#SentieonCommandLine: /lustre8/home/ykawai-tnproj-pg/packages/sentieon-genomics-201911/libexec/driver -t 8 -r /lustre8/home/ncbn-pg/data/resource/Homo_sapiens_assembly38.fasta -i HGDP/HGDP01271/HGDP01271.cram --algo InsertSizeMetricAlgo HGDP/HGDP01271/QCmetrics/HGDP01271.InsertSizeMetricAlgo.txt MEDIAN_INSERT_SIZE MEDIAN_ABSOLUTE_DEVIATION MIN_INSERT_SIZE MAX_INSERT_SIZE MEAN_INSERT_SIZE STANDARD_DEVIATION READ_PAIRS PAIR_ORIENTATION WIDTH_OF_10_PERCENT WIDTH_OF_20_PERCENT WIDTH_OF_30_PERCENT WIDTH_OF_40_PERCENT WIDTH_OF_50_PERCENT WIDTH_OF_60_PERCENT WIDTH_OF_70_PERCENT WIDTH_OF_80_PERCENT WIDTH_OF_90_PERCENT WIDTH_OF_99_PERCENT 401.000000 58.000000 2 245368808 413.673621 93.477482 428696282 FR 23 45 69 91 117 145 177 221 299 607 insert_size All_Reads.fr_count 2 1071 3 1287 4 1304 5 1250 6 1230 7 1348 8 1298 9 1254 10 1298 11 1295 12 1355 13 1390 14 1514 15 1604 16 1486 17 1609 18 1855 19 3819 20 3851 21 3895 22 4018 23 4379 24 4683 25 4851 26 5058 27 5143 28 5406 29 5571 30 5972 31 6216 32 6542 33 6815 34 7292 35 7459 36 7916 37 8126 38 8849 39 9300 40 9784 41 9758 42 10281 43 10967 44 11409 45 11727 46 11930 47 12255 48 13110 49 13129 50 13204 51 13770 52 13746 53 14198 54 14922 55 14801 56 15111 57 15190 58 15991 59 16387 60 16261 61 16366 62 16534 63 16923 64 17376 65 17640 66 17591 67 17810 68 18280 69 18890 70 18786 71 18991 72 18659 73 19103 74 19534 75 19234 76 19435 77 19057 78 19516 79 20011 80 19430 81 19149 82 18855 83 19535 84 19656 85 19245 86 19148 87 18895 88 19413 89 19722 90 19513 91 19019 92 18667 93 18858 94 19603 95 19245 96 19221 97 18665 98 19317 99 19564 100 19532 101 19240 102 19091 103 19571 104 19617 105 19057 106 18924 107 18835 108 18875 109 19282 110 18927 111 18410 112 18169 113 18029 114 18458 115 17908 116 17750 117 17359 118 17671 119 17513 120 17355 121 17458 122 16981 123 17195 124 17128 125 16900 126 16743 127 16609 128 16612 129 16967 130 16762 131 16667 132 16347 133 16681 134 16656 135 16247 136 16385 137 16015 138 15891 139 15776 140 15874 141 15661 142 15265 143 15299 144 15450 145 15146 146 14734 147 14708 148 14775 149 14628 150 14467 151 14367 152 14132 153 14231 154 13948 155 13596 156 13681 157 13278 158 13346 159 13257 160 13359 161 12931 162 13254 163 13003 164 13245 165 13347 166 13446 167 13254 168 13266 169 13059 170 13025 171 12974 172 12823 173 12950 174 12780 175 12771 176 12747 177 12470 178 12603 179 13459 180 12394 181 12459 182 12593 183 12574 184 12743 185 12432 186 12575 187 12733 188 12826 189 13048 190 12957 191 13237 192 13378 193 13897 194 13977 195 14064 196 14130 197 14525 198 15293 199 15393 200 15380 201 16093 202 16615 203 17391 204 18092 205 19242 206 19386 207 19966 208 20858 209 21616 210 22163 211 23380 212 24581 213 25266 214 26272 215 27319 216 28628 217 30164 218 31463 219 33183 220 34736 221 36398 222 38230 223 40059 224 42533 225 44264 226 47008 227 49270 228 51583 229 54693 230 57918 231 60960 232 63983 233 67629 234 70854 235 74533 236 79114 237 82820 238 87126 239 91653 240 96172 241 101395 242 106445 243 112793 244 117692 245 123821 246 130645 247 137477 248 143740 249 151028 250 159000 251 166013 252 174935 253 182861 254 192567 255 201426 256 209692 257 220682 258 231143 259 239806 260 252830 261 263088 262 274397 263 286199 264 299603 265 311164 266 323943 267 338231 268 351802 269 365961 270 382376 271 397237 272 413050 273 429175 274 446652 275 462879 276 484970 277 500591 278 518582 279 535281 280 554236 281 573135 282 592722 283 611353 284 632733 285 652045 286 673381 287 693452 288 716361 289 736926 290 759748 291 784731 292 805858 