#SentieonCommandLine: /lustre8/home/ykawai-tnproj-pg/packages/sentieon-genomics-201911/libexec/driver -t 8 -r /lustre8/home/ncbn-pg/data/resource/Homo_sapiens_assembly38.fasta -i HGDP/HGDP01229/HGDP01229.cram --algo InsertSizeMetricAlgo HGDP/HGDP01229/QCmetrics/HGDP01229.InsertSizeMetricAlgo.txt MEDIAN_INSERT_SIZE MEDIAN_ABSOLUTE_DEVIATION MIN_INSERT_SIZE MAX_INSERT_SIZE MEAN_INSERT_SIZE STANDARD_DEVIATION READ_PAIRS PAIR_ORIENTATION WIDTH_OF_10_PERCENT WIDTH_OF_20_PERCENT WIDTH_OF_30_PERCENT WIDTH_OF_40_PERCENT WIDTH_OF_50_PERCENT WIDTH_OF_60_PERCENT WIDTH_OF_70_PERCENT WIDTH_OF_80_PERCENT WIDTH_OF_90_PERCENT WIDTH_OF_99_PERCENT 449.000000 58.000000 2 246134695 458.449749 95.535888 332439306 FR 23 45 67 91 117 145 179 225 303 665 insert_size All_Reads.fr_count 2 261 3 310 4 279 5 246 6 286 7 373 8 291 9 293 10 257 11 268 12 274 13 282 14 280 15 284 16 297 17 279 18 278 19 297 20 332 21 312 22 338 23 340 24 364 25 414 26 381 27 413 28 540 29 605 30 1762 31 1931 32 2080 33 2130 34 2330 35 2739 36 2909 37 3115 38 3251 39 3502 40 3756 41 3954 42 4416 43 4895 44 5124 45 5294 46 5705 47 5688 48 6630 49 7428 50 8638 51 8703 52 10794 53 12589 54 15017 55 14788 56 15437 57 15481 58 15945 59 16368 60 16769 61 17306 62 17518 63 18363 64 20508 65 20244 66 20238 67 20411 68 20723 69 21280 70 20942 71 21318 72 21269 73 21609 74 21794 75 21586 76 21563 77 21545 78 21806 79 22481 80 21943 81 21672 82 21472 83 22146 84 22791 85 22435 86 22766 87 22551 88 23357 89 23664 90 23236 91 23270 92 22934 93 23227 94 23490 95 23052 96 22875 97 22622 98 23110 99 23206 100 22659 101 22609 102 22512 103 22635 104 22931 105 22801 106 22474 107 22154 108 22648 109 23033 110 22687 111 22293 112 22082 113 22778 114 23700 115 23095 116 23351 117 22859 118 22922 119 22974 120 22668 121 22747 122 22347 123 22507 124 22455 125 22201 126 21877 127 21448 128 21596 129 21420 130 21502 131 21249 132 20699 133 21042 134 20886 135 20615 136 20292 137 20125 138 20081 139 20383 140 20244 141 20201 142 20144 143 19965 144 20346 145 20050 146 19872 147 19508 148 19387 149 19440 150 19261 151 19025 152 18869 153 18632 154 18861 155 18141 156 18145 157 17572 158 17550 159 17168 160 17507 161 16854 162 16816 163 16826 164 16854 165 16365 166 16235 167 15992 168 15792 169 15853 170 15471 171 15258 172 15181 173 15358 174 15247 175 15337 176 15194 177 15157 178 15142 179 15046 180 14768 181 14462 182 14262 183 14193 184 13963 185 13897 186 13680 187 13653 188 13379 189 13470 190 13365 191 13065 192 12941 193 12786 194 12912 195 12610 196 12733 197 12512 198 12327 199 12239 200 12271 201 11803 202 11906 203 11807 204 11628 205 11621 206 11603 207 11780 208 12087 209 12259 210 12133 211 11985 212 12250 213 11997 214 11910 215 11985 216 11998 217 12041 218 12190 219 12056 220 12054 221 12128 222 12150 223 12297 224 12323 225 12543 226 12667 227 12704 228 13018 229 12964 230 13056 231 13549 232 13514 233 13631 234 14064 235 14320 236 14702 237 14745 238 15181 239 15536 240 15629 241 16414 242 16790 243 17405 244 17992 245 18593 246 19156 247 19502 248 20585 249 21615 250 22303 251 23234 252 23952 253 25221 254 25644 255 26556 256 27370 257 28915 258 30137 259 31216 260 32471 261 34184 262 35837 263 36516 264 38590 265 40103 266 41292 267 43682 268 45851 269 47610 270 50093 271 52104 272 54450 273 57467 274 60629 275 63606 276 68107 277 70806 278 73508 279 75939 280 78747 281 81927 282 85383 283 88959 284 93007 285 97185 286 100303 287 104548 288 109058 289 113401 290 117489 291 122999 292 127656 293 133702 294 139189 295 145682 296 150649 297 157365 298 163969 299 169893 300 176626 301 184253 302 190640 303 198336 304 206164 305 213195 306 220722 307 229543 308 237063 309 246857 310 255491 311 