 645 254491 646 251274 647 248810 648 244968 649 241075 650 237744 651 233772 652 231698 653 228198 654 225919 655 220757 656 218323 657 215914 658 213443 659 210662 660 207096 661 203978 662 201660 663 198975 664 196781 665 192970 666 190789 667 187316 668 183898 669 181212 670 180136 671 177075 672 174387 673 171813 674 169475 675 166399 676 164395 677 162046 678 159555 679 156877 680 155181 681 152653 682 150362 683 148406 684 146952 685 143955 686 141621 687 139877 688 137580 689 136041 690 133937 691 131657 692 129630 693 128350 694 125819 695 123875 696 122220 697 120490 698 118397 699 116570 700 114439 701 112738 702 111149 703 109488 704 107723 705 106487 706 104940 707 102742 708 100595 709 99225 710 97996 711 96775 712 94779 713 94081 714 91775 715 90403 716 89513 717 87871 718 86339 719 85351 720 83871 721 82296 722 80926 723 79771 724 78876 725 76871 726 75730 727 74186 728 73949 729 72115 730 71009 731 69915 732 69320 733 68064 734 66681 735 66238 736 64639 737 63152 738 62728 739 61890 740 60643 741 59873 742 58327 743 58122 744 57079 745 56106 746 54993 747 54092 748 53136 749 52390 750 51858 751 50622 752 49538 753 49102 754 47980 755 47453 756 46487 757 45566 758 45174 759 43911 760 43135 761 42483 762 41898 763 41355 764 40797 765 39608 766 39210 767 38222 768 37934 769 36984 770 36266 771 35560 772 35151 773 34363 774 34021 775 33267 776 32445 777 31987 778 31558 779 31089 780 30208 781 29729 782 29285 783 28693 784 27763 785 27419 786 27365 787 26450 788 26371 789 25966 790 25068 791 25049 792 24537 793 23865 794 23517 795 22859 796 22810 797 22315 798 21836 799 21193 800 21075 801 20565 802 20340 803 20011 804 19189 805 18923 806 18809 807 18360 808 18006 809 17700 810 17184 811 16846 812 16583 813 16336 814 16209 815 15754 816 15554 817 15093 818 14878 819 14448 820 14261 821 13873 822 13748 823 13519 824 13151 825 13140 826 12763 827 12547 828 12465 829 12340 830 11905 831 11640 832 11315 833 11315 834 11054 835 10961 836 10616 837 10401 838 10334 839 10368 840 10079 841 9827 842 9718 843 9380 844 9069 845 8956 846 8778 847 8398 848 8374 849 8355 850 8176 851 8267 852 7906 853 7847 854 7671 855 7679 856 7387 857 7297 858 7743 859 7058 860 6691 861 6646 862 6236 863 6113 864 6031 865 5890 866 5693 867 6015 868 5517 869 5365 870 5318 871 5359 872 5135 873 5015 874 4932 875 4834 876 4683 877 4746 878 4523 879 4617 880 4440 881 4337 882 4232 883 4184 884 4095 885 4022 886 3977 887 4093 888 3852 889 3796 890 3607 891 3521 892 3549 893 3384 894 3432 895 3135 896 3192 897 3075 898 2852 899 2947 900 2869 901 2806 902 2750 903 2711 904 2669 905 2640 906 2541 907 2482 908 2520 909 2458 910 2401 911 2309 912 2422 913 2445 914 2212 915 2115 916 2082 917 2168 918 1959 919 1954 920 1923 921 1902 922 1801 923 1774 924 1944 925 1697 926 1626 927 1663 928 1631 929 1525 930 1610 931 1496 932 1483 933 1440 934 1489 935 1404 936 1368 937 1321 938 1414 939 1326 940 1277 941 1258 942 1418 943 1203 944 1160 945 1399 946 1117 947 1045 948 1035 949 1040 950 1009 951 1008 952 971 953 951 954 997 955 925 956 908 957 858 958 886 959 853 960 815 961 830 962 825 963 832 964 799 965 766 966 678 967 772 968 730 969 719 970 726 971 680 972 704 973 706 974 621 975 633 976 641 977 607 978 607 979 609 980 565 981 575 982 571 983 514 984 578 985 571 986 527 987 519 988 500 989 487 990 518 991 462 992 441 993 472 994 467 995 462 996 434 997 477 998 468 999 422 1000 429 1001 426 1002 452 1003 380 1004 401 1005 345 1006 376 1007 351 1008 389 1009 370 1010 318 1011 320 1012 356 1013 339 1014 349 1015 307 1016 323 1017 323 1018 292 1019 316 1020 272 1021 309 1022 309 1023 296 1024 280 1025 279 1026 269 1027 256 1028 246 1029 260 1030 266 1031 243 1032 231 1033 266 1034 255 1035 251 1036 235 1037 224 1038 223 1039 234 1040 233 1041 200 1042 217 1043 231 1044 186 1045 228 1046 239 1047 184 1048 208 1049 200 1050 210 1051 229 1052 181 1053 185 1054 165 1055 186 1056 175 1057 151 1058 191 1059 176 1060 170 1061 193 1062 154 1063 167 1064 152 1065 147 1066 178 1067 174 1068 149 1069 132 1070 173 1071 167 1072 124 1073 157 1074 144 1075 122 1076 168 1077 159 1078 144 1079 136