#SentieonCommandLine: /lustre8/home/ykawai-tnproj-pg/packages/sentieon-genomics-201911/libexec/driver -t 8 -r /lustre8/home/ncbn-pg/data/resource/Homo_sapiens_assembly38.fasta -i HGDP/HGDP01254/HGDP01254.cram --algo InsertSizeMetricAlgo HGDP/HGDP01254/QCmetrics/HGDP01254.InsertSizeMetricAlgo.txt MEDIAN_INSERT_SIZE MEDIAN_ABSOLUTE_DEVIATION MIN_INSERT_SIZE MAX_INSERT_SIZE MEAN_INSERT_SIZE STANDARD_DEVIATION READ_PAIRS PAIR_ORIENTATION WIDTH_OF_10_PERCENT WIDTH_OF_20_PERCENT WIDTH_OF_30_PERCENT WIDTH_OF_40_PERCENT WIDTH_OF_50_PERCENT WIDTH_OF_60_PERCENT WIDTH_OF_70_PERCENT WIDTH_OF_80_PERCENT WIDTH_OF_90_PERCENT WIDTH_OF_99_PERCENT 410.000000 60.000000 2 245631250 425.245856 98.415421 351725501 FR 25 47 71 95 121 151 185 231 317 641 insert_size All_Reads.fr_count 2 763 3 778 4 758 5 815 6 757 7 824 8 797 9 826 10 1027 11 1005 12 952 13 1063 14 1053 15 946 16 1140 17 1012 18 1184 19 2858 20 2954 21 2798 22 3081 23 3256 24 3546 25 3706 26 3854 27 3828 28 4186 29 4300 30 4486 31 4659 32 4778 33 5278 34 5509 35 5699 36 5943 37 6014 38 6514 39 6771 40 7061 41 7245 42 7365 43 7864 44 8349 45 8565 46 8660 47 8737 48 9146 49 9421 50 9483 51 9819 52 9894 53 10286 54 10858 55 10618 56 11031 57 11211 58 11777 59 12232 60 12265 61 12239 62 12412 63 12563 64 13013 65 12936 66 13023 67 13074 68 13474 69 13764 70 13628 71 13833 72 13797 73 13843 74 14319 75 14191 76 14201 77 13896 78 14211 79 14662 80 14455 81 14162 82 13855 83 14049 84 14496 85 14455 86 14133 87 14279 88 14627 89 14900 90 14833 91 14545 92 14648 93 14560 94 14688 95 14516 96 14463 97 14236 98 14616 99 14766 100 14563 101 14497 102 14372 103 14526 104 14725 105 14602 106 14084 107 13888 108 14311 109 14464 110 14382 111 13955 112 13968 113 13941 114 14026 115 13638 116 13713 117 13505 118 13471 119 13588 120 13646 121 13485 122 13694 123 13468 124 13663 125 13310 126 13164 127 12877 128 13067 129 13263 130 13144 131 12944 132 12914 133 12852 134 13086 135 12865 136 12678 137 12677 138 12630 139 12658 140 12842 141 12507 142 12373 143 12546 144 12266 145 11990 146 11890 147 11806 148 11867 149 11939 150 11675 151 11609 152 11510 153 11604 154 11580 155 11437 156 11465 157 11109 158 11324 159 11382 160 11314 161 11299 162 11396 163 11351 164 11299 165 11236 166 11170 167 11042 168 10963 169 10985 170 11146 171 11191 172 10944 173 10900 174 10911 175 10780 176 10689 177 10990 178 10936 179 10745 180 10753 181 10979 182 10602 183 10674 184 10580 185 10780 186 10358 187 10655 188 10648 189 10910 190 10955 191 10849 192 11032 193 11111 194 11001 195 11139 196 11434 197 11361 198 11567 199 11746 200 11982 201 12078 202 12498 203 12997 204 13245 205 13481 206 13727 207 13878 208 14793 209 14968 210 15346 211 15745 212 16054 213 16950 214 17305 215 17844 216 18351 217 19276 218 19789 219 20811 220 21939 221 22639 222 23490 223 24693 224 25932 225 26843 226 28642 227 29464 228 30758 229 32791 230 34293 231 35825 232 37771 233 39460 234 42069 235 43853 236 45781 237 48360 238 50637 239 53485 240 56329 241 59360 242 62919 243 65642 244 68619 245 71922 246 76377 247 79462 248 84185 249 88338 250 92780 251 97428 252 102340 253 107802 254 113126 255 118491 256 125421 257 129966 258 136917 259 143320 260 150248 261 156762 262 163981 263 172454 264 179422 265 187633 266 195862 267 205008 268 213469 269 223307 270 232996 271 242396 272 254757 273 264476 274 275308 275 286886 276 300931 277 311167 278 323105 279 336638 280 347469 281 360656 282 375084 283 388904 284 402238 285 417046 286 429766 287 446075 288 460579 289 478437 290 493143 291 510417 292 526270 293 543379 294 562483 295 577477 296 595872 297 612662 298 629599 299 649386 300 668825 301 686925 302 705973 303 