#SentieonCommandLine: /lustre8/home/ykawai-tnproj-pg/packages/sentieon-genomics-201911/libexec/driver -t 8 -r /lustre8/home/ncbn-pg/data/resource/Homo_sapiens_assembly38.fasta -i HGDP/HGDP01329/HGDP01329.cram --algo InsertSizeMetricAlgo HGDP/HGDP01329/QCmetrics/HGDP01329.InsertSizeMetricAlgo.txt MEDIAN_INSERT_SIZE MEDIAN_ABSOLUTE_DEVIATION MIN_INSERT_SIZE MAX_INSERT_SIZE MEAN_INSERT_SIZE STANDARD_DEVIATION READ_PAIRS PAIR_ORIENTATION WIDTH_OF_10_PERCENT WIDTH_OF_20_PERCENT WIDTH_OF_30_PERCENT WIDTH_OF_40_PERCENT WIDTH_OF_50_PERCENT WIDTH_OF_60_PERCENT WIDTH_OF_70_PERCENT WIDTH_OF_80_PERCENT WIDTH_OF_90_PERCENT WIDTH_OF_99_PERCENT 414.000000 57.000000 2 247493790 425.138937 94.776139 486494044 FR 23 45 67 91 115 143 177 221 303 639 insert_size All_Reads.fr_count 2 786 3 833 4 855 5 1166 6 1092 7 1190 8 1145 9 1184 10 1175 11 1226 12 1142 13 1239 14 1260 15 1247 16 1259 17 1462 18 1511 19 2529 20 3666 21 3646 22 4370 23 4696 24 5037 25 5616 26 6182 27 6374 28 7517 29 7738 30 8683 31 9126 32 9626 33 9933 34 11637 35 11947 36 13168 37 13450 38 14372 39 14972 40 15954 41 16113 42 16548 43 17407 44 17983 45 18416 46 19079 47 19036 48 20188 49 20445 50 20603 51 21133 52 21247 53 22476 54 23663 55 23821 56 24198 57 24602 58 25715 59 26365 60 26397 61 27188 62 27029 63 27747 64 28868 65 28747 66 29048 67 28756 68 29765 69 30499 70 30321 71 30354 72 30288 73 30682 74 31145 75 30575 76 31139 77 30529 78 30912 79 31557 80 31878 81 31705 82 31841 83 32477 84 33551 85 33396 86 33313 87 32438 88 32903 89 33641 90 33881 91 33340 92 32949 93 33333 94 33696 95 33079 96 32689 97 32629 98 32645 99 33093 100 33013 101 32612 102 32322 103 32882 104 33053 105 32100 106 32259 107 31820 108 32087 109 32899 110 32041 111 32286 112 32113 113 32895 114 32651 115 32286 116 32235 117 31866 118 31991 119 32270 120 31622 121 31703 122 30622 123 30990 124 31016 125 30604 126 29938 127 29688 128 29524 129 29991 130 30100 131 29548 132 29206 133 29324 134 29497 135 28955 136 28445 137 28681 138 28143 139 28260 140 28252 141 27954 142 27951 143 27973 144 28042 145 27995 146 27938 147 27377 148 27271 149 27674 150 26835 151 26879 152 26766 153 26690 154 26099 155 25816 156 25493 157 25141 158 24915 159 24681 160 24476 161 24272 162 24198 163 24053 164 24143 165 23961 166 23727 167 23216 168 23033 169 23100 170 22771 171 22791 172 22365 173 22584 174 22251 175 22385 176 22358 177 22389 178 22601 179 22951 180 22612 181 22402 182 22053 183 22189 184 22186 185 21648 186 21547 187 21633 188 21478 189 21729 190 21615 191 21438 192 21317 193 21219 194 21531 195 21438 196 21345 197 21254 198 21744 199 21858 200 21840 201 22082 202 22462 203 22312 204 22290 205 22662 206 23317 207 23238 208 23861 209 24410 210 24788 211 24710 212 25801 213 26347 214 26811 215 27516 216 28549 217 29402 218 30623 219 31356 220 32282 221 33057 222 34315 223 35083 224 36136 225 37642 226 39050 227 40172 228 42067 229 42826 230 45744 231 46865 232 48932 233 51201 234 53559 235 55556 236 57496 237 60337 238 62735 239 65992 240 68752 241 71695 242 75589 243 78134 244 81739 245 85401 246 89735 247 93928 248 98558 249 102654 250 106606 251 112505 252 117797 253 121812 254 128187 255 133817 256 140113 257 145836 258 152423 259 160269 260 168044 261 174949 262 183633 263 191925 264 201073 265 209511 266 218303 267 227063 268 237524 269 247437 270 258869 271 269616 272 280989 273 292731 274 305750 275 318153 276 333704 277 346586 278 358698 279 372615 280 384629 281 400908 282 416463 283 430416 284 445593 285 463979 286 478773 287 496299 288 512385 289 531322 290 549810 291 568431 292 590278 293 608394 294 628276 295 648782 