265287 312 274136 313 284098 314 293751 315 303599 316 314610 317 324484 318 335378 319 347263 320 356470 321 369604 322 381495 323 393855 324 405988 325 418318 326 430833 327 443807 328 456686 329 469140 330 483514 331 495696 332 511662 333 524967 334 539676 335 553516 336 569834 337 582707 338 598021 339 614037 340 629841 341 643981 342 661167 343 677937 344 692557 345 708565 346 724809 347 740476 348 757449 349 772857 350 790322 351 805709 352 822538 353 841925 354 858238 355 876652 356 894697 357 909763 358 923474 359 941979 360 959078 361 977101 362 994400 363 1010036 364 1024930 365 1041941 366 1059729 367 1075571 368 1091569 369 1107360 370 1122520 371 1137374 372 1153150 373 1169217 374 1182377 375 1201153 376 1213924 377 1229924 378 1244081 379 1259449 380 1274473 381 1281658 382 1301090 383 1311499 384 1325462 385 1339341 386 1350898 387 1366924 388 1376869 389 1389135 390 1398462 391 1409155 392 1422478 393 1431696 394 1442530 395 1453651 396 1462508 397 1475623 398 1481603 399 1490378 400 1498514 401 1509063 402 1516153 403 1524599 404 1532007 405 1540104 406 1547359 407 1552881 408 1559082 409 1564984 410 1569643 411 1572639 412 1575454 413 1580494 414 1584146 415 1588624 416 1592517 417 1593452 418 1597804 419 1599820 420 1600755 421 1602324 422 1603429 423 1602441 424 1602966 425 1605696 426 1604778 427 1604588 428 1608180 429 1605790 430 1603126 431 1600936 432 1599087 433 1597159 434 1594869 435 1593741 436 1590882 437 1587405 438 1586723 439 1584403 440 1578509 441 1576732 442 1568314 443 1563736 444 1560988 445 1556706 446 1551017 447 1548583 448 1542091 449 1537959 450 1530334 451 1527244 452 1521605 453 1512668 454 1505157 455 1500084 456 1491409 457 1484970 458 1479911 459 1474909 460 1467309 461 1458789 462 1454242 463 1444686 464 1436900 465 1427873 466 1422326 467 1412995 468 1406473 469 1400057 470 1392746 471 1383241 472 1372890 473 1365272 474 1357758 475 1348026 476 1341497 477 1331083 478 1322636 479 1314223 480 1305558 481 1298388 482 1288110 483 1280664 484 1269511 485 1259389 486 1253779 487 1241837 488 1234606 489 1225695 490 1215565 491 1207469 492 1199969 493 1191847 494 1179737 495 1172080 496 1162187 497 1152360 498 1144586 499 1135911 500 1127695 501 1118113 502 1109064 503 1099452 504 1090308 505 1081421 506 1071083 507 1064443 508 1052466 509 1046020 510 1036262 511 1027668 512 1018899 513 1007692 514 1002109 515 990989 516 981926 517 974368 518 965770 519 957430 520 947567 521 939545 522 929605 523 921271 524 914121 525 904047 526 894898 527 886855 528 878902 529 869538 530 862104 531 853028 532 844386 533 837128 534 828732 535 821200 536 814163 537 803761 538 796555 539 787474 540 780391 541 772154 542 764448 543 753583 544 750347 545 741633 546 736018 547 723611 548 718689 549 707343 550 699642 551 692772 552 684492 553 678109 554 670202 555 664524 556 656298 557 649014 558 641934 559 633739 560 626560 561 619901 562 613544 563 605832 564 600094 565 594451 566 588139 567 579018 568 572326 569 567793 570 560359 571 552881 572 547952 573 541946 574 534183 575 527646 576 523440 577 515564 578 509623 579 503011 580 496913 581 490884 582 485549 583 479586 584 474042 585 467831 586 461030 587 456615 588 451376 589 444682 590 439812 591 434899 592 428931 593 423615 594 418863 595 412710 596 408986 597 402440 598 397706 599 392522 600 387436 601 382004 602 376997 603 373250 604 367879 605 364505 606 357651 607 353368 608 348231 609 343582 610 336411 611 333188 612 328752 613 324513 614 321113 615 316614 616 311734 617 308512 618 304396 619 299726 620 293485 621 290504 622 286579 623 282064 624 278087 625 274709 626 270104 627 266620 628 263526 629 260272 630 255478 631 251697 632 248057 633 245392 634 241943 