#SentieonCommandLine: /lustre8/home/ykawai-tnproj-pg/packages/sentieon-genomics-201911/libexec/driver -t 8 -r /lustre8/home/ncbn-pg/data/resource/Homo_sapiens_assembly38.fasta -i HGDP/HGDP01276/HGDP01276.cram --algo InsertSizeMetricAlgo HGDP/HGDP01276/QCmetrics/HGDP01276.InsertSizeMetricAlgo.txt MEDIAN_INSERT_SIZE MEDIAN_ABSOLUTE_DEVIATION MIN_INSERT_SIZE MAX_INSERT_SIZE MEAN_INSERT_SIZE STANDARD_DEVIATION READ_PAIRS PAIR_ORIENTATION WIDTH_OF_10_PERCENT WIDTH_OF_20_PERCENT WIDTH_OF_30_PERCENT WIDTH_OF_40_PERCENT WIDTH_OF_50_PERCENT WIDTH_OF_60_PERCENT WIDTH_OF_70_PERCENT WIDTH_OF_80_PERCENT WIDTH_OF_90_PERCENT WIDTH_OF_99_PERCENT 409.000000 60.000000 2 247111938 422.324704 97.052892 430516985 FR 23 47 71 95 121 149 185 229 313 633 insert_size All_Reads.fr_count 2 1681 3 1690 4 1781 5 1959 6 1973 7 2052 8 2039 9 2143 10 2088 11 2085 12 2122 13 2182 14 2187 15 2724 16 2279 17 2209 18 2511 19 4018 20 4438 21 4197 22 4350 23 4734 24 4954 25 5290 26 5434 27 5564 28 5545 29 6008 30 6360 31 6648 32 6922 33 7702 34 8023 35 8739 36 8877 37 9098 38 9763 39 9952 40 10478 41 10625 42 11024 43 11796 44 12452 45 12678 46 12742 47 13169 48 13912 49 14010 50 14150 51 14460 52 14649 53 15532 54 15994 55 15865 56 15840 57 16036 58 16888 59 17336 60 17873 61 18360 62 18733 63 19664 64 20465 65 20253 66 20425 67 19760 68 20418 69 21435 70 20938 71 21167 72 21081 73 21537 74 21927 75 21339 76 21385 77 21025 78 21445 79 21964 80 21802 81 21249 82 20990 83 21737 84 22226 85 21830 86 21779 87 20757 88 21274 89 21866 90 21585 91 21303 92 21808 93 22353 94 22932 95 22520 96 22216 97 21953 98 22515 99 22610 100 22568 101 22346 102 21632 103 22376 104 22797 105 21956 106 21915 107 21302 108 22124 109 22215 110 21711 111 21234 112 20926 113 21070 114 21159 115 21050 116 20814 117 20291 118 20566 119 20692 120 20263 121 19899 122 19328 123 19744 124 19816 125 20225 126 20042 127 19828 128 19674 129 20215 130 20348 131 19854 132 19656 133 20066 134 19806 135 19898 136 19364 137 19371 138 19327 139 19448 140 19179 141 19025 142 18998 143 18962 144 19019 145 18737 146 18677 147 18152 148 18492 149 18435 150 18301 151 18172 152 17958 153 18092 154 17600 155 17632 156 17723 157 17333 158 17323 159 17157 160 17178 161 17238 162 17290 163 17606 164 17722 165 17595 166 17539 167 17803 168 17422 169 17334 170 17349 171 17056 172 16975 173 17211 174 17199 175 17102 176 16767 177 16863 178 16745 179 17015 180 16764 181 16984 182 16731 183 16632 184 16752 185 16659 186 16734 187 16832 188 16779 189 16741 190 17003 191 16858 192 17120 193 17257 194 17337 195 17424 196 17422 197 17643 198 18387 199 18088 200 18425 201 18766 202 19184 203 19315 204 19966 205 20537 206 21399 207 21761 208 22531 209 22919 210 23318 211 24278 212 24746 213 25448 214 26459 215 27196 216 27900 217 28704 218 30246 219 31118 220 32346 221 33470 222 34953 223 36393 224 37908 225 39383 226 40808 227 42911 228 44981 229 46927 230 49464 231 51474 232 54358 233 56202 234 59394 235 61881 236 64866 237 67991 238 71762 239 74858 240 78885 241 82197 242 85820 243 90141 244 94750 245 99064 246 103454 247 108653 248 113771 249 119196 250 125704 251 131373 252 137697 253 144949 254 151044 255 158323 256 166521 257 174056 258 181738 259 190615 260 199409 261 208316 262 216502 263 226516 264 236958 265 246617 266 255525 267 267767 268 278632 269 290905 270 303991 271 315072 272 330077 273 342585 274 358296 275 371382 276 389046 277 403559 278 417149 279 432649 280 448604 281 463516 282 480823 283 498230 284 515289 285 532721 286 547817 287 566654 288 585767 289 607914 290 626229 291 644567 292 666528 293 687352 294 707149 295 730334 296 750494 297 771451 298 795072 299 814863 300 838149 301 