#SentieonCommandLine: /lustre8/home/ykawai-tnproj-pg/packages/sentieon-genomics-201911/libexec/driver -t 8 -r /lustre8/home/ncbn-pg/data/resource/Homo_sapiens_assembly38.fasta -i HGDP/HGDP01376/HGDP01376.cram --algo InsertSizeMetricAlgo HGDP/HGDP01376/QCmetrics/HGDP01376.InsertSizeMetricAlgo.txt MEDIAN_INSERT_SIZE MEDIAN_ABSOLUTE_DEVIATION MIN_INSERT_SIZE MAX_INSERT_SIZE MEAN_INSERT_SIZE STANDARD_DEVIATION READ_PAIRS PAIR_ORIENTATION WIDTH_OF_10_PERCENT WIDTH_OF_20_PERCENT WIDTH_OF_30_PERCENT WIDTH_OF_40_PERCENT WIDTH_OF_50_PERCENT WIDTH_OF_60_PERCENT WIDTH_OF_70_PERCENT WIDTH_OF_80_PERCENT WIDTH_OF_90_PERCENT WIDTH_OF_99_PERCENT 433.000000 54.000000 2 244823906 440.057702 86.524912 377024052 FR 21 41 63 85 109 135 167 207 273 585 insert_size All_Reads.fr_count 2 367 3 336 4 389 5 376 6 400 7 438 8 418 9 413 10 436 11 425 12 411 13 443 14 489 15 475 16 459 17 445 18 466 19 495 20 491 21 469 22 502 23 505 24 574 25 559 26 560 27 619 28 701 29 833 30 1508 31 1646 32 1674 33 1941 34 1949 35 2227 36 2504 37 2629 38 2820 39 2991 40 3150 41 3497 42 3504 43 3784 44 3925 45 4173 46 4247 47 4456 48 4656 49 4915 50 5003 51 5191 52 5271 53 5333 54 6252 55 6262 56 6175 57 6334 58 8114 59 8479 60 10286 61 11956 62 14540 63 14506 64 16047 65 16004 66 15850 67 15967 68 17359 69 18053 70 17509 71 17639 72 17996 73 18562 74 19421 75 18907 76 19121 77 19213 78 19731 79 19963 80 19850 81 19074 82 19102 83 19751 84 20233 85 19809 86 19581 87 19419 88 19901 89 19922 90 19674 91 19226 92 19161 93 19629 94 20002 95 20035 96 20094 97 19921 98 20399 99 20779 100 20762 101 20389 102 20168 103 20350 104 20416 105 20421 106 20265 107 19944 108 20344 109 20481 110 20127 111 19628 112 19333 113 19444 114 19916 115 19510 116 19500 117 18962 118 19386 119 19621 120 19115 121 19424 122 19430 123 19438 124 19971 125 19596 126 19197 127 19057 128 19256 129 19195 130 19022 131 18537 132 18210 133 18572 134 18477 135 18020 136 17905 137 17845 138 17782 139 18154 140 17705 141 17354 142 17023 143 16994 144 17264 145 17045 146 16686 147 16258 148 16696 149 16806 150 16799 151 16729 152 16328 153 16399 154 16493 155 16050 156 15944 157 15528 158 15428 159 15297 160 15040 161 14866 162 14711 163 14484 164 14451 165 14212 166 13885 167 13898 168 13832 169 13770 170 13428 171 13304 172 12918 173 13058 174 12936 175 12836 176 12741 177 12610 178 13066 179 13326 180 12892 181 12880 182 12717 183 12578 184 12193 185 12353 186 12286 187 12088 188 12160 189 11984 190 11802 191 11667 192 11735 193 11862 194 11645 195 11665 196 11639 197 11592 198 11744 199 11425 200 11374 201 11490 202 11527 203 11253 204 11627 205 11272 206 11710 207 11543 208 11697 209 11989 210 12182 211 12382 212 12756 213 13200 214 13375 215 13447 216 13652 217 13904 218 14066 219 14299 220 14467 221 14904 222 15374 223 15614 224 16007 225 16130 226 17035 227 17255 228 18300 229 18422 230 19207 231 19937 232 20474 233 21347 234 22253 235 22960 236 23798 237 24775 238 25786 239 27124 240 27959 241 29082 242 30473 243 31855 244 33260 245 34461 246 36411 247 37824 248 39427 249 41501 250 43822 251 45848 252 47619 253 49439 254 51559 255 53660 256 56081 257 59432 258 61450 259 64160 260 67024 261 70341 262 73089 263 76486 264 79935 265 83015 266 86690 267 91055 268 94225 269 98351 270 103059 271 107638 272 112401 273 117975 274 122553 275 127293 276 136078 277 141386 278 146389 279 150510 280 156889 281 162745 282 169131 283 175618 284 182292 285 189953 286 196862 287 203135 288 211697 289 220293 290 228278 291 236915 292 245016 293 256141 