#SentieonCommandLine: /lustre8/home/ykawai-tnproj-pg/packages/sentieon-genomics-201911/libexec/driver -t 8 -r /lustre8/home/ncbn-pg/data/resource/Homo_sapiens_assembly38.fasta -i HGDP/HGDP01237/HGDP01237.cram --algo InsertSizeMetricAlgo HGDP/HGDP01237/QCmetrics/HGDP01237.InsertSizeMetricAlgo.txt MEDIAN_INSERT_SIZE MEDIAN_ABSOLUTE_DEVIATION MIN_INSERT_SIZE MAX_INSERT_SIZE MEAN_INSERT_SIZE STANDARD_DEVIATION READ_PAIRS PAIR_ORIENTATION WIDTH_OF_10_PERCENT WIDTH_OF_20_PERCENT WIDTH_OF_30_PERCENT WIDTH_OF_40_PERCENT WIDTH_OF_50_PERCENT WIDTH_OF_60_PERCENT WIDTH_OF_70_PERCENT WIDTH_OF_80_PERCENT WIDTH_OF_90_PERCENT WIDTH_OF_99_PERCENT 455.000000 61.000000 2 246251028 464.930944 100.379593 378458611 FR 23 47 71 97 123 153 189 237 319 689 insert_size All_Reads.fr_count 2 652 3 689 4 686 5 707 6 751 7 917 8 716 9 704 10 740 11 809 12 699 13 738 14 795 15 810 16 734 17 799 18 847 19 877 20 818 21 850 22 890 23 874 24 879 25 925 26 917 27 1440 28 1641 29 1672 30 2539 31 3520 32 3611 33 4084 34 5528 35 6163 36 8021 37 8145 38 8791 39 9053 40 9773 41 10148 42 10939 43 12344 44 12784 45 12860 46 13946 47 14381 48 15236 49 16189 50 16418 51 17115 52 16929 53 17905 54 18917 55 18381 56 19220 57 19203 58 19673 59 20528 60 20630 61 20475 62 20954 63 21481 64 22104 65 21809 66 22254 67 21922 68 22651 69 23193 70 23332 71 23389 72 23307 73 23640 74 24761 75 24543 76 24444 77 24519 78 24832 79 25296 80 25293 81 25044 82 24977 83 25351 84 26333 85 25527 86 25034 87 24847 88 25266 89 25801 90 25417 91 25268 92 24890 93 25227 94 25526 95 25010 96 24768 97 24342 98 25192 99 25527 100 25353 101 25329 102 25058 103 25687 104 26204 105 25816 106 25878 107 25929 108 26130 109 26023 110 26133 111 25830 112 25199 113 25809 114 25895 115 25484 116 25190 117 24808 118 24987 119 24975 120 24965 121 24684 122 24461 123 24405 124 24404 125 23960 126 23744 127 23400 128 23217 129 23541 130 24031 131 23361 132 23352 133 22958 134 23272 135 23222 136 23208 137 22955 138 23033 139 22870 140 22610 141 22618 142 22231 143 22123 144 21831 145 21689 146 21655 147 21104 148 20924 149 21003 150 20779 151 20350 152 20380 153 20116 154 19781 155 19498 156 19316 157 18897 158 18492 159 18495 160 18215 161 17912 162 18026 163 17853 164 17708 165 17628 166 17224 167 17575 168 17520 169 17637 170 17504 171 16800 172 16886 173 16827 174 16524 175 16109 176 16071 177 15798 178 15848 179 15602 180 15306 181 15163 182 14930 183 14854 184 14819 185 14558 186 14313 187 14283 188 13950 189 13923 190 13884 191 13653 192 13371 193 13616 194 13600 195 13335 196 12992 197 12959 198 13005 199 12956 200 12999 201 13028 202 12903 203 12859 204 13075 205 13127 206 13489 207 13223 208 13275 209 13451 210 13370 211 13198 212 13336 213 13153 214 13226 215 13152 216 13420 217 13319 218 13431 219 13669 220 13566 221 13904 222 13865 223 13965 224 14289 225 14395 226 14691 227 14714 228 15115 229 15473 230 15764 231 16156 232 16599 233 16918 234 17193 235 17967 236 18428 237 18515 238 19262 239 19615 240 20356 241 20953 242 21697 243 22388 244 23319 245 24298 246 25203 247 26238 248 27356 249 28137 250 29496 251 30179 252 31058 253 32802 254 33784 255 35004 256 36225 257 37678 258 39346 259 40641 260 42743 261 43713 262 45972 263 47839 264 49526 265 51799 266 53397 267 56705 268 58662 269 61132 270 63640 271 66400 272 69357 273 72562 274 76775 275 80464 276 84671 277 87794 278 91653 279 94388 280 98118 281 101483 282 105271 283 110052 284 113559 285 118647 286 122239 287 126980 288 130612 289 137094 290 142230 291 147810 292 153537 293 160154 294 166143 295 173276 296 179961 297 184756 298 193202 299 200381 300 207741 301 216064 302 223631 303 231540 304 240104 305 247981 306 256089 307 264689 308 273831 309 283470 310 292729 311 303114 312 313291 313 323267 314 333346 315 344526 316 354434 317 365787 318 378090 319 387898 320 400850 321 413012 322 426277 323 