861667 302 886085 303 909740 304 932747 305 957445 306 977413 307 999522 308 1025250 309 1050816 310 1074776 311 1098909 312 1125560 313 1149957 314 1172847 315 1196822 316 1223967 317 1244209 318 1268830 319 1291185 320 1319657 321 1344659 322 1367344 323 1393111 324 1415305 325 1435987 326 1461550 327 1480189 328 1502231 329 1524143 330 1546488 331 1567462 332 1591429 333 1612146 334 1632052 335 1651305 336 1670304 337 1690088 338 1707196 339 1727658 340 1742474 341 1760857 342 1780224 343 1799085 344 1813244 345 1831042 346 1843884 347 1858070 348 1871551 349 1885180 350 1899373 351 1911827 352 1926340 353 1937336 354 1949609 355 1961288 356 1972138 357 1979666 358 1990462 359 1995415 360 1997199 361 2010222 362 2017062 363 2023122 364 2029639 365 2036957 366 2040931 367 2047245 368 2049380 369 2052051 370 2055395 371 2054522 372 2056484 373 2062052 374 2063446 375 2063289 376 2064264 377 2062401 378 2059156 379 2061390 380 2059655 381 2055267 382 2053179 383 2050678 384 2049748 385 2046245 386 2044179 387 2037961 388 2035625 389 2031807 390 2023659 391 2018459 392 2012843 393 2006379 394 2001809 395 1994865 396 1992248 397 1985898 398 1980479 399 1970324 400 1962124 401 1953408 402 1946319 403 1937482 404 1931291 405 1924490 406 1914111 407 1906618 408 1901826 409 1889076 410 1879730 411 1868673 412 1860142 413 1849984 414 1839780 415 1830993 416 1820967 417 1810957 418 1803891 419 1792039 420 1782269 421 1772170 422 1759586 423 1749924 424 1739813 425 1728376 426 1718661 427 1708339 428 1696960 429 1688168 430 1679545 431 1667272 432 1655820 433 1643674 434 1632982 435 1623011 436 1613830 437 1601892 438 1593479 439 1583344 440 1571943 441 1557932 442 1551058 443 1538432 444 1530302 445 1519338 446 1508753 447 1498312 448 1488603 449 1478344 450 1465682 451 1455622 452 1446364 453 1435266 454 1427016 455 1417965 456 1408024 457 1391879 458 1383919 459 1375928 460 1365897 461 1356333 462 1345751 463 1336804 464 1323826 465 1314019 466 1306711 467 1297089 468 1287649 469 1278193 470 1266658 471 1258835 472 1248227 473 1238278 474 1230188 475 1217258 476 1209293 477 1200442 478 1192318 479 1183834 480 1173654 481 1163833 482 1155976 483 1146903 484 1135990 485 1126748 486 1117636 487 1108087 488 1101007 489 1091069 490 1081584 491 1074515 492 1068728 493 1056198 494 1049323 495 1040398 496 1032165 497 1021868 498 1012309 499 1004901 500 998044 501 989904 502 981433 503 973786 504 963009 505 956024 506 946629 507 939833 508 930913 509 924349 510 917298 511 908959 512 897314 513 889839 514 883999 515 875452 516 868193 517 859745 518 852431 519 843775 520 837055 521 831220 522 820367 523 814194 524 807142 525 799528 526 790701 527 782287 528 775062 529 767861 530 758620 531 751294 532 745640 533 738384 534 731241 535 724641 536 717698 537 708943 538 701271 539 694845 540 688369 541 681145 542 675099 543 667749 544 662222 545 653143 546 647678 547 639843 548 633336 549 627072 550 619726 551 613156 552 605994 553 599773 554 593078 555 586007 556 579687 557 574095 558 566966 559 560117 560 554559 561 549277 562 543125 563 536914 564 529272 565 524683 566 517603 567 512000 568 505467 569 499972 570 494110 571 488096 572 481508 573 476377 574 469398 575 463774 576 457931 577 452372 578 447531 579 442446 580 435337 581 430502 582 425510 583 419027 584 413502 585 408447 586 403102 587 398368 588 393666 589 386620 590 383240 591 377746 592 372556 593 367518 594 360778 595 356450 596 351691 597 347312 598 342703 599 338494 600 332955 601 327906 602 324906 603 319859 604 316302 605 310990 606 306169 607 302463 608 298300 609 294250 610 290053 611 285852 612 282133 613 279007 614 273090 615 270359 616 266415 617 263052 618 257465 