#SentieonCommandLine: /lustre8/home/ykawai-tnproj-pg/packages/sentieon-genomics-201911/libexec/driver -t 8 -r /lustre8/home/ncbn-pg/data/resource/Homo_sapiens_assembly38.fasta -i HGDP/HGDP01251/HGDP01251.cram --algo InsertSizeMetricAlgo HGDP/HGDP01251/QCmetrics/HGDP01251.InsertSizeMetricAlgo.txt MEDIAN_INSERT_SIZE MEDIAN_ABSOLUTE_DEVIATION MIN_INSERT_SIZE MAX_INSERT_SIZE MEAN_INSERT_SIZE STANDARD_DEVIATION READ_PAIRS PAIR_ORIENTATION WIDTH_OF_10_PERCENT WIDTH_OF_20_PERCENT WIDTH_OF_30_PERCENT WIDTH_OF_40_PERCENT WIDTH_OF_50_PERCENT WIDTH_OF_60_PERCENT WIDTH_OF_70_PERCENT WIDTH_OF_80_PERCENT WIDTH_OF_90_PERCENT WIDTH_OF_99_PERCENT 457.000000 59.000000 2 248823794 465.675323 97.896756 328786040 FR 23 45 69 93 119 149 183 231 311 683 insert_size All_Reads.fr_count 2 404 3 410 4 424 5 422 6 415 7 515 8 459 9 469 10 455 11 472 12 429 13 448 14 483 15 492 16 494 17 460 18 511 19 531 20 489 21 552 22 545 23 555 24 574 25 627 26 646 27 675 28 726 29 884 30 1972 31 2116 32 2238 33 2248 34 2530 35 2809 36 3015 37 3227 38 3412 39 3902 40 3968 41 4079 42 4342 43 5337 44 5654 45 5821 46 6216 47 6222 48 6496 49 7083 50 8667 51 10219 52 10751 53 12148 54 13948 55 13808 56 14189 57 14425 58 14762 59 16592 60 16642 61 17663 62 17946 63 18460 64 19257 65 20250 66 20167 67 20090 68 20945 69 21342 70 21091 71 21345 72 21296 73 21390 74 22032 75 21740 76 21811 77 21685 78 21947 79 22422 80 22340 81 22284 82 21860 83 22281 84 23245 85 22929 86 23501 87 22860 88 23801 89 24046 90 23430 91 23341 92 22797 93 23380 94 24016 95 23482 96 23197 97 22937 98 23459 99 23617 100 23378 101 22854 102 22679 103 23085 104 23489 105 23011 106 22595 107 22782 108 22818 109 23187 110 22867 111 22715 112 22926 113 23131 114 23791 115 23624 116 23747 117 22951 118 23250 119 23513 120 23110 121 23234 122 22846 123 23071 124 22729 125 22729 126 22232 127 21882 128 21842 129 22285 130 22011 131 21648 132 20555 133 21023 134 20848 135 20808 136 20522 137 20341 138 20386 139 20734 140 20402 141 20334 142 19836 143 20408 144 20435 145 20273 146 20111 147 19922 148 19664 149 19739 150 19432 151 19433 152 19063 153 18905 154 18881 155 18434 156 17967 157 18036 158 17443 159 17251 160 17210 161 16684 162 16479 163 16485 164 16497 165 16143 166 15660 167 15748 168 15756 169 15623 170 15260 171 15142 172 15090 173 15202 174 15043 175 15206 176 15136 177 15067 178 14980 179 14849 180 14530 181 14454 182 14126 183 14258 184 13888 185 13781 186 13693 187 13728 188 13781 189 13398 190 13235 191 13001 192 13104 193 12965 194 13072 195 12436 196 12706 197 12573 198 12584 199 12242 200 12184 201 12103 202 12329 203 12045 204 12093 205 11862 206 11874 207 11964 208 11825 209 12012 210 12149 211 12236 212 12373 213 12467 214 12683 215 12623 216 12527 217 12784 218 12839 219 12938 220 12813 221 12591 222 12932 223 13155 224 13291 225 13264 226 13453 227 13600 228 13768 229 14247 230 14182 231 14488 232 14924 233 15363 234 15257 235 15483 236 15761 237 16250 238 16731 239 17172 240 17589 241 18143 242 18639 243 19084 244 19684 245 20035 246 20469 247 21217 248 22306 249 22682 250 24106 251 24951 252 25814 253 26745 254 27729 255 28590 256 29607 257 30616 258 31521 259 32605 260 33750 261 34967 262 36468 263 37904 264 39184 265 41002 266 42440 267 43978 268 46311 269 47981 270 49922 271 51702 272 53907 273 56401 274 58803 275 61493 276 66212 277 68160 278 70435 279 72617 280 75129 281 77574 282 80704 283 83718 284 86481 285 90904 286 93050 287 96625 288 100036 289 104769 290 107789 291 112805 292 117276 293 121286 294 125590 295 129896 296 134838 297 139810 298 145541 299 151534 300 157882 301 162960 302 169596 303 175398 304 181469 305 188886 306 194337 307 201055 308 207650 309 214910 310 222343 311 229673 312 238660 313 247143 314 253746 315 262462 316 271463 317 