294 264567 295 274001 296 283500 297 292543 298 303051 299 313319 300 324653 301 336809 302 348212 303 360712 304 371351 305 382277 306 395685 307 408353 308 421198 309 433687 310 448252 311 463369 312 475067 313 491117 314 506542 315 520652 316 534291 317 549906 318 564862 319 582601 320 598531 321 614124 322 632276 323 647958 324 664491 325 681245 326 698811 327 716518 328 733486 329 751009 330 767829 331 790040 332 807547 333 827390 334 847530 335 865118 336 884800 337 901810 338 922762 339 939542 340 958809 341 977629 342 1000405 343 1018881 344 1039447 345 1059648 346 1079866 347 1099977 348 1117398 349 1136100 350 1157214 351 1180323 352 1198704 353 1219882 354 1239627 355 1257008 356 1278509 357 1296594 358 1313209 359 1333797 360 1350675 361 1370415 362 1389745 363 1406502 364 1425996 365 1442429 366 1460986 367 1478619 368 1494128 369 1509170 370 1525368 371 1541394 372 1559050 373 1573858 374 1591552 375 1609006 376 1621179 377 1633829 378 1648877 379 1662993 380 1676834 381 1687824 382 1701181 383 1712071 384 1727787 385 1740080 386 1750889 387 1766106 388 1772337 389 1781894 390 1793325 391 1800826 392 1811066 393 1819418 394 1832626 395 1840192 396 1848750 397 1854994 398 1863642 399 1868434 400 1873789 401 1877593 402 1886331 403 1889937 404 1894586 405 1900052 406 1904661 407 1909885 408 1911214 409 1914366 410 1916255 411 1914727 412 1915633 413 1919002 414 1921533 415 1922883 416 1921955 417 1919950 418 1921452 419 1920095 420 1918300 421 1916163 422 1912913 423 1914925 424 1908728 425 1905515 426 1906016 427 1901387 428 1898809 429 1895787 430 1888914 431 1883254 432 1879151 433 1871722 434 1864833 435 1861657 436 1854695 437 1852946 438 1845008 439 1841082 440 1831686 441 1822337 442 1814448 443 1808241 444 1798341 445 1792342 446 1783971 447 1777123 448 1768812 449 1757821 450 1752350 451 1745598 452 1731811 453 1719708 454 1713095 455 1699110 456 1694742 457 1683035 458 1675083 459 1664581 460 1654854 461 1642505 462 1631732 463 1619960 464 1610456 465 1598213 466 1587439 467 1578008 468 1567618 469 1556403 470 1546230 471 1533647 472 1523018 473 1510312 474 1498284 475 1488309 476 1475873 477 1462327 478 1451409 479 1440260 480 1431110 481 1417225 482 1402698 483 1393005 484 1379987 485 1367692 486 1357166 487 1346543 488 1332873 489 1323399 490 1311184 491 1296900 492 1284994 493 1274011 494 1261963 495 1247887 496 1238045 497 1225433 498 1212929 499 1201645 500 1190861 501 1178741 502 1167715 503 1155449 504 1143503 505 1131534 506 1122093 507 1106980 508 1097650 509 1086628 510 1074325 511 1062657 512 1049993 513 1038758 514 1027572 515 1016326 516 1002791 517 991746 518 982368 519 971411 520 960049 521 950410 522 936858 523 924893 524 916179 525 905260 526 894864 527 879861 528 870089 529 862128 530 850692 531 838549 532 829565 533 816840 534 806905 535 795732 536 785416 537 775359 538 766563 539 754561 540 746259 541 735607 542 724805 543 717789 544 707721 545 697669 546 687605 547 678725 548 669573 549 661319 550 651509 551 642982 552 633289 553 624666 554 615994 555 607845 556 599171 557 589813 558 580156 559 572469 560 563566 561 555278 562 549358 563 540776 564 531094 565 524687 566 514747 567 508604 568 500104 569 492127 570 485799 571 477888 572 470930 573 463644 574 456038 575 448321 576 441846 577 433735 578 427991 579 421247 580 415514 581 408609 582 402346 583 393156 584 388169 585 380501 586 374857 587 367758 588 364218 589 356030 590 349180 591 343297 592 336845 593 330805 594 327939 595 320047 596 315006 597 309774 