296 669328 297 688926 298 710469 299 732287 300 756013 301 779188 302 802033 303 827797 304 852103 305 876718 306 899494 307 923362 308 947779 309 974801 310 1001201 311 1026538 312 1053024 313 1080497 314 1105150 315 1133676 316 1160477 317 1186479 318 1213271 319 1240195 320 1268398 321 1298509 322 1326748 323 1353844 324 1380634 325 1412162 326 1438566 327 1461915 328 1489489 329 1518629 330 1544769 331 1572911 332 1603332 333 1626788 334 1654949 335 1682137 336 1710967 337 1734043 338 1756793 339 1780840 340 1806525 341 1831180 342 1857652 343 1883242 344 1905315 345 1927702 346 1952620 347 1972129 348 1990892 349 2014147 350 2034193 351 2053826 352 2076437 353 2097942 354 2115465 355 2134941 356 2152711 357 2166957 358 2184361 359 2198582 360 2213294 361 2228082 362 2246031 363 2258537 364 2274353 365 2286575 366 2295544 367 2309809 368 2317466 369 2327557 370 2335675 371 2344622 372 2352650 373 2361781 374 2370551 375 2377816 376 2384312 377 2385251 378 2395549 379 2398278 380 2398596 381 2401954 382 2403386 383 2402253 384 2410696 385 2411843 386 2413808 387 2412355 388 2414513 389 2414379 390 2408454 391 2405587 392 2402765 393 2400959 394 2400190 395 2397957 396 2396504 397 2391662 398 2388367 399 2383713 400 2372661 401 2367919 402 2362354 403 2356780 404 2349454 405 2345194 406 2337843 407 2330101 408 2325258 409 2313049 410 2305024 411 2297004 412 2282336 413 2273671 414 2263417 415 2255543 416 2246103 417 2232189 418 2224494 419 2212191 420 2204431 421 2190981 422 2175861 423 2165614 424 2151235 425 2142805 426 2131695 427 2116690 428 2106381 429 2097209 430 2081707 431 2066671 432 2053332 433 2041542 434 2027789 435 2015668 436 2002406 437 1990067 438 1977276 439 1965988 440 1950669 441 1937223 442 1923092 443 1910674 444 1897205 445 1885014 446 1869438 447 1857716 448 1843322 449 1831535 450 1813884 451 1800039 452 1788586 453 1771698 454 1759309 455 1744014 456 1729789 457 1718056 458 1705317 459 1693888 460 1677267 461 1663859 462 1650749 463 1637298 464 1621652 465 1610555 466 1595764 467 1584451 468 1571328 469 1559348 470 1545075 471 1531424 472 1518077 473 1505612 474 1492360 475 1479649 476 1466286 477 1451371 478 1441524 479 1425833 480 1414889 481 1401847 482 1389760 483 1379964 484 1365736 485 1349855 486 1340595 487 1325518 488 1315614 489 1303286 490 1292533 491 1279307 492 1264680 493 1253731 494 1244170 495 1230083 496 1218909 497 1208238 498 1196010 499 1185560 500 1172259 501 1163881 502 1152683 503 1139611 504 1128526 505 1117379 506 1105786 507 1094049 508 1084946 509 1073630 510 1063733 511 1051302 512 1039667 513 1030208 514 1020272 515 1006370 516 998284 517 987438 518 978967 519 969415 520 957561 521 946241 522 936833 523 926729 524 919328 525 908729 526 899188 527 887340 528 877801 529 868673 530 860190 531 851621 532 841583 533 829660 534 823147 535 815793 536 804977 537 796658 538 788405 539 777969 540 770655 541 763981 542 754279 543 745882 544 735988 545 729574 546 720519 547 710702 548 703179 549 695666 550 688058 551 679574 552 671524 553 664433 554 656115 555 648402 556 640558 557 632862 558 623389 559 617818 560 610707 561 603934 562 594498 563 586933 564 580811 565 572930 566 566746 567 559732 568 554778 569 545068 570 539295 571 533285 572 526077 573 518992 574 512803 575 504482 576 500486 577 494073 578 487014 579 479753 580 473535 581 467333 582 461927 583 456415 584 448555 585 442926 586 438307 587 432043 588 427227 589 421042 590 414689 591 409884 592 404015 593 398353 594 393773 595 388513 596 384247 597 377627 598 371552 599 367416 600 361611 601 356810 602 352912 603 346491 604 342080 605 