#SentieonCommandLine: /lustre8/home/ykawai-tnproj-pg/packages/sentieon-genomics-201911/libexec/driver -t 8 -r /lustre8/home/ncbn-pg/data/resource/Homo_sapiens_assembly38.fasta -i HGDP/HGDP01268/HGDP01268.cram --algo InsertSizeMetricAlgo HGDP/HGDP01268/QCmetrics/HGDP01268.InsertSizeMetricAlgo.txt MEDIAN_INSERT_SIZE MEDIAN_ABSOLUTE_DEVIATION MIN_INSERT_SIZE MAX_INSERT_SIZE MEAN_INSERT_SIZE STANDARD_DEVIATION READ_PAIRS PAIR_ORIENTATION WIDTH_OF_10_PERCENT WIDTH_OF_20_PERCENT WIDTH_OF_30_PERCENT WIDTH_OF_40_PERCENT WIDTH_OF_50_PERCENT WIDTH_OF_60_PERCENT WIDTH_OF_70_PERCENT WIDTH_OF_80_PERCENT WIDTH_OF_90_PERCENT WIDTH_OF_99_PERCENT 404.000000 60.000000 2 246634293 419.282562 99.577251 323430641 FR 23 47 71 95 121 151 185 233 323 655 insert_size All_Reads.fr_count 2 1092 3 1282 4 1313 5 1413 6 1249 7 1314 8 1390 9 1394 10 1381 11 1509 12 1438 13 1610 14 1561 15 1616 16 1717 17 1485 18 1817 19 3382 20 3803 21 3642 22 3691 23 4046 24 4322 25 4500 26 4567 27 4600 28 4926 29 5161 30 5421 31 5490 32 5756 33 6086 34 6745 35 7002 36 7108 37 7313 38 7672 39 8310 40 8655 41 8677 42 8959 43 9419 44 9815 45 9751 46 10042 47 10221 48 11237 49 11527 50 11685 51 11964 52 11768 53 12794 54 13398 55 13334 56 13154 57 13415 58 13798 59 14370 60 14690 61 14787 62 15131 63 15335 64 15895 65 15977 66 16125 67 15914 68 16369 69 16728 70 16684 71 16368 72 16305 73 16743 74 16926 75 16512 76 16547 77 16261 78 17049 79 17571 80 17611 81 17349 82 17039 83 17754 84 17791 85 17697 86 17975 87 17296 88 17690 89 18041 90 17974 91 17596 92 17265 93 17870 94 18333 95 17786 96 17303 97 17146 98 17568 99 17540 100 17419 101 17377 102 16971 103 17221 104 17533 105 17063 106 16970 107 16551 108 17030 109 17325 110 16843 111 16629 112 16582 113 16825 114 17295 115 17012 116 16686 117 16290 118 16649 119 16753 120 16552 121 16560 122 16457 123 16281 124 16398 125 16507 126 16242 127 15992 128 15786 129 16044 130 15919 131 15955 132 15796 133 15653 134 16025 135 15587 136 15418 137 15331 138 15272 139 15676 140 15627 141 15581 142 15403 143 15472 144 15629 145 15449 146 15340 147 15075 148 15123 149 15323 150 15014 151 15491 152 15391 153 15697 154 15435 155 15370 156 15083 157 15091 158 15318 159 15564 160 15447 161 15482 162 15253 163 15215 164 15402 165 15174 166 15073 167 14888 168 15003 169 15075 170 15138 171 15087 172 15054 173 15003 174 14872 175 15068 176 14932 177 14875 178 15155 179 15486 180 15209 181 14879 182 14988 183 14881 184 14894 185 14835 186 15077 187 14705 188 15109 189 15336 190 15308 191 15358 192 15458 193 15602 194 15745 195 16111 196 16170 197 16451 198 16745 199 17073 200 17134 201 17414 202 17571 203 17844 204 18437 205 18708 206 19070 207 19685 208 19913 209 20173 210 21013 211 21215 212 22013 213 22795 214 23300 215 23992 216 24508 217 25519 218 26711 219 27703 220 28252 221 29769 222 31361 223 32313 224 33409 225 34563 226 35973 227 38047 228 39773 229 41592 230 43091 231 45246 232 47358 233 49399 234 52028 235 54052 236 56960 237 59726 238 62311 239 65577 240 69003 241 72219 242 75316 243 79253 244 82866 245 86736 246 91275 247 95657 248 100390 249 105657 250 110021 251 115696 252 121058 253 126516 254 132498 255 138425 256 144934 257 150902 258 156884 259 165134 260 172557 261 180115 262 187774 263 196067 264 204689 265 212468 266 221441 267 231384 268 240815 269 249724 270 260066 271 271888 272 283708 273 293838 274 306093 275 318094 276 330948 277 343065 278 355630 279 367228 280 380880 281 395207 282 409752 283 423036 284 437860 285 450878 286 465167 287 480333 288 494597 289 510021 290 528152 291 544141 292 562968 293 577844 294 595162 295 610808 296 626902 297 645988 298 