293 831066 294 854736 295 876156 296 898712 297 923641 298 947585 299 971438 300 997525 301 1022541 302 1046014 303 1072965 304 1099776 305 1121534 306 1144128 307 1171058 308 1194564 309 1221503 310 1247509 311 1272055 312 1297772 313 1324057 314 1348054 315 1370835 316 1396674 317 1421380 318 1443165 319 1466796 320 1488448 321 1511955 322 1537567 323 1557660 324 1583044 325 1602520 326 1622883 327 1647109 328 1666567 329 1684107 330 1703604 331 1723074 332 1745653 333 1764484 334 1783440 335 1799965 336 1818739 337 1832148 338 1851398 339 1864872 340 1880983 341 1897841 342 1906920 343 1924216 344 1939176 345 1952736 346 1959807 347 1972679 348 1984941 349 1993765 350 2004928 351 2015159 352 2024969 353 2033916 354 2046033 355 2051203 356 2057843 357 2065293 358 2070236 359 2074421 360 2079389 361 2081927 362 2086451 363 2091376 364 2095853 365 2097013 366 2101375 367 2102607 368 2103253 369 2104111 370 2101917 371 2100127 372 2101935 373 2102609 374 2102561 375 2101577 376 2098002 377 2095161 378 2094107 379 2089556 380 2084468 381 2079984 382 2074374 383 2071905 384 2068795 385 2063942 386 2060155 387 2052943 388 2048129 389 2040489 390 2032904 391 2025011 392 2018820 393 2011817 394 2005387 395 1999093 396 1989106 397 1982963 398 1974567 399 1967095 400 1958603 401 1948116 402 1940662 403 1928771 404 1921299 405 1913727 406 1905537 407 1895017 408 1887077 409 1876333 410 1865818 411 1853550 412 1843745 413 1832791 414 1825229 415 1814852 416 1802476 417 1792884 418 1784020 419 1770811 420 1759780 421 1746280 422 1738284 423 1724170 424 1712559 425 1703092 426 1695707 427 1682526 428 1672143 429 1663163 430 1650108 431 1637439 432 1626588 433 1614171 434 1603470 435 1593964 436 1581893 437 1571584 438 1558517 439 1550137 440 1538084 441 1527263 442 1513310 443 1502773 444 1490054 445 1480225 446 1470932 447 1459009 448 1446905 449 1437806 450 1429857 451 1416493 452 1406518 453 1392875 454 1382090 455 1371727 456 1361090 457 1348647 458 1340887 459 1328803 460 1318651 461 1308181 462 1295832 463 1286038 464 1274388 465 1265024 466 1252455 467 1244443 468 1231998 469 1225316 470 1212502 471 1203273 472 1193524 473 1180428 474 1173231 475 1160805 476 1152151 477 1142507 478 1131717 479 1122513 480 1111733 481 1103325 482 1093544 483 1083299 484 1072432 485 1064795 486 1053381 487 1043384 488 1035277 489 1025551 490 1017535 491 1003957 492 998746 493 989096 494 979916 495 971270 496 961206 497 949877 498 942627 499 935000 500 925333 501 915605 502 906056 503 898390 504 889250 505 882190 506 871704 507 863058 508 854563 509 846226 510 838251 511 830016 512 819713 513 813042 514 803364 515 795112 516 786640 517 779285 518 772042 519 763297 520 756234 521 747865 522 740326 523 733849 524 725493 525 719926 526 710521 527 700874 528 694417 529 684773 530 678655 531 672046 532 664367 533 657940 534 651492 535 643995 536 634624 537 628686 538 621332 539 615537 540 607046 541 601859 542 595623 543 587391 544 581868 545 574102 546 568969 547 562895 548 555629 549 546960 550 542466 551 535094 552 529717 553 521861 554 516233 555 510603 556 504491 557 496914 558 491616 559 485033 560 479468 561 473890 562 468497 563 462649 564 455892 565 449080 566 444046 567 437003 568 433207 569 425316 570 420913 571 415355 572 411079 573 405816 574 398786 575 395117 576 389306 577 384223 578 378352 579 373335 580 368949 581 363403 582 357896 583 353475 584 350555 585 343306 586 338561 587 334186 588 329738 589 325563 590 320421 591 315384 592 310285 593 305615 594 301038 595 297782 596 294138 597 289256 598 284978 599 280751 600 277087 601 