336980 606 334089 607 327471 608 322838 609 319046 610 314666 611 309897 612 305529 613 301631 614 297395 615 292574 616 289251 617 284322 618 280268 619 276153 620 271971 621 267484 622 264672 623 259864 624 256421 625 252939 626 248669 627 244683 628 242049 629 237875 630 234051 631 230347 632 227990 633 223591 634 220947 635 217087 636 213045 637 210495 638 207456 639 204696 640 200480 641 197396 642 195087 643 191264 644 189242 645 186803 646 183548 647 180481 648 176555 649 175273 650 172112 651 169127 652 167120 653 164447 654 161334 655 158742 656 156582 657 153987 658 151615 659 148714 660 146126 661 143971 662 141622 663 139636 664 137559 665 135074 666 132641 667 130375 668 127897 669 126470 670 124766 671 122398 672 120583 673 118171 674 115818 675 114453 676 111855 677 110215 678 109094 679 107426 680 104506 681 103759 682 101217 683 99625 684 98166 685 97145 686 94964 687 93838 688 91792 689 90768 690 88435 691 86501 692 85031 693 84289 694 82360 695 81246 696 79683 697 79070 698 77310 699 75722 700 74890 701 73092 702 71780 703 70485 704 69519 705 68000 706 66748 707 65817 708 64562 709 63274 710 62872 711 61360 712 59803 713 58694 714 57667 715 56052 716 55972 717 54790 718 53639 719 52858 720 51908 721 50955 722 50402 723 49381 724 48620 725 47686 726 46343 727 45798 728 45159 729 44206 730 43618 731 42729 732 41670 733 40778 734 40405 735 39850 736 38934 737 38112 738 37422 739 36801 740 36132 741 35650 742 34957 743 34013 744 33732 745 32958 746 32302 747 31985 748 31027 749 30722 750 30405 751 29491 752 28817 753 28044 754 27609 755 27250 756 26989 757 26027 758 25859 759 25264 760 24541 761 24262 762 23845 763 23040 764 22816 765 22237 766 21901 767 21370 768 20968 769 20407 770 20904 771 19834 772 19232 773 18989 774 18620 775 18274 776 17816 777 17599 778 17371 779 16961 780 16572 781 16272 782 16447 783 15835 784 14914 785 14457 786 14253 787 14213 788 13848 789 13520 790 13245 791 13264 792 12881 793 13018 794 12434 795 12646 796 11758 797 11315 798 11041 799 11040 800 10683 801 10294 802 10337 803 10637 804 9749 805 9336 806 9330 807 9216 808 9176 809 8611 810 8543 811 8439 812 8758 813 8077 814 7633 815 7521 816 7858 817 7537 818 6854 819 6781 820 6429 821 6410 822 6224 823 6172 824 6080 825 5914 826 5741 827 5668 828 5767 829 5283 830 5128 831 4968 832 4928 833 4900 834 4737 835 4617 836 4563 837 4408 838 4400 839 4239 840 4097 841 4106 842 4028 843 4032 844 4171 845 3638 846 3481 847 3479 848 3410 849 3419 850 3290 851 3222 852 3121 853 3129 854 3043 855 3033 856 2979 857 2833 858 2805 859 2813 860 2614 861 2504 862 2566 863 2492 864 2587 865 2434 866 2466 867 2310 868 2274 869 2222 870 2150 871 2078 872 2100 873 2055 874 2032 875 1894 876 1890 877 1778 878 1802 879 1773 880 1760 881 1686 882 1667 883 1690 884 1694 885 1554 886 1575 887 1552 888 1536 889 1493 890 1449 891 1464 892 1393 893 1348 894 1317 895 1370 896 1291 897 1287 898 1248 899 1237 900 1227 901 1187 902 1112 903 1178 904 1141 905 1095 906 1076 907 1033 908 1015 909 1018 910 1010 911 958 912 997 913 922 914 908 915 855 916 898 917 877 918 903 919 828 920 835 921 759 922 808 923 731 924 817 925 744 926 752 927 711 928 708 929 722 930 683 931 684 932 701 933 659 934 670 935 613 936 629 937 582 938 637 939 605 940 590 941 557 942 570 943 560 944 557 945 510 946 546 947 490 948 493 949 497 950 499 951 493 952 458 953 485 954 431 955 425 956 447 957 454 958 469 959 390 960 447 961 408 962 409 963 398 964 419 965 376 966 372 967 357 968 389 969 357 970 382 971 367 972 308 973 326 974 332 975 347 976 317 977 324 978 273 979 297 980 310 981 309 982 262 983 275 984 274