278997 318 288983 319 297918 320 306217 321 317118 322 326516 323 336703 324 347807 325 357663 326 368487 327 379498 328 390233 329 401275 330 411789 331 424012 332 436213 333 447823 334 459795 335 472655 336 485403 337 496752 338 510719 339 523171 340 536888 341 550318 342 564022 343 576574 344 592471 345 605532 346 619579 347 633801 348 647114 349 661834 350 675988 351 690544 352 706733 353 720902 354 737146 355 752677 356 766762 357 782399 358 796913 359 814034 360 827451 361 843098 362 857877 363 875091 364 892532 365 907970 366 923864 367 937367 368 953203 369 967020 370 982724 371 996673 372 1013688 373 1029031 374 1043608 375 1058479 376 1073675 377 1086956 378 1102769 379 1114771 380 1132624 381 1143753 382 1156944 383 1171558 384 1185176 385 1201611 386 1215300 387 1229546 388 1239559 389 1250942 390 1264916 391 1276598 392 1289173 393 1298875 394 1314215 395 1324707 396 1337288 397 1348660 398 1359745 399 1370601 400 1382513 401 1390288 402 1397621 403 1408093 404 1419826 405 1425796 406 1437249 407 1445620 408 1454455 409 1460843 410 1467272 411 1474398 412 1480193 413 1484562 414 1493134 415 1499391 416 1504690 417 1511874 418 1514833 419 1519759 420 1524899 421 1526417 422 1530018 423 1532152 424 1535603 425 1537769 426 1542697 427 1542390 428 1548104 429 1551126 430 1552381 431 1551263 432 1548752 433 1550111 434 1550595 435 1553263 436 1550063 437 1550762 438 1551694 439 1548574 440 1548192 441 1544295 442 1543578 443 1541405 444 1540689 445 1539274 446 1534701 447 1532615 448 1530118 449 1526538 450 1523091 451 1517463 452 1511499 453 1504997 454 1504478 455 1498090 456 1493302 457 1488601 458 1482285 459 1477480 460 1474445 461 1468669 462 1462469 463 1455926 464 1446138 465 1444190 466 1435422 467 1429215 468 1426063 469 1418206 470 1411989 471 1403048 472 1397163 473 1388485 474 1381956 475 1374094 476 1366161 477 1359971 478 1350899 479 1345983 480 1340325 481 1330035 482 1322410 483 1311620 484 1304655 485 1294401 486 1287283 487 1279079 488 1272557 489 1262252 490 1255095 491 1248024 492 1237790 493 1229752 494 1220068 495 1210226 496 1204137 497 1194461 498 1186681 499 1176563 500 1170150 501 1161599 502 1152365 503 1143659 504 1137030 505 1124862 506 1118187 507 1108833 508 1099922 509 1091842 510 1080349 511 1074177 512 1065882 513 1057635 514 1048437 515 1039465 516 1030744 517 1021677 518 1013162 519 1002966 520 997336 521 987249 522 979135 523 971586 524 960790 525 952321 526 944023 527 934434 528 926529 529 917003 530 910596 531 901610 532 894599 533 885650 534 876645 535 869517 536 861780 537 851341 538 844480 539 836527 540 828713 541 820419 542 811925 543 803594 544 798201 545 789500 546 780253 547 774914 548 765960 549 756546 550 749687 551 741519 552 734482 553 728205 554 719676 555 712566 556 703725 557 696055 558 689349 559 681947 560 673506 561 667699 562 661123 563 653155 564 646002 565 638512 566 630579 567 624127 568 617211 569 610796 570 604306 571 597059 572 589933 573 583905 574 577517 575 571631 576 566247 577 559558 578 551800 579 545904 580 539595 581 533309 582 526933 583 521002 584 515203 585 508005 586 503385 587 498372 588 492185 589 486989 590 481962 591 474207 592 469442 593 461843 594 457907 595 452304 596 446075 597 440827 598 436581 599 431249 600 425547 601 421292 602 414282 603 409767 604 404935 605 400244 606 395330 607 389948 608 385494 609 379756 610 375042 611 370954 612 365587 613 360596 614 357896 615 352338 616 346879 617 342887 618 338586 619 333759 620 329512 621 324782 622 320698 623 316534 624 311575 625 307607 626 302624 627 299284 628 295015 629 291055 630 286952 631 284143 632 279596 633 276913 634 272152 635 268596 636 264641 637 260351 638 258351 639 254181 640 251022 641 246757 642 243971 643 239974 644 236654 645 233042 646 231034 