598 304490 599 299839 600 294490 601 287750 602 284927 603 280332 604 273231 605 269509 606 264767 607 259830 608 255754 609 251231 610 246172 611 241444 612 237140 613 233706 614 229831 615 225127 616 221497 617 217249 618 213274 619 209188 620 205478 621 202481 622 198056 623 194838 624 190226 625 187100 626 183307 627 179948 628 177009 629 172990 630 169740 631 166692 632 163593 633 160165 634 156763 635 153514 636 150855 637 147661 638 145097 639 141617 640 139567 641 137421 642 134105 643 131449 644 128902 645 126240 646 124891 647 121543 648 119705 649 116411 650 115152 651 112622 652 110849 653 108016 654 106221 655 104202 656 101465 657 99864 658 97649 659 96661 660 94264 661 92598 662 89966 663 88349 664 86291 665 85039 666 83179 667 82386 668 80059 669 78165 670 76994 671 74839 672 73860 673 72903 674 70611 675 68949 676 67902 677 66110 678 65215 679 64371 680 62449 681 61681 682 59723 683 59331 684 57528 685 56420 686 55413 687 54531 688 53153 689 52093 690 50974 691 49697 692 49258 693 47856 694 47186 695 46053 696 45104 697 44058 698 43241 699 42318 700 41658 701 40791 702 39829 703 39199 704 38022 705 36791 706 36829 707 35438 708 34793 709 34353 710 33918 711 33172 712 32516 713 31402 714 31183 715 30412 716 29914 717 29599 718 28725 719 28282 720 28032 721 27142 722 26524 723 26280 724 25613 725 25078 726 24662 727 24003 728 23932 729 23291 730 22638 731 22650 732 21918 733 21395 734 21057 735 20544 736 20416 737 19858 738 19328 739 19092 740 18923 741 18334 742 17859 743 17793 744 17372 745 16811 746 16720 747 16290 748 16000 749 15641 750 15622 751 15179 752 14620 753 14422 754 14323 755 13952 756 13559 757 13515 758 13180 759 13115 760 12694 761 12326 762 11990 763 11772 764 11591 765 11321 766 11083 767 10929 768 10797 769 10470 770 10332 771 10079 772 9943 773 9633 774 9526 775 9550 776 9028 777 8894 778 8761 779 8459 780 8315 781 8297 782 7937 783 8053 784 7724 785 7567 786 7562 787 7360 788 7381 789 6982 790 6805 791 6733 792 6584 793 6413 794 6196 795 6210 796 6254 797 6087 798 6026 799 5895 800 5866 801 5815 802 5748 803 5826 804 5400 805 5077 806 5405 807 4833 808 4733 809 4907 810 4618 811 4477 812 4708 813 4306 814 3936 815 4304 816 4425 817 3328 818 3097 819 3051 820 3255 821 3141 822 2974 823 2854 824 2710 825 2731 826 2680 827 2665 828 2518 829 2506 830 2590 831 2407 832 2345 833 2406 834 2232 835 2322 836 2205 837 2159 838 2145 839 2143 840 2079 841 2027 842 1919 843 1935 844 1872 845 1885 846 1839 847 1832 848 1749 849 1847 850 1680 851 1640 852 1637 853 1657 854 1583 855 1542 856 1627 857 1520 858 1518 859 1516 860 1410 861 1400 862 1439 863 1342 864 1372 865 1329 866 1289 867 1317 868 1267 869 1264 870 1160 871 1235 872 1188 873 1135 874 1158 875 1092 876 1083 877 1101 878 1053 879 1012 880 997 881 976 882 1009 883 1050 884 967 885 938 886 943 887 908 888 907 889 907 890 871 891 859 892 829 893 828 894 819 895 797 896 836 897 773 898 811 899 749 900 763 901 748 902 684 903 710 904 677 905 748 906 677 907 738 908 683 909 660 910 658 911 650 912 631 913 618 914 612 915 600 916 609 917 616 918 595 919 530 920 595 921 554 922 574 923 581 924 532 925 564 926 526 927 492 928 505 929 493 930 474 931 497 932 525 933 482 934 483 935 476 936 435 937 471 938 462 939 441 940 431 941 405 942 435 943 439 944 422 945 402 946 367 947 395 948 420 949 401 950 384 951 390 952 359 953 353 954 373 955 392 956 370 957 332 958 372 959 373 960 330 961 339 962 323 963 318 964 326 965 303 966 291 967 327 968 298 969 291 970 292 971 307 972 298 973 271