662424 299 680659 300 698763 301 717421 302 737067 303 755402 304 776022 305 792149 306 812331 307 827222 308 848310 309 866958 310 885979 311 905412 312 924246 313 944573 314 964241 315 983364 316 999503 317 1017369 318 1034910 319 1053661 320 1070028 321 1089777 322 1108209 323 1125635 324 1144272 325 1162413 326 1176143 327 1191407 328 1208240 329 1224441 330 1240752 331 1255722 332 1271793 333 1287743 334 1303999 335 1318164 336 1331729 337 1344074 338 1355546 339 1366021 340 1382082 341 1392012 342 1407378 343 1417657 344 1429295 345 1441594 346 1448893 347 1460811 348 1469613 349 1478517 350 1486277 351 1494195 352 1498880 353 1511313 354 1518373 355 1525825 356 1532109 357 1537469 358 1539593 359 1545572 360 1549006 361 1552301 362 1557711 363 1562464 364 1562448 365 1567946 366 1570214 367 1570996 368 1570059 369 1571498 370 1571433 371 1573524 372 1569795 373 1569918 374 1569970 375 1570526 376 1567422 377 1564953 378 1563898 379 1559777 380 1557307 381 1552164 382 1548104 383 1543861 384 1542589 385 1536698 386 1532493 387 1527588 388 1521880 389 1519244 390 1510125 391 1505170 392 1499561 393 1493106 394 1486126 395 1479769 396 1475819 397 1468260 398 1462673 399 1454374 400 1446411 401 1437227 402 1431297 403 1425216 404 1415232 405 1410221 406 1401314 407 1394902 408 1386895 409 1375490 410 1368529 411 1357352 412 1351544 413 1342519 414 1334930 415 1324377 416 1318040 417 1308081 418 1300442 419 1290819 420 1283609 421 1273773 422 1262329 423 1255080 424 1246696 425 1237067 426 1229171 427 1221606 428 1212283 429 1205117 430 1196429 431 1186463 432 1177064 433 1169578 434 1159083 435 1151533 436 1142576 437 1133814 438 1126251 439 1118989 440 1111652 441 1103484 442 1094253 443 1085263 444 1080177 445 1070307 446 1061352 447 1054325 448 1046098 449 1038627 450 1031181 451 1021448 452 1014946 453 1006708 454 999012 455 991835 456 983303 457 977047 458 969925 459 961219 460 955658 461 948792 462 940448 463 933446 464 925088 465 919331 466 908838 467 904307 468 897124 469 891514 470 883290 471 877603 472 870688 473 863705 474 856505 475 850656 476 844921 477 837272 478 829533 479 823827 480 817336 481 812788 482 805864 483 799249 484 792902 485 784888 486 780121 487 775331 488 767968 489 761128 490 755677 491 751360 492 744968 493 739341 494 732405 495 726452 496 723018 497 713644 498 708461 499 703605 500 697846 501 691878 502 686717 503 681140 504 675358 505 668830 506 662524 507 658074 508 653515 509 648429 510 643983 511 639483 512 631348 513 628998 514 622302 515 616850 516 610782 517 607288 518 599816 519 594538 520 592103 521 584435 522 580962 523 576464 524 571156 525 566468 526 562721 527 555592 528 550399 529 542755 530 537947 531 535409 532 531526 533 525823 534 521124 535 516430 536 511014 537 506736 538 501519 539 497396 540 492438 541 488413 542 484393 543 479116 544 474936 545 469013 546 464637 547 461037 548 456990 549 450118 550 447486 551 442050 552 439243 553 433846 554 429279 555 425453 556 421327 557 416708 558 411351 559 408004 560 404050 561 398558 562 393969 563 389871 564 385236 565 380707 566 376570 567 374381 568 369014 569 364824 570 360896 571 356121 572 352557 573 349653 574 344381 575 340266 576 337375 577 332748 578 328709 579 324746 580 321757 581 317399 582 313829 583 309679 584 305955 585 301713 586 299509 587 294411 588 290002 589 289264 590 284096 591 280479 592 276403 593 273286 594 269195 595 264919 596 261303 597 258162 598 255526 599 251986 600 248998 601 245697 602 242456 603 239524 604 236029 605 233065 606 230012 607 226846 608 224302 609 220832 610 217352 611 215258 612 212062 613 208858 614 206939 615 204300 616 