647 226814 648 224476 649 220451 650 217699 651 214540 652 211517 653 208276 654 205625 655 202088 656 198826 657 196760 658 193209 659 191271 660 188642 661 185182 662 182861 663 179608 664 177292 665 174354 666 171540 667 168548 668 167056 669 164866 670 161714 671 159718 672 157738 673 154930 674 152517 675 149799 676 148472 677 145180 678 143425 679 140264 680 138771 681 136389 682 135165 683 132545 684 130755 685 128926 686 126346 687 124159 688 122621 689 119489 690 118809 691 117086 692 115420 693 113492 694 111238 695 110072 696 107203 697 106270 698 105014 699 102929 700 101321 701 99466 702 97636 703 95880 704 94751 705 92870 706 92545 707 89628 708 87773 709 87186 710 85874 711 83611 712 82623 713 81857 714 80024 715 78910 716 77450 717 75913 718 74600 719 73916 720 72371 721 71517 722 70198 723 69055 724 68349 725 67226 726 65920 727 64893 728 63755 729 62448 730 61106 731 60323 732 58965 733 58299 734 58011 735 56033 736 55433 737 55055 738 53384 739 52626 740 51862 741 51219 742 49708 743 49297 744 48209 745 47312 746 46894 747 46013 748 45082 749 44919 750 44074 751 43248 752 41902 753 41316 754 40492 755 40060 756 39333 757 38515 758 38154 759 37244 760 36494 761 36107 762 35284 763 34743 764 33956 765 33736 766 32903 767 32342 768 31620 769 31095 770 30507 771 29781 772 29350 773 28864 774 28229 775 27936 776 27391 777 26943 778 26432 779 25847 780 25605 781 24964 782 24468 783 24147 784 23553 785 22850 786 22696 787 22069 788 21915 789 21593 790 20965 791 20473 792 20073 793 19654 794 19547 795 19089 796 18568 797 18278 798 17902 799 17451 800 17360 801 16603 802 16619 803 16344 804 15921 805 15490 806 15148 807 15043 808 14843 809 14636 810 14193 811 13868 812 13614 813 13441 814 13305 815 12845 816 12871 817 12415 818 12440 819 11677 820 11858 821 11602 822 11249 823 11148 824 10942 825 10673 826 10645 827 10611 828 9992 829 9769 830 9561 831 9273 832 9157 833 9109 834 8969 835 9049 836 8424 837 8575 838 8068 839 7886 840 7696 841 7682 842 7406 843 7329 844 7229 845 7083 846 7019 847 6749 848 6647 849 6850 850 6849 851 6398 852 6072 853 5835 854 5607 855 5962 856 5308 857 4980 858 4940 859 4816 860 4821 861 4769 862 4726 863 4711 864 4474 865 4396 866 4352 867 4283 868 4535 869 3955 870 3695 871 3583 872 3646 873 3349 874 3322 875 3207 876 3311 877 3190 878 3056 879 3047 880 2967 881 2954 882 3098 883 2700 884 2507 885 2634 886 2547 887 2427 888 2465 889 2452 890 2329 891 2316 892 2292 893 2202 894 2138 895 2145 896 2103 897 1984 898 1963 899 1947 900 1905 901 1813 902 1919 903 1732 904 1805 905 1793 906 1630 907 1707 908 1638 909 1555 910 1568 911 1515 912 1528 913 1481 914 1477 915 1418 916 1438 917 1354 918 1323 919 1306 920 1266 921 1271 922 1239 923 1225 924 1227 925 1122 926 1113 927 1091 928 1069 929 1098 930 999 931 1011 932 943 933 999 934 981 935 986 936 995 937 929 938 969 939 912 940 885 941 842 942 826 943 816 944 831 945 856 946 763 947 759 948 766 949 774 950 728 951 728 952 723 953 653 954 672 955 681 956 658 957 660 958 598 959 670 960 598 961 588 962 565 963 600 964 530 965 534 966 551 967 537 968 538 969 475 970 513 971 474 972 525 973 511 974 458 975 490 976 482 977 451 978 468 979 459 980 443 981 442 982 392 983 362 984 389 985 368 986 387 987 364 988 391 989 399 990 349 991 338 992 352 993 338 994 338 995 303 996 322 997 340 998 323 999 331 1000 320 1001 314 1002 294 1003 296 1004 279 1005 279 1006 290 1007 295 1008 256 1009 256 1010 252 1011 280 1012 247 1013 240 1014 263 1015 235 1016 215 1017 246 1018 220 1019 201 1020 227 1021 238 1022 200 1023 223 1024 221 1025 219 1026 204 1027 208 1028 192 1029 185 1030 200 1031 188 1032 200 1033 170 1034 166 1035 177 1036 195 1037 170 1038 168 1039 159 1040 159 1041 166 1042 164 1043 136 1044 167 1045 169 1046 165 1047 164