726352 304 745559 305 763477 306 783416 307 804018 308 821094 309 842799 310 864460 311 884180 312 904855 313 923498 314 943114 315 962702 316 985162 317 1004327 318 1024562 319 1043345 320 1064879 321 1084087 322 1104865 323 1125524 324 1144066 325 1161278 326 1183234 327 1198037 328 1217193 329 1234890 330 1251450 331 1273348 332 1290695 333 1309483 334 1324146 335 1342085 336 1359008 337 1374092 338 1387473 339 1403787 340 1421528 341 1433491 342 1450091 343 1464326 344 1478868 345 1492024 346 1503199 347 1516147 348 1527483 349 1537892 350 1549233 351 1561362 352 1569974 353 1581147 354 1592788 355 1600687 356 1611297 357 1615864 358 1623335 359 1629794 360 1636621 361 1641176 362 1648530 363 1655439 364 1661507 365 1667362 366 1670750 367 1673463 368 1678369 369 1678648 370 1678102 371 1684802 372 1685355 373 1688819 374 1687271 375 1689662 376 1690903 377 1688343 378 1685285 379 1688063 380 1684430 381 1682144 382 1679130 383 1679260 384 1679006 385 1675089 386 1672356 387 1667695 388 1665023 389 1662585 390 1655231 391 1649803 392 1646470 393 1640675 394 1634465 395 1630072 396 1626161 397 1621158 398 1612572 399 1609326 400 1601752 401 1593458 402 1588334 403 1579968 404 1575017 405 1567359 406 1559625 407 1554262 408 1546648 409 1538454 410 1531423 411 1524086 412 1513389 413 1504870 414 1498142 415 1489624 416 1483354 417 1475869 418 1465206 419 1459497 420 1448482 421 1441794 422 1432028 423 1423420 424 1413387 425 1406612 426 1397912 427 1390244 428 1384178 429 1372375 430 1364268 431 1353666 432 1347364 433 1337410 434 1328651 435 1319699 436 1311978 437 1305316 438 1293818 439 1285785 440 1278234 441 1268314 442 1260251 443 1251983 444 1245459 445 1233760 446 1227321 447 1219795 448 1208839 449 1202706 450 1192426 451 1184222 452 1176014 453 1167610 454 1158392 455 1152544 456 1141726 457 1133721 458 1126855 459 1119454 460 1111692 461 1103494 462 1095182 463 1085576 464 1077504 465 1069720 466 1062586 467 1053709 468 1046702 469 1039911 470 1029960 471 1024729 472 1015192 473 1006660 474 1000122 475 989838 476 983502 477 975722 478 969304 479 962765 480 955087 481 947462 482 939287 483 932526 484 925199 485 917127 486 909156 487 903565 488 897222 489 889907 490 880457 491 876369 492 868856 493 860343 494 854829 495 848880 496 840401 497 832552 498 826784 499 821571 500 815414 501 806795 502 801943 503 795290 504 786981 505 778533 506 773365 507 767819 508 759655 509 754154 510 749413 511 742185 512 735984 513 728672 514 721833 515 715228 516 710538 517 704362 518 696821 519 689528 520 685127 521 680080 522 673579 523 668690 524 661866 525 655790 526 649433 527 644333 528 638928 529 632231 530 626283 531 620451 532 614868 533 607218 534 602475 535 597046 536 591797 537 584504 538 579426 539 573657 540 569400 541 563034 542 558118 543 552489 544 545864 545 543836 546 536083 547 530294 548 525320 549 520032 550 515633 551 511351 552 504581 553 499010 554 494537 555 489108 556 485195 557 478627 558 473454 559 470476 560 463547 561 458003 562 453250 563 448124 564 443186 565 438589 566 434367 567 428686 568 423794 569 419917 570 413828 571 408958 572 405126 573 399989 574 395515 575 390458 576 384816 577 381778 578 377339 579 371691 580 367491 581 363591 582 357894 583 354406 584 349722 585 345880 586 341769 587 338003 588 331966 589 328088 590 323615 591 320070 592 316517 593 312453 594 308278 595 304850 596 301105 597 296503 598 293041 599 288702 600 284305 601 279610 602 277127 603 273613 604 269550 605 267364 606 263581 607 260042 608 256007 609 252661 610 249613 611 245249 612 243390 613 238945 614 235691 615 232642 616 230154 617 226173 618 223801 619 220376 620 217159 621 214922 622 210742 