201345 617 197905 618 195327 619 192750 620 190678 621 186676 622 184652 623 182290 624 180195 625 177648 626 174281 627 171711 628 170266 629 168149 630 165438 631 163204 632 160970 633 158769 634 156517 635 154453 636 151926 637 149865 638 147817 639 145616 640 143391 641 141862 642 140140 643 138085 644 135522 645 133787 646 131906 647 129488 648 128259 649 126319 650 123100 651 122302 652 120737 653 118434 654 117507 655 115901 656 114108 657 112430 658 110204 659 109160 660 106941 661 106239 662 103797 663 103124 664 100788 665 99274 666 98279 667 96584 668 95028 669 94707 670 92425 671 90917 672 89805 673 88978 674 86827 675 86060 676 84617 677 83537 678 82239 679 80862 680 79874 681 78397 682 78160 683 76440 684 75129 685 73649 686 72595 687 71310 688 70503 689 68883 690 68066 691 67049 692 66010 693 64845 694 63880 695 62921 696 62284 697 61239 698 60151 699 59148 700 58438 701 57455 702 56591 703 55355 704 54734 705 54182 706 53319 707 52121 708 51250 709 50470 710 49212 711 48259 712 48089 713 47374 714 46546 715 45839 716 45168 717 43976 718 43649 719 42741 720 42009 721 41019 722 40962 723 40359 724 39771 725 38861 726 38229 727 37043 728 36956 729 35789 730 35278 731 34953 732 34433 733 33873 734 33253 735 32745 736 31877 737 31591 738 30862 739 30362 740 30036 741 29459 742 29330 743 28495 744 28261 745 27546 746 27252 747 26473 748 26323 749 25368 750 25488 751 24905 752 24391 753 24163 754 23571 755 23143 756 22509 757 22133 758 21834 759 21339 760 20936 761 20545 762 20060 763 19648 764 19328 765 19051 766 18601 767 18532 768 17794 769 17441 770 17369 771 16905 772 16693 773 16393 774 16252 775 15990 776 15776 777 15475 778 15154 779 14520 780 14859 781 14300 782 13977 783 13573 784 13280 785 13265 786 12749 787 12705 788 12279 789 12282 790 12125 791 11735 792 11695 793 11452 794 10796 795 10695 796 10323 797 10122 798 9813 799 9546 800 9533 801 9314 802 9260 803 9064 804 8899 805 9350 806 8500 807 8439 808 8231 809 7872 810 7871 811 7795 812 7757 813 7300 814 7348 815 7563 816 7007 817 6837 818 6717 819 6507 820 6468 821 6195 822 6297 823 5983 824 5968 825 5870 826 5680 827 5674 828 5606 829 5469 830 5372 831 5286 832 5195 833 5090 834 4917 835 4903 836 4715 837 4663 838 4433 839 4501 840 4466 841 4404 842 4194 843 4137 844 4079 845 4116 846 3920 847 3881 848 3841 849 3729 850 3641 851 3846 852 3726 853 3447 854 3281 855 3287 856 3299 857 2940 858 2812 859 2839 860 2685 861 2601 862 2595 863 2522 864 2486 865 2385 866 2431 867 2335 868 2295 869 2188 870 2242 871 2171 872 2119 873 2110 874 2058 875 2070 876 1951 877 1872 878 1866 879 1990 880 1754 881 1818 882 1750 883 1740 884 1758 885 1617 886 1650 887 1639 888 1594 889 1563 890 1519 891 1478 892 1499 893 1522 894 1412 895 1387 896 1317 897 1422 898 1323 899 1268 900 1267 901 1244 902 1236 903 1213 904 1164 905 1103 906 1168 907 1139 908 1090 909 1067 910 988 911 1015 912 1013 913 1004 914 986 915 970 916 985 917 934 918 890 919 846 920 886 921 946 922 880 923 858 924 802 925 833 926 801 927 824 928 729 929 685 930 795 931 748 932 764 933 739 934 761 935 663 936 645 937 687 938 676 939 705 940 656 941 628 942 598 943 594 944 594 945 641 946 584 947 592 948 602 949 561 950 549 951 563 952 510 953 543 954 509 955 516 956 494 957 508 958 511 959 481 960 442 961 433 962 447 963 459 964 439 965 425 966 419 967 441 968 456 969 413 970 422 971 427 972 398 973 378 974 353 975 360 976 353 977 391 978 335 979 348 980 355 981 312 982 358 983 318 984 324 985 301 986 329 987 320 988 300 989 308 990 327 991 253 992 292 993 287 994 290 995 267 996 300 997 299 998 284 999 245 1000 275 1001 268 1002 259 1003 259 1004 238