439257 324 451524 325 464107 326 476464 327 490488 328 503518 329 517493 330 531581 331 545535 332 561463 333 576204 334 590750 335 607123 336 623163 337 635358 338 650545 339 666186 340 681414 341 697183 342 712841 343 731623 344 749250 345 764046 346 782032 347 798305 348 813464 349 829609 350 845442 351 864443 352 881582 353 898111 354 914175 355 930983 356 952435 357 969080 358 983540 359 1001733 360 1017803 361 1034174 362 1053787 363 1074301 364 1089704 365 1105903 366 1124180 367 1139870 368 1154493 369 1170668 370 1188704 371 1203563 372 1218511 373 1235829 374 1253169 375 1266840 376 1284022 377 1297235 378 1315928 379 1327483 380 1341800 381 1355705 382 1371545 383 1385601 384 1400171 385 1415013 386 1427888 387 1440993 388 1453837 389 1467257 390 1475340 391 1488510 392 1499609 393 1513775 394 1524878 395 1536938 396 1549364 397 1559127 398 1571817 399 1580507 400 1586172 401 1596070 402 1606642 403 1615910 404 1623189 405 1634840 406 1643650 407 1651008 408 1656736 409 1661629 410 1668754 411 1675043 412 1678040 413 1684944 414 1689745 415 1694290 416 1701455 417 1705347 418 1709176 419 1710094 420 1716872 421 1718754 422 1718654 423 1720756 424 1721342 425 1724435 426 1728004 427 1727340 428 1727637 429 1728977 430 1729620 431 1726990 432 1727416 433 1727294 434 1725319 435 1722176 436 1722498 437 1720762 438 1720560 439 1717773 440 1715399 441 1711834 442 1708210 443 1704297 444 1701537 445 1698548 446 1697327 447 1691865 448 1689034 449 1684948 450 1679164 451 1675631 452 1668659 453 1663251 454 1657138 455 1652620 456 1646162 457 1638249 458 1636265 459 1629714 460 1623456 461 1616939 462 1610267 463 1602885 464 1594359 465 1585986 466 1580967 467 1574048 468 1569384 469 1562343 470 1554466 471 1547608 472 1539684 473 1530432 474 1521265 475 1514236 476 1507177 477 1497726 478 1489588 479 1482800 480 1475195 481 1465192 482 1456239 483 1446129 484 1439331 485 1430111 486 1420436 487 1413028 488 1403018 489 1396874 490 1386912 491 1376864 492 1369795 493 1358996 494 1350574 495 1341125 496 1333265 497 1322471 498 1312626 499 1304393 500 1296561 501 1286587 502 1279758 503 1269779 504 1257688 505 1252664 506 1241190 507 1231709 508 1223490 509 1212992 510 1206644 511 1196850 512 1187721 513 1179189 514 1170030 515 1158591 516 1150681 517 1143182 518 1130957 519 1123377 520 1111993 521 1106403 522 1096357 523 1088352 524 1078766 525 1069173 526 1059666 527 1050111 528 1041413 529 1032293 530 1024973 531 1014254 532 1006092 533 998373 534 989946 535 979788 536 971460 537 963587 538 953387 539 944517 540 936105 541 929048 542 919813 543 911634 544 903678 545 895037 546 886653 547 877962 548 868340 549 860672 550 851287 551 847553 552 838534 553 829141 554 822020 555 812682 556 806052 557 797875 558 787060 559 782052 560 774364 561 767716 562 757032 563 749467 564 742095 565 734738 566 726378 567 718458 568 711993 569 703993 570 697234 571 688674 572 678607 573 672546 574 666566 575 660000 576 652196 577 645840 578 638000 579 632516 580 625052 581 619407 582 611296 583 603892 584 598463 585 592810 586 585749 587 578934 588 572985 589 566035 590 559920 591 553056 592 546236 593 539804 594 535143 595 529520 596 522399 597 517618 598 509722 599 503206 600 497543 601 492905 602 487280 603 480594 604 476844 605 469396 606 465257 607 458044 608 453692 609 448752 610 442602 611 437946 612 432106 613 427011 614 421414 615 417692 616 411856 617 407287 618 401934 619 395838 620 390676 621 385098 622 380867 623 375623 624 371143 625 366814 626 361755 627 356571 628 352165 629 346803 630 343628 631 338134 632 334313 633 329622 634 325148 635 320890 636 316913 637 311350 638 307094 639 303367 640 299784 641 295168 642 290990 643 287641 644 283782 645 279368 646 276149 647 273133 648 269365 649 266308 650 261653 651 257858 652 253958 653 249657 654 247309 655 243693 656 240353 657 237509 658 233503 