635 238110 636 234807 637 231954 638 228777 639 224873 640 221520 641 217569 642 214314 643 211803 644 208891 645 205444 646 202473 647 199059 648 196345 649 194232 650 190748 651 187572 652 185376 653 182203 654 179726 655 176555 656 173228 657 170662 658 167680 659 164829 660 163406 661 160652 662 157413 663 155209 664 152921 665 151042 666 148787 667 146080 668 143456 669 141368 670 140352 671 136458 672 135105 673 132676 674 129904 675 128130 676 126059 677 124063 678 123016 679 120965 680 118312 681 116053 682 114677 683 112733 684 111006 685 109347 686 106964 687 105471 688 103379 689 102385 690 100673 691 99452 692 96849 693 95464 694 94218 695 91755 696 89914 697 88756 698 87057 699 86260 700 84386 701 82884 702 81660 703 80259 704 79461 705 76917 706 76354 707 75007 708 72971 709 72270 710 70765 711 69479 712 68200 713 67305 714 66433 715 65760 716 64102 717 62773 718 62038 719 61092 720 60065 721 58988 722 57624 723 56926 724 55858 725 55154 726 54542 727 53037 728 51822 729 50948 730 49438 731 49180 732 48271 733 47673 734 46757 735 45337 736 45260 737 44352 738 43826 739 42354 740 42114 741 41121 742 40771 743 40023 744 39131 745 38245 746 37829 747 37326 748 36531 749 35809 750 35286 751 34604 752 33813 753 33240 754 32845 755 32322 756 31590 757 31510 758 30586 759 29820 760 29069 761 28707 762 28184 763 27645 764 27213 765 26588 766 26286 767 25788 768 25388 769 25002 770 24282 771 24026 772 23383 773 23069 774 22382 775 22018 776 21781 777 21284 778 21056 779 20367 780 20061 781 19492 782 19529 783 19127 784 18784 785 18449 786 17923 787 17615 788 17201 789 16792 790 16337 791 16094 792 15735 793 15415 794 15145 795 14911 796 14471 797 14077 798 13944 799 13555 800 13403 801 13274 802 12948 803 12665 804 12367 805 12143 806 12007 807 11754 808 11382 809 11538 810 11128 811 11013 812 10761 813 10409 814 10246 815 10100 816 9734 817 9770 818 9502 819 9857 820 8987 821 8799 822 8758 823 8591 824 8467 825 8248 826 8256 827 7920 828 7896 829 7718 830 7612 831 7321 832 7300 833 7067 834 6937 835 6806 836 6878 837 7122 838 6622 839 6291 840 6483 841 5921 842 6262 843 5565 844 5020 845 4932 846 4780 847 4860 848 4675 849 4591 850 4418 851 4439 852 4335 853 4266 854 4287 855 4063 856 4010 857 3986 858 3866 859 4032 860 3698 861 3434 862 3299 863 3396 864 3257 865 3146 866 2965 867 3005 868 2829 869 2791 870 2741 871 2595 872 2615 873 2491 874 2623 875 2462 876 2423 877 2354 878 2397 879 2250 880 2285 881 2149 882 2199 883 2089 884 2101 885 2009 886 1998 887 2039 888 1932 889 1919 890 1821 891 1853 892 1832 893 1776 894 1694 895 1606 896 1651 897 1590 898 1523 899 1576 900 1525 901 1484 902 1464 903 1456 904 1405 905 1391 906 1439 907 1289 908 1271 909 1266 910 1246 911 1237 912 1192 913 1187 914 1103 915 1108 916 1147 917 1062 918 1076 919 1074 920 994 921 998 922 991 923 973 924 982 925 913 926 913 927 943 928 887 929 862 930 867 931 862 932 868 933 768 934 806 935 725 936 772 937 774 938 708 939 749 940 705 941 709 942 723 943 681 944 668 945 703 946 678 947 608 948 607 949 629 950 593 951 595 952 566 953 569 954 593 955 546 956 526 957 543 958 557 959 527 960 523 961 502 962 473 963 478 964 464 965 498 966 459 967 475 968 410 969 427 970 435 971 384 972 423 973 416 974 451 975 409 976 425 977 406 978 390 979 369 980 361 981 376 982 327 983 381 984 343 985 365 986 352 987 309 988 351 989 328 990 337 991 295 992 317 993 288 994 278 995 310 996 315 997 273 998 253 999 293 1000 245 1001 248 1002 266 1003 250 1004 274 1005 255 1006 266 1007 257 1008 246 1009 249 1010 228 1011 221 1012 215 1013 243 1014 244 1015 199 1016 205 1017 200 1018 196 1019 204 1020 199 1021 202 1022 184 1023 177 1024 210 1025 188 1026 194 1027 162 1028 172 1029 175