623 208778 624 205520 625 202776 626 200930 627 196952 628 194960 629 192260 630 189278 631 185846 632 184162 633 181447 634 178654 635 175810 636 173858 637 171014 638 169012 639 165867 640 164112 641 161267 642 158813 643 156339 644 155118 645 152253 646 150763 647 147894 648 146252 649 143812 650 142925 651 139284 652 137207 653 135879 654 133652 655 131704 656 129640 657 128138 658 125530 659 123894 660 122120 661 120519 662 118749 663 117176 664 115327 665 113372 666 111517 667 110569 668 108849 669 107015 670 105155 671 104218 672 101987 673 100510 674 99006 675 97856 676 96166 677 94673 678 93257 679 91617 680 89522 681 89180 682 86842 683 86000 684 84838 685 83292 686 82213 687 80801 688 79996 689 78656 690 77153 691 75548 692 74760 693 73508 694 72109 695 71459 696 70064 697 69427 698 67989 699 66960 700 65494 701 64927 702 63794 703 62895 704 61551 705 60518 706 59711 707 58914 708 58215 709 57021 710 56044 711 55220 712 54131 713 53386 714 52368 715 51881 716 50678 717 49945 718 49151 719 48645 720 47474 721 47061 722 45892 723 45246 724 44622 725 43844 726 43301 727 42282 728 41715 729 40873 730 40409 731 39474 732 39240 733 38152 734 38034 735 36879 736 36540 737 35873 738 35021 739 34584 740 34020 741 33472 742 33154 743 32630 744 31800 745 31417 746 31154 747 30180 748 29899 749 29352 750 28289 751 28303 752 27539 753 26849 754 26798 755 26346 756 25969 757 25534 758 24886 759 24527 760 24192 761 23727 762 22830 763 22762 764 22193 765 21914 766 21569 767 20875 768 20436 769 20244 770 19822 771 19781 772 19384 773 18782 774 18364 775 18394 776 18202 777 17470 778 17471 779 17119 780 16682 781 16390 782 16402 783 15891 784 15556 785 15391 786 15110 787 14743 788 14660 789 14413 790 14271 791 14068 792 13464 793 13719 794 12901 795 12924 796 12480 797 12328 798 12283 799 11915 800 11979 801 11228 802 11178 803 10724 804 10519 805 10445 806 10412 807 10116 808 9981 809 9620 810 9655 811 9420 812 9151 813 9248 814 9220 815 8631 816 8487 817 8412 818 8416 819 8268 820 8069 821 7878 822 7771 823 7547 824 7423 825 7398 826 7184 827 7018 828 6835 829 6677 830 6681 831 6538 832 6345 833 6340 834 6197 835 5977 836 5952 837 5884 838 5852 839 5677 840 5660 841 5779 842 5424 843 5370 844 5341 845 5207 846 4960 847 4982 848 4827 849 4804 850 4673 851 4742 852 4722 853 4613 854 4502 855 4418 856 4433 857 4332 858 4046 859 3944 860 3994 861 4033 862 3693 863 3440 864 3329 865 3491 866 3266 867 3299 868 3167 869 3213 870 3219 871 3018 872 3047 873 3003 874 2939 875 2827 876 2792 877 2810 878 2760 879 2674 880 2685 881 2603 882 2666 883 2496 884 2516 885 2451 886 2394 887 2370 888 2312 889 2301 890 2349 891 2196 892 2219 893 2125 894 2143 895 2056 896 1984 897 2062 898 2076 899 1962 900 1938 901 1935 902 1917 903 1997 904 1773 905 1754 906 1760 907 1759 908 1721 909 1641 910 1687 911 1605 912 1623 913 1638 914 1605 915 1556 916 1494 917 1497 918 1465 919 1478 920 1374 921 1441 922 1367 923 1375 924 1338 925 1358 926 1256 927 1250 928 1309 929 1223 930 1231 931 1257 932 1172 933 1165 934 1143 935 1159 936 1177 937 1112 938 1075 939 1097 940 1038 941 1134 942 1112 943 1049 944 987 945 958 946 952 947 990 948 900 949 892 950 913 951 951 952 853 953 944 954 908 955 831 956 907 957 850 958 809 959 833 960 827 961 835 962 775 963 765 964 770 965 788 966 729 967 725 968 693 969 714 970 769 971 716 972 686 973 678 974 677 975 657 976 648 977 648 978 621 979 606 980 647 981 596 982 609 983 596 984 588 985 547 986 569 987 564 988 548 989 552 990 522 991 559 992 552 993 554 994 463 995 498 996 470 997 504 998 486 999 521 1000 457 1001 495 1002 461 1003 446 1004 421 1005 437 1006 434 1007 410 1008 411 1009 456 1010 385