659 230547 660 227435 661 224389 662 221179 663 217971 664 214190 665 211115 666 209241 667 205545 668 201796 669 198945 670 197955 671 193631 672 190294 673 188165 674 185388 675 182618 676 179876 677 177163 678 174795 679 171790 680 169527 681 166754 682 164239 683 161705 684 160321 685 157457 686 154426 687 152422 688 149446 689 147032 690 144942 691 142645 692 140779 693 138439 694 135440 695 132992 696 131754 697 129847 698 128139 699 125436 700 123394 701 121657 702 119867 703 118434 704 116382 705 114475 706 112605 707 111317 708 108877 709 107582 710 105387 711 103488 712 101654 713 101148 714 99142 715 97161 716 95675 717 94066 718 92504 719 91215 720 89925 721 88651 722 86245 723 85076 724 83622 725 83113 726 81340 727 79605 728 78538 729 77613 730 75676 731 74273 732 73619 733 72299 734 71257 735 69695 736 68445 737 67620 738 66780 739 65613 740 64609 741 63922 742 63331 743 61518 744 60795 745 59218 746 58726 747 56973 748 56529 749 55550 750 54679 751 53439 752 52986 753 51924 754 51534 755 50017 756 49080 757 48580 758 47821 759 46629 760 45618 761 45482 762 44877 763 43814 764 42789 765 41843 766 41411 767 40942 768 39603 769 38899 770 38605 771 38088 772 37353 773 36635 774 35941 775 35095 776 34668 777 34138 778 33449 779 32574 780 32209 781 31616 782 30947 783 30572 784 29820 785 29782 786 29104 787 28050 788 27589 789 27292 790 26688 791 26053 792 25694 793 25021 794 24644 795 23980 796 23904 797 23417 798 23344 799 22845 800 22129 801 21731 802 21323 803 20923 804 20601 805 20093 806 19582 807 19367 808 19099 809 18748 810 18379 811 18034 812 17737 813 17038 814 17065 815 16645 816 16586 817 16067 818 16171 819 15630 820 15255 821 14749 822 14577 823 14598 824 13941 825 14014 826 13597 827 13547 828 13351 829 13166 830 12715 831 12226 832 12220 833 12063 834 11654 835 11478 836 11323 837 11209 838 10830 839 10998 840 10490 841 10375 842 10070 843 9994 844 9811 845 9692 846 9361 847 9282 848 9288 849 8662 850 8927 851 8655 852 8539 853 8371 854 8037 855 7869 856 7822 857 7642 858 7777 859 7539 860 7715 861 7270 862 6734 863 6665 864 6672 865 6312 866 6201 867 5967 868 5978 869 5909 870 5739 871 5787 872 5720 873 5416 874 5510 875 5506 876 5301 877 5276 878 4767 879 4757 880 4991 881 4541 882 4372 883 4338 884 4387 885 4363 886 4111 887 4287 888 4053 889 4261 890 3720 891 3627 892 3444 893 3363 894 3606 895 3237 896 2894 897 2900 898 2861 899 2812 900 2763 901 2753 902 2756 903 2537 904 2609 905 2582 906 2533 907 2360 908 2394 909 2312 910 2314 911 2230 912 2257 913 2183 914 2146 915 2101 916 2089 917 1995 918 2063 919 1926 920 1946 921 1893 922 1850 923 1897 924 1812 925 1802 926 1783 927 1719 928 1606 929 1691 930 1556 931 1589 932 1530 933 1582 934 1473 935 1520 936 1393 937 1459 938 1441 939 1388 940 1371 941 1370 942 1298 943 1296 944 1286 945 1257 946 1261 947 1177 948 1185 949 1101 950 1181 951 1060 952 1141 953 1043 954 1043 955 1040 956 1035 957 1035 958 936 959 980 960 991 961 927 962 892 963 891 964 918 965 834 966 861 967 881 968 830 969 856 970 821 971 800 972 756 973 799 974 765 975 788 976 758 977 717 978 690 979 692 980 664 981 663 982 697 983 674 984 634 985 648 986 651 987 611 988 619 989 557 990 600 991 660 992 571 993 527 994 513 995 524 996 555 997 590 998 534 999 511 1000 491 1001 487 1002 492 1003 478 1004 476 1005 439 1006 452 1007 430 1008 435 1009 479 1010 424 1011 461 1012 446 1013 434 1014 354 1015 422 1016 391 1017 410 1018 367 1019 392 1020 399 1021 348 1022 370 1023 354 1024 359 1025 382 1026 344 1027 357 1028 301 1029 337 1030 377 1031 295 1032 308 1033 280 1034 298 1035 250 1036 281 1037 298 1038 291 1039 286 1040 294 1041 274 1042 252 1043 270 1044 280 1045 276 1046 251 1047 260 1048 270 1049 246 1050 264 1051 277 1052 239 1053 253 1054 261 1055 222 1056 237 1057 229 1058 221 1059 220 1060 220 1061 213 1062 216 1063 212 1064 195 1065 209