272352 602 268863 603 264359 604 260167 605 257413 606 253235 607 249635 608 245373 609 241612 610 239448 611 234634 612 230921 613 227735 614 223848 615 220666 616 217108 617 214372 618 211219 619 206531 620 202917 621 200608 622 197089 623 194043 624 191724 625 187141 626 185457 627 181976 628 179672 629 176440 630 173045 631 170770 632 167623 633 164731 634 161161 635 159416 636 157629 637 155283 638 151684 639 150388 640 147887 641 144767 642 142152 643 139945 644 137824 645 135493 646 132521 647 130825 648 129028 649 126401 650 124100 651 122757 652 120294 653 118236 654 116334 655 113847 656 112606 657 110206 658 108152 659 106722 660 104979 661 103102 662 100545 663 99445 664 97542 665 95739 666 94102 667 92272 668 90836 669 89388 670 87837 671 86275 672 84704 673 83269 674 81555 675 81051 676 78765 677 77750 678 76030 679 75306 680 73936 681 72181 682 70897 683 69936 684 68375 685 66717 686 65331 687 64730 688 63649 689 62539 690 60908 691 60106 692 58679 693 58044 694 56986 695 56019 696 54721 697 53533 698 52844 699 51737 700 50602 701 49971 702 49079 703 47671 704 47269 705 46038 706 45448 707 44254 708 43895 709 42687 710 42501 711 41615 712 40813 713 40027 714 39310 715 38648 716 37872 717 37021 718 36553 719 35427 720 34874 721 34082 722 33667 723 32825 724 32165 725 31753 726 30736 727 30149 728 30121 729 29320 730 28971 731 28287 732 27613 733 27390 734 26525 735 25927 736 25920 737 25154 738 24739 739 24448 740 23984 741 23421 742 23103 743 22323 744 22202 745 21557 746 21401 747 20965 748 20201 749 20045 750 19711 751 19239 752 18910 753 18471 754 18274 755 17799 756 17212 757 17090 758 16603 759 16889 760 16376 761 15776 762 15649 763 15051 764 15036 765 15040 766 14236 767 13857 768 13711 769 13426 770 13057 771 12851 772 12711 773 12454 774 12280 775 11856 776 11670 777 11499 778 11438 779 11251 780 10849 781 10755 782 10404 783 10348 784 10066 785 9686 786 9566 787 9400 788 9139 789 8994 790 8673 791 8605 792 8537 793 8344 794 8255 795 8107 796 7941 797 7904 798 7634 799 7439 800 7722 801 7144 802 6914 803 6880 804 6700 805 6591 806 6555 807 6251 808 6095 809 6309 810 5820 811 6031 812 5663 813 5448 814 5350 815 5132 816 5234 817 4786 818 4894 819 4678 820 4682 821 4742 822 4416 823 4280 824 4077 825 4115 826 3962 827 3861 828 3832 829 3818 830 3584 831 3738 832 3507 833 3476 834 3535 835 3429 836 3331 837 3200 838 3168 839 3117 840 2987 841 3033 842 3021 843 2886 844 2929 845 2827 846 2769 847 2716 848 2694 849 2929 850 2510 851 2459 852 2448 853 2317 854 2388 855 2180 856 2158 857 2086 858 2062 859 2115 860 1967 861 1975 862 1940 863 1824 864 1872 865 1769 866 1748 867 1704 868 1712 869 1642 870 1647 871 1529 872 1642 873 1544 874 1532 875 1536 876 1449 877 1449 878 1420 879 1416 880 1331 881 1398 882 1334 883 1284 884 1280 885 1248 886 1285 887 1193 888 1236 889 1135 890 1167 891 1159 892 1185 893 1099 894 1047 895 1082 896 1001 897 1054 898 1036 899 1015 900 938 901 932 902 932 903 901 904 903 905 886 906 907 907 830 908 853 909 849 910 883 911 818 912 797 913 771 914 762 915 763 916 767 917 801 918 723 919 723 920 716 921 726 922 648 923 656 924 690 925 688 926 665 927 710 928 631 929 639 930 604 931 627 932 600 933 626 934 587 935 596 936 596 937 576 938 566 939 534 940 552 941 566 942 532 943 517 944 496 945 526 946 501 947 495 948 501 949 459 950 488 951 468 952 444 953 429 954 441 955 446 956 394 957 442 958 401 959 412 960 394 961 415 962 411 963 378 964 354 965 361 966 378 967 345 968 363 969 321 970 349 971 322 972 312 973 333 974 338 975 371 976 302 977 336 978 371 979 283 980 318 981 300