619 253927 620 250128 621 247744 622 243450 623 239921 624 236476 625 233584 626 228873 627 225992 628 222612 629 219361 630 216486 631 212939 632 209355 633 205574 634 203254 635 200170 636 197348 637 194352 638 191663 639 188738 640 185325 641 182842 642 179631 643 176077 644 173762 645 170706 646 168964 647 165329 648 163981 649 161617 650 158986 651 155872 652 153326 653 151443 654 149304 655 146329 656 145137 657 142141 658 140381 659 137049 660 135294 661 133162 662 130740 663 128399 664 126913 665 125033 666 122807 667 120860 668 119311 669 117013 670 114768 671 113006 672 111636 673 109665 674 107586 675 105465 676 103755 677 102578 678 100084 679 98752 680 97639 681 97054 682 93669 683 92806 684 91195 685 89581 686 88359 687 86449 688 85191 689 83523 690 82232 691 80560 692 79450 693 77930 694 76764 695 75267 696 73604 697 72445 698 71176 699 69728 700 69441 701 67491 702 66519 703 65649 704 64359 705 63548 706 62174 707 61287 708 59967 709 59522 710 57717 711 56967 712 56102 713 54701 714 53761 715 52957 716 52011 717 51045 718 50353 719 49617 720 48180 721 47556 722 46699 723 45546 724 44792 725 44116 726 43535 727 42321 728 41185 729 41008 730 40438 731 39526 732 38754 733 37805 734 37326 735 36961 736 36105 737 35528 738 35192 739 34297 740 33806 741 33242 742 32776 743 31398 744 31574 745 30916 746 30321 747 29770 748 29093 749 28595 750 27768 751 27410 752 27027 753 26403 754 25773 755 25257 756 24719 757 24600 758 23874 759 23565 760 22863 761 22115 762 21849 763 21396 764 21119 765 20433 766 20553 767 20118 768 19640 769 19196 770 18922 771 18328 772 18106 773 17941 774 17303 775 17062 776 16661 777 16441 778 16306 779 16017 780 15785 781 15261 782 15064 783 14864 784 14458 785 13917 786 13817 787 13759 788 13192 789 12985 790 12612 791 12464 792 12275 793 12063 794 11785 795 11644 796 11347 797 11140 798 11198 799 10760 800 10520 801 10435 802 10324 803 9813 804 9878 805 9815 806 9709 807 9191 808 9166 809 9042 810 8833 811 8481 812 8191 813 8218 814 7938 815 7933 816 7821 817 7271 818 7187 819 6978 820 6862 821 6749 822 6540 823 6600 824 6432 825 6426 826 6319 827 6218 828 6159 829 5812 830 5596 831 5710 832 5718 833 5432 834 5382 835 5167 836 5182 837 5058 838 5020 839 4829 840 4905 841 4825 842 4672 843 4649 844 4879 845 4374 846 4162 847 4367 848 4088 849 3984 850 3606 851 3493 852 3626 853 3460 854 3018 855 3032 856 2977 857 2981 858 2718 859 2733 860 2781 861 2792 862 2628 863 2695 864 2510 865 2445 866 2372 867 2454 868 2317 869 2259 870 2263 871 2188 872 2151 873 2025 874 2179 875 2023 876 2118 877 1998 878 1911 879 1918 880 1745 881 1796 882 1740 883 1767 884 1807 885 1706 886 1625 887 1703 888 1654 889 1658 890 1566 891 1542 892 1510 893 1495 894 1448 895 1430 896 1423 897 1350 898 1369 899 1315 900 1335 901 1306 902 1275 903 1250 904 1194 905 1242 906 1129 907 1138 908 1094 909 1177 910 1092 911 1054 912 1072 913 1040 914 1063 915 1063 916 963 917 988 918 961 919 950 920 894 921 919 922 927 923 927 924 866 925 868 926 849 927 779 928 832 929 785 930 772 931 772 932 733 933 746 934 744 935 771 936 716 937 745 938 747 939 680 940 724 941 675 942 679 943 660 944 629 945 597 946 651 947 633 948 587 949 602 950 578 951 590 952 547 953 542 954 558 955 571 956 556 957 558 958 508 959 506 960 476 961 545 962 463 963 481 964 471 965 437 966 444 967 459 968 451 969 466 970 426 971 416 972 437 973 399 974 405 975 434 976 406 977 414 978 402 979 390 980 368 981 366 982 362 983 387 984 318 985 354 986 334 987 359 988 340 989 328 990 314 991 331 992 323 993 310 994 321 995 324 996 285 997 306 998 276 999 305 1000 296 1001 272 1002 280 1003 302 1004 262 1005 271 1006 253 1007 273 1008 244 1009 279